Protein–RNA interactions for Protein: Q5NCF2

Trappc1, Trafficking protein particle complex subunit 1, mousemouse

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Length 145 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Trappc1Q5NCF2 Traf3-201ENSMUST00000021706 7060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.59□□□□□ -1.04
Trappc1Q5NCF2 Slitrk1-201ENSMUST00000100322 5359 ntAPPRIS P1 BASIC8.58□□□□□ -1.04
Trappc1Q5NCF2 Unc5cl-201ENSMUST00000074574 2838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.58□□□□□ -1.04
Trappc1Q5NCF2 Gm28590-201ENSMUST00000185679 1609 ntTSL 1 (best) BASIC8.58□□□□□ -1.04
Trappc1Q5NCF2 Abhd14b-209ENSMUST00000216130 1624 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC8.58□□□□□ -1.04
Trappc1Q5NCF2 Cldn14-204ENSMUST00000169391 1456 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC8.58□□□□□ -1.04
Trappc1Q5NCF2 Mef2b-204ENSMUST00000110146 1342 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC8.58□□□□□ -1.04
Trappc1Q5NCF2 Nmral1-203ENSMUST00000115851 1306 ntTSL 1 (best) BASIC8.58□□□□□ -1.04
Trappc1Q5NCF2 Sh2d7-202ENSMUST00000118413 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.58□□□□□ -1.04
Trappc1Q5NCF2 Robo4-203ENSMUST00000115048 3392 ntTSL 1 (best) BASIC8.58□□□□□ -1.04
Trappc1Q5NCF2 Rasgrp4-211ENSMUST00000203380 3077 ntTSL 5 BASIC8.58□□□□□ -1.04
Trappc1Q5NCF2 Cpt1c-201ENSMUST00000063761 2793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.58□□□□□ -1.04
Trappc1Q5NCF2 Alas2-202ENSMUST00000112715 1892 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC8.58□□□□□ -1.04
Trappc1Q5NCF2 Kif1b-203ENSMUST00000060537 10233 ntTSL 1 (best) BASIC8.58□□□□□ -1.04
Trappc1Q5NCF2 1600014C10Rik-201ENSMUST00000067854 3143 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC8.58□□□□□ -1.04
Trappc1Q5NCF2 Dusp16-202ENSMUST00000129433 3993 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC8.58□□□□□ -1.04
Trappc1Q5NCF2 Hmgcll1-202ENSMUST00000117981 1189 ntTSL 5 BASIC8.58□□□□□ -1.04
Trappc1Q5NCF2 Gm12384-201ENSMUST00000119228 919 ntBASIC8.58□□□□□ -1.04
Trappc1Q5NCF2 Gm7862-201ENSMUST00000121461 292 ntBASIC8.58□□□□□ -1.04
Trappc1Q5NCF2 Srrm3os-201ENSMUST00000131896 1271 ntTSL 1 (best) BASIC8.58□□□□□ -1.04
Trappc1Q5NCF2 Gm11201-201ENSMUST00000143473 701 ntTSL 3 BASIC8.58□□□□□ -1.04
Trappc1Q5NCF2 Sstr2-203ENSMUST00000146390 2143 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC8.58□□□□□ -1.04
Trappc1Q5NCF2 Gm14964-202ENSMUST00000149574 716 ntTSL 1 (best) BASIC8.58□□□□□ -1.04
Trappc1Q5NCF2 Rpl18a-ps1-201ENSMUST00000161190 523 ntBASIC8.58□□□□□ -1.04
Trappc1Q5NCF2 Mthfsl-204ENSMUST00000186863 725 ntTSL 2 BASIC8.58□□□□□ -1.04
Trappc1Q5NCF2 Krtcap3-208ENSMUST00000201937 889 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC8.58□□□□□ -1.04
Trappc1Q5NCF2 Bet1l-209ENSMUST00000211624 769 ntTSL 3 BASIC8.58□□□□□ -1.04
Trappc1Q5NCF2 Wdyhv1-204ENSMUST00000226955 1094 ntBASIC8.58□□□□□ -1.04
Trappc1Q5NCF2 4930465K10Rik-201ENSMUST00000056675 1238 ntBASIC8.58□□□□□ -1.04
Trappc1Q5NCF2 Birc5-201ENSMUST00000081387 947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.58□□□□□ -1.04
Trappc1Q5NCF2 Lce3e-201ENSMUST00000098886 607 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC8.58□□□□□ -1.04
Trappc1Q5NCF2 Prkag3-206ENSMUST00000188073 2832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.58□□□□□ -1.04
Trappc1Q5NCF2 Cnga4-202ENSMUST00000210344 1977 ntTSL 1 (best) BASIC8.58□□□□□ -1.04
Trappc1Q5NCF2 Zfp280d-205ENSMUST00000183468 1834 ntTSL 1 (best) BASIC8.58□□□□□ -1.04
Trappc1Q5NCF2 Gm26631-201ENSMUST00000181462 2505 ntTSL 1 (best) BASIC8.58□□□□□ -1.04
Trappc1Q5NCF2 Qars-203ENSMUST00000134939 2374 ntTSL 5 BASIC8.58□□□□□ -1.04
Trappc1Q5NCF2 5730455P16Rik-204ENSMUST00000179332 4536 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC8.58□□□□□ -1.04
Trappc1Q5NCF2 Itgad-201ENSMUST00000033051 3965 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC8.58□□□□□ -1.04
Trappc1Q5NCF2 Ccdc93-202ENSMUST00000112621 2338 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC8.58□□□□□ -1.04
Trappc1Q5NCF2 Slc4a9-201ENSMUST00000074298 2714 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC8.58□□□□□ -1.04
Trappc1Q5NCF2 Rasgef1a-203ENSMUST00000203804 2183 ntTSL 1 (best) BASIC8.58□□□□□ -1.04
Trappc1Q5NCF2 Impa1-202ENSMUST00000118410 2988 ntTSL 1 (best) BASIC8.58□□□□□ -1.04
Trappc1Q5NCF2 Knop1-203ENSMUST00000106549 1467 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC8.57□□□□□ -1.04
Trappc1Q5NCF2 Gm5740-201ENSMUST00000211003 1857 ntBASIC8.57□□□□□ -1.04
Trappc1Q5NCF2 Astn1-201ENSMUST00000046110 7195 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC8.57□□□□□ -1.04
Trappc1Q5NCF2 Smpd4-206ENSMUST00000163997 1722 ntTSL 5 BASIC8.57□□□□□ -1.04
Trappc1Q5NCF2 Adamts4-203ENSMUST00000219033 4386 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC8.57□□□□□ -1.04
Trappc1Q5NCF2 Commd7-202ENSMUST00000109782 1343 ntTSL 1 (best) BASIC8.57□□□□□ -1.04
Trappc1Q5NCF2 Gm6263-201ENSMUST00000120029 1342 ntBASIC8.57□□□□□ -1.04
Trappc1Q5NCF2 Rhbdl1-202ENSMUST00000183929 1349 ntTSL 5 BASIC8.57□□□□□ -1.04
Trappc1Q5NCF2 4933412A08Rik-201ENSMUST00000061046 1343 ntBASIC8.57□□□□□ -1.04
Trappc1Q5NCF2 Ptchd4-201ENSMUST00000048691 6890 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC8.57□□□□□ -1.04
Trappc1Q5NCF2 Lama3-201ENSMUST00000092070 10548 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC8.57□□□□□ -1.04
Trappc1Q5NCF2 Rab3a-203ENSMUST00000110092 1556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.57□□□□□ -1.04
Trappc1Q5NCF2 Specc1l-204ENSMUST00000218766 4725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.57□□□□□ -1.04
Trappc1Q5NCF2 Gpr155-203ENSMUST00000112043 3284 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC8.57□□□□□ -1.04
Trappc1Q5NCF2 AU022252-203ENSMUST00000141112 7151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.57□□□□□ -1.04
Trappc1Q5NCF2 Cnga4-201ENSMUST00000033187 2484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.57□□□□□ -1.04
Trappc1Q5NCF2 2810408A11Rik-202ENSMUST00000100969 1437 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC8.57□□□□□ -1.04
Trappc1Q5NCF2 Fam172a-203ENSMUST00000163257 1436 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC8.57□□□□□ -1.04
Trappc1Q5NCF2 Zfp710-203ENSMUST00000166250 3606 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC8.57□□□□□ -1.04
Trappc1Q5NCF2 D630003M21Rik-202ENSMUST00000103121 4521 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC8.57□□□□□ -1.04
Trappc1Q5NCF2 Gm6714-201ENSMUST00000218677 2330 ntBASIC8.57□□□□□ -1.04
Trappc1Q5NCF2 Phyhd1-212ENSMUST00000154647 1678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.57□□□□□ -1.04
Trappc1Q5NCF2 Lman1l-202ENSMUST00000093832 1685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.57□□□□□ -1.04
Trappc1Q5NCF2 Odf2l-202ENSMUST00000098538 2564 ntTSL 1 (best) BASIC8.57□□□□□ -1.04
Trappc1Q5NCF2 Abcc3-201ENSMUST00000021231 4999 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC8.57□□□□□ -1.04
Trappc1Q5NCF2 Pla2g2e-203ENSMUST00000105804 786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.57□□□□□ -1.04
Trappc1Q5NCF2 Dnajc8-205ENSMUST00000105939 746 ntTSL 5 BASIC8.57□□□□□ -1.04
Trappc1Q5NCF2 Gm15427-201ENSMUST00000117288 531 ntBASIC8.57□□□□□ -1.04
Trappc1Q5NCF2 Gm15240-201ENSMUST00000118156 720 ntBASIC8.57□□□□□ -1.04
Trappc1Q5NCF2 Gm13015-201ENSMUST00000118674 204 ntBASIC8.57□□□□□ -1.04
Trappc1Q5NCF2 Isg20-202ENSMUST00000118867 697 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC8.57□□□□□ -1.04
Trappc1Q5NCF2 Gm12428-201ENSMUST00000119844 727 ntBASIC8.57□□□□□ -1.04
Trappc1Q5NCF2 Tfg-202ENSMUST00000121554 716 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC8.57□□□□□ -1.04
Trappc1Q5NCF2 Rpl18-ps1-201ENSMUST00000121555 525 ntBASIC8.57□□□□□ -1.04
Trappc1Q5NCF2 2410006H16Rik-201ENSMUST00000131787 462 ntTSL 1 (best) BASIC8.57□□□□□ -1.04
Trappc1Q5NCF2 Csrp3-202ENSMUST00000167786 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.57□□□□□ -1.04
Trappc1Q5NCF2 Gm26620-201ENSMUST00000180542 817 ntAPPRIS P1 BASIC8.57□□□□□ -1.04
Trappc1Q5NCF2 Mir9-3hg-206ENSMUST00000182937 636 ntTSL 3 BASIC8.57□□□□□ -1.04
Trappc1Q5NCF2 Samd13-205ENSMUST00000197989 591 ntTSL 5 BASIC8.57□□□□□ -1.04
Trappc1Q5NCF2 Fmc1-201ENSMUST00000019833 479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.57□□□□□ -1.04
Trappc1Q5NCF2 Fuz-206ENSMUST00000207485 1140 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC8.57□□□□□ -1.04
Trappc1Q5NCF2 Gm45572-201ENSMUST00000211774 750 ntTSL 5 BASIC8.57□□□□□ -1.04
Trappc1Q5NCF2 Pts-206ENSMUST00000214873 511 ntTSL 5 BASIC8.57□□□□□ -1.04
Trappc1Q5NCF2 Prr13-201ENSMUST00000023810 1224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.57□□□□□ -1.04
Trappc1Q5NCF2 Pfdn6-201ENSMUST00000025163 807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.57□□□□□ -1.04
Trappc1Q5NCF2 Il17b-201ENSMUST00000025471 692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.57□□□□□ -1.04
Trappc1Q5NCF2 Inmt-201ENSMUST00000003569 1077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.57□□□□□ -1.04
Trappc1Q5NCF2 Isg20-201ENSMUST00000038142 1083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.57□□□□□ -1.04
Trappc1Q5NCF2 Olfr370-201ENSMUST00000058609 1096 ntAPPRIS P1 BASIC8.57□□□□□ -1.04
Trappc1Q5NCF2 Olfr541-201ENSMUST00000080681 1103 ntAPPRIS P1 BASIC8.57□□□□□ -1.04
Trappc1Q5NCF2 Capn3-204ENSMUST00000110716 2752 ntTSL 5 BASIC8.57□□□□□ -1.04
Trappc1Q5NCF2 Tyw1-201ENSMUST00000040213 3044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.57□□□□□ -1.04
Trappc1Q5NCF2 Sebox-201ENSMUST00000001130 1351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.57□□□□□ -1.04
Trappc1Q5NCF2 Ikbkg-204ENSMUST00000114128 1867 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC8.57□□□□□ -1.04
Trappc1Q5NCF2 Arhgap33os-201ENSMUST00000124276 2648 ntTSL 2 BASIC8.57□□□□□ -1.04
Trappc1Q5NCF2 Cct5-201ENSMUST00000022842 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.57□□□□□ -1.04
Trappc1Q5NCF2 Dusp19-201ENSMUST00000028384 1632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.57□□□□□ -1.04
Trappc1Q5NCF2 8030423F21Rik-201ENSMUST00000064097 2851 ntTSL 1 (best) BASIC8.57□□□□□ -1.04
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