Protein–RNA interactions for Protein: Q0VF76

Ttc39d, Tetratricopeptide repeat domain 39D, mousemouse

Predictions only

Length 604 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ttc39dQ0VF76 Gm42853-201ENSMUST00000201273 1387 ntBASIC12.64□□□□□ -0.39
Ttc39dQ0VF76 Gm18222-201ENSMUST00000202416 1387 ntBASIC12.64□□□□□ -0.39
Ttc39dQ0VF76 Stim1-209ENSMUST00000211457 2183 ntTSL 5 BASIC12.64□□□□□ -0.39
Ttc39dQ0VF76 Tfr2-208ENSMUST00000199054 2966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.64□□□□□ -0.39
Ttc39dQ0VF76 Foxj3-202ENSMUST00000106310 4660 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.64□□□□□ -0.39
Ttc39dQ0VF76 Ska3-201ENSMUST00000022536 2260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.64□□□□□ -0.39
Ttc39dQ0VF76 Tmeff2-202ENSMUST00000114565 2718 ntTSL 1 (best) BASIC12.64□□□□□ -0.39
Ttc39dQ0VF76 Fam161a-203ENSMUST00000109557 1947 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.64□□□□□ -0.39
Ttc39dQ0VF76 Prdx2-202ENSMUST00000109733 1590 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.64□□□□□ -0.39
Ttc39dQ0VF76 Prodh-205ENSMUST00000136776 2041 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.64□□□□□ -0.39
Ttc39dQ0VF76 Gm6015-201ENSMUST00000217493 1586 ntBASIC12.64□□□□□ -0.39
Ttc39dQ0VF76 Slc2a7-201ENSMUST00000059893 1578 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.64□□□□□ -0.39
Ttc39dQ0VF76 Fam71f1-201ENSMUST00000090487 1584 ntTSL 1 (best) BASIC12.64□□□□□ -0.39
Ttc39dQ0VF76 Ccdc151-202ENSMUST00000115336 2103 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.64□□□□□ -0.39
Ttc39dQ0VF76 Il1rap-206ENSMUST00000174202 2306 ntTSL 1 (best) BASIC12.63□□□□□ -0.39
Ttc39dQ0VF76 Msra-201ENSMUST00000067927 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.63□□□□□ -0.39
Ttc39dQ0VF76 Trpc7-207ENSMUST00000173817 2406 ntTSL 5 BASIC12.63□□□□□ -0.39
Ttc39dQ0VF76 Slx4-201ENSMUST00000040790 5706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.63□□□□□ -0.39
Ttc39dQ0VF76 Lrp8-203ENSMUST00000106732 2648 ntTSL 1 (best) BASIC12.63□□□□□ -0.39
Ttc39dQ0VF76 Fga-201ENSMUST00000029630 2083 ntTSL 1 (best) BASIC12.63□□□□□ -0.39
Ttc39dQ0VF76 Olfm4-201ENSMUST00000088735 1640 ntTSL 2 BASIC12.63□□□□□ -0.39
Ttc39dQ0VF76 Epha5-206ENSMUST00000113406 4606 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.63□□□□□ -0.39
Ttc39dQ0VF76 Abo-202ENSMUST00000114045 1811 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.63□□□□□ -0.39
Ttc39dQ0VF76 Rac1-201ENSMUST00000080537 4159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.63□□□□□ -0.39
Ttc39dQ0VF76 Flywch1-201ENSMUST00000045517 2798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.63□□□□□ -0.39
Ttc39dQ0VF76 Atxn7l1os2-201ENSMUST00000138617 2019 ntTSL 1 (best) BASIC12.63□□□□□ -0.39
Ttc39dQ0VF76 Rgs11-201ENSMUST00000025020 2006 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC12.63□□□□□ -0.39
Ttc39dQ0VF76 Ufc1-202ENSMUST00000111302 914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.63□□□□□ -0.39
Ttc39dQ0VF76 Sumo3-203ENSMUST00000124024 776 ntTSL 2 BASIC12.63□□□□□ -0.39
Ttc39dQ0VF76 AA672651-201ENSMUST00000151550 489 ntTSL 2 BASIC12.63□□□□□ -0.39
Ttc39dQ0VF76 Fhit-201ENSMUST00000160340 1094 ntTSL 5 BASIC12.63□□□□□ -0.39
Ttc39dQ0VF76 Cdk3-ps-202ENSMUST00000174177 915 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.63□□□□□ -0.39
Ttc39dQ0VF76 Fhit-208ENSMUST00000179394 453 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.63□□□□□ -0.39
Ttc39dQ0VF76 Rhox5-201ENSMUST00000179626 633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.63□□□□□ -0.39
Ttc39dQ0VF76 A330069E16Rik-201ENSMUST00000181191 887 ntTSL 1 (best) BASIC12.63□□□□□ -0.39
Ttc39dQ0VF76 Gm19744-202ENSMUST00000186135 948 ntTSL 5 BASIC12.63□□□□□ -0.39
Ttc39dQ0VF76 Gm43403-202ENSMUST00000198830 370 ntTSL 3 BASIC12.63□□□□□ -0.39
Ttc39dQ0VF76 Gm3961-201ENSMUST00000204425 994 ntBASIC12.63□□□□□ -0.39
Ttc39dQ0VF76 0610033M10Rik-201ENSMUST00000204546 506 ntTSL 5 BASIC12.63□□□□□ -0.39
Ttc39dQ0VF76 C530044C16Rik-202ENSMUST00000205217 1239 ntTSL 1 (best) BASIC12.63□□□□□ -0.39
Ttc39dQ0VF76 Pxt1-201ENSMUST00000051526 710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.63□□□□□ -0.39
Ttc39dQ0VF76 Clec4b2-201ENSMUST00000088455 1174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.63□□□□□ -0.39
Ttc39dQ0VF76 Taldo1-204ENSMUST00000211654 1362 ntTSL 5 BASIC12.63□□□□□ -0.39
Ttc39dQ0VF76 Cc2d1a-202ENSMUST00000117424 3262 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.63□□□□□ -0.39
Ttc39dQ0VF76 Mfsd4b5-205ENSMUST00000170579 1554 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.63□□□□□ -0.39
Ttc39dQ0VF76 AC123619.2-202ENSMUST00000225097 1568 ntBASIC12.63□□□□□ -0.39
Ttc39dQ0VF76 Gse1-201ENSMUST00000034279 7127 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC12.63□□□□□ -0.39
Ttc39dQ0VF76 Tbc1d1-202ENSMUST00000101195 5432 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.63□□□□□ -0.39
Ttc39dQ0VF76 Gdap2-201ENSMUST00000029459 3008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.63□□□□□ -0.39
Ttc39dQ0VF76 Mfsd13b-201ENSMUST00000033166 1883 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.63□□□□□ -0.39
Ttc39dQ0VF76 Pou2f1-209ENSMUST00000160908 2591 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.63□□□□□ -0.39
Ttc39dQ0VF76 Brd3-210ENSMUST00000164296 2791 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC12.63□□□□□ -0.39
Ttc39dQ0VF76 Cgnl1-202ENSMUST00000121322 6541 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.62□□□□□ -0.39
Ttc39dQ0VF76 Wapl-202ENSMUST00000090027 4185 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.62□□□□□ -0.39
Ttc39dQ0VF76 Tex45-203ENSMUST00000161680 1526 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.62□□□□□ -0.39
Ttc39dQ0VF76 Otud7b-201ENSMUST00000035519 8043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.62□□□□□ -0.39
Ttc39dQ0VF76 Rad9b-201ENSMUST00000049009 1631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.62□□□□□ -0.39
Ttc39dQ0VF76 Gm45495-201ENSMUST00000200940 1700 ntBASIC12.62□□□□□ -0.39
Ttc39dQ0VF76 Zfp112-204ENSMUST00000215113 2628 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.62□□□□□ -0.39
Ttc39dQ0VF76 Gm28373-201ENSMUST00000178129 2724 ntTSL 2 BASIC12.62□□□□□ -0.39
Ttc39dQ0VF76 Mylk-201ENSMUST00000023538 7824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.62□□□□□ -0.39
Ttc39dQ0VF76 Runx1-201ENSMUST00000023673 5861 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.62□□□□□ -0.39
Ttc39dQ0VF76 Ibsp-201ENSMUST00000031246 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.62□□□□□ -0.39
Ttc39dQ0VF76 Gm28719-201ENSMUST00000187779 1757 ntBASIC12.62□□□□□ -0.39
Ttc39dQ0VF76 Gm43807-201ENSMUST00000200678 1781 ntBASIC12.62□□□□□ -0.39
Ttc39dQ0VF76 Hnrnpa2b1-202ENSMUST00000090002 1662 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC12.62□□□□□ -0.39
Ttc39dQ0VF76 Tmem219-203ENSMUST00000120007 1087 ntTSL 1 (best) BASIC12.62□□□□□ -0.39
Ttc39dQ0VF76 1700003G18Rik-201ENSMUST00000140689 633 ntTSL 1 (best) BASIC12.62□□□□□ -0.39
Ttc39dQ0VF76 Gm15276-201ENSMUST00000145953 498 ntBASIC12.62□□□□□ -0.39
Ttc39dQ0VF76 Gm45711-202ENSMUST00000164175 979 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.62□□□□□ -0.39
Ttc39dQ0VF76 Gm38341-201ENSMUST00000195357 515 ntBASIC12.62□□□□□ -0.39
Ttc39dQ0VF76 Gm44364-201ENSMUST00000198368 141 ntBASIC12.62□□□□□ -0.39
Ttc39dQ0VF76 Gm43630-201ENSMUST00000201550 776 ntBASIC12.62□□□□□ -0.39
Ttc39dQ0VF76 AC025913.2-202ENSMUST00000219248 605 ntTSL 5 BASIC12.62□□□□□ -0.39
Ttc39dQ0VF76 AC123665.1-201ENSMUST00000228204 438 ntBASIC12.62□□□□□ -0.39
Ttc39dQ0VF76 Lce3d-201ENSMUST00000059053 491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.62□□□□□ -0.39
Ttc39dQ0VF76 Tas2r137-201ENSMUST00000064932 1073 ntAPPRIS P1 BASIC12.62□□□□□ -0.39
Ttc39dQ0VF76 Cbx1-202ENSMUST00000079702 912 ntTSL 1 (best) BASIC12.62□□□□□ -0.39
Ttc39dQ0VF76 Mirlet7c-2-201ENSMUST00000083674 95 ntBASIC12.62□□□□□ -0.39
Ttc39dQ0VF76 Pnpla6-202ENSMUST00000111070 4496 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.62□□□□□ -0.39
Ttc39dQ0VF76 Prss43-201ENSMUST00000077549 2327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.62□□□□□ -0.39
Ttc39dQ0VF76 Zfp423-201ENSMUST00000052250 4510 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.62□□□□□ -0.39
Ttc39dQ0VF76 Gfra1-203ENSMUST00000129100 4415 ntTSL 1 (best) BASIC12.62□□□□□ -0.39
Ttc39dQ0VF76 Psmc3-201ENSMUST00000002171 1819 ntTSL 1 (best) BASIC12.62□□□□□ -0.39
Ttc39dQ0VF76 Tmem230-203ENSMUST00000110164 2957 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.62□□□□□ -0.39
Ttc39dQ0VF76 Cyth3-202ENSMUST00000116456 3738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.62□□□□□ -0.39
Ttc39dQ0VF76 Pga5-201ENSMUST00000025647 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.62□□□□□ -0.39
Ttc39dQ0VF76 Zfp512-208ENSMUST00000202244 3045 ntTSL 1 (best) BASIC12.62□□□□□ -0.39
Ttc39dQ0VF76 Paqr5-201ENSMUST00000034817 3566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.61□□□□□ -0.39
Ttc39dQ0VF76 Tcf4-252ENSMUST00000202477 1873 ntTSL 5 BASIC12.61□□□□□ -0.39
Ttc39dQ0VF76 Gm29480-201ENSMUST00000188589 1655 ntTSL 1 (best) BASIC12.61□□□□□ -0.39
Ttc39dQ0VF76 Maats1-201ENSMUST00000023501 2750 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.61□□□□□ -0.39
Ttc39dQ0VF76 Plxnb2-201ENSMUST00000060808 6394 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.61□□□□□ -0.39
Ttc39dQ0VF76 Mark4-201ENSMUST00000085715 3886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.61□□□□□ -0.39
Ttc39dQ0VF76 Rabgef1-203ENSMUST00000119797 2690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.61□□□□□ -0.39
Ttc39dQ0VF76 Nudt15-201ENSMUST00000043813 3579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.61□□□□□ -0.39
Ttc39dQ0VF76 Mon1b-202ENSMUST00000179926 3470 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.61□□□□□ -0.39
Ttc39dQ0VF76 Ttc7-202ENSMUST00000125875 3917 ntTSL 2 BASIC12.61□□□□□ -0.39
Ttc39dQ0VF76 Gatb-202ENSMUST00000107672 1820 ntTSL 1 (best) BASIC12.61□□□□□ -0.39
Ttc39dQ0VF76 Adgrg5-201ENSMUST00000074570 2802 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.61□□□□□ -0.39
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 59.8 ms