Protein–RNA interactions for Protein: Q5SPL2

Phf12, PHD finger protein 12, mousemouse

Predictions only

Length 1,003 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Phf12Q5SPL2 Pcgf2-207ENSMUST00000179765 2485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Phf12Q5SPL2 Tspan14-201ENSMUST00000047652 2475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Phf12Q5SPL2 Ppp3cb-202ENSMUST00000159027 3831 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Phf12Q5SPL2 Prune1-201ENSMUST00000015855 3140 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Phf12Q5SPL2 Med8-204ENSMUST00000106384 1743 ntTSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Phf12Q5SPL2 Mtm1-201ENSMUST00000025391 3286 ntTSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Phf12Q5SPL2 Bean1-206ENSMUST00000213077 1373 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC11.66□□□□□ -0.54
Phf12Q5SPL2 Plekhg2-201ENSMUST00000094644 4623 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Phf12Q5SPL2 Tfdp2-204ENSMUST00000179065 2213 ntTSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Phf12Q5SPL2 Fam189b-201ENSMUST00000041913 3083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Phf12Q5SPL2 Epb41l3-202ENSMUST00000112680 4073 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.65□□□□□ -0.54
Phf12Q5SPL2 Kdm4a-202ENSMUST00000097911 4550 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Phf12Q5SPL2 Tor1aip1-202ENSMUST00000097527 4234 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Phf12Q5SPL2 Phyhd1-212ENSMUST00000154647 1678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Phf12Q5SPL2 4933412E12Rik-201ENSMUST00000217853 1698 ntTSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Phf12Q5SPL2 Xpot-203ENSMUST00000218004 6005 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.65□□□□□ -0.54
Phf12Q5SPL2 Shank2-202ENSMUST00000105900 8169 ntTSL 5 BASIC11.65□□□□□ -0.54
Phf12Q5SPL2 Tmeff2-201ENSMUST00000081851 3343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Phf12Q5SPL2 Ip6k3-201ENSMUST00000025046 2307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Phf12Q5SPL2 Vwf-201ENSMUST00000100941 1807 ntTSL 5 BASIC11.65□□□□□ -0.54
Phf12Q5SPL2 Gm45114-201ENSMUST00000208280 1349 ntBASIC11.65□□□□□ -0.54
Phf12Q5SPL2 Timm21-201ENSMUST00000025547 1315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Phf12Q5SPL2 AC131586.1-201ENSMUST00000228844 2964 ntBASIC11.65□□□□□ -0.54
Phf12Q5SPL2 Cd19-204ENSMUST00000206325 2452 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Phf12Q5SPL2 Lrp8-203ENSMUST00000106732 2648 ntTSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Phf12Q5SPL2 Chrdl1-204ENSMUST00000166406 2605 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Phf12Q5SPL2 Mroh1-204ENSMUST00000159218 5085 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.65□□□□□ -0.54
Phf12Q5SPL2 Gnas-203ENSMUST00000087876 3719 ntTSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Phf12Q5SPL2 Kalrn-209ENSMUST00000114963 3207 ntTSL 5 BASIC11.65□□□□□ -0.54
Phf12Q5SPL2 Grpel1-201ENSMUST00000031099 3528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Phf12Q5SPL2 Pigh-203ENSMUST00000217998 2868 ntTSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Phf12Q5SPL2 Galr1-201ENSMUST00000065224 2871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Phf12Q5SPL2 Nxf1-202ENSMUST00000010248 748 ntTSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Phf12Q5SPL2 4933409G03Rik-201ENSMUST00000102713 1263 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Phf12Q5SPL2 Gm10999-201ENSMUST00000108743 207 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.65□□□□□ -0.54
Phf12Q5SPL2 Gm15719-201ENSMUST00000120619 635 ntBASIC11.65□□□□□ -0.54
Phf12Q5SPL2 Adamtsl1-204ENSMUST00000120678 977 ntTSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Phf12Q5SPL2 Gm11964-201ENSMUST00000120982 444 ntBASIC11.65□□□□□ -0.54
Phf12Q5SPL2 Cep97-204ENSMUST00000121129 989 ntTSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Phf12Q5SPL2 Gm12363-201ENSMUST00000122250 668 ntBASIC11.65□□□□□ -0.54
Phf12Q5SPL2 Pla2g10os-201ENSMUST00000141172 174 ntTSL 5 BASIC11.65□□□□□ -0.54
Phf12Q5SPL2 Atpif1-203ENSMUST00000152993 462 ntTSL 2 BASIC11.65□□□□□ -0.54
Phf12Q5SPL2 Nme9-202ENSMUST00000163199 1196 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.65□□□□□ -0.54
Phf12Q5SPL2 Gm4141-201ENSMUST00000174364 921 ntAPPRIS P1 BASIC11.65□□□□□ -0.54
Phf12Q5SPL2 Gm4201-201ENSMUST00000174775 921 ntAPPRIS P1 BASIC11.65□□□□□ -0.54
Phf12Q5SPL2 Gm2449-201ENSMUST00000180676 585 ntTSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Phf12Q5SPL2 Obox1-206ENSMUST00000181001 1217 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.65□□□□□ -0.54
Phf12Q5SPL2 Mturn-202ENSMUST00000187701 503 ntTSL 5 BASIC11.65□□□□□ -0.54
Phf12Q5SPL2 4921511E07Rik-201ENSMUST00000194790 827 ntBASIC11.65□□□□□ -0.54
Phf12Q5SPL2 4930438A08Rik-202ENSMUST00000208022 918 ntTSL 5 BASIC11.65□□□□□ -0.54
Phf12Q5SPL2 AC174797.4-201ENSMUST00000225510 347 ntBASIC11.65□□□□□ -0.54
Phf12Q5SPL2 Gm9899-201ENSMUST00000065519 555 ntBASIC11.65□□□□□ -0.54
Phf12Q5SPL2 Serpine1-201ENSMUST00000041388 3011 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Phf12Q5SPL2 Nubp2-201ENSMUST00000044252 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Phf12Q5SPL2 Col14a1-202ENSMUST00000110217 6457 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC11.65□□□□□ -0.54
Phf12Q5SPL2 Gm28036-202ENSMUST00000132494 5505 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC11.65□□□□□ -0.54
Phf12Q5SPL2 Slc25a22-203ENSMUST00000106007 2546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Phf12Q5SPL2 Gm37600-201ENSMUST00000193764 3292 ntBASIC11.65□□□□□ -0.54
Phf12Q5SPL2 Osgin1-206ENSMUST00000152420 2005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Phf12Q5SPL2 AC211878.3-201ENSMUST00000222629 2018 ntBASIC11.65□□□□□ -0.54
Phf12Q5SPL2 Gm17244-201ENSMUST00000192482 3416 ntBASIC11.65□□□□□ -0.54
Phf12Q5SPL2 Usp20-211ENSMUST00000170476 4970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Phf12Q5SPL2 Ticam2-201ENSMUST00000070084 2340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Phf12Q5SPL2 Klhl22-208ENSMUST00000165790 2616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Phf12Q5SPL2 Iqcc-201ENSMUST00000046675 2639 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC11.65□□□□□ -0.54
Phf12Q5SPL2 Lmbr1-201ENSMUST00000055195 4926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Phf12Q5SPL2 Gm9361-201ENSMUST00000198695 1507 ntBASIC11.65□□□□□ -0.55
Phf12Q5SPL2 Plekhn1-203ENSMUST00000217885 1982 ntTSL 5 BASIC11.65□□□□□ -0.55
Phf12Q5SPL2 Mettl8-202ENSMUST00000100037 2254 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.55
Phf12Q5SPL2 Vps33b-201ENSMUST00000032749 2574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.55
Phf12Q5SPL2 Ank2-221ENSMUST00000182994 2715 ntTSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.55
Phf12Q5SPL2 Grid2ip-201ENSMUST00000010969 3459 ntTSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.55
Phf12Q5SPL2 Cdk13-207ENSMUST00000223490 12548 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.55
Phf12Q5SPL2 Kcnd1-201ENSMUST00000009875 5287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.55
Phf12Q5SPL2 Mtus2-203ENSMUST00000085558 7543 ntTSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.55
Phf12Q5SPL2 Fam172a-201ENSMUST00000091459 3892 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Phf12Q5SPL2 Kifc2-201ENSMUST00000004294 3143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Phf12Q5SPL2 Traf7-201ENSMUST00000070777 2384 ntTSL 5 BASIC11.64□□□□□ -0.55
Phf12Q5SPL2 Oraov1-204ENSMUST00000128057 2231 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Phf12Q5SPL2 Nfe2-207ENSMUST00000134554 1761 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.64□□□□□ -0.55
Phf12Q5SPL2 Retsat-205ENSMUST00000176364 1647 ntTSL 5 BASIC11.64□□□□□ -0.55
Phf12Q5SPL2 Pdss2-202ENSMUST00000159139 1467 ntTSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Phf12Q5SPL2 BC025446-201ENSMUST00000055719 1470 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Phf12Q5SPL2 Avpr2-202ENSMUST00000101470 2787 ntTSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Phf12Q5SPL2 Gm4316-201ENSMUST00000212411 2617 ntTSL 5 BASIC11.64□□□□□ -0.55
Phf12Q5SPL2 Kif26b-201ENSMUST00000160789 6216 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Phf12Q5SPL2 Nrd1-201ENSMUST00000065977 4311 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Phf12Q5SPL2 Map3k4-201ENSMUST00000089058 5305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Phf12Q5SPL2 Atp6v0a1-201ENSMUST00000044721 4008 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Phf12Q5SPL2 Pcp4l1-201ENSMUST00000111332 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Phf12Q5SPL2 Car6-201ENSMUST00000030817 1567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Phf12Q5SPL2 Trim26-202ENSMUST00000123715 1406 ntTSL 5 BASIC11.64□□□□□ -0.55
Phf12Q5SPL2 Phyh-201ENSMUST00000027975 1438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Phf12Q5SPL2 Lrrc8c-201ENSMUST00000067924 6976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Phf12Q5SPL2 Rps8-201ENSMUST00000102696 860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Phf12Q5SPL2 Ift20-202ENSMUST00000108275 582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Phf12Q5SPL2 Blvrb-202ENSMUST00000108357 782 ntTSL 2 BASIC11.64□□□□□ -0.55
Phf12Q5SPL2 Unc50-202ENSMUST00000114925 1094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Phf12Q5SPL2 Rhox2b-201ENSMUST00000115191 799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Phf12Q5SPL2 Gm4984-201ENSMUST00000115987 360 ntBASIC11.64□□□□□ -0.55
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 51.6 ms