Protein–RNA interactions for Protein: Q3UHX8

Nkx6-3, Homeobox protein Nkx-6.3, mousemouse

Predictions only

Length 262 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Nkx6-3Q3UHX8 Gm12395-201ENSMUST00000144765 536 ntTSL 5 BASIC11.28□□□□□ -0.6
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Nkx6-3Q3UHX8 1110038B12Rik-208ENSMUST00000174714 520 ntTSL 2 BASIC11.28□□□□□ -0.6
Nkx6-3Q3UHX8 Mir3102-201ENSMUST00000175555 104 ntBASIC11.28□□□□□ -0.6
Nkx6-3Q3UHX8 Ighv1-48-201ENSMUST00000191795 294 ntBASIC11.28□□□□□ -0.6
Nkx6-3Q3UHX8 Gm43138-201ENSMUST00000199123 708 ntBASIC11.28□□□□□ -0.6
Nkx6-3Q3UHX8 Gm45781-201ENSMUST00000212860 539 ntTSL 5 BASIC11.28□□□□□ -0.6
Nkx6-3Q3UHX8 Nudt7-201ENSMUST00000066514 935 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.28□□□□□ -0.6
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Nkx6-3Q3UHX8 Pla2g3-202ENSMUST00000064265 2566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.28□□□□□ -0.6
Nkx6-3Q3UHX8 Atp8a2-202ENSMUST00000131670 1725 ntTSL 2 BASIC11.28□□□□□ -0.6
Nkx6-3Q3UHX8 Tfdp1-201ENSMUST00000170909 1700 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.28□□□□□ -0.6
Nkx6-3Q3UHX8 Strada-202ENSMUST00000103072 1517 ntTSL 1 (best) BASIC11.28□□□□□ -0.6
Nkx6-3Q3UHX8 Gtf2i-203ENSMUST00000111261 4381 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.28□□□□□ -0.6
Nkx6-3Q3UHX8 Rev3l-201ENSMUST00000019986 10713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.28□□□□□ -0.6
Nkx6-3Q3UHX8 Qrsl1-201ENSMUST00000020012 1981 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.28□□□□□ -0.6
Nkx6-3Q3UHX8 Vmn1r198-202ENSMUST00000226786 6195 ntAPPRIS P2 BASIC11.28□□□□□ -0.6
Nkx6-3Q3UHX8 Oscar-203ENSMUST00000148012 1796 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.28□□□□□ -0.6
Nkx6-3Q3UHX8 Odf2l-201ENSMUST00000029920 2239 ntTSL 1 (best) BASIC11.28□□□□□ -0.6
Nkx6-3Q3UHX8 Plekhg5-204ENSMUST00000118648 3818 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.28□□□□□ -0.6
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Nkx6-3Q3UHX8 Hsd3b4-201ENSMUST00000179429 1575 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.28□□□□□ -0.6
Nkx6-3Q3UHX8 5033428I22Rik-201ENSMUST00000181638 2040 ntTSL 1 (best) BASIC11.28□□□□□ -0.6
Nkx6-3Q3UHX8 Gm10681-203ENSMUST00000186215 1575 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.28□□□□□ -0.6
Nkx6-3Q3UHX8 Slc2a7-201ENSMUST00000059893 1578 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.28□□□□□ -0.6
Nkx6-3Q3UHX8 Got1l1-201ENSMUST00000038174 1356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.28□□□□□ -0.6
Nkx6-3Q3UHX8 Arhgap1-202ENSMUST00000111329 3201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.28□□□□□ -0.6
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Nkx6-3Q3UHX8 Pde9a-201ENSMUST00000047168 2065 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.28□□□□□ -0.6
Nkx6-3Q3UHX8 Rnf44-218ENSMUST00000177950 3941 ntTSL 1 (best) BASIC11.28□□□□□ -0.6
Nkx6-3Q3UHX8 Dgkz-203ENSMUST00000111303 4169 ntTSL 1 (best) BASIC11.28□□□□□ -0.6
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Nkx6-3Q3UHX8 Cacna1g-208ENSMUST00000107790 8035 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.27□□□□□ -0.6
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Nkx6-3Q3UHX8 0610038B21Rik-201ENSMUST00000181420 1687 ntTSL 1 (best) BASIC11.27□□□□□ -0.6
Nkx6-3Q3UHX8 Cdc7-203ENSMUST00000117196 2864 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.27□□□□□ -0.6
Nkx6-3Q3UHX8 Chrdl1-202ENSMUST00000074660 4096 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.27□□□□□ -0.6
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Nkx6-3Q3UHX8 Inca1-202ENSMUST00000108541 1150 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.27□□□□□ -0.61
Nkx6-3Q3UHX8 Camk1d-202ENSMUST00000114987 1295 ntTSL 1 (best) BASIC11.27□□□□□ -0.61
Nkx6-3Q3UHX8 Inca1-205ENSMUST00000126114 1189 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.27□□□□□ -0.61
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Nkx6-3Q3UHX8 Ank2-203ENSMUST00000182008 2474 ntTSL 1 (best) BASIC11.27□□□□□ -0.61
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Nkx6-3Q3UHX8 Dolpp1-203ENSMUST00000123202 2294 ntTSL 1 (best) BASIC11.26□□□□□ -0.61
Nkx6-3Q3UHX8 Dolpp1-201ENSMUST00000028209 2251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.26□□□□□ -0.61
Nkx6-3Q3UHX8 Rab13-202ENSMUST00000107373 1415 ntTSL 1 (best) BASIC11.26□□□□□ -0.61
Nkx6-3Q3UHX8 Npy5r-203ENSMUST00000212563 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.26□□□□□ -0.61
Nkx6-3Q3UHX8 Zc3h6-202ENSMUST00000110320 4916 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.26□□□□□ -0.61
Nkx6-3Q3UHX8 Ppfia4-205ENSMUST00000189361 5238 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.26□□□□□ -0.61
Nkx6-3Q3UHX8 Slc29a1-213ENSMUST00000167692 2092 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.26□□□□□ -0.61
Nkx6-3Q3UHX8 Pgr-204ENSMUST00000189181 6889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.26□□□□□ -0.61
Nkx6-3Q3UHX8 Gdap2-201ENSMUST00000029459 3008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.26□□□□□ -0.61
Nkx6-3Q3UHX8 Sdf4-201ENSMUST00000050078 5177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.26□□□□□ -0.61
Nkx6-3Q3UHX8 Osbpl1a-201ENSMUST00000074352 3956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.26□□□□□ -0.61
Nkx6-3Q3UHX8 Klf11-201ENSMUST00000020982 4086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.26□□□□□ -0.61
Nkx6-3Q3UHX8 Sesn3-204ENSMUST00000208222 9125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.26□□□□□ -0.61
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Nkx6-3Q3UHX8 Gm7104-201ENSMUST00000179741 2532 ntBASIC11.26□□□□□ -0.61
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 85 ms