Protein–RNA interactions for Protein: Q3U827

Rnf180, E3 ubiquitin-protein ligase RNF180, mousemouse

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Length 592 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rnf180Q3U827 Trib1-201ENSMUST00000067543 4330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
Rnf180Q3U827 Pex3-201ENSMUST00000019945 2129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
Rnf180Q3U827 Alox5-207ENSMUST00000170186 1929 ntTSL 5 BASIC13.9□□□□□ -0.18
Rnf180Q3U827 Gm13561-201ENSMUST00000136879 1826 ntTSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
Rnf180Q3U827 Pax5-205ENSMUST00000107827 1315 ntTSL 5 BASIC13.9□□□□□ -0.19
Rnf180Q3U827 Cd55b-201ENSMUST00000112488 1325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.19
Rnf180Q3U827 Tmem56-204ENSMUST00000135818 1336 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.19
Rnf180Q3U827 Exoc6b-203ENSMUST00000160197 5439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
Rnf180Q3U827 Pygo2-201ENSMUST00000060061 3198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
Rnf180Q3U827 Rasgrp1-207ENSMUST00000178884 5104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
Rnf180Q3U827 Tchp-201ENSMUST00000094441 2882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
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Rnf180Q3U827 Oxr1-206ENSMUST00000170127 4251 ntTSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
Rnf180Q3U827 Sdk1-202ENSMUST00000085774 10352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
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Rnf180Q3U827 Hapln4-201ENSMUST00000007738 3648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
Rnf180Q3U827 Riox2-206ENSMUST00000160571 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
Rnf180Q3U827 Antxr1-205ENSMUST00000205033 3160 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
Rnf180Q3U827 Mks1-201ENSMUST00000038196 2499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
Rnf180Q3U827 Slc16a9-201ENSMUST00000046807 3756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
Rnf180Q3U827 Olfr157-202ENSMUST00000215442 1766 ntAPPRIS P1 BASIC13.88□□□□□ -0.19
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Rnf180Q3U827 Tcf25-201ENSMUST00000057934 2738 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
Rnf180Q3U827 Gm13608-201ENSMUST00000121807 1406 ntBASIC13.88□□□□□ -0.19
Rnf180Q3U827 Rbm47-201ENSMUST00000094756 2973 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
Rnf180Q3U827 St8sia2-201ENSMUST00000026896 5368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
Rnf180Q3U827 Tacr2-201ENSMUST00000020278 2258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
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Rnf180Q3U827 Lhfpl1-201ENSMUST00000040084 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
Rnf180Q3U827 Islr-202ENSMUST00000168864 2076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
Rnf180Q3U827 Cpne1-202ENSMUST00000109607 3441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
Rnf180Q3U827 Hells-201ENSMUST00000025965 5868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
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