Protein–RNA interactions for Protein: Q3UDK1

Trafd1, TRAF-type zinc finger domain-containing protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 580 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Trafd1Q3UDK1 Nol4-204ENSMUST00000097651 4549 ntTSL 1 (best) BASIC11.93□□□□□ -0.5
Trafd1Q3UDK1 Inca1-203ENSMUST00000108542 1080 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.93□□□□□ -0.5
Trafd1Q3UDK1 Gm6023-201ENSMUST00000118217 606 ntBASIC11.93□□□□□ -0.5
Trafd1Q3UDK1 Mdk-ps1-201ENSMUST00000119782 321 ntBASIC11.93□□□□□ -0.5
Trafd1Q3UDK1 4930515B02Rik-201ENSMUST00000140588 591 ntTSL 1 (best) BASIC11.93□□□□□ -0.5
Trafd1Q3UDK1 Gm11379-201ENSMUST00000154678 381 ntTSL 3 BASIC11.93□□□□□ -0.5
Trafd1Q3UDK1 Cdk3-ps-202ENSMUST00000174177 915 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.93□□□□□ -0.5
Trafd1Q3UDK1 Gm5597-201ENSMUST00000182353 1193 ntBASIC11.93□□□□□ -0.5
Trafd1Q3UDK1 Gm2546-201ENSMUST00000182630 991 ntBASIC11.93□□□□□ -0.5
Trafd1Q3UDK1 Gm4691-202ENSMUST00000182989 885 ntTSL 5 BASIC11.93□□□□□ -0.5
Trafd1Q3UDK1 Gm17931-201ENSMUST00000208132 634 ntBASIC11.93□□□□□ -0.5
Trafd1Q3UDK1 Tmem108-206ENSMUST00000215136 724 ntTSL 3 BASIC11.93□□□□□ -0.5
Trafd1Q3UDK1 AC158523.3-201ENSMUST00000220664 864 ntTSL 5 BASIC11.93□□□□□ -0.5
Trafd1Q3UDK1 Tnfrsf4-201ENSMUST00000030952 1030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.93□□□□□ -0.5
Trafd1Q3UDK1 Tmem247-201ENSMUST00000042172 752 ntTSL 1 (best) BASIC11.93□□□□□ -0.5
Trafd1Q3UDK1 4930442H23Rik-201ENSMUST00000056086 1245 ntAPPRIS P1 BASIC11.93□□□□□ -0.5
Trafd1Q3UDK1 Pygo1-201ENSMUST00000038489 7916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.93□□□□□ -0.5
Trafd1Q3UDK1 Gfap-201ENSMUST00000067444 2648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.93□□□□□ -0.5
Trafd1Q3UDK1 Lrfn5-201ENSMUST00000055815 4410 ntTSL 1 (best) BASIC11.93□□□□□ -0.5
Trafd1Q3UDK1 Siglech-206ENSMUST00000171077 1934 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC11.93□□□□□ -0.5
Trafd1Q3UDK1 Eng-202ENSMUST00000113272 3021 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.93□□□□□ -0.5
Trafd1Q3UDK1 Zmynd8-203ENSMUST00000099084 5232 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.93□□□□□ -0.5
Trafd1Q3UDK1 Gm16083-201ENSMUST00000125681 2547 ntTSL 1 (best) BASIC11.93□□□□□ -0.5
Trafd1Q3UDK1 Grpel2-201ENSMUST00000062991 4030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.93□□□□□ -0.5
Trafd1Q3UDK1 Zfp280d-205ENSMUST00000183468 1834 ntTSL 1 (best) BASIC11.93□□□□□ -0.5
Trafd1Q3UDK1 Pcdh15-238ENSMUST00000193739 5034 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.93□□□□□ -0.5
Trafd1Q3UDK1 Gucy1a3-204ENSMUST00000193924 4710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.92□□□□□ -0.5
Trafd1Q3UDK1 Borcs7-201ENSMUST00000074912 2176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.92□□□□□ -0.5
Trafd1Q3UDK1 Hbs1l-201ENSMUST00000020153 2793 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.92□□□□□ -0.5
Trafd1Q3UDK1 Adgre5-208ENSMUST00000166939 2980 ntTSL 1 (best) BASIC11.92□□□□□ -0.5
Trafd1Q3UDK1 Adgre5-201ENSMUST00000002964 2986 ntTSL 1 (best) BASIC11.92□□□□□ -0.5
Trafd1Q3UDK1 2210406O10Rik-202ENSMUST00000122882 1743 ntTSL 1 (best) BASIC11.92□□□□□ -0.5
Trafd1Q3UDK1 Fggy-201ENSMUST00000043335 1910 ntTSL 1 (best) BASIC11.92□□□□□ -0.5
Trafd1Q3UDK1 Haus6-201ENSMUST00000070607 6158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.92□□□□□ -0.5
Trafd1Q3UDK1 Vps25-204ENSMUST00000107280 876 ntTSL 2 BASIC11.92□□□□□ -0.5
Trafd1Q3UDK1 Gm15808-201ENSMUST00000119046 604 ntBASIC11.92□□□□□ -0.5
Trafd1Q3UDK1 Gm13297-201ENSMUST00000120205 934 ntBASIC11.92□□□□□ -0.5
Trafd1Q3UDK1 Gm14832-201ENSMUST00000121289 322 ntBASIC11.92□□□□□ -0.5
Trafd1Q3UDK1 Mia-202ENSMUST00000121848 572 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.92□□□□□ -0.5
Trafd1Q3UDK1 Serf1-203ENSMUST00000132053 516 ntTSL 1 (best) BASIC11.92□□□□□ -0.5
Trafd1Q3UDK1 D230022J07Rik-201ENSMUST00000144735 1062 ntTSL 1 (best) BASIC11.92□□□□□ -0.5
Trafd1Q3UDK1 Gm13832-202ENSMUST00000151159 370 ntTSL 3 BASIC11.92□□□□□ -0.5
Trafd1Q3UDK1 Gm2991-201ENSMUST00000173338 480 ntBASIC11.92□□□□□ -0.5
Trafd1Q3UDK1 AC132384.14-201ENSMUST00000219346 1147 ntBASIC11.92□□□□□ -0.5
Trafd1Q3UDK1 1700011B04Rik-203ENSMUST00000220654 1033 ntTSL 5 BASIC11.92□□□□□ -0.5
Trafd1Q3UDK1 1700011B04Rik-209ENSMUST00000221760 779 ntTSL 5 BASIC11.92□□□□□ -0.5
Trafd1Q3UDK1 4930447K03Rik-201ENSMUST00000222745 1033 ntTSL 1 (best) BASIC11.92□□□□□ -0.5
Trafd1Q3UDK1 Asb8-201ENSMUST00000059112 1049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.92□□□□□ -0.5
Trafd1Q3UDK1 Cryge-201ENSMUST00000087359 631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.92□□□□□ -0.5
Trafd1Q3UDK1 Pjvk-201ENSMUST00000099986 1219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.92□□□□□ -0.5
Trafd1Q3UDK1 Myo9b-202ENSMUST00000168839 7102 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.92□□□□□ -0.5
Trafd1Q3UDK1 Col18a1-203ENSMUST00000105409 4791 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.92□□□□□ -0.5
Trafd1Q3UDK1 Serinc4-202ENSMUST00000110613 2240 ntTSL 1 (best) BASIC11.92□□□□□ -0.5
Trafd1Q3UDK1 Slc35e2-202ENSMUST00000105608 6291 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.92□□□□□ -0.5
Trafd1Q3UDK1 Gdap2-202ENSMUST00000106997 2014 ntTSL 2 BASIC11.92□□□□□ -0.5
Trafd1Q3UDK1 Ube2v1-202ENSMUST00000109207 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.92□□□□□ -0.5
Trafd1Q3UDK1 Ebf2-202ENSMUST00000176029 2784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.92□□□□□ -0.5
Trafd1Q3UDK1 Ckmt1-201ENSMUST00000000317 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.92□□□□□ -0.5
Trafd1Q3UDK1 Atp9a-201ENSMUST00000029060 3529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.92□□□□□ -0.5
Trafd1Q3UDK1 Pros1-201ENSMUST00000023629 3303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.92□□□□□ -0.5
Trafd1Q3UDK1 Rims2-202ENSMUST00000082054 4800 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC11.92□□□□□ -0.5
Trafd1Q3UDK1 Ptprr-204ENSMUST00000128399 2173 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.92□□□□□ -0.5
Trafd1Q3UDK1 Slc39a6-201ENSMUST00000070726 3882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.92□□□□□ -0.5
Trafd1Q3UDK1 3110062M04Rik-201ENSMUST00000055097 3681 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.92□□□□□ -0.5
Trafd1Q3UDK1 Bahcc1-202ENSMUST00000118987 10712 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.92□□□□□ -0.5
Trafd1Q3UDK1 Aldh3a2-202ENSMUST00000074127 3091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.92□□□□□ -0.5
Trafd1Q3UDK1 Ifnar1-201ENSMUST00000023689 3909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.92□□□□□ -0.5
Trafd1Q3UDK1 Mindy1-202ENSMUST00000107187 2827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.92□□□□□ -0.5
Trafd1Q3UDK1 Mindy1-201ENSMUST00000039537 2800 ntTSL 1 (best) BASIC11.92□□□□□ -0.5
Trafd1Q3UDK1 Prkag2-202ENSMUST00000076306 2838 ntTSL 1 (best) BASIC11.92□□□□□ -0.5
Trafd1Q3UDK1 Gm26872-201ENSMUST00000180862 2261 ntTSL 1 (best) BASIC11.91□□□□□ -0.5
Trafd1Q3UDK1 Samd11-201ENSMUST00000179919 2610 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.91□□□□□ -0.5
Trafd1Q3UDK1 Lynx1-201ENSMUST00000023259 4023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.91□□□□□ -0.5
Trafd1Q3UDK1 Tunar-201ENSMUST00000180458 3282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.91□□□□□ -0.5
Trafd1Q3UDK1 Amz2-203ENSMUST00000103061 1832 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.91□□□□□ -0.5
Trafd1Q3UDK1 Kcnq3-201ENSMUST00000070256 11824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.91□□□□□ -0.5
Trafd1Q3UDK1 Mapk8ip3-202ENSMUST00000115228 5424 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.91□□□□□ -0.5
Trafd1Q3UDK1 Plxna4os1-201ENSMUST00000150314 1977 ntTSL 1 (best) BASIC11.91□□□□□ -0.5
Trafd1Q3UDK1 Gpld1-201ENSMUST00000021773 5224 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.91□□□□□ -0.5
Trafd1Q3UDK1 Adamts10-201ENSMUST00000087623 4043 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.91□□□□□ -0.5
Trafd1Q3UDK1 Frmd8-201ENSMUST00000025728 4504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.91□□□□□ -0.5
Trafd1Q3UDK1 Trav4d-3-201ENSMUST00000103592 331 ntAPPRIS P1 BASIC11.91□□□□□ -0.5
Trafd1Q3UDK1 Trav4d-4-201ENSMUST00000103600 354 ntAPPRIS P1 BASIC11.91□□□□□ -0.5
Trafd1Q3UDK1 Trav4n-3-201ENSMUST00000103618 331 ntAPPRIS P1 BASIC11.91□□□□□ -0.5
Trafd1Q3UDK1 Trav4n-4-201ENSMUST00000103627 354 ntAPPRIS P1 BASIC11.91□□□□□ -0.5
Trafd1Q3UDK1 Trav4-3-201ENSMUST00000103655 411 ntAPPRIS P1 BASIC11.91□□□□□ -0.5
Trafd1Q3UDK1 Trav4-4-dv10-201ENSMUST00000103663 361 ntAPPRIS P1 BASIC11.91□□□□□ -0.5
Trafd1Q3UDK1 Pigp-205ENSMUST00000113917 805 ntTSL 1 (best) BASIC11.91□□□□□ -0.5
Trafd1Q3UDK1 Gm14441-201ENSMUST00000121960 540 ntBASIC11.91□□□□□ -0.5
Trafd1Q3UDK1 Gm26083-201ENSMUST00000157904 193 ntBASIC11.91□□□□□ -0.5
Trafd1Q3UDK1 Rps19-ps11-201ENSMUST00000160308 433 ntBASIC11.91□□□□□ -0.5
Trafd1Q3UDK1 Gm7008-202ENSMUST00000170019 402 ntTSL 2 BASIC11.91□□□□□ -0.5
Trafd1Q3UDK1 Mocs2-215ENSMUST00000184335 646 ntTSL 5 BASIC11.91□□□□□ -0.5
Trafd1Q3UDK1 Ccl4-201ENSMUST00000019074 660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.91□□□□□ -0.5
Trafd1Q3UDK1 AC159747.1-201ENSMUST00000219903 265 ntBASIC11.91□□□□□ -0.5
Trafd1Q3UDK1 Gm7046-201ENSMUST00000221351 977 ntBASIC11.91□□□□□ -0.5
Trafd1Q3UDK1 CT485787.1-201ENSMUST00000225617 968 ntBASIC11.91□□□□□ -0.5
Trafd1Q3UDK1 Olfr171-201ENSMUST00000079891 945 ntAPPRIS P2 BASIC11.91□□□□□ -0.5
Trafd1Q3UDK1 4931415C17Rik-202ENSMUST00000131064 2255 ntTSL 1 (best) BASIC11.91□□□□□ -0.5
Trafd1Q3UDK1 Gm18626-201ENSMUST00000221512 1409 ntBASIC11.91□□□□□ -0.5
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 55.4 ms