Protein–RNA interactions for Protein: Q02853

Mmp11, Stromelysin-3, mousemouse

Predictions only

Length 492 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Mmp11Q02853 Adm2-201ENSMUST00000066991 1043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Mmp11Q02853 Rps15-202ENSMUST00000068408 500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Mmp11Q02853 Cbx3-ps1-201ENSMUST00000091539 545 ntBASIC11.64□□□□□ -0.55
Mmp11Q02853 Adck2-204ENSMUST00000140364 3542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Mmp11Q02853 Tcf4-251ENSMUST00000202474 1810 ntTSL 5 BASIC11.64□□□□□ -0.55
Mmp11Q02853 Spdye4a-201ENSMUST00000085733 1819 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Mmp11Q02853 Ikbip-201ENSMUST00000020149 3232 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Mmp11Q02853 Gm45902-202ENSMUST00000140494 2390 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.64□□□□□ -0.55
Mmp11Q02853 Rgs17-203ENSMUST00000117676 1651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Mmp11Q02853 P4ha1-203ENSMUST00000105466 2918 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Mmp11Q02853 Arid3b-209ENSMUST00000171444 4171 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.64□□□□□ -0.55
Mmp11Q02853 Adrb3-201ENSMUST00000081438 2795 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Mmp11Q02853 Fyn-206ENSMUST00000136659 1910 ntTSL 5 BASIC11.64□□□□□ -0.55
Mmp11Q02853 Plxdc1-201ENSMUST00000017561 2881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Mmp11Q02853 Nfatc2-209ENSMUST00000171689 2742 ntTSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Mmp11Q02853 3110062M04Rik-201ENSMUST00000055097 3681 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Mmp11Q02853 Ablim1-211ENSMUST00000111555 2562 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.64□□□□□ -0.55
Mmp11Q02853 Hspa4l-208ENSMUST00000204702 9479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Mmp11Q02853 AC127242.1-201ENSMUST00000222861 1464 ntTSL 3 BASIC11.63□□□□□ -0.55
Mmp11Q02853 Tmem266-202ENSMUST00000085754 4417 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Mmp11Q02853 Cyp4f40-201ENSMUST00000165061 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Mmp11Q02853 Mzf1-205ENSMUST00000182515 3340 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Mmp11Q02853 Prc1-206ENSMUST00000173824 2912 ntTSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Mmp11Q02853 Mip-201ENSMUST00000026455 2144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Mmp11Q02853 9330199G10Rik-202ENSMUST00000221607 1728 ntTSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Mmp11Q02853 AC173482.6-201ENSMUST00000225889 1741 ntBASIC11.63□□□□□ -0.55
Mmp11Q02853 Maats1-201ENSMUST00000023501 2750 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Mmp11Q02853 Slc35a4-202ENSMUST00000050476 2362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Mmp11Q02853 Nup62cl-201ENSMUST00000101212 1996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Mmp11Q02853 Osgin1-201ENSMUST00000098365 1959 ntTSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Mmp11Q02853 C130012C08Rik-201ENSMUST00000194287 3665 ntBASIC11.63□□□□□ -0.55
Mmp11Q02853 Dock11-201ENSMUST00000033419 6665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Mmp11Q02853 Taf1b-201ENSMUST00000075954 2209 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Mmp11Q02853 Rps6ka6-203ENSMUST00000096348 4151 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.63□□□□□ -0.55
Mmp11Q02853 Iba57-201ENSMUST00000054523 4021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Mmp11Q02853 Fut8-201ENSMUST00000062804 3358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Mmp11Q02853 Fen1-203ENSMUST00000142241 2152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Mmp11Q02853 Gm22133-201ENSMUST00000102082 109 ntBASIC11.63□□□□□ -0.55
Mmp11Q02853 Gm6890-201ENSMUST00000114117 776 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.63□□□□□ -0.55
Mmp11Q02853 Gm14130-201ENSMUST00000118417 987 ntBASIC11.63□□□□□ -0.55
Mmp11Q02853 Has2os-201ENSMUST00000125401 485 ntTSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Mmp11Q02853 Gm12395-201ENSMUST00000144765 536 ntTSL 5 BASIC11.63□□□□□ -0.55
Mmp11Q02853 Gm20442-201ENSMUST00000174630 492 ntTSL 3 BASIC11.63□□□□□ -0.55
Mmp11Q02853 Mymx-203ENSMUST00000178858 804 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Mmp11Q02853 Gm4819-201ENSMUST00000182170 1009 ntBASIC11.63□□□□□ -0.55
Mmp11Q02853 S100a3-205ENSMUST00000200508 587 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC11.63□□□□□ -0.55
Mmp11Q02853 Nmnat1-201ENSMUST00000030845 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Mmp11Q02853 Blvrb-201ENSMUST00000037399 1028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Mmp11Q02853 Cldn17-201ENSMUST00000069549 1172 ntAPPRIS P1 BASIC11.63□□□□□ -0.55
Mmp11Q02853 4930564D02Rik-201ENSMUST00000070584 737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Mmp11Q02853 Asb18-202ENSMUST00000097656 788 ntTSL 5 BASIC11.63□□□□□ -0.55
Mmp11Q02853 Tmcc3os-201ENSMUST00000146744 2912 ntTSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Mmp11Q02853 6030458C11Rik-204ENSMUST00000228177 3156 ntBASIC11.63□□□□□ -0.55
Mmp11Q02853 Cpa5-202ENSMUST00000115138 1778 ntTSL 5 BASIC11.63□□□□□ -0.55
Mmp11Q02853 Oscar-203ENSMUST00000148012 1796 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.63□□□□□ -0.55
Mmp11Q02853 Gm28719-201ENSMUST00000187779 1757 ntBASIC11.63□□□□□ -0.55
Mmp11Q02853 Rapgef2-201ENSMUST00000118100 6573 ntTSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Mmp11Q02853 4931415C17Rik-202ENSMUST00000131064 2255 ntTSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Mmp11Q02853 Gm42913-201ENSMUST00000197936 1853 ntBASIC11.63□□□□□ -0.55
Mmp11Q02853 Gm45871-202ENSMUST00000209969 1368 ntTSL 5 BASIC11.63□□□□□ -0.55
Mmp11Q02853 Txndc12-201ENSMUST00000030296 1359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Mmp11Q02853 Ckmt1-201ENSMUST00000000317 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Mmp11Q02853 Brdt-201ENSMUST00000031215 4745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Mmp11Q02853 Tinf2-201ENSMUST00000007733 2956 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Mmp11Q02853 Syt16-203ENSMUST00000221220 8156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Mmp11Q02853 Xkr6-202ENSMUST00000120820 1702 ntTSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Mmp11Q02853 Zfp639-201ENSMUST00000029203 1458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Mmp11Q02853 Vmn1r45-207ENSMUST00000228492 2849 ntBASIC11.63□□□□□ -0.55
Mmp11Q02853 Olfr648-202ENSMUST00000216612 2929 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.63□□□□□ -0.55
Mmp11Q02853 Tor3a-201ENSMUST00000079625 3285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
Mmp11Q02853 Agxt2-204ENSMUST00000110542 2198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
Mmp11Q02853 Psg23-201ENSMUST00000057810 2179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
Mmp11Q02853 Aldh4a1-201ENSMUST00000039818 3382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
Mmp11Q02853 Prkcg-201ENSMUST00000100301 3127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
Mmp11Q02853 Immt-202ENSMUST00000101301 2299 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
Mmp11Q02853 Sun2-201ENSMUST00000046259 3804 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
Mmp11Q02853 Rapgef3-204ENSMUST00000128775 3586 ntTSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
Mmp11Q02853 Nlrx1-202ENSMUST00000168499 3579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
Mmp11Q02853 Sypl-201ENSMUST00000020885 2019 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
Mmp11Q02853 Ttc7-202ENSMUST00000125875 3917 ntTSL 2 BASIC11.62□□□□□ -0.55
Mmp11Q02853 Plekhg2-202ENSMUST00000119990 4880 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
Mmp11Q02853 Dusp6-204ENSMUST00000220291 2359 ntTSL 5 BASIC11.62□□□□□ -0.55
Mmp11Q02853 Wdr31-201ENSMUST00000030087 1440 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
Mmp11Q02853 Rbm47-204ENSMUST00000113726 4703 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
Mmp11Q02853 Sstr2-203ENSMUST00000146390 2143 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.62□□□□□ -0.55
Mmp11Q02853 Lsg1-201ENSMUST00000117363 3180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
Mmp11Q02853 Arhgef3-204ENSMUST00000225949 3198 ntBASIC11.62□□□□□ -0.55
Mmp11Q02853 Cd300lf-202ENSMUST00000106561 1885 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
Mmp11Q02853 Ncapd3-201ENSMUST00000073127 5499 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.62□□□□□ -0.55
Mmp11Q02853 Gm20125-205ENSMUST00000208005 1979 ntTSL 5 BASIC11.62□□□□□ -0.55
Mmp11Q02853 Prps1-201ENSMUST00000033809 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
Mmp11Q02853 Gm26286-201ENSMUST00000104166 134 ntBASIC11.62□□□□□ -0.55
Mmp11Q02853 Rpl13-ps1-201ENSMUST00000121801 668 ntBASIC11.62□□□□□ -0.55
Mmp11Q02853 Gm15738-202ENSMUST00000140892 427 ntTSL 2 BASIC11.62□□□□□ -0.55
Mmp11Q02853 Rpl41-206ENSMUST00000177163 544 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
Mmp11Q02853 Gm27627-201ENSMUST00000183644 150 ntBASIC11.62□□□□□ -0.55
Mmp11Q02853 Nr1h2-ps-201ENSMUST00000183844 478 ntBASIC11.62□□□□□ -0.55
Mmp11Q02853 Gm37666-201ENSMUST00000194110 866 ntBASIC11.62□□□□□ -0.55
Mmp11Q02853 AC164612.1-201ENSMUST00000216699 517 ntTSL 5 BASIC11.62□□□□□ -0.55
Mmp11Q02853 Polr2d-201ENSMUST00000025106 956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 33.8 ms