Protein–RNA interactions for Protein: Q3U0Y2

Tmem35b, Transmembrane protein 35B, mousemouse

Predictions only

Length 150 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tmem35bQ3U0Y2 Rbms2-201ENSMUST00000092033 1481 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
Tmem35bQ3U0Y2 Nbeal2-211ENSMUST00000196488 8599 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.87□□□□□ -0.35
Tmem35bQ3U0Y2 Sstr3-201ENSMUST00000053239 3928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
Tmem35bQ3U0Y2 Ggt6-203ENSMUST00000108499 874 ntTSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
Tmem35bQ3U0Y2 Gm6370-201ENSMUST00000110611 1142 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC12.87□□□□□ -0.35
Tmem35bQ3U0Y2 A330102I10Rik-202ENSMUST00000140415 682 ntTSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
Tmem35bQ3U0Y2 Fam166b-206ENSMUST00000171134 1198 ntTSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
Tmem35bQ3U0Y2 Gm6309-201ENSMUST00000174320 1154 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.87□□□□□ -0.35
Tmem35bQ3U0Y2 Cplx3-202ENSMUST00000215487 594 ntTSL 3 BASIC12.87□□□□□ -0.35
Tmem35bQ3U0Y2 Rwdd3-201ENSMUST00000039761 1145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
Tmem35bQ3U0Y2 Vrk1-201ENSMUST00000021539 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
Tmem35bQ3U0Y2 Spem2-201ENSMUST00000056941 1640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
Tmem35bQ3U0Y2 Anks1b-224ENSMUST00000182960 3397 ntTSL 5 BASIC12.87□□□□□ -0.35
Tmem35bQ3U0Y2 Gpr45-201ENSMUST00000114761 1546 ntAPPRIS P1 BASIC12.87□□□□□ -0.35
Tmem35bQ3U0Y2 Fbxl22-201ENSMUST00000056890 3935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
Tmem35bQ3U0Y2 Scpep1-201ENSMUST00000000287 2097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
Tmem35bQ3U0Y2 Dcaf11-202ENSMUST00000117236 2538 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
Tmem35bQ3U0Y2 Rab11fip1-202ENSMUST00000054212 7965 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC12.87□□□□□ -0.35
Tmem35bQ3U0Y2 Pcdhb16-201ENSMUST00000051442 5225 ntAPPRIS P1 BASIC12.86□□□□□ -0.35
Tmem35bQ3U0Y2 Smpd3-201ENSMUST00000067512 5148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
Tmem35bQ3U0Y2 Pcdh19-202ENSMUST00000149154 10289 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
Tmem35bQ3U0Y2 Entpd5-203ENSMUST00000110272 4972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
Tmem35bQ3U0Y2 Gabrr1-201ENSMUST00000029947 2286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
Tmem35bQ3U0Y2 Kirrel3-209ENSMUST00000190549 3074 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
Tmem35bQ3U0Y2 Col9a1-202ENSMUST00000088349 3059 ntTSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
Tmem35bQ3U0Y2 Rapgef3-205ENSMUST00000129223 3750 ntTSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
Tmem35bQ3U0Y2 Gm14169-201ENSMUST00000124676 2519 ntTSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
Tmem35bQ3U0Y2 Trim35-201ENSMUST00000022623 3678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
Tmem35bQ3U0Y2 Npy5r-202ENSMUST00000211920 1715 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.86□□□□□ -0.35
Tmem35bQ3U0Y2 Scamp5-201ENSMUST00000046587 3225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
Tmem35bQ3U0Y2 Bcas3-202ENSMUST00000092821 2769 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
Tmem35bQ3U0Y2 Gm11595-201ENSMUST00000107440 1200 ntAPPRIS P1 BASIC12.86□□□□□ -0.35
Tmem35bQ3U0Y2 Spata3-202ENSMUST00000113344 1047 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
Tmem35bQ3U0Y2 Gm15547-201ENSMUST00000122152 333 ntBASIC12.86□□□□□ -0.35
Tmem35bQ3U0Y2 Gm11961-202ENSMUST00000141157 760 ntTSL 3 BASIC12.86□□□□□ -0.35
Tmem35bQ3U0Y2 Crb3-205ENSMUST00000169543 778 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC12.86□□□□□ -0.35
Tmem35bQ3U0Y2 Gm13381-202ENSMUST00000177012 640 ntTSL 5 BASIC12.86□□□□□ -0.35
Tmem35bQ3U0Y2 Gm4607-201ENSMUST00000206649 577 ntBASIC12.86□□□□□ -0.35
Tmem35bQ3U0Y2 Rnf7-201ENSMUST00000057500 1232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
Tmem35bQ3U0Y2 Snf8-201ENSMUST00000006217 1004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
Tmem35bQ3U0Y2 Coq7-202ENSMUST00000098090 1215 ntTSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
Tmem35bQ3U0Y2 Olfm4-201ENSMUST00000088735 1640 ntTSL 2 BASIC12.86□□□□□ -0.35
Tmem35bQ3U0Y2 Gm13553-201ENSMUST00000133025 1970 ntTSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
Tmem35bQ3U0Y2 Irf9-205ENSMUST00000138037 2343 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
Tmem35bQ3U0Y2 Msh5-202ENSMUST00000097338 2678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
Tmem35bQ3U0Y2 Neat1-202ENSMUST00000174287 3004 ntTSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
Tmem35bQ3U0Y2 Amer2-201ENSMUST00000022561 10506 ntAPPRIS P1 BASIC12.86□□□□□ -0.35
Tmem35bQ3U0Y2 Dnajb6-201ENSMUST00000008733 2918 ntTSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
Tmem35bQ3U0Y2 Tor1aip1-202ENSMUST00000097527 4234 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
Tmem35bQ3U0Y2 Camkv-204ENSMUST00000194206 2827 ntTSL 5 BASIC12.86□□□□□ -0.35
Tmem35bQ3U0Y2 Gm44755-201ENSMUST00000207830 2102 ntBASIC12.86□□□□□ -0.35
Tmem35bQ3U0Y2 Cyp2s1-201ENSMUST00000043314 2745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
Tmem35bQ3U0Y2 Mamld1-202ENSMUST00000114629 3346 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.86□□□□□ -0.35
Tmem35bQ3U0Y2 Gprasp1-201ENSMUST00000113144 5843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
Tmem35bQ3U0Y2 AI464131-201ENSMUST00000054920 4173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
Tmem35bQ3U0Y2 Esr1-204ENSMUST00000105590 6339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
Tmem35bQ3U0Y2 Cyp4f17-201ENSMUST00000165999 1693 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.86□□□□□ -0.35
Tmem35bQ3U0Y2 Pag1-201ENSMUST00000108384 3729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
Tmem35bQ3U0Y2 Folr1-203ENSMUST00000106983 1307 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.86□□□□□ -0.35
Tmem35bQ3U0Y2 Gm10152-201ENSMUST00000193475 1344 ntBASIC12.86□□□□□ -0.35
Tmem35bQ3U0Y2 Hdac6-201ENSMUST00000033501 4142 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.86□□□□□ -0.35
Tmem35bQ3U0Y2 Lynx1-201ENSMUST00000023259 4023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
Tmem35bQ3U0Y2 Ddx17-201ENSMUST00000054014 4761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
Tmem35bQ3U0Y2 Vcp-201ENSMUST00000030164 3316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
Tmem35bQ3U0Y2 Arvcf-202ENSMUST00000115610 3829 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.85□□□□□ -0.35
Tmem35bQ3U0Y2 Riox2-206ENSMUST00000160571 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
Tmem35bQ3U0Y2 Pla2g15-201ENSMUST00000034377 2706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
Tmem35bQ3U0Y2 Fam110b-201ENSMUST00000054857 3210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
Tmem35bQ3U0Y2 Sik2-205ENSMUST00000176663 4107 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.85□□□□□ -0.35
Tmem35bQ3U0Y2 Xpo1-201ENSMUST00000020538 5145 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.85□□□□□ -0.35
Tmem35bQ3U0Y2 Eif5a2-201ENSMUST00000060500 5027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
Tmem35bQ3U0Y2 Plod3-201ENSMUST00000004968 3280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
Tmem35bQ3U0Y2 Pla2g6-206ENSMUST00000173163 3018 ntTSL 5 BASIC12.85□□□□□ -0.35
Tmem35bQ3U0Y2 Traf7-202ENSMUST00000088464 2504 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.85□□□□□ -0.35
Tmem35bQ3U0Y2 D130017N08Rik-203ENSMUST00000196629 2265 ntBASIC12.85□□□□□ -0.35
Tmem35bQ3U0Y2 Tef-202ENSMUST00000109553 4401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
Tmem35bQ3U0Y2 Trappc5-202ENSMUST00000207787 4411 ntAPPRIS P1 BASIC12.85□□□□□ -0.35
Tmem35bQ3U0Y2 Brwd1-201ENSMUST00000023631 8209 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
Tmem35bQ3U0Y2 Npr2-201ENSMUST00000030191 3660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
Tmem35bQ3U0Y2 Tfr2-201ENSMUST00000031729 2926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
Tmem35bQ3U0Y2 Trav13d-4-201ENSMUST00000103607 264 ntAPPRIS P1 BASIC12.85□□□□□ -0.35
Tmem35bQ3U0Y2 Smyd3-202ENSMUST00000111134 1229 ntTSL 2 BASIC12.85□□□□□ -0.35
Tmem35bQ3U0Y2 Fuom-203ENSMUST00000121115 872 ntTSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
Tmem35bQ3U0Y2 Kcnmb4os1-201ENSMUST00000134586 824 ntTSL 2 BASIC12.85□□□□□ -0.35
Tmem35bQ3U0Y2 Glmp-201ENSMUST00000001454 1017 ntTSL 5 BASIC12.85□□□□□ -0.35
Tmem35bQ3U0Y2 Gm12349-201ENSMUST00000153030 657 ntTSL 3 BASIC12.85□□□□□ -0.35
Tmem35bQ3U0Y2 Atp10d-206ENSMUST00000169617 761 ntTSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
Tmem35bQ3U0Y2 Trav13-4-dv7-202ENSMUST00000184905 264 ntAPPRIS P1 BASIC12.85□□□□□ -0.35
Tmem35bQ3U0Y2 2010320M18Rik-201ENSMUST00000191396 1009 ntBASIC12.85□□□□□ -0.35
Tmem35bQ3U0Y2 Gm43433-201ENSMUST00000196573 481 ntBASIC12.85□□□□□ -0.35
Tmem35bQ3U0Y2 Gm45720-201ENSMUST00000211881 484 ntTSL 3 BASIC12.85□□□□□ -0.35
Tmem35bQ3U0Y2 AC132384.14-201ENSMUST00000219346 1147 ntBASIC12.85□□□□□ -0.35
Tmem35bQ3U0Y2 Lect2-202ENSMUST00000225183 823 ntBASIC12.85□□□□□ -0.35
Tmem35bQ3U0Y2 Gemin7-201ENSMUST00000051364 763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
Tmem35bQ3U0Y2 Lect2-201ENSMUST00000062806 837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
Tmem35bQ3U0Y2 Gm42706-201ENSMUST00000199733 1910 ntBASIC12.85□□□□□ -0.35
Tmem35bQ3U0Y2 Far2-201ENSMUST00000032443 3480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
Tmem35bQ3U0Y2 AC149222.1-201ENSMUST00000154987 5188 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
Tmem35bQ3U0Y2 Nars2-201ENSMUST00000044466 3778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
Tmem35bQ3U0Y2 Gatb-202ENSMUST00000107672 1820 ntTSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 35.4 ms