Protein–RNA interactions for Protein: Q3UHC1

Rapgef1, Rap guanine nucleotide exchange factor (GEF) 1, mousemouse

Predictions only

Length 1,224 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rapgef1Q3UHC1 Eno3-206ENSMUST00000170716 1461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Rapgef1Q3UHC1 Pde9a-201ENSMUST00000047168 2065 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Rapgef1Q3UHC1 Gdap2-201ENSMUST00000029459 3008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Rapgef1Q3UHC1 Celf2-205ENSMUST00000114927 1721 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.11□□□□□ -0.31
Rapgef1Q3UHC1 Tor3a-201ENSMUST00000079625 3285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Rapgef1Q3UHC1 Gm6370-201ENSMUST00000110611 1142 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.11□□□□□ -0.31
Rapgef1Q3UHC1 A430060F13Rik-201ENSMUST00000124176 378 ntBASIC13.11□□□□□ -0.31
Rapgef1Q3UHC1 Gm13388-201ENSMUST00000126659 425 ntTSL 3 BASIC13.11□□□□□ -0.31
Rapgef1Q3UHC1 F630206G17Rik-201ENSMUST00000137002 685 ntTSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Rapgef1Q3UHC1 Gm13165-201ENSMUST00000152923 383 ntTSL 5 BASIC13.11□□□□□ -0.31
Rapgef1Q3UHC1 Gm17040-201ENSMUST00000168672 548 ntTSL 3 BASIC13.11□□□□□ -0.31
Rapgef1Q3UHC1 Gm6309-201ENSMUST00000174320 1154 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.11□□□□□ -0.31
Rapgef1Q3UHC1 Ldlrad2-201ENSMUST00000178923 429 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.11□□□□□ -0.31
Rapgef1Q3UHC1 Gm28172-201ENSMUST00000189880 506 ntTSL 3 BASIC13.11□□□□□ -0.31
Rapgef1Q3UHC1 1700031P21Rik-203ENSMUST00000191400 466 ntTSL 3 BASIC13.11□□□□□ -0.31
Rapgef1Q3UHC1 Ip6k2-204ENSMUST00000192307 1191 ntTSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Rapgef1Q3UHC1 Gm37312-201ENSMUST00000195753 685 ntTSL 5 BASIC13.11□□□□□ -0.31
Rapgef1Q3UHC1 Gm44967-201ENSMUST00000207047 631 ntBASIC13.11□□□□□ -0.31
Rapgef1Q3UHC1 Fam168a-210ENSMUST00000216021 968 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.11□□□□□ -0.31
Rapgef1Q3UHC1 Orc5-201ENSMUST00000030872 2103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Rapgef1Q3UHC1 Olfr368-201ENSMUST00000053990 985 ntAPPRIS P1 BASIC13.11□□□□□ -0.31
Rapgef1Q3UHC1 Cryga-201ENSMUST00000061497 625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Rapgef1Q3UHC1 Astl-201ENSMUST00000059839 2377 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Rapgef1Q3UHC1 Dgcr8-201ENSMUST00000009321 4320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Rapgef1Q3UHC1 Pamr1-201ENSMUST00000028612 2864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Rapgef1Q3UHC1 BC048403-201ENSMUST00000065600 3123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Rapgef1Q3UHC1 Tmem92-203ENSMUST00000162809 1437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Rapgef1Q3UHC1 Stpg3-201ENSMUST00000043774 1430 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Rapgef1Q3UHC1 Shbg-201ENSMUST00000005334 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Rapgef1Q3UHC1 Camkk1-201ENSMUST00000092937 3424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Rapgef1Q3UHC1 Wdr59-202ENSMUST00000038193 5083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Rapgef1Q3UHC1 Galc-201ENSMUST00000021390 3832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Rapgef1Q3UHC1 Rims4-201ENSMUST00000044734 4962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Rapgef1Q3UHC1 Tmem215-201ENSMUST00000049655 4733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Rapgef1Q3UHC1 Nfatc2-209ENSMUST00000171689 2742 ntTSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Rapgef1Q3UHC1 Acsf3-201ENSMUST00000015160 2206 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.11□□□□□ -0.31
Rapgef1Q3UHC1 Herpud1-201ENSMUST00000034220 1873 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Rapgef1Q3UHC1 Abca7-201ENSMUST00000043866 6590 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Rapgef1Q3UHC1 Lgr5-206ENSMUST00000172806 2652 ntTSL 5 BASIC13.1□□□□□ -0.31
Rapgef1Q3UHC1 Adipor2-202ENSMUST00000169744 3489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Rapgef1Q3UHC1 Paupar-201ENSMUST00000194826 3482 ntBASIC13.1□□□□□ -0.31
Rapgef1Q3UHC1 Nup210-201ENSMUST00000032179 7037 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Rapgef1Q3UHC1 P2rx7-203ENSMUST00000100737 4936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Rapgef1Q3UHC1 Btbd9-201ENSMUST00000079924 6657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Rapgef1Q3UHC1 Pbrm1-208ENSMUST00000112098 6566 ntTSL 5 BASIC13.1□□□□□ -0.31
Rapgef1Q3UHC1 Tmc4-201ENSMUST00000038743 2310 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Rapgef1Q3UHC1 Shank2-202ENSMUST00000105900 8169 ntTSL 5 BASIC13.1□□□□□ -0.31
Rapgef1Q3UHC1 Mroh7-201ENSMUST00000106770 4346 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.1□□□□□ -0.31
Rapgef1Q3UHC1 Fthl17d-201ENSMUST00000105004 856 ntAPPRIS P1 BASIC13.1□□□□□ -0.31
Rapgef1Q3UHC1 Rhox2c-201ENSMUST00000115190 762 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.1□□□□□ -0.31
Rapgef1Q3UHC1 Gm26361-201ENSMUST00000158868 186 ntBASIC13.1□□□□□ -0.31
Rapgef1Q3UHC1 Hsbp1l1-201ENSMUST00000166219 1251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Rapgef1Q3UHC1 C1qtnf2-203ENSMUST00000173002 1147 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.1□□□□□ -0.31
Rapgef1Q3UHC1 Gm43727-201ENSMUST00000198021 2647 ntBASIC13.1□□□□□ -0.31
Rapgef1Q3UHC1 F11-201ENSMUST00000034064 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Rapgef1Q3UHC1 Irak2-201ENSMUST00000059286 3196 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Rapgef1Q3UHC1 Cib2-201ENSMUST00000041901 1433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Rapgef1Q3UHC1 Prr15l-201ENSMUST00000054311 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Rapgef1Q3UHC1 Actg2-201ENSMUST00000075161 1333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Rapgef1Q3UHC1 Ddx55-202ENSMUST00000111438 2737 ntTSL 2 BASIC13.1□□□□□ -0.31
Rapgef1Q3UHC1 Qrich2-201ENSMUST00000093909 2156 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Rapgef1Q3UHC1 Cdh22-201ENSMUST00000065438 3702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Rapgef1Q3UHC1 Prss43-201ENSMUST00000077549 2327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Rapgef1Q3UHC1 Jak3-203ENSMUST00000110013 4009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Rapgef1Q3UHC1 Jak3-201ENSMUST00000051995 4019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Rapgef1Q3UHC1 Elmod3-204ENSMUST00000141833 2509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Rapgef1Q3UHC1 Tomt-202ENSMUST00000106970 1354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Rapgef1Q3UHC1 Tex10-201ENSMUST00000030030 3102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Rapgef1Q3UHC1 Cbln3-201ENSMUST00000063871 4866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Rapgef1Q3UHC1 Jmjd1c-211ENSMUST00000174408 8377 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.09□□□□□ -0.31
Rapgef1Q3UHC1 Jmjd1c-201ENSMUST00000051446 8382 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC13.09□□□□□ -0.31
Rapgef1Q3UHC1 Igfn1-203ENSMUST00000166193 8989 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Rapgef1Q3UHC1 Adgrl3-214ENSMUST00000120445 5230 ntTSL 5 BASIC13.09□□□□□ -0.31
Rapgef1Q3UHC1 Lipe-201ENSMUST00000003207 3613 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Rapgef1Q3UHC1 Aldoc-202ENSMUST00000102478 1700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Rapgef1Q3UHC1 Gm23912-201ENSMUST00000104687 87 ntBASIC13.09□□□□□ -0.31
Rapgef1Q3UHC1 Rbm3-202ENSMUST00000115615 1183 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Rapgef1Q3UHC1 Rbm3-203ENSMUST00000115616 1225 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Rapgef1Q3UHC1 Gm14832-201ENSMUST00000121289 322 ntBASIC13.09□□□□□ -0.31
Rapgef1Q3UHC1 Gm24845-201ENSMUST00000158034 109 ntBASIC13.09□□□□□ -0.31
Rapgef1Q3UHC1 Gm20498-202ENSMUST00000164386 1043 ntTSL 2 BASIC13.09□□□□□ -0.31
Rapgef1Q3UHC1 Cyp4f40-201ENSMUST00000165061 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Rapgef1Q3UHC1 Ftl1-ps2-201ENSMUST00000169477 549 ntBASIC13.09□□□□□ -0.31
Rapgef1Q3UHC1 Prr3-203ENSMUST00000172429 1878 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Rapgef1Q3UHC1 Bloc1s2-ps-201ENSMUST00000183232 432 ntBASIC13.09□□□□□ -0.31
Rapgef1Q3UHC1 Nipsnap3a-204ENSMUST00000188045 1099 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Rapgef1Q3UHC1 Caly-204ENSMUST00000211283 975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Rapgef1Q3UHC1 Olfr279-203ENSMUST00000216822 5605 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.09□□□□□ -0.31
Rapgef1Q3UHC1 AC167229.2-201ENSMUST00000218902 675 ntTSL 5 BASIC13.09□□□□□ -0.31
Rapgef1Q3UHC1 Gm18626-201ENSMUST00000221512 1409 ntBASIC13.09□□□□□ -0.31
Rapgef1Q3UHC1 AC154222.2-201ENSMUST00000225848 607 ntBASIC13.09□□□□□ -0.31
Rapgef1Q3UHC1 Cmtm6-201ENSMUST00000035007 3383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Rapgef1Q3UHC1 A530016L24Rik-201ENSMUST00000057465 2636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Rapgef1Q3UHC1 Olfr1413-201ENSMUST00000074859 1082 ntAPPRIS P1 BASIC13.09□□□□□ -0.31
Rapgef1Q3UHC1 Rpl30-201ENSMUST00000009039 570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Rapgef1Q3UHC1 Sgpp2-201ENSMUST00000036172 4002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Rapgef1Q3UHC1 Tiam1-214ENSMUST00000164263 3569 ntTSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Rapgef1Q3UHC1 Arvcf-204ENSMUST00000115613 4800 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.09□□□□□ -0.31
Rapgef1Q3UHC1 Traf7-201ENSMUST00000070777 2384 ntTSL 5 BASIC13.09□□□□□ -0.31
Rapgef1Q3UHC1 H2-T22-203ENSMUST00000080015 1761 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
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