Protein–RNA interactions for Protein: Q3U3Q1

Ulk3, Serine/threonine-protein kinase ULK3, mousemouse

Predictions only

Length 472 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ulk3Q3U3Q1 Sox2ot-207ENSMUST00000196987 727 ntTSL 3 BASIC11.58□□□□□ -0.56
Ulk3Q3U3Q1 Gm43133-201ENSMUST00000197472 463 ntBASIC11.58□□□□□ -0.56
Ulk3Q3U3Q1 Gm18062-201ENSMUST00000208020 547 ntBASIC11.58□□□□□ -0.56
Ulk3Q3U3Q1 Gm18055-201ENSMUST00000208254 547 ntBASIC11.58□□□□□ -0.56
Ulk3Q3U3Q1 Galc-201ENSMUST00000021390 3832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.58□□□□□ -0.56
Ulk3Q3U3Q1 Gm29208-205ENSMUST00000214517 1056 ntTSL 5 BASIC11.58□□□□□ -0.56
Ulk3Q3U3Q1 Tmem108-206ENSMUST00000215136 724 ntTSL 3 BASIC11.58□□□□□ -0.56
Ulk3Q3U3Q1 AC166095.1-201ENSMUST00000223731 1241 ntBASIC11.58□□□□□ -0.56
Ulk3Q3U3Q1 CU024892.2-201ENSMUST00000224608 832 ntBASIC11.58□□□□□ -0.56
Ulk3Q3U3Q1 Tnfrsf17-201ENSMUST00000023140 815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.58□□□□□ -0.56
Ulk3Q3U3Q1 Lypd2-201ENSMUST00000023260 513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.58□□□□□ -0.56
Ulk3Q3U3Q1 Lim2-201ENSMUST00000004732 884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.58□□□□□ -0.56
Ulk3Q3U3Q1 Saa3-201ENSMUST00000006956 555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.58□□□□□ -0.56
Ulk3Q3U3Q1 Olfr117-201ENSMUST00000073636 954 ntAPPRIS P1 BASIC11.58□□□□□ -0.56
Ulk3Q3U3Q1 Olfr130-201ENSMUST00000087129 954 ntAPPRIS P1 BASIC11.58□□□□□ -0.56
Ulk3Q3U3Q1 Gpr31b-201ENSMUST00000091648 960 ntAPPRIS P1 BASIC11.58□□□□□ -0.56
Ulk3Q3U3Q1 Ubap1-201ENSMUST00000072866 3456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.58□□□□□ -0.56
Ulk3Q3U3Q1 Pla2g4f-201ENSMUST00000054651 3116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.58□□□□□ -0.56
Ulk3Q3U3Q1 Tcp11l1-202ENSMUST00000111118 5474 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.58□□□□□ -0.56
Ulk3Q3U3Q1 Sema5b-201ENSMUST00000050625 4350 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.58□□□□□ -0.56
Ulk3Q3U3Q1 Eif5-213ENSMUST00000222388 3543 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.58□□□□□ -0.56
Ulk3Q3U3Q1 Mical3-217ENSMUST00000207889 9204 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.58□□□□□ -0.56
Ulk3Q3U3Q1 Myh2-201ENSMUST00000018641 6018 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.58□□□□□ -0.56
Ulk3Q3U3Q1 Il2rb-201ENSMUST00000089398 2692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.58□□□□□ -0.56
Ulk3Q3U3Q1 Gm21986-201ENSMUST00000113671 5560 ntTSL 2 BASIC11.58□□□□□ -0.56
Ulk3Q3U3Q1 Zfp426-202ENSMUST00000115562 3557 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.58□□□□□ -0.56
Ulk3Q3U3Q1 Vmn2r-ps25-201ENSMUST00000202322 2321 ntBASIC11.58□□□□□ -0.56
Ulk3Q3U3Q1 Pdhx-202ENSMUST00000111183 2078 ntTSL 1 (best) BASIC11.58□□□□□ -0.56
Ulk3Q3U3Q1 Gemin2-201ENSMUST00000021379 1588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.58□□□□□ -0.56
Ulk3Q3U3Q1 Styxl1-201ENSMUST00000053906 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.58□□□□□ -0.56
Ulk3Q3U3Q1 Yipf1-201ENSMUST00000075693 1321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.58□□□□□ -0.56
Ulk3Q3U3Q1 Madd-213ENSMUST00000111376 5927 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.58□□□□□ -0.56
Ulk3Q3U3Q1 Madd-206ENSMUST00000099725 5905 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.58□□□□□ -0.56
Ulk3Q3U3Q1 Rragd-202ENSMUST00000084747 4295 ntTSL 5 BASIC11.57□□□□□ -0.56
Ulk3Q3U3Q1 Gm2916-202ENSMUST00000181779 1702 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.57□□□□□ -0.56
Ulk3Q3U3Q1 Sp6-201ENSMUST00000047997 3546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.57□□□□□ -0.56
Ulk3Q3U3Q1 1700030J22Rik-202ENSMUST00000213068 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.57□□□□□ -0.56
Ulk3Q3U3Q1 Rbms2-201ENSMUST00000092033 1481 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.57□□□□□ -0.56
Ulk3Q3U3Q1 Rnf170-201ENSMUST00000014022 3929 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.57□□□□□ -0.56
Ulk3Q3U3Q1 Mtf2-201ENSMUST00000081567 4060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.57□□□□□ -0.56
Ulk3Q3U3Q1 Npas2-201ENSMUST00000056815 4236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.57□□□□□ -0.56
Ulk3Q3U3Q1 Tyk2-201ENSMUST00000001036 4619 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.57□□□□□ -0.56
Ulk3Q3U3Q1 Plpbp-205ENSMUST00000209856 3954 ntTSL 1 (best) BASIC11.57□□□□□ -0.56
Ulk3Q3U3Q1 Nos3-201ENSMUST00000030834 4132 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.57□□□□□ -0.56
Ulk3Q3U3Q1 Fcgbp-203ENSMUST00000138392 7926 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.57□□□□□ -0.56
Ulk3Q3U3Q1 Fcgbp-201ENSMUST00000076648 7928 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.57□□□□□ -0.56
Ulk3Q3U3Q1 L3mbtl2-208ENSMUST00000174229 2578 ntTSL 1 (best) BASIC11.57□□□□□ -0.56
Ulk3Q3U3Q1 Acadl-201ENSMUST00000027153 1916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.57□□□□□ -0.56
Ulk3Q3U3Q1 Gnb1l-202ENSMUST00000090086 3549 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.57□□□□□ -0.56
Ulk3Q3U3Q1 Acad8-201ENSMUST00000060513 2859 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.57□□□□□ -0.56
Ulk3Q3U3Q1 Gm24830-201ENSMUST00000102024 166 ntBASIC11.57□□□□□ -0.56
Ulk3Q3U3Q1 Styxl1-202ENSMUST00000111161 963 ntTSL 1 (best) BASIC11.57□□□□□ -0.56
Ulk3Q3U3Q1 Htr2c-203ENSMUST00000112831 809 ntTSL 3 BASIC11.57□□□□□ -0.56
Ulk3Q3U3Q1 Pin4-201ENSMUST00000113627 489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.57□□□□□ -0.56
Ulk3Q3U3Q1 6330418K02Rik-201ENSMUST00000124298 743 ntTSL 1 (best) BASIC11.57□□□□□ -0.56
Ulk3Q3U3Q1 Serf1-203ENSMUST00000132053 516 ntTSL 1 (best) BASIC11.57□□□□□ -0.56
Ulk3Q3U3Q1 Aamdc-210ENSMUST00000146605 642 ntTSL 3 BASIC11.57□□□□□ -0.56
Ulk3Q3U3Q1 Gm17028-201ENSMUST00000170026 704 ntTSL 3 BASIC11.57□□□□□ -0.56
Ulk3Q3U3Q1 Nat8f7-202ENSMUST00000179613 686 ntAPPRIS P1 BASIC11.57□□□□□ -0.56
Ulk3Q3U3Q1 Mospd4-201ENSMUST00000180618 576 ntBASIC11.57□□□□□ -0.56
Ulk3Q3U3Q1 Hmgcll1-207ENSMUST00000183979 1136 ntTSL 5 BASIC11.57□□□□□ -0.56
Ulk3Q3U3Q1 1500004A13Rik-208ENSMUST00000184958 823 ntTSL 3 BASIC11.57□□□□□ -0.56
Ulk3Q3U3Q1 Rfxank-203ENSMUST00000212320 1121 ntTSL 1 (best) BASIC11.57□□□□□ -0.56
Ulk3Q3U3Q1 AC158605.1-202ENSMUST00000217860 540 ntTSL 2 BASIC11.57□□□□□ -0.56
Ulk3Q3U3Q1 Gm19309-201ENSMUST00000218295 205 ntBASIC11.57□□□□□ -0.56
Ulk3Q3U3Q1 Gm9004-201ENSMUST00000218739 1222 ntBASIC11.57□□□□□ -0.56
Ulk3Q3U3Q1 Rnase2b-201ENSMUST00000075648 759 ntAPPRIS P1 BASIC11.57□□□□□ -0.56
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Ulk3Q3U3Q1 Rnu1b6-201ENSMUST00000083839 166 ntBASIC11.57□□□□□ -0.56
Ulk3Q3U3Q1 Pars2-202ENSMUST00000106781 3046 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.57□□□□□ -0.56
Ulk3Q3U3Q1 Gm26543-201ENSMUST00000180729 2221 ntTSL 1 (best) BASIC11.57□□□□□ -0.56
Ulk3Q3U3Q1 Cldn12-201ENSMUST00000060947 3597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.57□□□□□ -0.56
Ulk3Q3U3Q1 Chit1-202ENSMUST00000159963 1815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.57□□□□□ -0.56
Ulk3Q3U3Q1 AC122840.1-201ENSMUST00000220915 3334 ntBASIC11.57□□□□□ -0.56
Ulk3Q3U3Q1 Ankrd52-201ENSMUST00000014642 6620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.57□□□□□ -0.56
Ulk3Q3U3Q1 Mdh1b-201ENSMUST00000114094 1719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.57□□□□□ -0.56
Ulk3Q3U3Q1 4930488B22Rik-201ENSMUST00000172500 1722 ntTSL 1 (best) BASIC11.57□□□□□ -0.56
Ulk3Q3U3Q1 Gm37849-201ENSMUST00000194722 1881 ntBASIC11.57□□□□□ -0.56
Ulk3Q3U3Q1 Gm4366-201ENSMUST00000201488 1342 ntBASIC11.57□□□□□ -0.56
Ulk3Q3U3Q1 Slc45a4-201ENSMUST00000054266 4664 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.57□□□□□ -0.56
Ulk3Q3U3Q1 Fam126a-203ENSMUST00000115109 2195 ntTSL 5 BASIC11.57□□□□□ -0.56
Ulk3Q3U3Q1 Mrps17-206ENSMUST00000121339 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.57□□□□□ -0.56
Ulk3Q3U3Q1 Hsd3b3-201ENSMUST00000090743 1492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.57□□□□□ -0.56
Ulk3Q3U3Q1 Tcf4-254ENSMUST00000202674 2615 ntTSL 5 BASIC11.56□□□□□ -0.56
Ulk3Q3U3Q1 Lins1-202ENSMUST00000077967 2647 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.56□□□□□ -0.56
Ulk3Q3U3Q1 Mfsd13b-205ENSMUST00000216241 1761 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.56□□□□□ -0.56
Ulk3Q3U3Q1 Nras-201ENSMUST00000029445 4470 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.56□□□□□ -0.56
Ulk3Q3U3Q1 Zfp646-201ENSMUST00000050383 6310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.56□□□□□ -0.56
Ulk3Q3U3Q1 Zfp689-201ENSMUST00000053392 3621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.56□□□□□ -0.56
Ulk3Q3U3Q1 Rcor3-202ENSMUST00000110849 3791 ntTSL 1 (best) BASIC11.56□□□□□ -0.56
Ulk3Q3U3Q1 Arhgef9-206ENSMUST00000113884 3784 ntTSL 5 BASIC11.56□□□□□ -0.56
Ulk3Q3U3Q1 Akt2-201ENSMUST00000051356 2923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.56□□□□□ -0.56
Ulk3Q3U3Q1 Prdm16-203ENSMUST00000097759 8544 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.56□□□□□ -0.56
Ulk3Q3U3Q1 Maip1-201ENSMUST00000027114 3540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.56□□□□□ -0.56
Ulk3Q3U3Q1 Gm17089-201ENSMUST00000171098 1394 ntTSL 1 (best) BASIC11.56□□□□□ -0.56
Ulk3Q3U3Q1 Git2-202ENSMUST00000086564 2984 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.56□□□□□ -0.56
Ulk3Q3U3Q1 Kctd10-202ENSMUST00000102581 3103 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.56□□□□□ -0.56
Ulk3Q3U3Q1 Vwf-201ENSMUST00000100941 1807 ntTSL 5 BASIC11.56□□□□□ -0.56
Ulk3Q3U3Q1 Ccdc151-202ENSMUST00000115336 2103 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.56□□□□□ -0.56
Ulk3Q3U3Q1 Prc1-211ENSMUST00000174199 2128 ntTSL 5 BASIC11.56□□□□□ -0.56
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 135.6 ms