Protein–RNA interactions for Protein: Q3SYJ2

Prr27, 4930432K09Rik protein, mousemouse

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Length 352 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Prr27Q3SYJ2 2310026I22Rik-201ENSMUST00000180941 1300 ntTSL 1 (best) BASIC10.5□□□□□ -0.73
Prr27Q3SYJ2 AC167669.2-201ENSMUST00000224417 1620 ntBASIC10.5□□□□□ -0.73
Prr27Q3SYJ2 Got2-201ENSMUST00000034097 2530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.5□□□□□ -0.73
Prr27Q3SYJ2 Rab14-202ENSMUST00000113025 4346 ntTSL 1 (best) BASIC10.5□□□□□ -0.73
Prr27Q3SYJ2 Arhgef15-203ENSMUST00000108671 4372 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.5□□□□□ -0.73
Prr27Q3SYJ2 Rgma-202ENSMUST00000119206 3481 ntTSL 1 (best) BASIC10.5□□□□□ -0.73
Prr27Q3SYJ2 Selenot-201ENSMUST00000107924 3157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.5□□□□□ -0.73
Prr27Q3SYJ2 Clpx-201ENSMUST00000015501 2885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.5□□□□□ -0.73
Prr27Q3SYJ2 Fmo2-202ENSMUST00000111510 2260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.5□□□□□ -0.73
Prr27Q3SYJ2 Mylip-202ENSMUST00000222178 1954 ntTSL 1 (best) BASIC10.5□□□□□ -0.73
Prr27Q3SYJ2 Gm5580-201ENSMUST00000122096 1362 ntAPPRIS P1 BASIC10.5□□□□□ -0.73
Prr27Q3SYJ2 Ikbip-201ENSMUST00000020149 3232 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.5□□□□□ -0.73
Prr27Q3SYJ2 Sparc-201ENSMUST00000018737 2300 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.5□□□□□ -0.73
Prr27Q3SYJ2 Dis3l-208ENSMUST00000168844 3575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.5□□□□□ -0.73
Prr27Q3SYJ2 Dync1i1-202ENSMUST00000115555 2669 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC10.5□□□□□ -0.73
Prr27Q3SYJ2 AC093022.4-203ENSMUST00000228523 2657 ntBASIC10.5□□□□□ -0.73
Prr27Q3SYJ2 Lgi4-201ENSMUST00000039775 4037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.49□□□□□ -0.73
Prr27Q3SYJ2 Gng5-202ENSMUST00000118280 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.49□□□□□ -0.73
Prr27Q3SYJ2 Brd3-201ENSMUST00000028282 5419 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC10.49□□□□□ -0.73
Prr27Q3SYJ2 Grap2-201ENSMUST00000043149 3158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.49□□□□□ -0.73
Prr27Q3SYJ2 Fam53a-203ENSMUST00000065162 8219 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.49□□□□□ -0.73
Prr27Q3SYJ2 Otub2-202ENSMUST00000101094 3228 ntTSL 1 (best) BASIC10.49□□□□□ -0.73
Prr27Q3SYJ2 Gm42943-201ENSMUST00000199676 3242 ntBASIC10.49□□□□□ -0.73
Prr27Q3SYJ2 Tcf25-202ENSMUST00000108840 2582 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.49□□□□□ -0.73
Prr27Q3SYJ2 Hk1-205ENSMUST00000130422 2916 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.49□□□□□ -0.73
Prr27Q3SYJ2 Prc1-206ENSMUST00000173824 2912 ntTSL 1 (best) BASIC10.49□□□□□ -0.73
Prr27Q3SYJ2 Dph6-201ENSMUST00000028640 2632 ntTSL 1 (best) BASIC10.49□□□□□ -0.73
Prr27Q3SYJ2 Unkl-204ENSMUST00000160896 4787 ntTSL 1 (best) BASIC10.49□□□□□ -0.73
Prr27Q3SYJ2 Fam60a-201ENSMUST00000054080 2697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.49□□□□□ -0.73
Prr27Q3SYJ2 Vmac-202ENSMUST00000164907 1988 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.49□□□□□ -0.73
Prr27Q3SYJ2 Trav4-2-201ENSMUST00000103637 370 ntAPPRIS P1 BASIC10.49□□□□□ -0.73
Prr27Q3SYJ2 Cstl1-202ENSMUST00000109954 454 ntTSL 1 (best) BASIC10.49□□□□□ -0.73
Prr27Q3SYJ2 Rpl3-ps2-201ENSMUST00000117131 1214 ntBASIC10.49□□□□□ -0.73
Prr27Q3SYJ2 Gm11793-201ENSMUST00000120433 981 ntBASIC10.49□□□□□ -0.73
Prr27Q3SYJ2 Ppp3cb-202ENSMUST00000159027 3831 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.49□□□□□ -0.73
Prr27Q3SYJ2 Pdxk-ps-202ENSMUST00000160550 876 ntBASIC10.49□□□□□ -0.73
Prr27Q3SYJ2 Commd6-203ENSMUST00000168587 519 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.49□□□□□ -0.73
Prr27Q3SYJ2 Aif1-203ENSMUST00000172693 842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.49□□□□□ -0.73
Prr27Q3SYJ2 Hmgcll1-207ENSMUST00000183979 1136 ntTSL 5 BASIC10.49□□□□□ -0.73
Prr27Q3SYJ2 Gm9230-201ENSMUST00000188228 532 ntBASIC10.49□□□□□ -0.73
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Prr27Q3SYJ2 Gm42838-201ENSMUST00000196503 439 ntTSL 5 BASIC10.49□□□□□ -0.73
Prr27Q3SYJ2 Gm45021-201ENSMUST00000204521 369 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.49□□□□□ -0.73
Prr27Q3SYJ2 Gm17931-201ENSMUST00000208132 634 ntBASIC10.49□□□□□ -0.73
Prr27Q3SYJ2 Gm19309-201ENSMUST00000218295 205 ntBASIC10.49□□□□□ -0.73
Prr27Q3SYJ2 Gm31793-201ENSMUST00000218557 415 ntTSL 1 (best) BASIC10.49□□□□□ -0.73
Prr27Q3SYJ2 Gm33115-201ENSMUST00000220913 743 ntTSL 1 (best) BASIC10.49□□□□□ -0.73
Prr27Q3SYJ2 AC166344.1-202ENSMUST00000224139 234 ntBASIC10.49□□□□□ -0.73
Prr27Q3SYJ2 Fam241b-201ENSMUST00000027719 771 ntTSL 3 BASIC10.49□□□□□ -0.73
Prr27Q3SYJ2 Pglyrp1-201ENSMUST00000032573 694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.49□□□□□ -0.73
Prr27Q3SYJ2 Oaz1-ps-201ENSMUST00000052440 681 ntBASIC10.49□□□□□ -0.73
Prr27Q3SYJ2 Rnase2b-201ENSMUST00000075648 759 ntAPPRIS P1 BASIC10.49□□□□□ -0.73
Prr27Q3SYJ2 Gm10312-201ENSMUST00000078515 489 ntBASIC10.49□□□□□ -0.73
Prr27Q3SYJ2 Pdp2-201ENSMUST00000059588 5692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.49□□□□□ -0.73
Prr27Q3SYJ2 Stxbp6-202ENSMUST00000120531 4209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.49□□□□□ -0.73
Prr27Q3SYJ2 Zfp629-201ENSMUST00000058038 6120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.49□□□□□ -0.73
Prr27Q3SYJ2 Plekha6-204ENSMUST00000187285 5040 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.49□□□□□ -0.73
Prr27Q3SYJ2 Prkag3-206ENSMUST00000188073 2832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.49□□□□□ -0.73
Prr27Q3SYJ2 Brsk1-202ENSMUST00000120836 2867 ntTSL 5 BASIC10.49□□□□□ -0.73
Prr27Q3SYJ2 Scmh1-201ENSMUST00000000087 3353 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.49□□□□□ -0.73
Prr27Q3SYJ2 Csf1-201ENSMUST00000014743 4176 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.49□□□□□ -0.73
Prr27Q3SYJ2 Pdgfrb-201ENSMUST00000025522 5407 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.49□□□□□ -0.73
Prr27Q3SYJ2 Eya1-202ENSMUST00000080664 3426 ntTSL 1 (best) BASIC10.49□□□□□ -0.73
Prr27Q3SYJ2 Gm11766-201ENSMUST00000143428 3018 ntTSL 1 (best) BASIC10.49□□□□□ -0.73
Prr27Q3SYJ2 Ppp1r16b-202ENSMUST00000052927 6685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.49□□□□□ -0.73
Prr27Q3SYJ2 Dpm2-203ENSMUST00000140592 1412 ntTSL 5 BASIC10.49□□□□□ -0.73
Prr27Q3SYJ2 Wnt3-201ENSMUST00000000127 3076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.49□□□□□ -0.73
Prr27Q3SYJ2 Fbxo40-201ENSMUST00000075869 5137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.49□□□□□ -0.73
Prr27Q3SYJ2 Emc1-201ENSMUST00000042096 4706 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.49□□□□□ -0.73
Prr27Q3SYJ2 Gp2-202ENSMUST00000207887 1853 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.49□□□□□ -0.73
Prr27Q3SYJ2 Accs-202ENSMUST00000068513 1872 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC10.49□□□□□ -0.73
Prr27Q3SYJ2 Elp5-201ENSMUST00000108594 1454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.49□□□□□ -0.73
Prr27Q3SYJ2 Gm4864-201ENSMUST00000219894 1461 ntBASIC10.49□□□□□ -0.73
Prr27Q3SYJ2 Steap3-202ENSMUST00000112640 2752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.48□□□□□ -0.73
Prr27Q3SYJ2 Nxph1-202ENSMUST00000160300 2815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.48□□□□□ -0.73
Prr27Q3SYJ2 Tas1r1-201ENSMUST00000030792 2863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.48□□□□□ -0.73
Prr27Q3SYJ2 Galnt11-202ENSMUST00000114950 2493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.48□□□□□ -0.73
Prr27Q3SYJ2 Man2c1-215ENSMUST00000161182 2909 ntTSL 5 BASIC10.48□□□□□ -0.73
Prr27Q3SYJ2 Galc-201ENSMUST00000021390 3832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.48□□□□□ -0.73
Prr27Q3SYJ2 Grin2b-202ENSMUST00000111905 7484 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.48□□□□□ -0.73
Prr27Q3SYJ2 Rab3d-203ENSMUST00000122211 3886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.48□□□□□ -0.73
Prr27Q3SYJ2 Tubgcp2-201ENSMUST00000026547 2960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.48□□□□□ -0.73
Prr27Q3SYJ2 Dixdc1-202ENSMUST00000117093 1613 ntTSL 1 (best) BASIC10.48□□□□□ -0.73
Prr27Q3SYJ2 Slc39a8-205ENSMUST00000167390 3533 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.48□□□□□ -0.73
Prr27Q3SYJ2 Hkdc1-201ENSMUST00000020277 3517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.48□□□□□ -0.73
Prr27Q3SYJ2 Mmachc-201ENSMUST00000030453 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.48□□□□□ -0.73
Prr27Q3SYJ2 Hs3st1-202ENSMUST00000117944 1686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.48□□□□□ -0.73
Prr27Q3SYJ2 Gm10851-201ENSMUST00000192087 1685 ntTSL 1 (best) BASIC10.48□□□□□ -0.73
Prr27Q3SYJ2 Ddx11-205ENSMUST00000224497 4141 ntAPPRIS ALT2 BASIC10.48□□□□□ -0.73
Prr27Q3SYJ2 Zfp467-204ENSMUST00000114559 3163 ntTSL 1 (best) BASIC10.48□□□□□ -0.73
Prr27Q3SYJ2 Gck-201ENSMUST00000102920 2727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.48□□□□□ -0.73
Prr27Q3SYJ2 Gm42427-201ENSMUST00000200473 5292 ntBASIC10.48□□□□□ -0.73
Prr27Q3SYJ2 Mrpl55-203ENSMUST00000108785 792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.48□□□□□ -0.73
Prr27Q3SYJ2 Tcf7l2-205ENSMUST00000111651 1127 ntTSL 1 (best) BASIC10.48□□□□□ -0.73
Prr27Q3SYJ2 Gm13786-201ENSMUST00000122371 333 ntBASIC10.48□□□□□ -0.73
Prr27Q3SYJ2 A330102I10Rik-202ENSMUST00000140415 682 ntTSL 1 (best) BASIC10.48□□□□□ -0.73
Prr27Q3SYJ2 Retn-202ENSMUST00000169234 1139 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.48□□□□□ -0.73
Prr27Q3SYJ2 Rpl19-201ENSMUST00000017548 751 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.48□□□□□ -0.73
Prr27Q3SYJ2 Gm29396-201ENSMUST00000185659 716 ntBASIC10.48□□□□□ -0.73
Prr27Q3SYJ2 Gm8176-201ENSMUST00000191297 1099 ntBASIC10.48□□□□□ -0.73
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 37.5 ms