Protein–RNA interactions for Protein: Q08624

Hoxc4, Homeobox protein Hox-C4, mousemouse

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Length 264 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Hoxc4Q08624 Gm19744-202ENSMUST00000186135 948 ntTSL 5 BASIC11.5□□□□□ -0.57
Hoxc4Q08624 Stpg4-202ENSMUST00000186211 591 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.5□□□□□ -0.57
Hoxc4Q08624 Gm9136-201ENSMUST00000193368 454 ntBASIC11.5□□□□□ -0.57
Hoxc4Q08624 3110080O07Rik-201ENSMUST00000193469 1021 ntBASIC11.5□□□□□ -0.57
Hoxc4Q08624 Gm5982-201ENSMUST00000196234 512 ntBASIC11.5□□□□□ -0.57
Hoxc4Q08624 Gm45113-201ENSMUST00000207518 165 ntBASIC11.5□□□□□ -0.57
Hoxc4Q08624 Gm45550-201ENSMUST00000209380 946 ntBASIC11.5□□□□□ -0.57
Hoxc4Q08624 2010001M07Rik-201ENSMUST00000214235 364 ntTSL 1 (best) BASIC11.5□□□□□ -0.57
Hoxc4Q08624 9430078K24Rik-201ENSMUST00000218818 1082 ntTSL 1 (best) BASIC11.5□□□□□ -0.57
Hoxc4Q08624 Rpl10a-201ENSMUST00000042334 829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.5□□□□□ -0.57
Hoxc4Q08624 Poc1a-201ENSMUST00000072206 2337 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.5□□□□□ -0.57
Hoxc4Q08624 Tacc3-202ENSMUST00000079534 2899 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.5□□□□□ -0.57
Hoxc4Q08624 Acin1-208ENSMUST00000126166 2369 ntTSL 1 (best) BASIC11.5□□□□□ -0.57
Hoxc4Q08624 Gm9387-201ENSMUST00000098624 1320 ntBASIC11.5□□□□□ -0.57
Hoxc4Q08624 Maged2-202ENSMUST00000112697 1851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.5□□□□□ -0.57
Hoxc4Q08624 Afdn-216ENSMUST00000170827 7338 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.5□□□□□ -0.57
Hoxc4Q08624 Drc1-201ENSMUST00000101448 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.5□□□□□ -0.57
Hoxc4Q08624 Gsdmcl2-203ENSMUST00000185431 1911 ntBASIC11.5□□□□□ -0.57
Hoxc4Q08624 Plagl1-202ENSMUST00000121646 5260 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.5□□□□□ -0.57
Hoxc4Q08624 Cyp8b1-201ENSMUST00000062474 1950 ntAPPRIS P1 BASIC11.5□□□□□ -0.57
Hoxc4Q08624 Ap1g2-211ENSMUST00000170285 2596 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.5□□□□□ -0.57
Hoxc4Q08624 Zfp108-203ENSMUST00000206777 2562 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.5□□□□□ -0.57
Hoxc4Q08624 Fam49b-201ENSMUST00000063838 3797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.5□□□□□ -0.57
Hoxc4Q08624 Gm44999-201ENSMUST00000207456 1493 ntBASIC11.5□□□□□ -0.57
Hoxc4Q08624 Sema3d-201ENSMUST00000030868 6307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.5□□□□□ -0.57
Hoxc4Q08624 Plagl1-201ENSMUST00000121325 3946 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.5□□□□□ -0.57
Hoxc4Q08624 Gm28373-201ENSMUST00000178129 2724 ntTSL 2 BASIC11.5□□□□□ -0.57
Hoxc4Q08624 Vcl-201ENSMUST00000022369 5267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.5□□□□□ -0.57
Hoxc4Q08624 Slc22a15-201ENSMUST00000106928 6573 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.5□□□□□ -0.57
Hoxc4Q08624 Slc29a1-209ENSMUST00000166119 1598 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.5□□□□□ -0.57
Hoxc4Q08624 6230400D17Rik-201ENSMUST00000180987 1554 ntTSL 1 (best) BASIC11.5□□□□□ -0.57
Hoxc4Q08624 Trpc2-201ENSMUST00000124189 2874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.5□□□□□ -0.57
Hoxc4Q08624 Rtl5-204ENSMUST00000188731 4325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.49□□□□□ -0.57
Hoxc4Q08624 Sv2a-201ENSMUST00000035371 4334 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.49□□□□□ -0.57
Hoxc4Q08624 Tecpr1-201ENSMUST00000085701 5106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.49□□□□□ -0.57
Hoxc4Q08624 Top2b-201ENSMUST00000017629 10335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.49□□□□□ -0.57
Hoxc4Q08624 Fig4-201ENSMUST00000043814 3282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.49□□□□□ -0.57
Hoxc4Q08624 Chrdl1-204ENSMUST00000166406 2605 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.49□□□□□ -0.57
Hoxc4Q08624 Slc6a9-210ENSMUST00000169885 1876 ntTSL 5 BASIC11.49□□□□□ -0.57
Hoxc4Q08624 Ptpru-201ENSMUST00000030741 4416 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.49□□□□□ -0.57
Hoxc4Q08624 Calcoco1-201ENSMUST00000023818 2822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.49□□□□□ -0.57
Hoxc4Q08624 Olfr1258-202ENSMUST00000111516 936 ntAPPRIS P1 BASIC11.49□□□□□ -0.57
Hoxc4Q08624 Gm13328-201ENSMUST00000120816 1020 ntBASIC11.49□□□□□ -0.57
Hoxc4Q08624 Gm15972-201ENSMUST00000132571 418 ntTSL 2 BASIC11.49□□□□□ -0.57
Hoxc4Q08624 Ly6g6e-201ENSMUST00000013910 1142 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.49□□□□□ -0.57
Hoxc4Q08624 1810020O05Rik-201ENSMUST00000162547 1047 ntTSL 1 (best) BASIC11.49□□□□□ -0.57
Hoxc4Q08624 Gm3150-201ENSMUST00000166418 204 ntBASIC11.49□□□□□ -0.57
Hoxc4Q08624 Mrpl23-ps1-201ENSMUST00000173086 580 ntBASIC11.49□□□□□ -0.57
Hoxc4Q08624 Ager-207ENSMUST00000173992 1248 ntTSL 1 (best) BASIC11.49□□□□□ -0.57
Hoxc4Q08624 Ccl19-ps3-201ENSMUST00000179634 324 ntBASIC11.49□□□□□ -0.57
Hoxc4Q08624 Gm12407-201ENSMUST00000180219 324 ntBASIC11.49□□□□□ -0.57
Hoxc4Q08624 Kdm4dl-201ENSMUST00000184843 1187 ntBASIC11.49□□□□□ -0.57
Hoxc4Q08624 Gm28262-201ENSMUST00000185463 477 ntTSL 5 BASIC11.49□□□□□ -0.57
Hoxc4Q08624 1700029J03Rik-201ENSMUST00000185803 789 ntTSL 1 (best) BASIC11.49□□□□□ -0.57
Hoxc4Q08624 Ighv5-11-201ENSMUST00000193354 371 ntBASIC11.49□□□□□ -0.57
Hoxc4Q08624 Ighv6-7-201ENSMUST00000193397 357 ntAPPRIS P1 BASIC11.49□□□□□ -0.57
Hoxc4Q08624 A430050A11Rik-201ENSMUST00000195348 646 ntBASIC11.49□□□□□ -0.57
Hoxc4Q08624 Gm5051-201ENSMUST00000204085 485 ntBASIC11.49□□□□□ -0.57
Hoxc4Q08624 Gm2511-202ENSMUST00000206158 455 ntTSL 1 (best) BASIC11.49□□□□□ -0.57
Hoxc4Q08624 Colca2-202ENSMUST00000215038 1269 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.49□□□□□ -0.57
Hoxc4Q08624 Gm29787-201ENSMUST00000222129 849 ntBASIC11.49□□□□□ -0.57
Hoxc4Q08624 AC134869.4-202ENSMUST00000224350 837 ntBASIC11.49□□□□□ -0.57
Hoxc4Q08624 Cryab-201ENSMUST00000034562 946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.49□□□□□ -0.57
Hoxc4Q08624 Phxr2-201ENSMUST00000060761 1159 ntAPPRIS P1 BASIC11.49□□□□□ -0.57
Hoxc4Q08624 Clec4b1-202ENSMUST00000078559 748 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.49□□□□□ -0.57
Hoxc4Q08624 Gm21998-201ENSMUST00000117552 1308 ntBASIC11.49□□□□□ -0.57
Hoxc4Q08624 Myzap-201ENSMUST00000093823 2283 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.49□□□□□ -0.57
Hoxc4Q08624 Gm5136-201ENSMUST00000218023 1397 ntAPPRIS P1 BASIC11.49□□□□□ -0.57
Hoxc4Q08624 Fcna-201ENSMUST00000028307 1374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.49□□□□□ -0.57
Hoxc4Q08624 Ism2-201ENSMUST00000051601 1350 ntTSL 5 BASIC11.49□□□□□ -0.57
Hoxc4Q08624 Hhipl2-202ENSMUST00000192527 2310 ntTSL 1 (best) BASIC11.49□□□□□ -0.57
Hoxc4Q08624 Rnf183-203ENSMUST00000107455 1432 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC11.49□□□□□ -0.57
Hoxc4Q08624 Psd-210ENSMUST00000225323 3398 ntAPPRIS ALT2 BASIC11.49□□□□□ -0.57
Hoxc4Q08624 Slc13a2-201ENSMUST00000001122 2412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.49□□□□□ -0.57
Hoxc4Q08624 Gm31518-201ENSMUST00000211925 2548 ntTSL 5 BASIC11.49□□□□□ -0.57
Hoxc4Q08624 Strada-202ENSMUST00000103072 1517 ntTSL 1 (best) BASIC11.49□□□□□ -0.57
Hoxc4Q08624 Rfx1-204ENSMUST00000211046 3677 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.49□□□□□ -0.57
Hoxc4Q08624 9230110C19Rik-201ENSMUST00000065291 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.49□□□□□ -0.57
Hoxc4Q08624 Ckmt1-201ENSMUST00000000317 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.49□□□□□ -0.57
Hoxc4Q08624 1110059E24Rik-201ENSMUST00000038830 1614 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.49□□□□□ -0.57
Hoxc4Q08624 Pgbd5-203ENSMUST00000136892 1739 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.49□□□□□ -0.57
Hoxc4Q08624 Tgm1-202ENSMUST00000168729 2852 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.49□□□□□ -0.57
Hoxc4Q08624 Utp23-203ENSMUST00000137116 2921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.49□□□□□ -0.57
Hoxc4Q08624 AC138329.2-201ENSMUST00000225579 1842 ntBASIC11.49□□□□□ -0.57
Hoxc4Q08624 Nrp2-204ENSMUST00000102822 6708 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.49□□□□□ -0.57
Hoxc4Q08624 Sppl2a-201ENSMUST00000028844 5616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.49□□□□□ -0.57
Hoxc4Q08624 Lrrc20-201ENSMUST00000049242 3216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.48□□□□□ -0.57
Hoxc4Q08624 Slc25a25-201ENSMUST00000028160 3294 ntTSL 1 (best) BASIC11.48□□□□□ -0.57
Hoxc4Q08624 5033428I22Rik-201ENSMUST00000181638 2040 ntTSL 1 (best) BASIC11.48□□□□□ -0.57
Hoxc4Q08624 Hars2-201ENSMUST00000019287 2002 ntTSL 1 (best) BASIC11.48□□□□□ -0.57
Hoxc4Q08624 Cecr2-202ENSMUST00000112686 9212 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.48□□□□□ -0.57
Hoxc4Q08624 Magi1-206ENSMUST00000203688 4969 ntTSL 1 (best) BASIC11.48□□□□□ -0.57
Hoxc4Q08624 Ubqln1-202ENSMUST00000076454 3561 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.48□□□□□ -0.57
Hoxc4Q08624 Eif4enif1-213ENSMUST00000179770 3676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.48□□□□□ -0.57
Hoxc4Q08624 A830082K12Rik-201ENSMUST00000123998 2203 ntTSL 1 (best) BASIC11.48□□□□□ -0.57
Hoxc4Q08624 Pitpnm2-205ENSMUST00000161273 6792 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.48□□□□□ -0.57
Hoxc4Q08624 Slc19a1-209ENSMUST00000144234 2309 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.48□□□□□ -0.57
Hoxc4Q08624 Rbm48-201ENSMUST00000042753 2368 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.48□□□□□ -0.57
Hoxc4Q08624 Atp6v0a1-210ENSMUST00000168757 3967 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC11.48□□□□□ -0.57
Hoxc4Q08624 Fgfr3-209ENSMUST00000164207 4150 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.48□□□□□ -0.57
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