Protein–RNA interactions for Protein: Q5PSV9

Mdc1, Mediator of DNA damage checkpoint protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 1,707 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Mdc1Q5PSV9 Mei4-201ENSMUST00000057067 2670 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Mdc1Q5PSV9 Gm44190-201ENSMUST00000205083 1401 ntBASIC15.46■□□□□ 0.07
Mdc1Q5PSV9 Stau1-203ENSMUST00000109236 2860 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Mdc1Q5PSV9 Pik3r1-201ENSMUST00000035532 2923 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Mdc1Q5PSV9 Eef1d-205ENSMUST00000109972 1624 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Mdc1Q5PSV9 Adnp-201ENSMUST00000057793 4917 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Mdc1Q5PSV9 Xkr6-202ENSMUST00000120820 1702 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Mdc1Q5PSV9 Atp8a2-202ENSMUST00000131670 1725 ntTSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Mdc1Q5PSV9 Gm45428-201ENSMUST00000209619 1789 ntBASIC15.46■□□□□ 0.07
Mdc1Q5PSV9 Sim2-201ENSMUST00000072182 3670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Mdc1Q5PSV9 Gm37269-201ENSMUST00000193906 1891 ntBASIC15.46■□□□□ 0.07
Mdc1Q5PSV9 H2-Q1-202ENSMUST00000105041 1954 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Mdc1Q5PSV9 Fitm2-201ENSMUST00000109418 3967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Mdc1Q5PSV9 Ppig-201ENSMUST00000040915 6245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Mdc1Q5PSV9 Strada-201ENSMUST00000007444 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Mdc1Q5PSV9 AC157950.1-201ENSMUST00000217561 2168 ntBASIC15.46■□□□□ 0.07
Mdc1Q5PSV9 Ikzf4-203ENSMUST00000221150 2213 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Mdc1Q5PSV9 4933427G23Rik-201ENSMUST00000122963 2515 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Mdc1Q5PSV9 Ap1g2-211ENSMUST00000170285 2596 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Mdc1Q5PSV9 Ube3b-201ENSMUST00000074002 5194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Mdc1Q5PSV9 Fam214b-205ENSMUST00000107959 3060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Mdc1Q5PSV9 Fam214b-201ENSMUST00000036462 3074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Mdc1Q5PSV9 Slc25a13-203ENSMUST00000188414 3121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Mdc1Q5PSV9 Zbtb4-202ENSMUST00000108639 7811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
Mdc1Q5PSV9 Rbm48-201ENSMUST00000042753 2368 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
Mdc1Q5PSV9 Hist1h2bk-201ENSMUST00000110455 476 ntAPPRIS P1 BASIC15.46■□□□□ 0.06
Mdc1Q5PSV9 Bckdk-202ENSMUST00000124533 1792 ntTSL 3 BASIC15.46■□□□□ 0.06
Mdc1Q5PSV9 4930502E09Rik-201ENSMUST00000126016 755 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
Mdc1Q5PSV9 Prr33-202ENSMUST00000151580 399 ntTSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.06
Mdc1Q5PSV9 Tsku-203ENSMUST00000165257 2514 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.06
Mdc1Q5PSV9 Galnt9-202ENSMUST00000165856 1541 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
Mdc1Q5PSV9 Gm21759-201ENSMUST00000178345 1828 ntBASIC15.46■□□□□ 0.06
Mdc1Q5PSV9 Tcf4-251ENSMUST00000202474 1810 ntTSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.06
Mdc1Q5PSV9 Gm4924-205ENSMUST00000211099 490 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
Mdc1Q5PSV9 CT030653.1-201ENSMUST00000224382 1279 ntBASIC15.46■□□□□ 0.06
Mdc1Q5PSV9 Zfp94-201ENSMUST00000032673 2529 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
Mdc1Q5PSV9 Foxh1-201ENSMUST00000037824 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
Mdc1Q5PSV9 H2-M3-201ENSMUST00000038580 1438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
Mdc1Q5PSV9 Psg23-201ENSMUST00000057810 2179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
Mdc1Q5PSV9 4930555K19Rik-201ENSMUST00000060066 171 ntBASIC15.46■□□□□ 0.06
Mdc1Q5PSV9 Fbxo3-201ENSMUST00000028603 4740 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Mdc1Q5PSV9 Wnt9a-202ENSMUST00000108783 3318 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Mdc1Q5PSV9 Phactr2-203ENSMUST00000105545 8556 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Mdc1Q5PSV9 Tcf4-254ENSMUST00000202674 2615 ntTSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Mdc1Q5PSV9 Trpc7-207ENSMUST00000173817 2406 ntTSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Mdc1Q5PSV9 Trpc7-208ENSMUST00000174457 2424 ntTSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Mdc1Q5PSV9 Tfb2m-201ENSMUST00000027769 2449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Mdc1Q5PSV9 Rp2-202ENSMUST00000115387 4498 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Mdc1Q5PSV9 Gm43773-201ENSMUST00000198548 2162 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
Mdc1Q5PSV9 Gm8146-201ENSMUST00000192106 1847 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
Mdc1Q5PSV9 Gm10750-201ENSMUST00000099266 1506 ntAPPRIS P1 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Mdc1Q5PSV9 AC108858.2-201ENSMUST00000228186 1425 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
Mdc1Q5PSV9 Tcf25-202ENSMUST00000108840 2582 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Mdc1Q5PSV9 Tomm5-201ENSMUST00000107807 442 ntTSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Mdc1Q5PSV9 Olfr1267-ps1-201ENSMUST00000118957 930 ntAPPRIS P1 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Mdc1Q5PSV9 Gm10169-201ENSMUST00000121822 348 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
Mdc1Q5PSV9 Gm13791-201ENSMUST00000123263 608 ntTSL 3 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Mdc1Q5PSV9 Gm12682-201ENSMUST00000144637 1081 ntTSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Mdc1Q5PSV9 Gm26134-201ENSMUST00000178484 110 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
Mdc1Q5PSV9 Olfr1415-203ENSMUST00000204766 403 ntTSL 3 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Mdc1Q5PSV9 CT573086.4-201ENSMUST00000226729 342 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
Mdc1Q5PSV9 Fth1-201ENSMUST00000025563 866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Mdc1Q5PSV9 Gm10263-201ENSMUST00000085163 300 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
Mdc1Q5PSV9 Slc25a22-203ENSMUST00000106007 2546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Mdc1Q5PSV9 Hist1h2be-202ENSMUST00000091704 2480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Mdc1Q5PSV9 Kcnk2-202ENSMUST00000110920 3572 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Mdc1Q5PSV9 Hhipl2-202ENSMUST00000192527 2310 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Mdc1Q5PSV9 Meioc-201ENSMUST00000100378 4573 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Mdc1Q5PSV9 Fam13c-202ENSMUST00000105436 3380 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Mdc1Q5PSV9 Zbtb5-202ENSMUST00000107817 3867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Mdc1Q5PSV9 Egfl6-201ENSMUST00000000412 2704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Mdc1Q5PSV9 Papss1-201ENSMUST00000029666 2600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Mdc1Q5PSV9 Asz1-201ENSMUST00000010940 1736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Mdc1Q5PSV9 Paip2b-201ENSMUST00000058383 3982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Mdc1Q5PSV9 Otop1-201ENSMUST00000063136 3106 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Mdc1Q5PSV9 Immt-202ENSMUST00000101301 2299 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Mdc1Q5PSV9 Clec10a-201ENSMUST00000000327 1454 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Mdc1Q5PSV9 Fig4-201ENSMUST00000043814 3282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Mdc1Q5PSV9 Uvrag-201ENSMUST00000037968 5157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Mdc1Q5PSV9 Psap-203ENSMUST00000165878 2564 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Mdc1Q5PSV9 Slc4a5-201ENSMUST00000039212 5123 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Mdc1Q5PSV9 Gm25053-201ENSMUST00000103982 133 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
Mdc1Q5PSV9 Gm25922-201ENSMUST00000104281 130 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
Mdc1Q5PSV9 Gm24679-201ENSMUST00000158762 111 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
Mdc1Q5PSV9 Fxyd5-209ENSMUST00000162087 762 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Mdc1Q5PSV9 Gm28345-201ENSMUST00000188769 1139 ntTSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Mdc1Q5PSV9 Gm28970-201ENSMUST00000191098 1139 ntTSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Mdc1Q5PSV9 Gm25053-202ENSMUST00000199731 132 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
Mdc1Q5PSV9 Gm8436-201ENSMUST00000210152 1080 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
Mdc1Q5PSV9 Gm5749-201ENSMUST00000210673 1090 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
Mdc1Q5PSV9 Gm45410-201ENSMUST00000211331 1093 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
Mdc1Q5PSV9 Mon1b-201ENSMUST00000035777 4998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Mdc1Q5PSV9 Olfml2a-201ENSMUST00000057279 5579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Mdc1Q5PSV9 Foxd4-201ENSMUST00000058600 2345 ntAPPRIS P1 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Mdc1Q5PSV9 Cog7-203ENSMUST00000205438 3355 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Mdc1Q5PSV9 Zbtb7b-203ENSMUST00000107433 3650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Mdc1Q5PSV9 Gm19680-201ENSMUST00000095050 1513 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
Mdc1Q5PSV9 Ank3-201ENSMUST00000047061 2517 ntTSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Mdc1Q5PSV9 Ehd1-201ENSMUST00000025684 3353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Mdc1Q5PSV9 Traf3ip3-212ENSMUST00000192020 1854 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
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