Protein–RNA interactions for Protein: Q3U2K5

Kdm4d, Lysine-specific demethylase 4D, mousemouse

Predictions only

Length 510 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Kdm4dQ3U2K5 Chil1-201ENSMUST00000082060 1687 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.42□□□□□ -0.58
Kdm4dQ3U2K5 Capn3-205ENSMUST00000110719 2778 ntTSL 5 BASIC11.42□□□□□ -0.58
Kdm4dQ3U2K5 2310035C23Rik-210ENSMUST00000190501 3852 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.42□□□□□ -0.58
Kdm4dQ3U2K5 BC030867-201ENSMUST00000100392 2547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.42□□□□□ -0.58
Kdm4dQ3U2K5 Dgkb-205ENSMUST00000221176 1439 ntTSL 1 (best) BASIC11.42□□□□□ -0.58
Kdm4dQ3U2K5 Mxd1-201ENSMUST00000001184 4666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.42□□□□□ -0.58
Kdm4dQ3U2K5 Cyp2d34-201ENSMUST00000109515 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.42□□□□□ -0.58
Kdm4dQ3U2K5 Efna1-202ENSMUST00000118587 1632 ntTSL 1 (best) BASIC11.42□□□□□ -0.58
Kdm4dQ3U2K5 Plxnb2-202ENSMUST00000109331 6377 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.42□□□□□ -0.58
Kdm4dQ3U2K5 Wfs1-201ENSMUST00000043964 3787 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.42□□□□□ -0.58
Kdm4dQ3U2K5 Plekhg2-203ENSMUST00000121085 4649 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.42□□□□□ -0.58
Kdm4dQ3U2K5 Qrich1-201ENSMUST00000006851 3331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.42□□□□□ -0.58
Kdm4dQ3U2K5 Psap-204ENSMUST00000177779 2657 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.42□□□□□ -0.58
Kdm4dQ3U2K5 Psap-205ENSMUST00000179238 2657 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC11.42□□□□□ -0.58
Kdm4dQ3U2K5 Sf1-208ENSMUST00000131252 4353 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.42□□□□□ -0.58
Kdm4dQ3U2K5 Accs-201ENSMUST00000041593 2036 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.42□□□□□ -0.58
Kdm4dQ3U2K5 Sowahb-201ENSMUST00000061328 3900 ntAPPRIS P1 BASIC11.41□□□□□ -0.58
Kdm4dQ3U2K5 Gm38569-201ENSMUST00000205476 2228 ntTSL 1 (best) BASIC11.41□□□□□ -0.58
Kdm4dQ3U2K5 Phkg2-201ENSMUST00000033086 1570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.41□□□□□ -0.58
Kdm4dQ3U2K5 Bcl11a-202ENSMUST00000109514 5989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.41□□□□□ -0.58
Kdm4dQ3U2K5 Dram1-201ENSMUST00000020249 2807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.41□□□□□ -0.58
Kdm4dQ3U2K5 Cnot7-211ENSMUST00000149992 2982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.41□□□□□ -0.58
Kdm4dQ3U2K5 Olfr1349-204ENSMUST00000207820 1325 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC11.41□□□□□ -0.58
Kdm4dQ3U2K5 Tead3-207ENSMUST00000219703 1320 ntTSL 1 (best) BASIC11.41□□□□□ -0.58
Kdm4dQ3U2K5 Mapkapk5-204ENSMUST00000111783 1513 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.41□□□□□ -0.58
Kdm4dQ3U2K5 Lrrc18-204ENSMUST00000120951 1511 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.41□□□□□ -0.58
Kdm4dQ3U2K5 Cd72-201ENSMUST00000030179 1505 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.41□□□□□ -0.58
Kdm4dQ3U2K5 Ccpg1-208ENSMUST00000150826 2939 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.41□□□□□ -0.58
Kdm4dQ3U2K5 Gm26819-201ENSMUST00000180656 5128 ntTSL 5 BASIC11.41□□□□□ -0.58
Kdm4dQ3U2K5 Map1b-203ENSMUST00000223725 2669 ntBASIC11.41□□□□□ -0.58
Kdm4dQ3U2K5 Cend1-203ENSMUST00000137488 1697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.41□□□□□ -0.58
Kdm4dQ3U2K5 Mdga1-201ENSMUST00000073556 7566 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.41□□□□□ -0.58
Kdm4dQ3U2K5 AC127242.1-201ENSMUST00000222861 1464 ntTSL 3 BASIC11.41□□□□□ -0.58
Kdm4dQ3U2K5 Cd27-203ENSMUST00000112282 588 ntTSL 1 (best) BASIC11.41□□□□□ -0.58
Kdm4dQ3U2K5 Gm13461-201ENSMUST00000120980 662 ntBASIC11.41□□□□□ -0.58
Kdm4dQ3U2K5 4930595D18Rik-201ENSMUST00000121608 818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.41□□□□□ -0.58
Kdm4dQ3U2K5 Gm44793-201ENSMUST00000136923 582 ntTSL 2 BASIC11.41□□□□□ -0.58
Kdm4dQ3U2K5 Gm12951-201ENSMUST00000150216 434 ntTSL 1 (best) BASIC11.41□□□□□ -0.58
Kdm4dQ3U2K5 Gm23085-201ENSMUST00000157849 293 ntBASIC11.41□□□□□ -0.58
Kdm4dQ3U2K5 1110038B12Rik-203ENSMUST00000173070 434 ntTSL 1 (best) BASIC11.41□□□□□ -0.58
Kdm4dQ3U2K5 Gm7467-201ENSMUST00000185173 652 ntBASIC11.41□□□□□ -0.58
Kdm4dQ3U2K5 Qdpr-209ENSMUST00000198258 1172 ntTSL 5 BASIC11.41□□□□□ -0.58
Kdm4dQ3U2K5 Gm5051-201ENSMUST00000204085 485 ntBASIC11.41□□□□□ -0.58
Kdm4dQ3U2K5 Gm13522-202ENSMUST00000209682 997 ntTSL 5 BASIC11.41□□□□□ -0.58
Kdm4dQ3U2K5 Cct2-206ENSMUST00000219573 637 ntTSL 3 BASIC11.41□□□□□ -0.58
Kdm4dQ3U2K5 AC154849.4-201ENSMUST00000224868 365 ntBASIC11.41□□□□□ -0.58
Kdm4dQ3U2K5 Gm9785-201ENSMUST00000062642 1006 ntBASIC11.41□□□□□ -0.58
Kdm4dQ3U2K5 Sypl-201ENSMUST00000020885 2019 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.41□□□□□ -0.58
Kdm4dQ3U2K5 Nckipsd-201ENSMUST00000035218 3360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.41□□□□□ -0.58
Kdm4dQ3U2K5 Fank1-201ENSMUST00000065359 2004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.41□□□□□ -0.58
Kdm4dQ3U2K5 Ppp1r16b-201ENSMUST00000045503 6408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.41□□□□□ -0.58
Kdm4dQ3U2K5 Mirt1-202ENSMUST00000180667 1633 ntTSL 5 BASIC11.41□□□□□ -0.58
Kdm4dQ3U2K5 Chpf2-201ENSMUST00000088295 5371 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.41□□□□□ -0.58
Kdm4dQ3U2K5 Ip6k3-201ENSMUST00000025046 2307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.41□□□□□ -0.58
Kdm4dQ3U2K5 D030025P21Rik-202ENSMUST00000220643 3987 ntBASIC11.41□□□□□ -0.58
Kdm4dQ3U2K5 Calu-202ENSMUST00000090481 2670 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.41□□□□□ -0.58
Kdm4dQ3U2K5 Dnmt3a-201ENSMUST00000020991 9685 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.41□□□□□ -0.58
Kdm4dQ3U2K5 Slc38a6-206ENSMUST00000140523 3032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.41□□□□□ -0.58
Kdm4dQ3U2K5 5330439B14Rik-201ENSMUST00000194811 1392 ntTSL 1 (best) BASIC11.41□□□□□ -0.58
Kdm4dQ3U2K5 Fcna-201ENSMUST00000028307 1374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.41□□□□□ -0.58
Kdm4dQ3U2K5 2010315B03Rik-202ENSMUST00000177714 2623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.4□□□□□ -0.58
Kdm4dQ3U2K5 Iqcc-201ENSMUST00000046675 2639 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC11.4□□□□□ -0.58
Kdm4dQ3U2K5 Rbm12b2-201ENSMUST00000063839 3327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.4□□□□□ -0.58
Kdm4dQ3U2K5 Gm15594-201ENSMUST00000137958 2215 ntTSL 1 (best) BASIC11.4□□□□□ -0.58
Kdm4dQ3U2K5 Epha5-202ENSMUST00000113398 4830 ntTSL 5 BASIC11.4□□□□□ -0.58
Kdm4dQ3U2K5 Tyk2-206ENSMUST00000216874 4828 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.4□□□□□ -0.58
Kdm4dQ3U2K5 Zfp536-201ENSMUST00000056338 4621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.4□□□□□ -0.58
Kdm4dQ3U2K5 Mrps26-202ENSMUST00000145614 4278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.4□□□□□ -0.58
Kdm4dQ3U2K5 Atp13a1-201ENSMUST00000034326 3915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.4□□□□□ -0.58
Kdm4dQ3U2K5 Ip6k2-201ENSMUST00000085018 1846 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.4□□□□□ -0.58
Kdm4dQ3U2K5 Eprs-201ENSMUST00000046514 4906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.4□□□□□ -0.58
Kdm4dQ3U2K5 Rmi1-201ENSMUST00000042450 3855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.4□□□□□ -0.58
Kdm4dQ3U2K5 Krtap4-8-201ENSMUST00000107439 983 ntAPPRIS P1 BASIC11.4□□□□□ -0.58
Kdm4dQ3U2K5 Cdk2ap1-202ENSMUST00000111472 648 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC11.4□□□□□ -0.58
Kdm4dQ3U2K5 Gm15004-201ENSMUST00000119192 630 ntBASIC11.4□□□□□ -0.58
Kdm4dQ3U2K5 Gm15595-201ENSMUST00000120840 961 ntBASIC11.4□□□□□ -0.58
Kdm4dQ3U2K5 Mrps17-207ENSMUST00000121813 868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.4□□□□□ -0.58
Kdm4dQ3U2K5 Gm13966-201ENSMUST00000148420 832 ntTSL 3 BASIC11.4□□□□□ -0.58
Kdm4dQ3U2K5 Setdb2-205ENSMUST00000161459 2995 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.4□□□□□ -0.58
Kdm4dQ3U2K5 Gm6397-201ENSMUST00000161973 1069 ntBASIC11.4□□□□□ -0.58
Kdm4dQ3U2K5 Pcgf1-207ENSMUST00000177177 854 ntTSL 1 (best) BASIC11.4□□□□□ -0.58
Kdm4dQ3U2K5 Ccser2-208ENSMUST00000183007 1293 ntTSL 5 BASIC11.4□□□□□ -0.58
Kdm4dQ3U2K5 Dusp13-211ENSMUST00000183943 779 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.4□□□□□ -0.58
Kdm4dQ3U2K5 Gm38228-201ENSMUST00000193169 1293 ntBASIC11.4□□□□□ -0.58
Kdm4dQ3U2K5 Rpl36-ps9-201ENSMUST00000196458 277 ntBASIC11.4□□□□□ -0.58
Kdm4dQ3U2K5 Gm2965-201ENSMUST00000198365 343 ntBASIC11.4□□□□□ -0.58
Kdm4dQ3U2K5 Saa2-202ENSMUST00000210272 511 ntTSL 3 BASIC11.4□□□□□ -0.58
Kdm4dQ3U2K5 Tepp-207ENSMUST00000212056 613 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.4□□□□□ -0.58
Kdm4dQ3U2K5 Gm29208-205ENSMUST00000214517 1056 ntTSL 5 BASIC11.4□□□□□ -0.58
Kdm4dQ3U2K5 Cthrc1-201ENSMUST00000067072 1166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.4□□□□□ -0.58
Kdm4dQ3U2K5 Gm7551-201ENSMUST00000089593 1074 ntBASIC11.4□□□□□ -0.58
Kdm4dQ3U2K5 Tsku-202ENSMUST00000164726 2620 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.4□□□□□ -0.58
Kdm4dQ3U2K5 Agrn-201ENSMUST00000071248 4831 ntTSL 5 BASIC11.4□□□□□ -0.58
Kdm4dQ3U2K5 Elmsan1-201ENSMUST00000046266 6848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.4□□□□□ -0.58
Kdm4dQ3U2K5 Arid5a-204ENSMUST00000115032 4640 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.4□□□□□ -0.58
Kdm4dQ3U2K5 Ttc23-202ENSMUST00000107470 1915 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.4□□□□□ -0.58
Kdm4dQ3U2K5 Mafk-202ENSMUST00000110836 3097 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.4□□□□□ -0.58
Kdm4dQ3U2K5 Rbfox2-202ENSMUST00000111581 3072 ntTSL 1 (best) BASIC11.4□□□□□ -0.58
Kdm4dQ3U2K5 Olfr1419-203ENSMUST00000217617 3087 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.4□□□□□ -0.58
Kdm4dQ3U2K5 Fgfr1op-201ENSMUST00000024636 3077 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.4□□□□□ -0.58
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 49.4 ms