Protein–RNA interactions for Protein: Q02650

Pax5, Paired box protein Pax-5, mousemouse

Predictions only

Length 391 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pax5Q02650 Gm13966-201ENSMUST00000148420 832 ntTSL 3 BASIC10.1□□□□□ -0.79
Pax5Q02650 Stard10-207ENSMUST00000173270 670 ntTSL 5 BASIC10.1□□□□□ -0.79
Pax5Q02650 BC023719-201ENSMUST00000174728 978 ntTSL 1 (best) BASIC10.1□□□□□ -0.79
Pax5Q02650 Crip2-202ENSMUST00000196015 772 ntTSL 3 BASIC10.1□□□□□ -0.79
Pax5Q02650 Gm39185-201ENSMUST00000212941 540 ntTSL 5 BASIC10.1□□□□□ -0.79
Pax5Q02650 Gm36756-203ENSMUST00000223029 1166 ntTSL 5 BASIC10.1□□□□□ -0.79
Pax5Q02650 Dhrs4-202ENSMUST00000226168 828 ntBASIC10.1□□□□□ -0.79
Pax5Q02650 Ddit3-201ENSMUST00000026475 890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.1□□□□□ -0.79
Pax5Q02650 4933434E20Rik-202ENSMUST00000029552 1080 ntTSL 1 (best) BASIC10.1□□□□□ -0.79
Pax5Q02650 Nr0b2-201ENSMUST00000042706 1132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.1□□□□□ -0.79
Pax5Q02650 Sdf4-202ENSMUST00000097734 973 ntTSL 1 (best) BASIC10.1□□□□□ -0.79
Pax5Q02650 Hsd3b6-202ENSMUST00000170847 1539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.1□□□□□ -0.79
Pax5Q02650 Rorc-204ENSMUST00000200009 1543 ntTSL 1 (best) BASIC10.1□□□□□ -0.79
Pax5Q02650 Arhgef3-204ENSMUST00000225949 3198 ntBASIC10.1□□□□□ -0.79
Pax5Q02650 Lcor-201ENSMUST00000067795 4810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.1□□□□□ -0.79
Pax5Q02650 Dip2a-201ENSMUST00000036033 6322 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.1□□□□□ -0.79
Pax5Q02650 Herpud1-201ENSMUST00000034220 1873 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.1□□□□□ -0.79
Pax5Q02650 Rnf6-201ENSMUST00000067837 2388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.1□□□□□ -0.79
Pax5Q02650 Rims2-202ENSMUST00000082054 4800 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC10.1□□□□□ -0.79
Pax5Q02650 Cysltr2-202ENSMUST00000169168 1744 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.1□□□□□ -0.79
Pax5Q02650 Exosc1-202ENSMUST00000112123 1499 ntTSL 1 (best) BASIC10.1□□□□□ -0.79
Pax5Q02650 Dnmt3l-202ENSMUST00000123940 1452 ntTSL 1 (best) BASIC10.1□□□□□ -0.79
Pax5Q02650 Togaram1-201ENSMUST00000066296 6372 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.1□□□□□ -0.79
Pax5Q02650 Gm5475-202ENSMUST00000148928 2320 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.1□□□□□ -0.79
Pax5Q02650 Ppm1g-201ENSMUST00000031032 2307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.1□□□□□ -0.79
Pax5Q02650 Calu-202ENSMUST00000090481 2670 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.1□□□□□ -0.79
Pax5Q02650 Cyp26b1-204ENSMUST00000204146 4495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.09□□□□□ -0.79
Pax5Q02650 Trpm7-202ENSMUST00000103224 7107 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.09□□□□□ -0.79
Pax5Q02650 4931406C07Rik-203ENSMUST00000180339 2756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.09□□□□□ -0.79
Pax5Q02650 Tubb2a-ps2-201ENSMUST00000221547 1339 ntBASIC10.09□□□□□ -0.79
Pax5Q02650 Gm14340-201ENSMUST00000148700 1913 ntTSL 1 (best) BASIC10.09□□□□□ -0.79
Pax5Q02650 Plin4-202ENSMUST00000190703 5756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.09□□□□□ -0.79
Pax5Q02650 Slc25a22-203ENSMUST00000106007 2546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.09□□□□□ -0.79
Pax5Q02650 Acad8-201ENSMUST00000060513 2859 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.09□□□□□ -0.79
Pax5Q02650 Hnrnpc-206ENSMUST00000227458 1683 ntAPPRIS ALT1 BASIC10.09□□□□□ -0.79
Pax5Q02650 Gfi1b-201ENSMUST00000028156 1681 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.09□□□□□ -0.79
Pax5Q02650 Papss1-201ENSMUST00000029666 2600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.09□□□□□ -0.79
Pax5Q02650 Dpm2-203ENSMUST00000140592 1412 ntTSL 5 BASIC10.09□□□□□ -0.79
Pax5Q02650 Lysmd1-201ENSMUST00000066386 2394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.09□□□□□ -0.79
Pax5Q02650 Ttc27-201ENSMUST00000024882 2820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.09□□□□□ -0.79
Pax5Q02650 Frmpd2-203ENSMUST00000208577 5192 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.09□□□□□ -0.79
Pax5Q02650 1500009C09Rik-201ENSMUST00000136948 1526 ntAPPRIS P5 TSL 3 BASIC10.09□□□□□ -0.79
Pax5Q02650 Tmppe-201ENSMUST00000111820 2921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.09□□□□□ -0.79
Pax5Q02650 Vmn1r45-206ENSMUST00000227977 3297 ntAPPRIS P1 BASIC10.09□□□□□ -0.79
Pax5Q02650 Lrrn1-201ENSMUST00000049285 3700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.09□□□□□ -0.79
Pax5Q02650 Gm12015-201ENSMUST00000117065 843 ntBASIC10.09□□□□□ -0.79
Pax5Q02650 Gm12957-201ENSMUST00000117835 377 ntBASIC10.09□□□□□ -0.79
Pax5Q02650 H2-M6-ps-201ENSMUST00000119193 1034 ntBASIC10.09□□□□□ -0.79
Pax5Q02650 Fuom-203ENSMUST00000121115 872 ntTSL 1 (best) BASIC10.09□□□□□ -0.79
Pax5Q02650 Gm13562-201ENSMUST00000125198 797 ntTSL 2 BASIC10.09□□□□□ -0.79
Pax5Q02650 C230066G23Rik-201ENSMUST00000150195 650 ntTSL 1 (best) BASIC10.09□□□□□ -0.79
Pax5Q02650 Gm13832-202ENSMUST00000151159 370 ntTSL 3 BASIC10.09□□□□□ -0.79
Pax5Q02650 Rprl1-201ENSMUST00000158050 327 ntBASIC10.09□□□□□ -0.79
Pax5Q02650 Mir7085-201ENSMUST00000184353 66 ntBASIC10.09□□□□□ -0.79
Pax5Q02650 Olfr1414-202ENSMUST00000189174 1159 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC10.09□□□□□ -0.79
Pax5Q02650 1700031P21Rik-203ENSMUST00000191400 466 ntTSL 3 BASIC10.09□□□□□ -0.79
Pax5Q02650 Gm21769-201ENSMUST00000211922 111 ntBASIC10.09□□□□□ -0.79
Pax5Q02650 Gm6013-201ENSMUST00000212264 699 ntBASIC10.09□□□□□ -0.79
Pax5Q02650 Gm45880-201ENSMUST00000213041 853 ntBASIC10.09□□□□□ -0.79
Pax5Q02650 Trappc4-206ENSMUST00000217163 1185 ntTSL 1 (best) BASIC10.09□□□□□ -0.79
Pax5Q02650 1700011B04Rik-203ENSMUST00000220654 1033 ntTSL 5 BASIC10.09□□□□□ -0.79
Pax5Q02650 AC158523.3-201ENSMUST00000220664 864 ntTSL 5 BASIC10.09□□□□□ -0.79
Pax5Q02650 1700011B04Rik-209ENSMUST00000221760 779 ntTSL 5 BASIC10.09□□□□□ -0.79
Pax5Q02650 AC154252.2-201ENSMUST00000223593 767 ntBASIC10.09□□□□□ -0.79
Pax5Q02650 Lgals1-201ENSMUST00000089377 800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.09□□□□□ -0.79
Pax5Q02650 Gjb2-201ENSMUST00000055698 2406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.09□□□□□ -0.79
Pax5Q02650 Ptpn11-201ENSMUST00000054547 5535 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.09□□□□□ -0.79
Pax5Q02650 Pgbd5-203ENSMUST00000136892 1739 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.09□□□□□ -0.79
Pax5Q02650 Pax7-202ENSMUST00000174681 1725 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC10.09□□□□□ -0.79
Pax5Q02650 Car14-201ENSMUST00000036181 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.09□□□□□ -0.79
Pax5Q02650 AC127597.1-201ENSMUST00000225697 5711 ntBASIC10.09□□□□□ -0.79
Pax5Q02650 Hps1-209ENSMUST00000162061 2608 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.09□□□□□ -0.79
Pax5Q02650 Pabpc4-203ENSMUST00000106241 3050 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC10.09□□□□□ -0.79
Pax5Q02650 Gm34425-201ENSMUST00000216269 3079 ntTSL 5 BASIC10.09□□□□□ -0.79
Pax5Q02650 3200001D21Rik-201ENSMUST00000221603 2283 ntTSL 1 (best) BASIC10.09□□□□□ -0.79
Pax5Q02650 Iqsec1-201ENSMUST00000101151 6490 ntTSL 5 BASIC10.09□□□□□ -0.79
Pax5Q02650 Pex1-201ENSMUST00000006061 4433 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.09□□□□□ -0.79
Pax5Q02650 Srp54b-202ENSMUST00000218879 3642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.09□□□□□ -0.79
Pax5Q02650 Frmd8-201ENSMUST00000025728 4504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.09□□□□□ -0.79
Pax5Q02650 Cacng5-201ENSMUST00000039071 3705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.09□□□□□ -0.79
Pax5Q02650 Rbm47-202ENSMUST00000094757 4643 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.09□□□□□ -0.79
Pax5Q02650 Ascc2-202ENSMUST00000109930 4844 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.09□□□□□ -0.79
Pax5Q02650 Fut1-201ENSMUST00000008605 2580 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.09□□□□□ -0.79
Pax5Q02650 Bbs1-201ENSMUST00000053506 5581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.09□□□□□ -0.79
Pax5Q02650 Ikzf4-204ENSMUST00000222067 2688 ntTSL 1 (best) BASIC10.09□□□□□ -0.79
Pax5Q02650 Adcyap1r1-201ENSMUST00000070736 3695 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC10.09□□□□□ -0.79
Pax5Q02650 Tyk2-203ENSMUST00000214454 4770 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.09□□□□□ -0.79
Pax5Q02650 Ptpn4-201ENSMUST00000064091 10874 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.09□□□□□ -0.79
Pax5Q02650 Alg12-201ENSMUST00000043087 1793 ntTSL 1 (best) BASIC10.09□□□□□ -0.79
Pax5Q02650 Lnx1-206ENSMUST00000121690 2302 ntTSL 1 (best) BASIC10.08□□□□□ -0.8
Pax5Q02650 Adgre5-203ENSMUST00000109802 2867 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.08□□□□□ -0.8
Pax5Q02650 Ccdc154-203ENSMUST00000182621 2402 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.08□□□□□ -0.8
Pax5Q02650 Myh10-203ENSMUST00000102611 7791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.08□□□□□ -0.8
Pax5Q02650 Gm43727-201ENSMUST00000198021 2647 ntBASIC10.08□□□□□ -0.8
Pax5Q02650 Ank2-221ENSMUST00000182994 2715 ntTSL 1 (best) BASIC10.08□□□□□ -0.8
Pax5Q02650 AC124433.1-202ENSMUST00000224762 1535 ntBASIC10.08□□□□□ -0.8
Pax5Q02650 Olfr222-203ENSMUST00000215339 2166 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.08□□□□□ -0.8
Pax5Q02650 Tnc-201ENSMUST00000030056 6833 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.08□□□□□ -0.8
Pax5Q02650 Pdyn-201ENSMUST00000028883 2386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.08□□□□□ -0.8
Pax5Q02650 Tollip-201ENSMUST00000001950 3788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.08□□□□□ -0.8
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 68.5 ms