Protein–RNA interactions for Protein: Q0P547

Vmn1r181, Vomeronasal type-1 receptor, mousemouse

Predictions only

Length 304 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Vmn1r181Q0P547 Amz2-203ENSMUST00000103061 1832 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.1□□□□□ -0.79
Vmn1r181Q0P547 Stra6-202ENSMUST00000085677 2725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.1□□□□□ -0.79
Vmn1r181Q0P547 Cacna1c-212ENSMUST00000187940 7507 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.1□□□□□ -0.79
Vmn1r181Q0P547 Slc19a1-209ENSMUST00000144234 2309 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.1□□□□□ -0.79
Vmn1r181Q0P547 Rapgef2-206ENSMUST00000195708 6964 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.1□□□□□ -0.79
Vmn1r181Q0P547 Coa5-201ENSMUST00000027286 3863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.1□□□□□ -0.79
Vmn1r181Q0P547 Cxcr5-202ENSMUST00000179828 2824 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.1□□□□□ -0.79
Vmn1r181Q0P547 Gm26857-201ENSMUST00000181580 3347 ntTSL 5 BASIC10.1□□□□□ -0.79
Vmn1r181Q0P547 Sowahc-201ENSMUST00000182161 4482 ntAPPRIS P1 BASIC10.1□□□□□ -0.79
Vmn1r181Q0P547 Gm22018-201ENSMUST00000104357 131 ntBASIC10.1□□□□□ -0.79
Vmn1r181Q0P547 Mrpl55-203ENSMUST00000108785 792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.1□□□□□ -0.79
Vmn1r181Q0P547 Pigp-205ENSMUST00000113917 805 ntTSL 1 (best) BASIC10.1□□□□□ -0.79
Vmn1r181Q0P547 Mia-202ENSMUST00000121848 572 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.1□□□□□ -0.79
Vmn1r181Q0P547 4930515B02Rik-201ENSMUST00000140588 591 ntTSL 1 (best) BASIC10.1□□□□□ -0.79
Vmn1r181Q0P547 Gm27514-201ENSMUST00000183692 110 ntBASIC10.1□□□□□ -0.79
Vmn1r181Q0P547 Mocs2-215ENSMUST00000184335 646 ntTSL 5 BASIC10.1□□□□□ -0.79
Vmn1r181Q0P547 Wfdc1-202ENSMUST00000212901 921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.1□□□□□ -0.79
Vmn1r181Q0P547 Polr2h-201ENSMUST00000021405 950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.1□□□□□ -0.79
Vmn1r181Q0P547 CU024892.2-201ENSMUST00000224608 832 ntBASIC10.1□□□□□ -0.79
Vmn1r181Q0P547 4930442H23Rik-201ENSMUST00000056086 1245 ntAPPRIS P1 BASIC10.1□□□□□ -0.79
Vmn1r181Q0P547 Snap23-201ENSMUST00000028743 2658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.1□□□□□ -0.79
Vmn1r181Q0P547 Rims2-202ENSMUST00000082054 4800 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC10.1□□□□□ -0.79
Vmn1r181Q0P547 Apbb1-201ENSMUST00000081165 2530 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC10.1□□□□□ -0.79
Vmn1r181Q0P547 Lsamp-208ENSMUST00000189358 2766 ntTSL 5 BASIC10.1□□□□□ -0.79
Vmn1r181Q0P547 Dmp1-201ENSMUST00000066708 2764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.1□□□□□ -0.79
Vmn1r181Q0P547 Plod3-201ENSMUST00000004968 3280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.1□□□□□ -0.79
Vmn1r181Q0P547 Acsl1-202ENSMUST00000110371 2100 ntTSL 5 BASIC10.1□□□□□ -0.79
Vmn1r181Q0P547 Gm3836-201ENSMUST00000211377 1613 ntBASIC10.1□□□□□ -0.79
Vmn1r181Q0P547 4921522P10Rik-201ENSMUST00000048606 2101 ntTSL 1 (best) BASIC10.1□□□□□ -0.79
Vmn1r181Q0P547 Rnf214-208ENSMUST00000161187 2847 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.1□□□□□ -0.79
Vmn1r181Q0P547 Abat-201ENSMUST00000065987 4636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.1□□□□□ -0.79
Vmn1r181Q0P547 4930520O04Rik-202ENSMUST00000131898 2660 ntTSL 1 (best) BASIC10.1□□□□□ -0.79
Vmn1r181Q0P547 Sec23a-201ENSMUST00000021375 4109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.09□□□□□ -0.79
Vmn1r181Q0P547 Rps6kb1-202ENSMUST00000058286 3250 ntTSL 1 (best) BASIC10.09□□□□□ -0.79
Vmn1r181Q0P547 Nr4a2-202ENSMUST00000112627 2400 ntTSL 5 BASIC10.09□□□□□ -0.79
Vmn1r181Q0P547 Aicda-201ENSMUST00000043301 2405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.09□□□□□ -0.79
Vmn1r181Q0P547 Gemin2-201ENSMUST00000021379 1588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.09□□□□□ -0.79
Vmn1r181Q0P547 Pars2-202ENSMUST00000106781 3046 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.09□□□□□ -0.79
Vmn1r181Q0P547 Tshr-201ENSMUST00000021343 1339 ntTSL 1 (best) BASIC10.09□□□□□ -0.79
Vmn1r181Q0P547 D330041H03Rik-205ENSMUST00000181014 1903 ntTSL 1 (best) BASIC10.09□□□□□ -0.79
Vmn1r181Q0P547 Pag1-201ENSMUST00000108384 3729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.09□□□□□ -0.79
Vmn1r181Q0P547 4931415C17Rik-202ENSMUST00000131064 2255 ntTSL 1 (best) BASIC10.09□□□□□ -0.79
Vmn1r181Q0P547 Wdr4-207ENSMUST00000171171 4153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.09□□□□□ -0.79
Vmn1r181Q0P547 Vax2os-201ENSMUST00000123402 1435 ntTSL 5 BASIC10.09□□□□□ -0.79
Vmn1r181Q0P547 Rbm4b-201ENSMUST00000036744 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.09□□□□□ -0.79
Vmn1r181Q0P547 Sertm1-201ENSMUST00000070342 3083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.09□□□□□ -0.79
Vmn1r181Q0P547 Trim11-202ENSMUST00000108809 3522 ntTSL 1 (best) BASIC10.09□□□□□ -0.79
Vmn1r181Q0P547 Asap3-201ENSMUST00000047526 4225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.09□□□□□ -0.79
Vmn1r181Q0P547 Metap2-208ENSMUST00000181091 1876 ntTSL 1 (best) BASIC10.09□□□□□ -0.79
Vmn1r181Q0P547 Vps25-204ENSMUST00000107280 876 ntTSL 2 BASIC10.09□□□□□ -0.79
Vmn1r181Q0P547 Leng8-202ENSMUST00000117274 874 ntTSL 1 (best) BASIC10.09□□□□□ -0.79
Vmn1r181Q0P547 Gm12329-201ENSMUST00000120829 1007 ntBASIC10.09□□□□□ -0.79
Vmn1r181Q0P547 Gm14441-201ENSMUST00000121960 540 ntBASIC10.09□□□□□ -0.79
Vmn1r181Q0P547 Gm17227-202ENSMUST00000170286 1016 ntTSL 1 (best) BASIC10.09□□□□□ -0.79
Vmn1r181Q0P547 Gm27017-201ENSMUST00000183031 656 ntTSL 3 BASIC10.09□□□□□ -0.79
Vmn1r181Q0P547 Gm28192-201ENSMUST00000189381 778 ntTSL 5 BASIC10.09□□□□□ -0.79
Vmn1r181Q0P547 Gm37748-201ENSMUST00000194379 1140 ntBASIC10.09□□□□□ -0.79
Vmn1r181Q0P547 Gm38158-201ENSMUST00000194617 339 ntBASIC10.09□□□□□ -0.79
Vmn1r181Q0P547 Gm42627-201ENSMUST00000197347 224 ntBASIC10.09□□□□□ -0.79
Vmn1r181Q0P547 Zfp787-205ENSMUST00000207957 880 ntTSL 5 BASIC10.09□□□□□ -0.79
Vmn1r181Q0P547 Gm19994-201ENSMUST00000217086 586 ntBASIC10.09□□□□□ -0.79
Vmn1r181Q0P547 Rps21-201ENSMUST00000059080 394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.09□□□□□ -0.79
Vmn1r181Q0P547 Alkbh6-201ENSMUST00000060834 982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.09□□□□□ -0.79
Vmn1r181Q0P547 Krtap19-9a-201ENSMUST00000062005 168 ntAPPRIS P1 BASIC10.09□□□□□ -0.79
Vmn1r181Q0P547 Prune1-201ENSMUST00000015855 3140 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.09□□□□□ -0.79
Vmn1r181Q0P547 Kifc2-201ENSMUST00000004294 3143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.09□□□□□ -0.79
Vmn1r181Q0P547 Trpc7-207ENSMUST00000173817 2406 ntTSL 5 BASIC10.09□□□□□ -0.79
Vmn1r181Q0P547 Tgm2-201ENSMUST00000103122 3596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.09□□□□□ -0.79
Vmn1r181Q0P547 Adcyap1-201ENSMUST00000064775 2088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.09□□□□□ -0.79
Vmn1r181Q0P547 Robo3-201ENSMUST00000034643 4712 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.09□□□□□ -0.79
Vmn1r181Q0P547 Aff3-203ENSMUST00000095027 5857 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.09□□□□□ -0.79
Vmn1r181Q0P547 Trim35-201ENSMUST00000022623 3678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.09□□□□□ -0.79
Vmn1r181Q0P547 Tpcn2-201ENSMUST00000058022 2993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.09□□□□□ -0.79
Vmn1r181Q0P547 Ndc1-204ENSMUST00000139560 4584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.09□□□□□ -0.79
Vmn1r181Q0P547 Olfr140-202ENSMUST00000111506 3449 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.09□□□□□ -0.79
Vmn1r181Q0P547 Katnal2-207ENSMUST00000137354 1482 ntTSL 5 BASIC10.09□□□□□ -0.79
Vmn1r181Q0P547 Bin2-205ENSMUST00000182814 1901 ntTSL 5 BASIC10.09□□□□□ -0.79
Vmn1r181Q0P547 Plin4-201ENSMUST00000002908 5755 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.09□□□□□ -0.79
Vmn1r181Q0P547 F10-201ENSMUST00000033821 1903 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.09□□□□□ -0.79
Vmn1r181Q0P547 Wdr59-202ENSMUST00000038193 5083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.09□□□□□ -0.79
Vmn1r181Q0P547 Dusp14-201ENSMUST00000018792 1571 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.09□□□□□ -0.79
Vmn1r181Q0P547 Smndc1-201ENSMUST00000025997 2125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.09□□□□□ -0.79
Vmn1r181Q0P547 Ndufs4-201ENSMUST00000022286 1698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.09□□□□□ -0.79
Vmn1r181Q0P547 Mmel1-203ENSMUST00000105634 2669 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.09□□□□□ -0.79
Vmn1r181Q0P547 Sugp1-201ENSMUST00000011450 2681 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.09□□□□□ -0.79
Vmn1r181Q0P547 Slc7a3-201ENSMUST00000073927 2232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.09□□□□□ -0.79
Vmn1r181Q0P547 Crybg2-201ENSMUST00000121391 4761 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.09□□□□□ -0.79
Vmn1r181Q0P547 Dgcr8-201ENSMUST00000009321 4320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.09□□□□□ -0.79
Vmn1r181Q0P547 Sdr9c7-201ENSMUST00000047134 2868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.08□□□□□ -0.8
Vmn1r181Q0P547 Zfp689-201ENSMUST00000053392 3621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.08□□□□□ -0.8
Vmn1r181Q0P547 Maml3-201ENSMUST00000118075 5450 ntTSL 1 (best) BASIC10.08□□□□□ -0.8
Vmn1r181Q0P547 Gm44579-201ENSMUST00000142443 2064 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.08□□□□□ -0.8
Vmn1r181Q0P547 Tifa-203ENSMUST00000164447 1538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.08□□□□□ -0.8
Vmn1r181Q0P547 AC126257.1-201ENSMUST00000213195 1536 ntBASIC10.08□□□□□ -0.8
Vmn1r181Q0P547 Syt7-202ENSMUST00000076968 6624 ntTSL 1 (best) BASIC10.08□□□□□ -0.8
Vmn1r181Q0P547 4931428F04Rik-201ENSMUST00000014981 3492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.08□□□□□ -0.8
Vmn1r181Q0P547 Eef1d-205ENSMUST00000109972 1624 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.08□□□□□ -0.8
Vmn1r181Q0P547 Dab2ip-201ENSMUST00000065001 6392 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.08□□□□□ -0.8
Vmn1r181Q0P547 Gm13093-201ENSMUST00000126212 2485 ntTSL 1 (best) BASIC10.08□□□□□ -0.8
Vmn1r181Q0P547 Olfr1344-202ENSMUST00000218906 2590 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.08□□□□□ -0.8
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 39.6 ms