Protein–RNA interactions for Protein: Q3UI66

Ccdc34, Coiled-coil domain-containing protein 34, mousemouse

Predictions only

Length 367 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccdc34Q3UI66 Tollip-204ENSMUST00000151890 1753 ntTSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
Ccdc34Q3UI66 Hbs1l-209ENSMUST00000219915 2733 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
Ccdc34Q3UI66 Tmem92-201ENSMUST00000100554 2043 ntTSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
Ccdc34Q3UI66 Ube2v1-202ENSMUST00000109207 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
Ccdc34Q3UI66 Gpc6-202ENSMUST00000088483 3488 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC12.86□□□□□ -0.35
Ccdc34Q3UI66 Gm10544-202ENSMUST00000181887 1923 ntTSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
Ccdc34Q3UI66 Mirg-202ENSMUST00000181543 1300 ntTSL 5 BASIC12.86□□□□□ -0.35
Ccdc34Q3UI66 Stim1-209ENSMUST00000211457 2183 ntTSL 5 BASIC12.86□□□□□ -0.35
Ccdc34Q3UI66 1700019D03Rik-201ENSMUST00000050567 3641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
Ccdc34Q3UI66 Gtf2h4-207ENSMUST00000160734 1569 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.86□□□□□ -0.35
Ccdc34Q3UI66 Gm15446-201ENSMUST00000112544 2417 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.86□□□□□ -0.35
Ccdc34Q3UI66 Nr2c1-202ENSMUST00000099343 2413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
Ccdc34Q3UI66 Th-201ENSMUST00000000219 1829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
Ccdc34Q3UI66 Tube1-201ENSMUST00000019991 2929 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
Ccdc34Q3UI66 Pphln1-201ENSMUST00000049122 4023 ntTSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
Ccdc34Q3UI66 Psd-201ENSMUST00000041391 3900 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
Ccdc34Q3UI66 Psd-202ENSMUST00000096029 3903 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.85□□□□□ -0.35
Ccdc34Q3UI66 Rnf25-201ENSMUST00000027357 1479 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
Ccdc34Q3UI66 Qrsl1-201ENSMUST00000020012 1981 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
Ccdc34Q3UI66 Pla2g16-202ENSMUST00000136465 3048 ntTSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
Ccdc34Q3UI66 Treh-201ENSMUST00000034609 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
Ccdc34Q3UI66 Nfasc-203ENSMUST00000163770 3903 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.85□□□□□ -0.35
Ccdc34Q3UI66 Uba1-201ENSMUST00000001989 4071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
Ccdc34Q3UI66 Ebf2-203ENSMUST00000176161 5204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
Ccdc34Q3UI66 Gm14435-201ENSMUST00000108995 643 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC12.85□□□□□ -0.35
Ccdc34Q3UI66 Cmss1-201ENSMUST00000114371 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
Ccdc34Q3UI66 Fam219aos-201ENSMUST00000151164 708 ntTSL 2 BASIC12.85□□□□□ -0.35
Ccdc34Q3UI66 Gm8988-201ENSMUST00000155015 1240 ntBASIC12.85□□□□□ -0.35
Ccdc34Q3UI66 Gm26464-201ENSMUST00000157094 305 ntBASIC12.85□□□□□ -0.35
Ccdc34Q3UI66 Gm20753-201ENSMUST00000190105 545 ntTSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
Ccdc34Q3UI66 Dnajb6-210ENSMUST00000196528 1018 ntTSL 5 BASIC12.85□□□□□ -0.35
Ccdc34Q3UI66 Gm43094-201ENSMUST00000196549 921 ntBASIC12.85□□□□□ -0.35
Ccdc34Q3UI66 Gm32877-201ENSMUST00000197419 709 ntTSL 5 BASIC12.85□□□□□ -0.35
Ccdc34Q3UI66 Gm7774-201ENSMUST00000200064 533 ntBASIC12.85□□□□□ -0.35
Ccdc34Q3UI66 Fmnl1-207ENSMUST00000218163 3824 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.85□□□□□ -0.35
Ccdc34Q3UI66 AC139382.1-201ENSMUST00000221402 498 ntBASIC12.85□□□□□ -0.35
Ccdc34Q3UI66 Erp27-201ENSMUST00000032343 1029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
Ccdc34Q3UI66 Olfr765-201ENSMUST00000071559 930 ntAPPRIS P1 BASIC12.85□□□□□ -0.35
Ccdc34Q3UI66 Zfp108-202ENSMUST00000205982 2577 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
Ccdc34Q3UI66 Ttc33-203ENSMUST00000118193 1671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
Ccdc34Q3UI66 Dnmt3l-201ENSMUST00000000746 1676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
Ccdc34Q3UI66 Aqp6-201ENSMUST00000023754 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
Ccdc34Q3UI66 Mtmr12-202ENSMUST00000071993 3351 ntTSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
Ccdc34Q3UI66 Phka2-203ENSMUST00000112377 3947 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
Ccdc34Q3UI66 Tspan31-201ENSMUST00000060991 1556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
Ccdc34Q3UI66 Smpd4-206ENSMUST00000163997 1722 ntTSL 5 BASIC12.85□□□□□ -0.35
Ccdc34Q3UI66 Xpnpep1-211ENSMUST00000183274 2120 ntTSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
Ccdc34Q3UI66 D17H6S53E-201ENSMUST00000061859 2142 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC12.85□□□□□ -0.35
Ccdc34Q3UI66 Pde5a-201ENSMUST00000066728 6939 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
Ccdc34Q3UI66 Zfp629-203ENSMUST00000122066 5850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
Ccdc34Q3UI66 Il27ra-201ENSMUST00000005601 2664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
Ccdc34Q3UI66 Rad17-201ENSMUST00000022136 2839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
Ccdc34Q3UI66 Bcl9l-203ENSMUST00000218183 6771 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC12.84□□□□□ -0.35
Ccdc34Q3UI66 Arhgef7-203ENSMUST00000098938 4628 ntTSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
Ccdc34Q3UI66 Mbnl2-208ENSMUST00000227594 2334 ntAPPRIS P1 BASIC12.84□□□□□ -0.35
Ccdc34Q3UI66 Poc1a-201ENSMUST00000072206 2337 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
Ccdc34Q3UI66 Creld2-201ENSMUST00000024042 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
Ccdc34Q3UI66 Atp9b-201ENSMUST00000091790 5357 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.84□□□□□ -0.35
Ccdc34Q3UI66 Med19-201ENSMUST00000102645 2059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
Ccdc34Q3UI66 Zc3hc1-203ENSMUST00000115184 1504 ntTSL 5 BASIC12.84□□□□□ -0.35
Ccdc34Q3UI66 Hcrtr2-203ENSMUST00000184757 2230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
Ccdc34Q3UI66 Nhsl1-201ENSMUST00000037341 7321 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC12.84□□□□□ -0.35
Ccdc34Q3UI66 Tro-203ENSMUST00000112709 6610 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC12.84□□□□□ -0.35
Ccdc34Q3UI66 Otog-201ENSMUST00000164538 10043 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.84□□□□□ -0.35
Ccdc34Q3UI66 Styxl1-204ENSMUST00000111163 1276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
Ccdc34Q3UI66 Crybb3-203ENSMUST00000118226 892 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC12.84□□□□□ -0.35
Ccdc34Q3UI66 Gm11439-201ENSMUST00000118598 409 ntBASIC12.84□□□□□ -0.35
Ccdc34Q3UI66 Gm16191-201ENSMUST00000141445 520 ntTSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
Ccdc34Q3UI66 Acat3-202ENSMUST00000160378 987 ntTSL 5 BASIC12.84□□□□□ -0.35
Ccdc34Q3UI66 Zdhhc23-202ENSMUST00000165648 1278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
Ccdc34Q3UI66 Skiv2l-ps1-201ENSMUST00000173935 658 ntBASIC12.84□□□□□ -0.35
Ccdc34Q3UI66 Gm29233-201ENSMUST00000190311 281 ntTSL 5 BASIC12.84□□□□□ -0.35
Ccdc34Q3UI66 Snhg8-203ENSMUST00000199645 528 ntTSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
Ccdc34Q3UI66 Gm43416-201ENSMUST00000201916 1015 ntBASIC12.84□□□□□ -0.35
Ccdc34Q3UI66 Plpp4-203ENSMUST00000205896 714 ntTSL 5 BASIC12.84□□□□□ -0.35
Ccdc34Q3UI66 Gm42196-201ENSMUST00000209618 730 ntTSL 5 BASIC12.84□□□□□ -0.35
Ccdc34Q3UI66 AC142191.1-201ENSMUST00000219217 699 ntTSL 5 BASIC12.84□□□□□ -0.35
Ccdc34Q3UI66 Aif1-201ENSMUST00000025257 847 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.84□□□□□ -0.35
Ccdc34Q3UI66 Alkbh7-201ENSMUST00000002737 917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
Ccdc34Q3UI66 Nicn1-201ENSMUST00000035227 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
Ccdc34Q3UI66 Zfp366-201ENSMUST00000056558 6382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
Ccdc34Q3UI66 Crybb3-201ENSMUST00000076069 816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
Ccdc34Q3UI66 Gm11937-201ENSMUST00000076478 396 ntAPPRIS P1 BASIC12.84□□□□□ -0.35
Ccdc34Q3UI66 Lyzl4-201ENSMUST00000077706 996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
Ccdc34Q3UI66 2610318N02Rik-201ENSMUST00000093336 1265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
Ccdc34Q3UI66 Gm6124-201ENSMUST00000188240 2580 ntBASIC12.84□□□□□ -0.35
Ccdc34Q3UI66 Cish-204ENSMUST00000168260 2742 ntTSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
Ccdc34Q3UI66 Ccnk-202ENSMUST00000221167 2789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
Ccdc34Q3UI66 Cep76-201ENSMUST00000097542 3979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
Ccdc34Q3UI66 Cnbp-209ENSMUST00000204890 1614 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
Ccdc34Q3UI66 Fam180a-201ENSMUST00000051176 1606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
Ccdc34Q3UI66 Gm28578-201ENSMUST00000187727 2698 ntTSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
Ccdc34Q3UI66 Itgb2-201ENSMUST00000000299 2970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
Ccdc34Q3UI66 Ngef-202ENSMUST00000068681 3109 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
Ccdc34Q3UI66 Arvcf-203ENSMUST00000115612 4218 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.83□□□□□ -0.35
Ccdc34Q3UI66 Ccdc62-201ENSMUST00000094320 3924 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.83□□□□□ -0.35
Ccdc34Q3UI66 Grap2-201ENSMUST00000043149 3158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.83□□□□□ -0.35
Ccdc34Q3UI66 4732490B19Rik-201ENSMUST00000130373 2446 ntTSL 1 (best) BASIC12.83□□□□□ -0.35
Ccdc34Q3UI66 A430033K04Rik-203ENSMUST00000198958 2264 ntTSL 1 (best) BASIC12.83□□□□□ -0.35
Ccdc34Q3UI66 Ccnb2-201ENSMUST00000034742 1531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.83□□□□□ -0.35
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 55.9 ms