Protein–RNA interactions for Protein: Q5RIS0

Gm11487, Novel protein, mousemouse

Predictions only

Length 354 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gm11487Q5RIS0 Snai2-201ENSMUST00000023356 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
Gm11487Q5RIS0 Zfp593-201ENSMUST00000030644 1994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
Gm11487Q5RIS0 Oasl1-201ENSMUST00000031540 2125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
Gm11487Q5RIS0 Lyplal1-201ENSMUST00000045388 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
Gm11487Q5RIS0 Cd200r1-201ENSMUST00000057488 1892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
Gm11487Q5RIS0 Btnl4-201ENSMUST00000065841 1761 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.75□□□□□ -0.37
Gm11487Q5RIS0 Sim2-201ENSMUST00000072182 3670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
Gm11487Q5RIS0 Tbc1d24-209ENSMUST00000201301 4261 ntTSL 5 BASIC12.75□□□□□ -0.37
Gm11487Q5RIS0 Ap2a1-203ENSMUST00000166972 3449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
Gm11487Q5RIS0 Zmat1-202ENSMUST00000113185 3378 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.75□□□□□ -0.37
Gm11487Q5RIS0 Mcm8-201ENSMUST00000028831 3179 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
Gm11487Q5RIS0 Tas1r1-201ENSMUST00000030792 2863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
Gm11487Q5RIS0 Dusp6-201ENSMUST00000020118 2796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
Gm11487Q5RIS0 Parp16-202ENSMUST00000213396 2518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
Gm11487Q5RIS0 Gorab-201ENSMUST00000045138 2538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
Gm11487Q5RIS0 Tnpo2-201ENSMUST00000093360 4863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
Gm11487Q5RIS0 Pdzk1-201ENSMUST00000058865 2406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
Gm11487Q5RIS0 Rsbn1-201ENSMUST00000051139 4762 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
Gm11487Q5RIS0 Trpm1-219ENSMUST00000206314 2323 ntTSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
Gm11487Q5RIS0 Zbtb39-201ENSMUST00000054287 5960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
Gm11487Q5RIS0 Nynrin-202ENSMUST00000168479 7511 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.74□□□□□ -0.37
Gm11487Q5RIS0 Tcf4-252ENSMUST00000202477 1873 ntTSL 5 BASIC12.74□□□□□ -0.37
Gm11487Q5RIS0 Dclk1-215ENSMUST00000200352 1662 ntTSL 2 BASIC12.74□□□□□ -0.37
Gm11487Q5RIS0 1110059E24Rik-201ENSMUST00000038830 1614 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
Gm11487Q5RIS0 Samd4-201ENSMUST00000022386 4564 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
Gm11487Q5RIS0 Arhgef10l-202ENSMUST00000069623 4531 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
Gm11487Q5RIS0 Ebna1bp2-201ENSMUST00000030501 2960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
Gm11487Q5RIS0 Ret-201ENSMUST00000032201 5456 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
Gm11487Q5RIS0 Lipe-202ENSMUST00000054301 2661 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
Gm11487Q5RIS0 Gm6655-201ENSMUST00000201932 1309 ntBASIC12.74□□□□□ -0.37
Gm11487Q5RIS0 AC107452.3-201ENSMUST00000228807 1308 ntBASIC12.74□□□□□ -0.37
Gm11487Q5RIS0 Apc2-202ENSMUST00000105359 9173 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.74□□□□□ -0.37
Gm11487Q5RIS0 Cdc73-201ENSMUST00000018337 11586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
Gm11487Q5RIS0 Tcea3-201ENSMUST00000102533 1251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
Gm11487Q5RIS0 Rffl-205ENSMUST00000103218 1264 ntTSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
Gm11487Q5RIS0 Gm13600-201ENSMUST00000117949 744 ntBASIC12.74□□□□□ -0.37
Gm11487Q5RIS0 Gm11789-203ENSMUST00000140645 737 ntTSL 2 BASIC12.74□□□□□ -0.37
Gm11487Q5RIS0 Gm7741-201ENSMUST00000181445 989 ntBASIC12.74□□□□□ -0.37
Gm11487Q5RIS0 Calm5-202ENSMUST00000184271 423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
Gm11487Q5RIS0 Gm8502-201ENSMUST00000185708 901 ntBASIC12.74□□□□□ -0.37
Gm11487Q5RIS0 Gm21147-201ENSMUST00000186046 913 ntBASIC12.74□□□□□ -0.37
Gm11487Q5RIS0 Gm19744-202ENSMUST00000186135 948 ntTSL 5 BASIC12.74□□□□□ -0.37
Gm11487Q5RIS0 Gm8510-201ENSMUST00000189202 895 ntBASIC12.74□□□□□ -0.37
Gm11487Q5RIS0 Gm2316-201ENSMUST00000190613 921 ntBASIC12.74□□□□□ -0.37
Gm11487Q5RIS0 Gm43452-201ENSMUST00000201873 991 ntBASIC12.74□□□□□ -0.37
Gm11487Q5RIS0 Fxyd4-202ENSMUST00000203066 522 ntTSL 3 BASIC12.74□□□□□ -0.37
Gm11487Q5RIS0 Gm44759-201ENSMUST00000206057 430 ntTSL 3 BASIC12.74□□□□□ -0.37
Gm11487Q5RIS0 Gm45878-201ENSMUST00000211839 241 ntBASIC12.74□□□□□ -0.37
Gm11487Q5RIS0 Gm3619-201ENSMUST00000219947 775 ntBASIC12.74□□□□□ -0.37
Gm11487Q5RIS0 Ccdc28b-201ENSMUST00000030586 879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
Gm11487Q5RIS0 Polb-201ENSMUST00000033938 1201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
Gm11487Q5RIS0 Gm10334-201ENSMUST00000095999 876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
Gm11487Q5RIS0 Gm5544-201ENSMUST00000098828 891 ntTSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
Gm11487Q5RIS0 Cplx2-201ENSMUST00000026985 4928 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.74□□□□□ -0.37
Gm11487Q5RIS0 Mcc-202ENSMUST00000164666 3606 ntTSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
Gm11487Q5RIS0 Nphp4-201ENSMUST00000056567 4583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
Gm11487Q5RIS0 Ripor2-201ENSMUST00000038477 3371 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
Gm11487Q5RIS0 Shank2-203ENSMUST00000105902 8988 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.74□□□□□ -0.37
Gm11487Q5RIS0 Cdc45-201ENSMUST00000000028 2143 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
Gm11487Q5RIS0 Nfic-202ENSMUST00000078185 3163 ntTSL 5 BASIC12.74□□□□□ -0.37
Gm11487Q5RIS0 Ube2q2-203ENSMUST00000122441 2081 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
Gm11487Q5RIS0 Tbr1-201ENSMUST00000048934 3977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
Gm11487Q5RIS0 Tbrg1-201ENSMUST00000117654 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
Gm11487Q5RIS0 Fgd4-211ENSMUST00000162671 2714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
Gm11487Q5RIS0 Xrra1-201ENSMUST00000036155 2731 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
Gm11487Q5RIS0 1700010I14Rik-201ENSMUST00000024650 1769 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
Gm11487Q5RIS0 Sacs-202ENSMUST00000119509 3468 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.74□□□□□ -0.37
Gm11487Q5RIS0 Camkk1-201ENSMUST00000092937 3424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
Gm11487Q5RIS0 Ccdc15-204ENSMUST00000216042 1669 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
Gm11487Q5RIS0 Bbip1-201ENSMUST00000135402 2488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
Gm11487Q5RIS0 Vax2os-203ENSMUST00000155159 4063 ntTSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
Gm11487Q5RIS0 Anxa9-204ENSMUST00000164406 1611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
Gm11487Q5RIS0 Pip5kl1-201ENSMUST00000055304 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
Gm11487Q5RIS0 Pax6-202ENSMUST00000090397 3069 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC12.73□□□□□ -0.37
Gm11487Q5RIS0 Sun2-203ENSMUST00000100439 3768 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
Gm11487Q5RIS0 Mier3-203ENSMUST00000109272 5279 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
Gm11487Q5RIS0 Cipc-208ENSMUST00000189246 1454 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC12.73□□□□□ -0.37
Gm11487Q5RIS0 Emb-201ENSMUST00000022242 2923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
Gm11487Q5RIS0 Pde4d-201ENSMUST00000074103 2167 ntTSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
Gm11487Q5RIS0 AC154747.3-201ENSMUST00000224471 3470 ntBASIC12.73□□□□□ -0.37
Gm11487Q5RIS0 Cfap100-207ENSMUST00000165673 2072 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC12.73□□□□□ -0.37
Gm11487Q5RIS0 Cd163l1-203ENSMUST00000209398 3437 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
Gm11487Q5RIS0 Pnma3-201ENSMUST00000060418 3405 ntAPPRIS P1 BASIC12.73□□□□□ -0.37
Gm11487Q5RIS0 Mgat1-202ENSMUST00000101293 2729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
Gm11487Q5RIS0 Fgfr3-211ENSMUST00000171509 4020 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.73□□□□□ -0.37
Gm11487Q5RIS0 Rufy2-203ENSMUST00000122231 2664 ntTSL 5 BASIC12.73□□□□□ -0.37
Gm11487Q5RIS0 Dph6-201ENSMUST00000028640 2632 ntTSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
Gm11487Q5RIS0 Neurl3-201ENSMUST00000056946 2598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
Gm11487Q5RIS0 Gm10479-201ENSMUST00000101568 318 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.73□□□□□ -0.37
Gm11487Q5RIS0 Cd27-202ENSMUST00000112281 832 ntTSL 3 BASIC12.73□□□□□ -0.37
Gm11487Q5RIS0 Rbm3-205ENSMUST00000115619 969 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC12.73□□□□□ -0.37
Gm11487Q5RIS0 Gm12274-201ENSMUST00000120062 385 ntBASIC12.73□□□□□ -0.37
Gm11487Q5RIS0 Gm14441-201ENSMUST00000121960 540 ntBASIC12.73□□□□□ -0.37
Gm11487Q5RIS0 Gm12628-201ENSMUST00000122193 382 ntBASIC12.73□□□□□ -0.37
Gm11487Q5RIS0 Gm38389-201ENSMUST00000147871 653 ntTSL 3 BASIC12.73□□□□□ -0.37
Gm11487Q5RIS0 Gm15744-201ENSMUST00000161734 213 ntBASIC12.73□□□□□ -0.37
Gm11487Q5RIS0 Gm10320-201ENSMUST00000170205 527 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.73□□□□□ -0.37
Gm11487Q5RIS0 Gm6407-201ENSMUST00000176468 549 ntBASIC12.73□□□□□ -0.37
Gm11487Q5RIS0 Gm2449-201ENSMUST00000180676 585 ntTSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
Gm11487Q5RIS0 Gm7271-202ENSMUST00000191515 836 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.73□□□□□ -0.37
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 82.9 ms