Protein–RNA interactions for Protein: Q3U9F6

Rnf166, RING finger protein 166, mousemouse

Predictions only

Length 237 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rnf166Q3U9F6 Gm4887-201ENSMUST00000122230 1053 ntBASIC11.29□□□□□ -0.6
Rnf166Q3U9F6 Pigyl-201ENSMUST00000123680 695 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.29□□□□□ -0.6
Rnf166Q3U9F6 Gm15848-202ENSMUST00000125056 832 ntTSL 3 BASIC11.29□□□□□ -0.6
Rnf166Q3U9F6 Gm14617-201ENSMUST00000128053 798 ntTSL 5 BASIC11.29□□□□□ -0.6
Rnf166Q3U9F6 Vmn1r29-201ENSMUST00000168416 1023 ntAPPRIS P1 BASIC11.29□□□□□ -0.6
Rnf166Q3U9F6 Vmn1r170-201ENSMUST00000170166 915 ntAPPRIS P1 BASIC11.29□□□□□ -0.6
Rnf166Q3U9F6 Mir7654-201ENSMUST00000185082 70 ntBASIC11.29□□□□□ -0.6
Rnf166Q3U9F6 Gm21718-202ENSMUST00000186974 817 ntTSL 5 BASIC11.29□□□□□ -0.6
Rnf166Q3U9F6 Gm18183-201ENSMUST00000191024 615 ntBASIC11.29□□□□□ -0.6
Rnf166Q3U9F6 C030018K13Rik-202ENSMUST00000196829 712 ntTSL 3 BASIC11.29□□□□□ -0.6
Rnf166Q3U9F6 Gm42599-201ENSMUST00000201308 469 ntBASIC11.29□□□□□ -0.6
Rnf166Q3U9F6 Gm18452-201ENSMUST00000202968 1111 ntBASIC11.29□□□□□ -0.6
Rnf166Q3U9F6 Gm44988-201ENSMUST00000203835 1161 ntBASIC11.29□□□□□ -0.6
Rnf166Q3U9F6 Ino80e-214ENSMUST00000206349 883 ntTSL 2 BASIC11.29□□□□□ -0.6
Rnf166Q3U9F6 Gm18268-201ENSMUST00000208445 943 ntBASIC11.29□□□□□ -0.6
Rnf166Q3U9F6 Gm45552-201ENSMUST00000209340 778 ntTSL 3 BASIC11.29□□□□□ -0.6
Rnf166Q3U9F6 Gm31105-201ENSMUST00000211421 687 ntTSL 2 BASIC11.29□□□□□ -0.6
Rnf166Q3U9F6 Olfr864-ps1-201ENSMUST00000212664 930 ntBASIC11.29□□□□□ -0.6
Rnf166Q3U9F6 AC158804.1-201ENSMUST00000219046 541 ntTSL 3 BASIC11.29□□□□□ -0.6
Rnf166Q3U9F6 AC238811.3-201ENSMUST00000225422 709 ntBASIC11.29□□□□□ -0.6
Rnf166Q3U9F6 AC116395.1-201ENSMUST00000225480 1143 ntBASIC11.29□□□□□ -0.6
Rnf166Q3U9F6 Fars2-202ENSMUST00000099582 962 ntTSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
Rnf166Q3U9F6 Tktl2-201ENSMUST00000002025 2021 ntAPPRIS P1 BASIC11.29□□□□□ -0.6
Rnf166Q3U9F6 Slc22a13b-ps-201ENSMUST00000173185 1458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
Rnf166Q3U9F6 Gtf2ird1-202ENSMUST00000074114 3330 ntTSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
Rnf166Q3U9F6 Limd2-201ENSMUST00000045923 2950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
Rnf166Q3U9F6 Gm36970-201ENSMUST00000193688 1859 ntBASIC11.29□□□□□ -0.6
Rnf166Q3U9F6 Gabrg3-201ENSMUST00000068394 1724 ntTSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
Rnf166Q3U9F6 Gm13722-201ENSMUST00000117964 3066 ntBASIC11.29□□□□□ -0.6
Rnf166Q3U9F6 Zfp365-201ENSMUST00000064656 4259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
Rnf166Q3U9F6 Ascc3-201ENSMUST00000035606 7760 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.29□□□□□ -0.6
Rnf166Q3U9F6 Sp7-201ENSMUST00000078508 2906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
Rnf166Q3U9F6 Mapt-201ENSMUST00000100347 1362 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.28□□□□□ -0.6
Rnf166Q3U9F6 AC101945.2-201ENSMUST00000227886 1377 ntBASIC11.28□□□□□ -0.6
Rnf166Q3U9F6 Atp2a3-203ENSMUST00000108485 4520 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.28□□□□□ -0.6
Rnf166Q3U9F6 Atp2a3-204ENSMUST00000108486 4540 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.28□□□□□ -0.6
Rnf166Q3U9F6 Mageb18-201ENSMUST00000088137 1571 ntAPPRIS P1 BASIC11.28□□□□□ -0.6
Rnf166Q3U9F6 Cerk-203ENSMUST00000156546 2162 ntTSL 1 (best) BASIC11.28□□□□□ -0.6
Rnf166Q3U9F6 Adora1-201ENSMUST00000038191 3625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.28□□□□□ -0.6
Rnf166Q3U9F6 Capn3-201ENSMUST00000028748 2606 ntTSL 1 (best) BASIC11.28□□□□□ -0.6
Rnf166Q3U9F6 Kcne2-202ENSMUST00000113971 1632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.28□□□□□ -0.6
Rnf166Q3U9F6 4933404K08Rik-201ENSMUST00000156977 1434 ntTSL 1 (best) BASIC11.28□□□□□ -0.6
Rnf166Q3U9F6 Ntng1-208ENSMUST00000133268 5587 ntTSL 1 (best) BASIC11.28□□□□□ -0.6
Rnf166Q3U9F6 Igsf23-204ENSMUST00000208974 1850 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.28□□□□□ -0.6
Rnf166Q3U9F6 Anxa8-201ENSMUST00000022519 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.28□□□□□ -0.6
Rnf166Q3U9F6 F3-201ENSMUST00000029771 1872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.28□□□□□ -0.6
Rnf166Q3U9F6 Scyl2-201ENSMUST00000092227 3566 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.28□□□□□ -0.6
Rnf166Q3U9F6 Spaca3-202ENSMUST00000103223 947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.28□□□□□ -0.6
Rnf166Q3U9F6 Gm22543-201ENSMUST00000104347 94 ntBASIC11.28□□□□□ -0.6
Rnf166Q3U9F6 Trappc6a-202ENSMUST00000108455 651 ntTSL 1 (best) BASIC11.28□□□□□ -0.6
Rnf166Q3U9F6 Kat6b-203ENSMUST00000112458 997 ntTSL 5 BASIC11.28□□□□□ -0.6
Rnf166Q3U9F6 Cabp5-202ENSMUST00000117400 1258 ntTSL 1 (best) BASIC11.28□□□□□ -0.6
Rnf166Q3U9F6 Gm16149-201ENSMUST00000117631 309 ntBASIC11.28□□□□□ -0.6
Rnf166Q3U9F6 Gm15616-201ENSMUST00000118662 375 ntBASIC11.28□□□□□ -0.6
Rnf166Q3U9F6 Gm15238-201ENSMUST00000119938 1296 ntBASIC11.28□□□□□ -0.6
Rnf166Q3U9F6 Nectin3-204ENSMUST00000119941 529 ntTSL 3 BASIC11.28□□□□□ -0.6
Rnf166Q3U9F6 Klra17-202ENSMUST00000122219 1167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.28□□□□□ -0.6
Rnf166Q3U9F6 Rabepk-207ENSMUST00000145903 2968 ntTSL 1 (best) BASIC11.28□□□□□ -0.6
Rnf166Q3U9F6 Gm20537-202ENSMUST00000173131 889 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC11.28□□□□□ -0.6
Rnf166Q3U9F6 Smlr1-201ENSMUST00000179685 669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.28□□□□□ -0.6
Rnf166Q3U9F6 Gm27042-201ENSMUST00000181109 1097 ntTSL 1 (best) BASIC11.28□□□□□ -0.6
Rnf166Q3U9F6 2700099C18Rik-203ENSMUST00000182475 969 ntTSL 1 (best) BASIC11.28□□□□□ -0.6
Rnf166Q3U9F6 A330069K06Rik-201ENSMUST00000194077 917 ntTSL 1 (best) BASIC11.28□□□□□ -0.6
Rnf166Q3U9F6 Trmt112-ps1-201ENSMUST00000202320 375 ntBASIC11.28□□□□□ -0.6
Rnf166Q3U9F6 Gm44654-201ENSMUST00000208052 329 ntBASIC11.28□□□□□ -0.6
Rnf166Q3U9F6 Tdrp-206ENSMUST00000210414 323 ntTSL 3 BASIC11.28□□□□□ -0.6
Rnf166Q3U9F6 Aprt-209ENSMUST00000213062 560 ntTSL 2 BASIC11.28□□□□□ -0.6
Rnf166Q3U9F6 AC166051.1-201ENSMUST00000214313 210 ntBASIC11.28□□□□□ -0.6
Rnf166Q3U9F6 AC155927.1-201ENSMUST00000220114 1200 ntTSL 5 BASIC11.28□□□□□ -0.6
Rnf166Q3U9F6 Gm7557-201ENSMUST00000221935 865 ntBASIC11.28□□□□□ -0.6
Rnf166Q3U9F6 AC121542.1-201ENSMUST00000227245 721 ntBASIC11.28□□□□□ -0.6
Rnf166Q3U9F6 Dapl1-201ENSMUST00000028369 573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.28□□□□□ -0.6
Rnf166Q3U9F6 Pdcd10-201ENSMUST00000029424 907 ntTSL 5 BASIC11.28□□□□□ -0.6
Rnf166Q3U9F6 Mgat4d-201ENSMUST00000038692 1293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.28□□□□□ -0.6
Rnf166Q3U9F6 Tmco5b-201ENSMUST00000040856 1237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.28□□□□□ -0.6
Rnf166Q3U9F6 Skint2-201ENSMUST00000058791 1094 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.28□□□□□ -0.6
Rnf166Q3U9F6 Xlr4a-201ENSMUST00000078775 1162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.28□□□□□ -0.6
Rnf166Q3U9F6 Gm37995-201ENSMUST00000194958 1714 ntBASIC11.28□□□□□ -0.6
Rnf166Q3U9F6 Kir3dl1-202ENSMUST00000113105 1544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.28□□□□□ -0.6
Rnf166Q3U9F6 Nup62cl-201ENSMUST00000101212 1996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.28□□□□□ -0.6
Rnf166Q3U9F6 Gm26531-201ENSMUST00000181727 1967 ntTSL 1 (best) BASIC11.28□□□□□ -0.6
Rnf166Q3U9F6 E230029C05Rik-205ENSMUST00000208362 2444 ntTSL 2 BASIC11.28□□□□□ -0.6
Rnf166Q3U9F6 Arid5a-208ENSMUST00000137906 5504 ntTSL 1 (best) BASIC11.28□□□□□ -0.6
Rnf166Q3U9F6 Zbtb39-201ENSMUST00000054287 5960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.28□□□□□ -0.6
Rnf166Q3U9F6 AC164702.1-201ENSMUST00000220135 2212 ntBASIC11.28□□□□□ -0.6
Rnf166Q3U9F6 Wdcp-205ENSMUST00000220215 2202 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.28□□□□□ -0.6
Rnf166Q3U9F6 Kalrn-210ENSMUST00000114964 2693 ntTSL 5 BASIC11.28□□□□□ -0.6
Rnf166Q3U9F6 Astn1-202ENSMUST00000170718 2927 ntTSL 1 (best) BASIC11.28□□□□□ -0.6
Rnf166Q3U9F6 Tmem17-201ENSMUST00000059319 1568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.28□□□□□ -0.6
Rnf166Q3U9F6 Cdc73-201ENSMUST00000018337 11586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.28□□□□□ -0.6
Rnf166Q3U9F6 Acsl6-201ENSMUST00000000145 2297 ntTSL 5 BASIC11.28□□□□□ -0.6
Rnf166Q3U9F6 Gm5780-201ENSMUST00000217774 1834 ntBASIC11.28□□□□□ -0.6
Rnf166Q3U9F6 E330011O21Rik-204ENSMUST00000210839 1361 ntTSL 5 BASIC11.28□□□□□ -0.6
Rnf166Q3U9F6 BC055324-202ENSMUST00000097493 3217 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.28□□□□□ -0.6
Rnf166Q3U9F6 Dmxl1-202ENSMUST00000180611 11319 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.28□□□□□ -0.6
Rnf166Q3U9F6 Slc36a1-202ENSMUST00000108867 1611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.27□□□□□ -0.6
Rnf166Q3U9F6 Gm42536-201ENSMUST00000197562 1613 ntBASIC11.27□□□□□ -0.6
Rnf166Q3U9F6 Trpv6-203ENSMUST00000201471 2304 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.27□□□□□ -0.6
Rnf166Q3U9F6 Spred2-202ENSMUST00000093299 4449 ntTSL 5 BASIC11.27□□□□□ -0.6
Rnf166Q3U9F6 Nrxn1-201ENSMUST00000054059 4697 ntTSL 5 BASIC11.27□□□□□ -0.6
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 40.2 ms