Protein–RNA interactions for Protein: Q01727

Mc1r, Melanocyte-stimulating hormone receptor, mousemouse

Predictions only

Length 315 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Mc1rQ01727 Armcx1-205ENSMUST00000113199 2413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.07□□□□□ -0.48
Mc1rQ01727 Kcnv2-201ENSMUST00000056708 5108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.07□□□□□ -0.48
Mc1rQ01727 Osgin1-201ENSMUST00000098365 1959 ntTSL 1 (best) BASIC12.07□□□□□ -0.48
Mc1rQ01727 Tcf4-251ENSMUST00000202474 1810 ntTSL 5 BASIC12.07□□□□□ -0.48
Mc1rQ01727 Rgs17-203ENSMUST00000117676 1651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.06□□□□□ -0.48
Mc1rQ01727 Myo9b-202ENSMUST00000168839 7102 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.06□□□□□ -0.48
Mc1rQ01727 Rab11fip1-203ENSMUST00000209377 3769 ntTSL 5 BASIC12.06□□□□□ -0.48
Mc1rQ01727 Agxt2-204ENSMUST00000110542 2198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.06□□□□□ -0.48
Mc1rQ01727 Cpsf7-201ENSMUST00000038379 3604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.06□□□□□ -0.48
Mc1rQ01727 Slc39a14-202ENSMUST00000068044 4926 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC12.06□□□□□ -0.48
Mc1rQ01727 4933411K16Rik-201ENSMUST00000164518 1380 ntAPPRIS P1 BASIC12.06□□□□□ -0.48
Mc1rQ01727 Txndc12-201ENSMUST00000030296 1359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.06□□□□□ -0.48
Mc1rQ01727 Cyp4f40-201ENSMUST00000165061 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.06□□□□□ -0.48
Mc1rQ01727 Spast-201ENSMUST00000024869 4672 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.06□□□□□ -0.48
Mc1rQ01727 Rab11fip3-203ENSMUST00000122103 5015 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC12.06□□□□□ -0.48
Mc1rQ01727 Myh6-205ENSMUST00000226297 6008 ntAPPRIS P1 BASIC12.06□□□□□ -0.48
Mc1rQ01727 Pla2g15-204ENSMUST00000212963 2578 ntTSL 1 (best) BASIC12.06□□□□□ -0.48
Mc1rQ01727 Fyn-206ENSMUST00000136659 1910 ntTSL 5 BASIC12.06□□□□□ -0.48
Mc1rQ01727 Slc7a4-207ENSMUST00000172164 3281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.06□□□□□ -0.48
Mc1rQ01727 Maats1-201ENSMUST00000023501 2750 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.06□□□□□ -0.48
Mc1rQ01727 Cpa5-202ENSMUST00000115138 1778 ntTSL 5 BASIC12.06□□□□□ -0.48
Mc1rQ01727 Gm28719-201ENSMUST00000187779 1757 ntBASIC12.06□□□□□ -0.48
Mc1rQ01727 Gm26286-201ENSMUST00000104166 134 ntBASIC12.06□□□□□ -0.48
Mc1rQ01727 Gm14441-201ENSMUST00000121960 540 ntBASIC12.06□□□□□ -0.48
Mc1rQ01727 Gm10863-201ENSMUST00000130745 438 ntTSL 3 BASIC12.06□□□□□ -0.48
Mc1rQ01727 Gm12395-201ENSMUST00000144765 536 ntTSL 5 BASIC12.06□□□□□ -0.48
Mc1rQ01727 Gm5616-201ENSMUST00000165252 384 ntBASIC12.06□□□□□ -0.48
Mc1rQ01727 Gm8741-201ENSMUST00000174736 384 ntBASIC12.06□□□□□ -0.48
Mc1rQ01727 Rhoc-204ENSMUST00000176347 583 ntTSL 5 BASIC12.06□□□□□ -0.48
Mc1rQ01727 Gm27246-201ENSMUST00000183611 1240 ntTSL 5 BASIC12.06□□□□□ -0.48
Mc1rQ01727 S100a3-205ENSMUST00000200508 587 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC12.06□□□□□ -0.48
Mc1rQ01727 Calca-204ENSMUST00000205714 416 ntTSL 2 BASIC12.06□□□□□ -0.48
Mc1rQ01727 Acsm5-207ENSMUST00000207813 1084 ntTSL 1 (best) BASIC12.06□□□□□ -0.48
Mc1rQ01727 Olfr742-202ENSMUST00000213935 2117 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.06□□□□□ -0.48
Mc1rQ01727 Nmnat1-201ENSMUST00000030845 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.06□□□□□ -0.48
Mc1rQ01727 Fam96a-201ENSMUST00000034945 1240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.06□□□□□ -0.48
Mc1rQ01727 Lce3d-201ENSMUST00000059053 491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.06□□□□□ -0.48
Mc1rQ01727 Adm2-201ENSMUST00000066991 1043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.06□□□□□ -0.48
Mc1rQ01727 4930564D02Rik-201ENSMUST00000070584 737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.06□□□□□ -0.48
Mc1rQ01727 Cbx3-ps1-201ENSMUST00000091539 545 ntBASIC12.06□□□□□ -0.48
Mc1rQ01727 Prps1-201ENSMUST00000033809 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.06□□□□□ -0.48
Mc1rQ01727 Gng7-203ENSMUST00000117805 3382 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.06□□□□□ -0.48
Mc1rQ01727 AC127242.1-201ENSMUST00000222861 1464 ntTSL 3 BASIC12.06□□□□□ -0.48
Mc1rQ01727 Mrvi1-201ENSMUST00000005751 6198 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.06□□□□□ -0.48
Mc1rQ01727 Prx-204ENSMUST00000125990 4298 ntTSL 1 (best) BASIC12.06□□□□□ -0.48
Mc1rQ01727 Sik2-205ENSMUST00000176663 4107 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.06□□□□□ -0.48
Mc1rQ01727 Dusp6-204ENSMUST00000220291 2359 ntTSL 5 BASIC12.06□□□□□ -0.48
Mc1rQ01727 Sypl-201ENSMUST00000020885 2019 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.06□□□□□ -0.48
Mc1rQ01727 Sun2-201ENSMUST00000046259 3804 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.06□□□□□ -0.48
Mc1rQ01727 Gprasp1-201ENSMUST00000113144 5843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.06□□□□□ -0.48
Mc1rQ01727 3110062M04Rik-201ENSMUST00000055097 3681 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.06□□□□□ -0.48
Mc1rQ01727 Mzf1-205ENSMUST00000182515 3340 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.06□□□□□ -0.48
Mc1rQ01727 6030458C11Rik-204ENSMUST00000228177 3156 ntBASIC12.06□□□□□ -0.48
Mc1rQ01727 Immt-202ENSMUST00000101301 2299 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.06□□□□□ -0.48
Mc1rQ01727 4931415C17Rik-202ENSMUST00000131064 2255 ntTSL 1 (best) BASIC12.06□□□□□ -0.48
Mc1rQ01727 Col14a1-202ENSMUST00000110217 6457 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC12.05□□□□□ -0.48
Mc1rQ01727 Srek1-201ENSMUST00000074616 3934 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.05□□□□□ -0.48
Mc1rQ01727 Gm29609-201ENSMUST00000101411 3223 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.05□□□□□ -0.48
Mc1rQ01727 Sstr2-203ENSMUST00000146390 2143 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.05□□□□□ -0.48
Mc1rQ01727 Poll-201ENSMUST00000026239 2324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.05□□□□□ -0.48
Mc1rQ01727 Runx1-201ENSMUST00000023673 5861 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.05□□□□□ -0.48
Mc1rQ01727 Rab8a-201ENSMUST00000003121 4550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.05□□□□□ -0.48
Mc1rQ01727 Oscar-203ENSMUST00000148012 1796 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.05□□□□□ -0.48
Mc1rQ01727 Cd33-202ENSMUST00000039861 1791 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.05□□□□□ -0.48
Mc1rQ01727 Tor3a-201ENSMUST00000079625 3285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.05□□□□□ -0.48
Mc1rQ01727 Gm20125-205ENSMUST00000208005 1979 ntTSL 5 BASIC12.05□□□□□ -0.48
Mc1rQ01727 Reps2-201ENSMUST00000101102 7630 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.05□□□□□ -0.48
Mc1rQ01727 Tmcc3os-201ENSMUST00000146744 2912 ntTSL 1 (best) BASIC12.05□□□□□ -0.48
Mc1rQ01727 Prkcg-201ENSMUST00000100301 3127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.05□□□□□ -0.48
Mc1rQ01727 Ngef-202ENSMUST00000068681 3109 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC12.05□□□□□ -0.48
Mc1rQ01727 Slc35a4-202ENSMUST00000050476 2362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.05□□□□□ -0.48
Mc1rQ01727 Gm9008-201ENSMUST00000097218 2353 ntAPPRIS P1 BASIC12.05□□□□□ -0.48
Mc1rQ01727 Adck2-204ENSMUST00000140364 3542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.05□□□□□ -0.48
Mc1rQ01727 Tcp10b-202ENSMUST00000116666 2588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.05□□□□□ -0.48
Mc1rQ01727 Tinf2-201ENSMUST00000007733 2956 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.05□□□□□ -0.48
Mc1rQ01727 Alg13-202ENSMUST00000070801 1802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.05□□□□□ -0.48
Mc1rQ01727 Lsg1-201ENSMUST00000117363 3180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.05□□□□□ -0.48
Mc1rQ01727 Myh2-203ENSMUST00000170159 6083 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.05□□□□□ -0.48
Mc1rQ01727 Nlrx1-202ENSMUST00000168499 3579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.05□□□□□ -0.48
Mc1rQ01727 Zeb2-201ENSMUST00000028229 5335 ntTSL 1 (best) BASIC12.05□□□□□ -0.48
Mc1rQ01727 Camta2-202ENSMUST00000100933 4383 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.05□□□□□ -0.48
Mc1rQ01727 Camta2-204ENSMUST00000108545 4377 ntTSL 1 (best) BASIC12.05□□□□□ -0.48
Mc1rQ01727 Camta2-206ENSMUST00000120261 4398 ntTSL 5 BASIC12.05□□□□□ -0.48
Mc1rQ01727 Gm22133-201ENSMUST00000102082 109 ntBASIC12.05□□□□□ -0.48
Mc1rQ01727 Gm6890-201ENSMUST00000114117 776 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.05□□□□□ -0.48
Mc1rQ01727 Gm13205-201ENSMUST00000123548 562 ntTSL 3 BASIC12.05□□□□□ -0.48
Mc1rQ01727 Fkbp2-202ENSMUST00000177752 627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.05□□□□□ -0.48
Mc1rQ01727 AC121960.1-201ENSMUST00000227982 564 ntBASIC12.05□□□□□ -0.48
Mc1rQ01727 Phpt1-201ENSMUST00000039156 937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.05□□□□□ -0.48
Mc1rQ01727 Olfr398-201ENSMUST00000053874 945 ntAPPRIS P1 BASIC12.05□□□□□ -0.48
Mc1rQ01727 Cldn17-201ENSMUST00000069549 1172 ntAPPRIS P1 BASIC12.05□□□□□ -0.48
Mc1rQ01727 Zfp639-201ENSMUST00000029203 1458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.05□□□□□ -0.48
Mc1rQ01727 Gm26905-201ENSMUST00000180798 6621 ntTSL 5 BASIC12.05□□□□□ -0.48
Mc1rQ01727 Fzd6-201ENSMUST00000022906 4081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.05□□□□□ -0.48
Mc1rQ01727 Kif1a-210ENSMUST00000190723 6141 ntTSL 5 BASIC12.05□□□□□ -0.48
Mc1rQ01727 Esrp1-201ENSMUST00000043781 3743 ntTSL 5 BASIC12.05□□□□□ -0.48
Mc1rQ01727 Thegl-201ENSMUST00000031161 1719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.05□□□□□ -0.48
Mc1rQ01727 Aldh4a1-201ENSMUST00000039818 3382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.05□□□□□ -0.48
Mc1rQ01727 Tnfrsf13b-201ENSMUST00000010286 2556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.05□□□□□ -0.48
Mc1rQ01727 Cd163l1-204ENSMUST00000209637 3210 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.05□□□□□ -0.48
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 102.9 ms