Protein–RNA interactions for Protein: Q3TMP1

Gtf3c3, General transcription factor IIIC, polypeptide 3, mousemouse

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Length 882 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gtf3c3Q3TMP1 Otud6a-201ENSMUST00000060241 873 ntAPPRIS P1 BASIC14.53□□□□□ -0.08
Gtf3c3Q3TMP1 Rps15-201ENSMUST00000062674 572 ntTSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Gtf3c3Q3TMP1 Vmn1r217-201ENSMUST00000091721 897 ntAPPRIS P1 BASIC14.53□□□□□ -0.08
Gtf3c3Q3TMP1 Srr-201ENSMUST00000065211 3699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Gtf3c3Q3TMP1 Nucks1-201ENSMUST00000062264 5998 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Gtf3c3Q3TMP1 4632411P08Rik-201ENSMUST00000181005 3237 ntTSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Gtf3c3Q3TMP1 Magel2-201ENSMUST00000080403 4631 ntAPPRIS P1 BASIC14.53□□□□□ -0.08
Gtf3c3Q3TMP1 Zfp28-201ENSMUST00000081022 4447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Gtf3c3Q3TMP1 Tuft1-201ENSMUST00000006123 2631 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Gtf3c3Q3TMP1 Capn8-201ENSMUST00000048941 2406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Gtf3c3Q3TMP1 Ormdl1-201ENSMUST00000027266 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Gtf3c3Q3TMP1 Abcf1-201ENSMUST00000043757 3161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Gtf3c3Q3TMP1 Nuak2-202ENSMUST00000082125 3107 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.08
Gtf3c3Q3TMP1 Plekhg4-201ENSMUST00000014927 4167 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.52□□□□□ -0.08
Gtf3c3Q3TMP1 Hs3st1-202ENSMUST00000117944 1686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.08
Gtf3c3Q3TMP1 Gaa-203ENSMUST00000106259 3633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.08
Gtf3c3Q3TMP1 Slc38a3-201ENSMUST00000010208 2585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.08
Gtf3c3Q3TMP1 Zranb2-201ENSMUST00000029831 2540 ntTSL 5 BASIC14.52□□□□□ -0.08
Gtf3c3Q3TMP1 Vmn1r16-203ENSMUST00000228356 3492 ntAPPRIS ALT2 BASIC14.52□□□□□ -0.08
Gtf3c3Q3TMP1 Zfp354b-201ENSMUST00000109124 2455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.08
Gtf3c3Q3TMP1 Psmc3-203ENSMUST00000111441 1419 ntTSL 5 BASIC14.52□□□□□ -0.08
Gtf3c3Q3TMP1 Cuzd1-201ENSMUST00000046611 2256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.08
Gtf3c3Q3TMP1 Runx3-201ENSMUST00000056977 3884 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.08
Gtf3c3Q3TMP1 Lcn5-202ENSMUST00000100312 660 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
Gtf3c3Q3TMP1 Zfp157-202ENSMUST00000100524 869 ntTSL 3 BASIC14.52□□□□□ -0.09
Gtf3c3Q3TMP1 Lims1-203ENSMUST00000105468 1205 ntTSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
Gtf3c3Q3TMP1 Blvrb-202ENSMUST00000108357 782 ntTSL 2 BASIC14.52□□□□□ -0.09
Gtf3c3Q3TMP1 Agbl3-202ENSMUST00000115012 790 ntTSL 3 BASIC14.52□□□□□ -0.09
Gtf3c3Q3TMP1 Agbl3-203ENSMUST00000115014 805 ntTSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
Gtf3c3Q3TMP1 Akirin1-ps-201ENSMUST00000119676 458 ntBASIC14.52□□□□□ -0.09
Gtf3c3Q3TMP1 Gm17232-201ENSMUST00000164515 453 ntTSL 2 BASIC14.52□□□□□ -0.09
Gtf3c3Q3TMP1 Gm10535-201ENSMUST00000182275 915 ntTSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
Gtf3c3Q3TMP1 Gm6652-201ENSMUST00000186414 1070 ntBASIC14.52□□□□□ -0.09
Gtf3c3Q3TMP1 Gm42722-201ENSMUST00000198855 940 ntTSL 3 BASIC14.52□□□□□ -0.09
Gtf3c3Q3TMP1 Apoa5-203ENSMUST00000213878 727 ntTSL 3 BASIC14.52□□□□□ -0.09
Gtf3c3Q3TMP1 Gm8227-201ENSMUST00000223306 571 ntBASIC14.52□□□□□ -0.09
Gtf3c3Q3TMP1 Mt1-201ENSMUST00000034215 549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
Gtf3c3Q3TMP1 Hdhd3-201ENSMUST00000037820 1205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
Gtf3c3Q3TMP1 Otos-201ENSMUST00000053144 704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
Gtf3c3Q3TMP1 Ahnak2-201ENSMUST00000101010 2821 ntAPPRIS ALT2 BASIC14.52□□□□□ -0.09
Gtf3c3Q3TMP1 Bsdc1-201ENSMUST00000048162 2823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
Gtf3c3Q3TMP1 Zfp710-203ENSMUST00000166250 3606 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
Gtf3c3Q3TMP1 Gm43417-201ENSMUST00000201586 5207 ntBASIC14.52□□□□□ -0.09
Gtf3c3Q3TMP1 Rbbp5-202ENSMUST00000187505 1977 ntTSL 5 BASIC14.52□□□□□ -0.09
Gtf3c3Q3TMP1 Sox9-201ENSMUST00000000579 4135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
Gtf3c3Q3TMP1 Slc20a1-201ENSMUST00000028880 3316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
Gtf3c3Q3TMP1 Arpp21-223ENSMUST00000162097 3952 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.52□□□□□ -0.09
Gtf3c3Q3TMP1 Klhdc7b-202ENSMUST00000225666 3951 ntAPPRIS ALT2 BASIC14.52□□□□□ -0.09
Gtf3c3Q3TMP1 Lmo3-207ENSMUST00000163065 2425 ntTSL 3 BASIC14.52□□□□□ -0.09
Gtf3c3Q3TMP1 Vill-202ENSMUST00000074734 2440 ntTSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
Gtf3c3Q3TMP1 Ints6l-201ENSMUST00000039374 3766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
Gtf3c3Q3TMP1 Slx4-201ENSMUST00000040790 5706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
Gtf3c3Q3TMP1 Snx13-202ENSMUST00000163677 3681 ntTSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
Gtf3c3Q3TMP1 Acox3-203ENSMUST00000114237 2956 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
Gtf3c3Q3TMP1 Serpinb13-201ENSMUST00000027564 1607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
Gtf3c3Q3TMP1 Ttc14-201ENSMUST00000099153 9661 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Gtf3c3Q3TMP1 Zfp462-202ENSMUST00000079605 4684 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.51□□□□□ -0.09
Gtf3c3Q3TMP1 Gm28581-201ENSMUST00000186086 2177 ntBASIC14.51□□□□□ -0.09
Gtf3c3Q3TMP1 Slc22a18-201ENSMUST00000052348 1525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Gtf3c3Q3TMP1 Arhgap29-201ENSMUST00000037958 5787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Gtf3c3Q3TMP1 Pcdh10-203ENSMUST00000171554 7273 ntTSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Gtf3c3Q3TMP1 Gpr173-201ENSMUST00000070316 4855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Gtf3c3Q3TMP1 Nrde2-201ENSMUST00000021596 3718 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.51□□□□□ -0.09
Gtf3c3Q3TMP1 Gm9816-201ENSMUST00000122292 1414 ntBASIC14.51□□□□□ -0.09
Gtf3c3Q3TMP1 Dennd1c-201ENSMUST00000011623 2520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Gtf3c3Q3TMP1 Spice1-201ENSMUST00000050897 4627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Gtf3c3Q3TMP1 Slit2-216ENSMUST00000174313 7734 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Gtf3c3Q3TMP1 Syt8-201ENSMUST00000097939 1300 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Gtf3c3Q3TMP1 Ttc16-206ENSMUST00000161430 2874 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Gtf3c3Q3TMP1 Syt15-202ENSMUST00000119693 1801 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Gtf3c3Q3TMP1 Zfp809-206ENSMUST00000215902 1800 ntTSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Gtf3c3Q3TMP1 Prss45-201ENSMUST00000011391 1232 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Gtf3c3Q3TMP1 Gm14508-201ENSMUST00000127049 901 ntTSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Gtf3c3Q3TMP1 Gm13850-201ENSMUST00000140465 623 ntTSL 3 BASIC14.51□□□□□ -0.09
Gtf3c3Q3TMP1 Snhg17-206ENSMUST00000152125 1046 ntTSL 3 BASIC14.51□□□□□ -0.09
Gtf3c3Q3TMP1 Gm26927-201ENSMUST00000182385 965 ntBASIC14.51□□□□□ -0.09
Gtf3c3Q3TMP1 Srgn-201ENSMUST00000020271 938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Gtf3c3Q3TMP1 4930438A08Rik-202ENSMUST00000208022 918 ntTSL 5 BASIC14.51□□□□□ -0.09
Gtf3c3Q3TMP1 Gm9908-201ENSMUST00000211534 448 ntBASIC14.51□□□□□ -0.09
Gtf3c3Q3TMP1 AC087891.2-201ENSMUST00000219293 658 ntTSL 5 BASIC14.51□□□□□ -0.09
Gtf3c3Q3TMP1 AC134254.1-201ENSMUST00000221362 167 ntBASIC14.51□□□□□ -0.09
Gtf3c3Q3TMP1 AC159006.1-201ENSMUST00000226396 258 ntBASIC14.51□□□□□ -0.09
Gtf3c3Q3TMP1 AC169036.1-201ENSMUST00000227994 296 ntBASIC14.51□□□□□ -0.09
Gtf3c3Q3TMP1 Pts-201ENSMUST00000034570 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Gtf3c3Q3TMP1 Rhbdl2-201ENSMUST00000053202 1217 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.51□□□□□ -0.09
Gtf3c3Q3TMP1 Gm26035-201ENSMUST00000083065 308 ntBASIC14.51□□□□□ -0.09
Gtf3c3Q3TMP1 Gdf9-201ENSMUST00000018382 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Gtf3c3Q3TMP1 Shank2-202ENSMUST00000105900 8169 ntTSL 5 BASIC14.51□□□□□ -0.09
Gtf3c3Q3TMP1 Sdad1-201ENSMUST00000031364 5020 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Gtf3c3Q3TMP1 Tcf4-254ENSMUST00000202674 2615 ntTSL 5 BASIC14.51□□□□□ -0.09
Gtf3c3Q3TMP1 Pfkfb3-202ENSMUST00000049849 2076 ntTSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Gtf3c3Q3TMP1 Ptprr-206ENSMUST00000148731 2511 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.51□□□□□ -0.09
Gtf3c3Q3TMP1 Bzw1-201ENSMUST00000050552 3876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Gtf3c3Q3TMP1 Pofut1-201ENSMUST00000049863 5600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Gtf3c3Q3TMP1 Fuca2-201ENSMUST00000060212 2007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Gtf3c3Q3TMP1 Lysmd4-202ENSMUST00000179106 3319 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.51□□□□□ -0.09
Gtf3c3Q3TMP1 Als2cl-203ENSMUST00000130386 5056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Gtf3c3Q3TMP1 Gm16853-201ENSMUST00000181812 1986 ntTSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Gtf3c3Q3TMP1 Dna2-203ENSMUST00000131422 4122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Gtf3c3Q3TMP1 Cab39-201ENSMUST00000097666 2369 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.51□□□□□ -0.09
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