Protein–RNA interactions for Protein: Q00LT2

Prcd, Progressive rod-cone degeneration protein homolog, mousemouse

Predictions only

Length 53 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PrcdQ00LT2 Tubgcp6-201ENSMUST00000041656 5357 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC8.44□□□□□ -1.06
PrcdQ00LT2 F11-201ENSMUST00000034064 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.44□□□□□ -1.06
PrcdQ00LT2 Cabin1-201ENSMUST00000001712 7417 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC8.43□□□□□ -1.06
PrcdQ00LT2 Cep350-204ENSMUST00000138762 13307 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC8.43□□□□□ -1.06
PrcdQ00LT2 Ptpn11-201ENSMUST00000054547 5535 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC8.43□□□□□ -1.06
PrcdQ00LT2 Slc24a4-201ENSMUST00000079020 2337 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC8.43□□□□□ -1.06
PrcdQ00LT2 Phf24-203ENSMUST00000107976 6538 ntTSL 1 (best) BASIC8.43□□□□□ -1.06
PrcdQ00LT2 Timeless-201ENSMUST00000055539 4457 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC8.43□□□□□ -1.06
PrcdQ00LT2 Pax7-202ENSMUST00000174681 1725 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC8.43□□□□□ -1.06
PrcdQ00LT2 Zfp125-201ENSMUST00000079237 2488 ntBASIC8.43□□□□□ -1.06
PrcdQ00LT2 Cc2d1a-202ENSMUST00000117424 3262 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC8.43□□□□□ -1.06
PrcdQ00LT2 Gng7-203ENSMUST00000117805 3382 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC8.43□□□□□ -1.06
PrcdQ00LT2 Iqcc-201ENSMUST00000046675 2639 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC8.43□□□□□ -1.06
PrcdQ00LT2 Ikzf4-204ENSMUST00000222067 2688 ntTSL 1 (best) BASIC8.43□□□□□ -1.06
PrcdQ00LT2 Amotl2-211ENSMUST00000153965 4222 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC8.43□□□□□ -1.06
PrcdQ00LT2 Trappc8-202ENSMUST00000097658 2703 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC8.43□□□□□ -1.06
PrcdQ00LT2 Pax5-204ENSMUST00000107826 1228 ntTSL 5 BASIC8.43□□□□□ -1.06
PrcdQ00LT2 Mogat1-202ENSMUST00000113524 1228 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC8.43□□□□□ -1.06
PrcdQ00LT2 Mettl1-202ENSMUST00000120542 1044 ntTSL 1 (best) BASIC8.43□□□□□ -1.06
PrcdQ00LT2 Mitd1-205ENSMUST00000139725 1175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.43□□□□□ -1.06
PrcdQ00LT2 Gm15276-201ENSMUST00000145953 498 ntBASIC8.43□□□□□ -1.06
PrcdQ00LT2 Ccdc28a-203ENSMUST00000173243 590 ntTSL 5 BASIC8.43□□□□□ -1.06
PrcdQ00LT2 Magohb-205ENSMUST00000173837 897 ntTSL 5 BASIC8.43□□□□□ -1.06
PrcdQ00LT2 Gm26542-201ENSMUST00000180443 1235 ntTSL 1 (best) BASIC8.43□□□□□ -1.06
PrcdQ00LT2 2610016A17Rik-202ENSMUST00000186768 689 ntBASIC8.43□□□□□ -1.06
PrcdQ00LT2 Gm5441-202ENSMUST00000190132 449 ntTSL 2 BASIC8.43□□□□□ -1.06
PrcdQ00LT2 Gm19187-201ENSMUST00000206781 892 ntBASIC8.43□□□□□ -1.06
PrcdQ00LT2 Gm44710-201ENSMUST00000208885 471 ntTSL 2 BASIC8.43□□□□□ -1.06
PrcdQ00LT2 AC153929.1-201ENSMUST00000219009 303 ntBASIC8.43□□□□□ -1.06
PrcdQ00LT2 Ggt1-201ENSMUST00000006508 2167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.43□□□□□ -1.06
PrcdQ00LT2 Tsta3-201ENSMUST00000023231 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.43□□□□□ -1.06
PrcdQ00LT2 Zfp341-202ENSMUST00000109702 3162 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC8.43□□□□□ -1.06
PrcdQ00LT2 Gm5580-201ENSMUST00000122096 1362 ntAPPRIS P1 BASIC8.43□□□□□ -1.06
PrcdQ00LT2 Kalrn-209ENSMUST00000114963 3207 ntTSL 5 BASIC8.43□□□□□ -1.06
PrcdQ00LT2 Lnx1-206ENSMUST00000121690 2302 ntTSL 1 (best) BASIC8.43□□□□□ -1.06
PrcdQ00LT2 Npepps-201ENSMUST00000001480 4215 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC8.43□□□□□ -1.06
PrcdQ00LT2 Eif4ebp2-202ENSMUST00000167087 1422 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC8.43□□□□□ -1.06
PrcdQ00LT2 Nhsl1-201ENSMUST00000037341 7321 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC8.43□□□□□ -1.06
PrcdQ00LT2 Gm10782-202ENSMUST00000223775 1480 ntBASIC8.43□□□□□ -1.06
PrcdQ00LT2 Srfbp1-201ENSMUST00000025406 1463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.43□□□□□ -1.06
PrcdQ00LT2 Mybl1-202ENSMUST00000115468 2493 ntTSL 5 BASIC8.43□□□□□ -1.06
PrcdQ00LT2 Misp-202ENSMUST00000169041 2497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.43□□□□□ -1.06
PrcdQ00LT2 Trak1-213ENSMUST00000211439 3533 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC8.43□□□□□ -1.06
PrcdQ00LT2 Lrba-202ENSMUST00000192145 8843 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC8.43□□□□□ -1.06
PrcdQ00LT2 Papss1-201ENSMUST00000029666 2600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.43□□□□□ -1.06
PrcdQ00LT2 Nanos2-201ENSMUST00000063563 1563 ntAPPRIS P1 BASIC8.43□□□□□ -1.06
PrcdQ00LT2 Polm-202ENSMUST00000109837 2697 ntTSL 5 BASIC8.43□□□□□ -1.06
PrcdQ00LT2 Map1b-203ENSMUST00000223725 2669 ntBASIC8.43□□□□□ -1.06
PrcdQ00LT2 Mob3b-201ENSMUST00000102975 6030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.43□□□□□ -1.06
PrcdQ00LT2 Gm45743-201ENSMUST00000212701 2795 ntBASIC8.43□□□□□ -1.06
PrcdQ00LT2 Ttc7-202ENSMUST00000125875 3917 ntTSL 2 BASIC8.43□□□□□ -1.06
PrcdQ00LT2 Celf2-205ENSMUST00000114927 1721 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC8.43□□□□□ -1.06
PrcdQ00LT2 Man2c1-215ENSMUST00000161182 2909 ntTSL 5 BASIC8.43□□□□□ -1.06
PrcdQ00LT2 Slc25a13-203ENSMUST00000188414 3121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.43□□□□□ -1.06
PrcdQ00LT2 Pdcd1-201ENSMUST00000027507 1930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.42□□□□□ -1.06
PrcdQ00LT2 Slc7a15-201ENSMUST00000036938 1907 ntTSL 1 (best) BASIC8.42□□□□□ -1.06
PrcdQ00LT2 Snx6-201ENSMUST00000005798 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.42□□□□□ -1.06
PrcdQ00LT2 AL732309.1-201ENSMUST00000228627 2045 ntAPPRIS P1 BASIC8.42□□□□□ -1.06
PrcdQ00LT2 Ly6e-210ENSMUST00000188866 2068 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC8.42□□□□□ -1.06
PrcdQ00LT2 Myf5-201ENSMUST00000000445 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.42□□□□□ -1.06
PrcdQ00LT2 Spns3-202ENSMUST00000092940 2080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.42□□□□□ -1.06
PrcdQ00LT2 Oasl1-201ENSMUST00000031540 2125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.42□□□□□ -1.06
PrcdQ00LT2 E2f3-201ENSMUST00000102948 5097 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC8.42□□□□□ -1.06
PrcdQ00LT2 Rab3d-203ENSMUST00000122211 3886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.42□□□□□ -1.06
PrcdQ00LT2 Rspry1-201ENSMUST00000060389 3852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.42□□□□□ -1.06
PrcdQ00LT2 Gm43677-201ENSMUST00000198098 2378 ntBASIC8.42□□□□□ -1.06
PrcdQ00LT2 Slc7a11-205ENSMUST00000194462 2419 ntTSL 1 (best) BASIC8.42□□□□□ -1.06
PrcdQ00LT2 Patj-201ENSMUST00000030290 2495 ntTSL 1 (best) BASIC8.42□□□□□ -1.06
PrcdQ00LT2 Gm7104-201ENSMUST00000179741 2532 ntBASIC8.42□□□□□ -1.06
PrcdQ00LT2 CT025624.1-201ENSMUST00000224007 2700 ntBASIC8.42□□□□□ -1.06
PrcdQ00LT2 Bahcc1-203ENSMUST00000122148 10712 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC8.42□□□□□ -1.06
PrcdQ00LT2 Dgcr2-203ENSMUST00000117082 2987 ntTSL 1 (best) BASIC8.42□□□□□ -1.06
PrcdQ00LT2 Plekha6-204ENSMUST00000187285 5040 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC8.42□□□□□ -1.06
PrcdQ00LT2 Mmab-201ENSMUST00000031560 3020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.42□□□□□ -1.06
PrcdQ00LT2 L1cam-202ENSMUST00000102871 5113 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC8.42□□□□□ -1.06
PrcdQ00LT2 Csf1-202ENSMUST00000118593 3058 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC8.42□□□□□ -1.06
PrcdQ00LT2 Rspo2-203ENSMUST00000226810 3091 ntAPPRIS P1 BASIC8.42□□□□□ -1.06
PrcdQ00LT2 Tfcp2-201ENSMUST00000009877 3250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.42□□□□□ -1.06
PrcdQ00LT2 Pif1-202ENSMUST00000131483 3309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.42□□□□□ -1.06
PrcdQ00LT2 Mmp28-202ENSMUST00000103209 3438 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC8.42□□□□□ -1.06
PrcdQ00LT2 Nfatc4-202ENSMUST00000172271 3775 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC8.42□□□□□ -1.06
PrcdQ00LT2 Gm24255-201ENSMUST00000104481 128 ntBASIC8.42□□□□□ -1.06
PrcdQ00LT2 Chchd7-202ENSMUST00000108386 524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.42□□□□□ -1.06
PrcdQ00LT2 Cstl1-202ENSMUST00000109954 454 ntTSL 1 (best) BASIC8.42□□□□□ -1.06
PrcdQ00LT2 Gm12015-201ENSMUST00000117065 843 ntBASIC8.42□□□□□ -1.06
PrcdQ00LT2 Gm13350-201ENSMUST00000120519 479 ntBASIC8.42□□□□□ -1.06
PrcdQ00LT2 Chchd7-206ENSMUST00000121110 381 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC8.42□□□□□ -1.06
PrcdQ00LT2 Gm11379-201ENSMUST00000154678 381 ntTSL 3 BASIC8.42□□□□□ -1.06
PrcdQ00LT2 Abhd14a-203ENSMUST00000171925 1122 ntTSL 3 BASIC8.42□□□□□ -1.06
PrcdQ00LT2 Rpl36-ps4-201ENSMUST00000179601 354 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC8.42□□□□□ -1.06
PrcdQ00LT2 Gm26618-201ENSMUST00000181123 497 ntTSL 2 BASIC8.42□□□□□ -1.06
PrcdQ00LT2 Ino80dos-202ENSMUST00000186436 652 ntTSL 5 BASIC8.42□□□□□ -1.06
PrcdQ00LT2 Rprl1-202ENSMUST00000198476 238 ntBASIC8.42□□□□□ -1.06
PrcdQ00LT2 Gm42902-201ENSMUST00000199508 662 ntTSL 5 BASIC8.42□□□□□ -1.06
PrcdQ00LT2 Gm45598-202ENSMUST00000210719 986 ntBASIC8.42□□□□□ -1.06
PrcdQ00LT2 Mt2-202ENSMUST00000212806 388 ntTSL 2 BASIC8.42□□□□□ -1.06
PrcdQ00LT2 Calml4-207ENSMUST00000215968 526 ntTSL 2 BASIC8.42□□□□□ -1.06
PrcdQ00LT2 Gm19994-201ENSMUST00000217086 586 ntBASIC8.42□□□□□ -1.06
PrcdQ00LT2 Gm7172-201ENSMUST00000218047 1152 ntBASIC8.42□□□□□ -1.06
PrcdQ00LT2 Pxt1-201ENSMUST00000051526 710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.42□□□□□ -1.06
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 44.7 ms