Protein–RNA interactions for Protein: Q3UJD6

Usp19, Ubiquitin carboxyl-terminal hydrolase 19, mousemouse

Predictions only

Length 1,360 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Usp19Q3UJD6 Inca1-202ENSMUST00000108541 1150 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Usp19Q3UJD6 Gm13888-201ENSMUST00000119148 422 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
Usp19Q3UJD6 Inca1-205ENSMUST00000126114 1189 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Usp19Q3UJD6 0610033M10Rik-201ENSMUST00000204546 506 ntTSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Usp19Q3UJD6 Gm21057-202ENSMUST00000206111 512 ntTSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Usp19Q3UJD6 Fabp6-201ENSMUST00000020672 479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Usp19Q3UJD6 Gm45113-201ENSMUST00000207518 165 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
Usp19Q3UJD6 Immp1l-201ENSMUST00000037499 955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Usp19Q3UJD6 Inca1-201ENSMUST00000073625 1218 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Usp19Q3UJD6 Slc22a4-201ENSMUST00000020586 2263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Usp19Q3UJD6 Zfp12-203ENSMUST00000077485 4294 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Usp19Q3UJD6 Dars2-201ENSMUST00000035430 3619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Usp19Q3UJD6 Paqr9-201ENSMUST00000079597 8367 ntAPPRIS P1 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Usp19Q3UJD6 Gm15082-201ENSMUST00000147045 1960 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Usp19Q3UJD6 Gorasp1-201ENSMUST00000035099 3906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Usp19Q3UJD6 Lmnb2-204ENSMUST00000179022 3370 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Usp19Q3UJD6 Tor3a-201ENSMUST00000079625 3285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Usp19Q3UJD6 Olfr1349-204ENSMUST00000207820 1325 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Usp19Q3UJD6 Arid4b-201ENSMUST00000039538 5844 ntTSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Usp19Q3UJD6 0610038B21Rik-201ENSMUST00000181420 1687 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Usp19Q3UJD6 1700030J22Rik-201ENSMUST00000070577 2976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Usp19Q3UJD6 Gm20658-201ENSMUST00000175871 1489 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Usp19Q3UJD6 Brd3-210ENSMUST00000164296 2791 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Usp19Q3UJD6 Armcx1-205ENSMUST00000113199 2413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Usp19Q3UJD6 Sgo2a-201ENSMUST00000027202 4939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Usp19Q3UJD6 Lrmp-201ENSMUST00000032396 2319 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Usp19Q3UJD6 Prkch-201ENSMUST00000021527 3545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Usp19Q3UJD6 Ufd1-201ENSMUST00000005394 1996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Usp19Q3UJD6 C130050O18Rik-202ENSMUST00000163940 1618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Usp19Q3UJD6 Galnt11-202ENSMUST00000114950 2493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Usp19Q3UJD6 Ttc4-202ENSMUST00000106772 935 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Usp19Q3UJD6 Gm11211-201ENSMUST00000143618 359 ntTSL 3 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Usp19Q3UJD6 Gm11683-201ENSMUST00000147006 918 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Usp19Q3UJD6 F12-202ENSMUST00000170921 478 ntTSL 3 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Usp19Q3UJD6 Gm28375-201ENSMUST00000185304 430 ntTSL 3 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Usp19Q3UJD6 1700081H04Rik-201ENSMUST00000190550 1128 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Usp19Q3UJD6 AC134869.4-202ENSMUST00000224350 837 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
Usp19Q3UJD6 Lcn6-201ENSMUST00000059693 1254 ntTSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Usp19Q3UJD6 Pde4dip-202ENSMUST00000090750 8376 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Usp19Q3UJD6 Cbx7-203ENSMUST00000109616 2899 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Usp19Q3UJD6 Ldhd-201ENSMUST00000070004 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Usp19Q3UJD6 Rab13-202ENSMUST00000107373 1415 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Usp19Q3UJD6 Grm6-201ENSMUST00000000631 4291 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Usp19Q3UJD6 Ctsd-201ENSMUST00000066401 1922 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Usp19Q3UJD6 S1pr3-201ENSMUST00000087978 4463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Usp19Q3UJD6 Gm16364-201ENSMUST00000153722 1313 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Usp19Q3UJD6 Inip-201ENSMUST00000095063 3237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Usp19Q3UJD6 AC164702.1-201ENSMUST00000220135 2212 ntBASIC15.46■□□□□ 0.07
Usp19Q3UJD6 Otop1-202ENSMUST00000114099 3141 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Usp19Q3UJD6 Arntl2-203ENSMUST00000111638 1710 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Usp19Q3UJD6 Npy5r-202ENSMUST00000211920 1715 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Usp19Q3UJD6 Arntl2-201ENSMUST00000080530 1740 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Usp19Q3UJD6 Dis3l-208ENSMUST00000168844 3575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Usp19Q3UJD6 Dcaf4-201ENSMUST00000021645 2008 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Usp19Q3UJD6 Bbs5-202ENSMUST00000112286 1397 ntTSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Usp19Q3UJD6 Nr4a2-202ENSMUST00000112627 2400 ntTSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Usp19Q3UJD6 Fam49a-201ENSMUST00000069005 1771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Usp19Q3UJD6 Usp20-202ENSMUST00000102849 5088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Usp19Q3UJD6 Nrf1-219ENSMUST00000167972 1541 ntTSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Usp19Q3UJD6 Sema6d-208ENSMUST00000103241 6157 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Usp19Q3UJD6 Cc2d1a-202ENSMUST00000117424 3262 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Usp19Q3UJD6 4933412E12Rik-201ENSMUST00000217853 1698 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Usp19Q3UJD6 Urad-201ENSMUST00000100433 766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Usp19Q3UJD6 Cdc42se1-204ENSMUST00000107201 907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Usp19Q3UJD6 5730437C11Rik-201ENSMUST00000155540 242 ntTSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Usp19Q3UJD6 Gm5778-201ENSMUST00000171003 1072 ntBASIC15.46■□□□□ 0.07
Usp19Q3UJD6 Gm27175-201ENSMUST00000183759 606 ntTSL 3 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Usp19Q3UJD6 Dusp13-211ENSMUST00000183943 779 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Usp19Q3UJD6 Gm27223-201ENSMUST00000184653 606 ntTSL 3 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Usp19Q3UJD6 Gm5714-201ENSMUST00000197343 566 ntBASIC15.46■□□□□ 0.07
Usp19Q3UJD6 Gm42682-201ENSMUST00000198349 1265 ntBASIC15.46■□□□□ 0.07
Usp19Q3UJD6 AC159819.2-201ENSMUST00000216151 342 ntBASIC15.46■□□□□ 0.07
Usp19Q3UJD6 Gm6867-201ENSMUST00000219165 425 ntBASIC15.46■□□□□ 0.07
Usp19Q3UJD6 AC127270.1-201ENSMUST00000221441 491 ntTSL 3 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Usp19Q3UJD6 Prg2-201ENSMUST00000028467 838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Usp19Q3UJD6 Rbp2-201ENSMUST00000035029 672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Usp19Q3UJD6 Olfr323-201ENSMUST00000070804 972 ntAPPRIS P1 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Usp19Q3UJD6 Gatb-202ENSMUST00000107672 1820 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
Usp19Q3UJD6 Pax5-203ENSMUST00000107825 1445 ntTSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.06
Usp19Q3UJD6 BC004004-203ENSMUST00000149405 1402 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.06
Usp19Q3UJD6 Atp6v1b1-201ENSMUST00000006431 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
Usp19Q3UJD6 Mpv17l-201ENSMUST00000023360 3087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
Usp19Q3UJD6 Gbp5-201ENSMUST00000090127 3055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
Usp19Q3UJD6 Kmt5b-205ENSMUST00000113972 4159 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.06
Usp19Q3UJD6 Kctd18-210ENSMUST00000164963 2114 ntTSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.06
Usp19Q3UJD6 Eif5-212ENSMUST00000222375 3547 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
Usp19Q3UJD6 Eif5-213ENSMUST00000222388 3543 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
Usp19Q3UJD6 Foxred2-201ENSMUST00000016696 4793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
Usp19Q3UJD6 Tubb4b-ps2-201ENSMUST00000187481 1337 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
Usp19Q3UJD6 Mob1a-202ENSMUST00000055261 4412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Usp19Q3UJD6 Epha8-201ENSMUST00000030420 4713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Usp19Q3UJD6 Dlgap3-203ENSMUST00000106094 4207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Usp19Q3UJD6 Gipc3-201ENSMUST00000045102 3521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Usp19Q3UJD6 Zfp426-202ENSMUST00000115562 3557 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Usp19Q3UJD6 Ccdc154-203ENSMUST00000182621 2402 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Usp19Q3UJD6 Sall4-201ENSMUST00000029061 5073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Usp19Q3UJD6 Trmt61b-202ENSMUST00000137830 2572 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Usp19Q3UJD6 Shroom3-202ENSMUST00000113054 6401 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Usp19Q3UJD6 Ppil6-201ENSMUST00000105507 1068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Usp19Q3UJD6 1700080O16Rik-202ENSMUST00000114866 1232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 69.4 ms