Protein–RNA interactions for Protein: Q01320

Top2a, DNA topoisomerase 2-alpha, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 1,528 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Top2aQ01320 Gm16219-201ENSMUST00000120096 274 ntBASIC18.87■□□□□ 0.61
Top2aQ01320 4930515B02Rik-201ENSMUST00000140588 591 ntTSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
Top2aQ01320 Gm11753-201ENSMUST00000151091 396 ntTSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
Top2aQ01320 Gm9081-201ENSMUST00000182346 991 ntBASIC18.87■□□□□ 0.61
Top2aQ01320 Gm43458-201ENSMUST00000200791 462 ntTSL 3 BASIC18.87■□□□□ 0.61
Top2aQ01320 Gm6653-201ENSMUST00000218063 1288 ntBASIC18.87■□□□□ 0.61
Top2aQ01320 Crygb-201ENSMUST00000027090 634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
Top2aQ01320 Gm3402-202ENSMUST00000077133 924 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.87■□□□□ 0.61
Top2aQ01320 Apon-201ENSMUST00000060782 1397 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.87■□□□□ 0.61
Top2aQ01320 Misp-202ENSMUST00000169041 2497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
Top2aQ01320 Gm42943-201ENSMUST00000199676 3242 ntBASIC18.87■□□□□ 0.61
Top2aQ01320 Chrnd-201ENSMUST00000073252 2925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
Top2aQ01320 Telo2-201ENSMUST00000024987 3434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
Top2aQ01320 Mb21d1-201ENSMUST00000034898 3231 ntTSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
Top2aQ01320 Thrap3-201ENSMUST00000080919 4378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
Top2aQ01320 Copz1-201ENSMUST00000100162 1669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
Top2aQ01320 Nfatc2-209ENSMUST00000171689 2742 ntTSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
Top2aQ01320 Prdx2-202ENSMUST00000109733 1590 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.86■□□□□ 0.61
Top2aQ01320 3830406C13Rik-209ENSMUST00000224389 2444 ntAPPRIS P1 BASIC18.86■□□□□ 0.61
Top2aQ01320 Zfp568-203ENSMUST00000148442 4005 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
Top2aQ01320 1700125H20Rik-202ENSMUST00000100681 687 ntTSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
Top2aQ01320 Trgv2-201ENSMUST00000103563 491 ntAPPRIS P1 BASIC18.86■□□□□ 0.61
Top2aQ01320 Gm8111-201ENSMUST00000117659 987 ntBASIC18.86■□□□□ 0.61
Top2aQ01320 Gm7929-201ENSMUST00000178711 624 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.86■□□□□ 0.61
Top2aQ01320 Gm3015-202ENSMUST00000179803 624 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.86■□□□□ 0.61
Top2aQ01320 Ly6e-207ENSMUST00000187606 735 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.86■□□□□ 0.61
Top2aQ01320 Gm5870-201ENSMUST00000196461 282 ntBASIC18.86■□□□□ 0.61
Top2aQ01320 Gm44323-201ENSMUST00000198689 129 ntBASIC18.86■□□□□ 0.61
Top2aQ01320 Pet100-203ENSMUST00000207389 363 ntTSL 2 BASIC18.86■□□□□ 0.61
Top2aQ01320 Gm19046-201ENSMUST00000221263 1298 ntBASIC18.86■□□□□ 0.61
Top2aQ01320 Cluh-202ENSMUST00000117818 4284 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
Top2aQ01320 Mms22l-201ENSMUST00000050446 4261 ntTSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
Top2aQ01320 Zfp354a-202ENSMUST00000102766 2592 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
Top2aQ01320 Nxph2-201ENSMUST00000102945 2579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
Top2aQ01320 Dmac2-202ENSMUST00000085953 2387 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
Top2aQ01320 Sema4a-214ENSMUST00000166237 3046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
Top2aQ01320 Dis3l-203ENSMUST00000120760 3661 ntTSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
Top2aQ01320 Gm13553-201ENSMUST00000133025 1970 ntTSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
Top2aQ01320 Dnajc6-204ENSMUST00000106930 5127 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
Top2aQ01320 Hmx2-201ENSMUST00000051997 3102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
Top2aQ01320 Anapc7-202ENSMUST00000119792 3599 ntTSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
Top2aQ01320 Pcdha4-202ENSMUST00000192512 5363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
Top2aQ01320 Git2-202ENSMUST00000086564 2984 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.85■□□□□ 0.61
Top2aQ01320 Clstn1-202ENSMUST00000105691 4459 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
Top2aQ01320 Alox12b-201ENSMUST00000036424 2431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
Top2aQ01320 Oprl1-204ENSMUST00000108767 1248 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
Top2aQ01320 Fam187b-203ENSMUST00000129773 1213 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
Top2aQ01320 Gm8615-202ENSMUST00000201946 737 ntTSL 3 BASIC18.85■□□□□ 0.61
Top2aQ01320 1700086D15Rik-201ENSMUST00000020855 1092 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.85■□□□□ 0.61
Top2aQ01320 AC112146.1-201ENSMUST00000221641 733 ntTSL 3 BASIC18.85■□□□□ 0.61
Top2aQ01320 AC154305.2-201ENSMUST00000225813 901 ntBASIC18.85■□□□□ 0.61
Top2aQ01320 Retnla-201ENSMUST00000023329 598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
Top2aQ01320 Pla2g1b-201ENSMUST00000031495 557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
Top2aQ01320 Tns1-222ENSMUST00000212888 5643 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.85■□□□□ 0.61
Top2aQ01320 Fosb-207ENSMUST00000208505 3523 ntTSL 5 BASIC18.85■□□□□ 0.61
Top2aQ01320 Aknad1-202ENSMUST00000133931 2603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
Top2aQ01320 Polrmt-202ENSMUST00000159016 3535 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
Top2aQ01320 Lrp6-201ENSMUST00000032322 9368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
Top2aQ01320 Rbm12b1-201ENSMUST00000050069 2949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
Top2aQ01320 Thy1-201ENSMUST00000114840 1735 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.85■□□□□ 0.61
Top2aQ01320 Riok1-201ENSMUST00000021866 2738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
Top2aQ01320 Trim46-201ENSMUST00000041022 3122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
Top2aQ01320 Fhad1-202ENSMUST00000105779 4263 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.85■□□□□ 0.61
Top2aQ01320 Vmn1r45-206ENSMUST00000227977 3297 ntAPPRIS P1 BASIC18.85■□□□□ 0.61
Top2aQ01320 Ttc17-202ENSMUST00000094801 3408 ntTSL 5 BASIC18.85■□□□□ 0.61
Top2aQ01320 Snrk-201ENSMUST00000118886 4811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
Top2aQ01320 Trav13d-1-201ENSMUST00000103588 396 ntAPPRIS P1 BASIC18.84■□□□□ 0.61
Top2aQ01320 Gm14270-201ENSMUST00000118388 846 ntBASIC18.84■□□□□ 0.61
Top2aQ01320 Gm6630-201ENSMUST00000119199 454 ntBASIC18.84■□□□□ 0.61
Top2aQ01320 Gm12756-201ENSMUST00000126294 599 ntTSL 3 BASIC18.84■□□□□ 0.61
Top2aQ01320 Txnrd2-205ENSMUST00000126778 491 ntTSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
Top2aQ01320 AC158605.1-201ENSMUST00000156803 764 ntTSL 3 BASIC18.84■□□□□ 0.61
Top2aQ01320 Gm9135-201ENSMUST00000182963 990 ntBASIC18.84■□□□□ 0.61
Top2aQ01320 Gm28833-201ENSMUST00000189671 559 ntBASIC18.84■□□□□ 0.61
Top2aQ01320 Gm37638-201ENSMUST00000194337 1123 ntBASIC18.84■□□□□ 0.61
Top2aQ01320 Gm9369-201ENSMUST00000196009 733 ntBASIC18.84■□□□□ 0.61
Top2aQ01320 Ftl1-204ENSMUST00000210864 503 ntTSL 5 BASIC18.84■□□□□ 0.61
Top2aQ01320 Acy1-211ENSMUST00000216400 1030 ntTSL 5 BASIC18.84■□□□□ 0.61
Top2aQ01320 9430078K24Rik-203ENSMUST00000220293 638 ntTSL 3 BASIC18.84■□□□□ 0.61
Top2aQ01320 Meikin-201ENSMUST00000094193 1433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
Top2aQ01320 Olfr707-203ENSMUST00000210644 1817 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.84■□□□□ 0.61
Top2aQ01320 Miga1-202ENSMUST00000073089 4965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
Top2aQ01320 Skida1-202ENSMUST00000091420 4376 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.84■□□□□ 0.61
Top2aQ01320 Tmppe-201ENSMUST00000111820 2921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
Top2aQ01320 Hsd17b6-203ENSMUST00000219447 1459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
Top2aQ01320 Chfr-201ENSMUST00000014812 3146 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
Top2aQ01320 Armcx2-203ENSMUST00000119010 3007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
Top2aQ01320 Rhot1-202ENSMUST00000055056 4260 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
Top2aQ01320 Tarm1-203ENSMUST00000203821 1535 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
Top2aQ01320 6530402F18Rik-203ENSMUST00000155949 4301 ntTSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
Top2aQ01320 Mir181d-201ENSMUST00000102383 72 ntBASIC18.84■□□□□ 0.61
Top2aQ01320 Gm24791-201ENSMUST00000104284 131 ntBASIC18.84■□□□□ 0.61
Top2aQ01320 Rpl35a-205ENSMUST00000115079 510 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.84■□□□□ 0.61
Top2aQ01320 Gm11417-201ENSMUST00000150536 920 ntTSL 2 BASIC18.84■□□□□ 0.61
Top2aQ01320 Gm24809-201ENSMUST00000175318 271 ntBASIC18.84■□□□□ 0.61
Top2aQ01320 Gm43695-201ENSMUST00000196545 196 ntTSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
Top2aQ01320 Krtap4-1-201ENSMUST00000081007 1015 ntAPPRIS P1 BASIC18.84■□□□□ 0.61
Top2aQ01320 Galnt2-201ENSMUST00000034458 4113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
Top2aQ01320 Gm44056-201ENSMUST00000204623 1427 ntBASIC18.84■□□□□ 0.61
Top2aQ01320 Flt1-203ENSMUST00000110529 6292 ntTSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 28.9 ms