Protein–RNA interactions for Protein: Q00288

Pax8, Paired box protein Pax-8, mousemouse

Predictions only

Length 457 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pax8Q00288 Stat5a-203ENSMUST00000107357 3605 ntTSL 1 (best) BASIC10.18□□□□□ -0.78
Pax8Q00288 Gm19434-201ENSMUST00000204330 2573 ntTSL 1 (best) BASIC10.18□□□□□ -0.78
Pax8Q00288 Dock11-201ENSMUST00000033419 6665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.18□□□□□ -0.78
Pax8Q00288 Ltbp2-202ENSMUST00000110254 6602 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.18□□□□□ -0.78
Pax8Q00288 Arhgap12-211ENSMUST00000182383 2500 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.17□□□□□ -0.78
Pax8Q00288 1110051M20Rik-203ENSMUST00000102594 1977 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.17□□□□□ -0.78
Pax8Q00288 Hrct1-201ENSMUST00000095109 1452 ntAPPRIS P1 BASIC10.17□□□□□ -0.78
Pax8Q00288 Wdr59-201ENSMUST00000034437 4896 ntTSL 1 (best) BASIC10.17□□□□□ -0.78
Pax8Q00288 Gm7537-201ENSMUST00000221660 1414 ntBASIC10.17□□□□□ -0.78
Pax8Q00288 Baiap3-202ENSMUST00000182056 4645 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.17□□□□□ -0.78
Pax8Q00288 Abcb9-201ENSMUST00000031354 3661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.17□□□□□ -0.78
Pax8Q00288 Rnf113a2-201ENSMUST00000183146 1383 ntAPPRIS P1 BASIC10.17□□□□□ -0.78
Pax8Q00288 Riox2-206ENSMUST00000160571 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.17□□□□□ -0.78
Pax8Q00288 Adh4-201ENSMUST00000013458 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.17□□□□□ -0.78
Pax8Q00288 Mcf2l-203ENSMUST00000110866 5108 ntTSL 1 (best) BASIC10.17□□□□□ -0.78
Pax8Q00288 Pcgf2-203ENSMUST00000103149 817 ntTSL 5 BASIC10.17□□□□□ -0.78
Pax8Q00288 Gm11568-201ENSMUST00000107434 1145 ntAPPRIS P1 BASIC10.17□□□□□ -0.78
Pax8Q00288 Gngt2-207ENSMUST00000107714 558 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC10.17□□□□□ -0.78
Pax8Q00288 Fgd3-203ENSMUST00000110087 4698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.17□□□□□ -0.78
Pax8Q00288 Mrps17-207ENSMUST00000121813 868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.17□□□□□ -0.78
Pax8Q00288 1110028F11Rik-201ENSMUST00000137077 837 ntTSL 1 (best) BASIC10.17□□□□□ -0.78
Pax8Q00288 Gm12589-201ENSMUST00000153767 638 ntTSL 1 (best) BASIC10.17□□□□□ -0.78
Pax8Q00288 5430405H02Rik-202ENSMUST00000176134 1196 ntTSL 1 (best) BASIC10.17□□□□□ -0.78
Pax8Q00288 Tnnt1-213ENSMUST00000178163 934 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.17□□□□□ -0.78
Pax8Q00288 Hcfc1r1-203ENSMUST00000180140 693 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC10.17□□□□□ -0.78
Pax8Q00288 Gm29539-201ENSMUST00000188031 758 ntTSL 3 BASIC10.17□□□□□ -0.78
Pax8Q00288 Gm3332-201ENSMUST00000189337 928 ntBASIC10.17□□□□□ -0.78
Pax8Q00288 Gm28778-201ENSMUST00000190734 785 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC10.17□□□□□ -0.78
Pax8Q00288 Gm33222-201ENSMUST00000193725 654 ntTSL 3 BASIC10.17□□□□□ -0.78
Pax8Q00288 Gm39460-201ENSMUST00000215728 1266 ntTSL 5 BASIC10.17□□□□□ -0.78
Pax8Q00288 Gm807-202ENSMUST00000224929 408 ntBASIC10.17□□□□□ -0.78
Pax8Q00288 Prss52-201ENSMUST00000022537 1064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.17□□□□□ -0.78
Pax8Q00288 AC133602.1-201ENSMUST00000227510 509 ntBASIC10.17□□□□□ -0.78
Pax8Q00288 Spata24-201ENSMUST00000025209 701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.17□□□□□ -0.78
Pax8Q00288 D17H6S53E-201ENSMUST00000061859 2142 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC10.17□□□□□ -0.78
Pax8Q00288 Spata24-202ENSMUST00000096573 709 ntTSL 1 (best) BASIC10.17□□□□□ -0.78
Pax8Q00288 Zfp94-201ENSMUST00000032673 2529 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.17□□□□□ -0.78
Pax8Q00288 Gfra1-201ENSMUST00000026076 4641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.17□□□□□ -0.78
Pax8Q00288 Patj-201ENSMUST00000030290 2495 ntTSL 1 (best) BASIC10.17□□□□□ -0.78
Pax8Q00288 Cdc7-203ENSMUST00000117196 2864 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.17□□□□□ -0.78
Pax8Q00288 Cyp2d34-201ENSMUST00000109515 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.17□□□□□ -0.78
Pax8Q00288 Efna1-202ENSMUST00000118587 1632 ntTSL 1 (best) BASIC10.17□□□□□ -0.78
Pax8Q00288 Mirt1-202ENSMUST00000180667 1633 ntTSL 5 BASIC10.17□□□□□ -0.78
Pax8Q00288 Trpc7-208ENSMUST00000174457 2424 ntTSL 5 BASIC10.17□□□□□ -0.78
Pax8Q00288 Six4-202ENSMUST00000175693 6817 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.17□□□□□ -0.78
Pax8Q00288 Palld-204ENSMUST00000121785 6349 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.17□□□□□ -0.78
Pax8Q00288 Plxna4os1-201ENSMUST00000150314 1977 ntTSL 1 (best) BASIC10.17□□□□□ -0.78
Pax8Q00288 Prrt3-204ENSMUST00000205075 1956 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC10.17□□□□□ -0.78
Pax8Q00288 Fyb2-201ENSMUST00000106803 3136 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.17□□□□□ -0.78
Pax8Q00288 Mrps26-202ENSMUST00000145614 4278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.17□□□□□ -0.78
Pax8Q00288 Unc5c-202ENSMUST00000106236 9646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.17□□□□□ -0.78
Pax8Q00288 Snx6-201ENSMUST00000005798 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.17□□□□□ -0.78
Pax8Q00288 Gm10787-201ENSMUST00000099552 1548 ntTSL 2 BASIC10.17□□□□□ -0.78
Pax8Q00288 D630014O11Rik-201ENSMUST00000160562 3019 ntTSL 1 (best) BASIC10.17□□□□□ -0.78
Pax8Q00288 Gm9866-202ENSMUST00000182473 1882 ntTSL 1 (best) BASIC10.17□□□□□ -0.78
Pax8Q00288 Dmtn-208ENSMUST00000228009 2643 ntAPPRIS P2 BASIC10.17□□□□□ -0.78
Pax8Q00288 Mtmr10-201ENSMUST00000032736 5205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.17□□□□□ -0.78
Pax8Q00288 Pdhx-201ENSMUST00000011058 2506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.16□□□□□ -0.78
Pax8Q00288 Sv2a-201ENSMUST00000035371 4334 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.16□□□□□ -0.78
Pax8Q00288 Cars-201ENSMUST00000010899 3222 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.16□□□□□ -0.78
Pax8Q00288 Trpv4-201ENSMUST00000071968 3228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.16□□□□□ -0.78
Pax8Q00288 Dgkb-205ENSMUST00000221176 1439 ntTSL 1 (best) BASIC10.16□□□□□ -0.78
Pax8Q00288 Syncrip-210ENSMUST00000174391 6257 ntTSL 1 (best) BASIC10.16□□□□□ -0.78
Pax8Q00288 Sod2-201ENSMUST00000007012 3824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.16□□□□□ -0.78
Pax8Q00288 Gm17276-201ENSMUST00000180839 2782 ntTSL 1 (best) BASIC10.16□□□□□ -0.78
Pax8Q00288 Trpc7-207ENSMUST00000173817 2406 ntTSL 5 BASIC10.16□□□□□ -0.78
Pax8Q00288 Myh2-203ENSMUST00000170159 6083 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.16□□□□□ -0.78
Pax8Q00288 S1pr1-201ENSMUST00000055676 3046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.16□□□□□ -0.78
Pax8Q00288 Rab11fip3-203ENSMUST00000122103 5015 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC10.16□□□□□ -0.78
Pax8Q00288 Gjd4-201ENSMUST00000041007 2661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.16□□□□□ -0.78
Pax8Q00288 Pcdhgb6-201ENSMUST00000003599 4684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.16□□□□□ -0.78
Pax8Q00288 Olfr139-204ENSMUST00000214111 1311 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.16□□□□□ -0.78
Pax8Q00288 Coro2b-201ENSMUST00000048043 3610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.16□□□□□ -0.78
Pax8Q00288 Dolpp1-203ENSMUST00000123202 2294 ntTSL 1 (best) BASIC10.16□□□□□ -0.78
Pax8Q00288 Dolpp1-201ENSMUST00000028209 2251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.16□□□□□ -0.78
Pax8Q00288 Gata3-201ENSMUST00000102976 3215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.16□□□□□ -0.78
Pax8Q00288 6430571L13Rik-201ENSMUST00000042581 2599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.16□□□□□ -0.78
Pax8Q00288 Rpl35a-204ENSMUST00000115078 500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.16□□□□□ -0.78
Pax8Q00288 Gm14396-201ENSMUST00000126966 548 ntTSL 1 (best) BASIC10.16□□□□□ -0.78
Pax8Q00288 Gm15891-201ENSMUST00000127307 611 ntTSL 5 BASIC10.16□□□□□ -0.78
Pax8Q00288 Prdx5-203ENSMUST00000149261 755 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC10.16□□□□□ -0.78
Pax8Q00288 Spata3-210ENSMUST00000153247 884 ntTSL 1 (best) BASIC10.16□□□□□ -0.78
Pax8Q00288 Cd63-ps-202ENSMUST00000154992 717 ntBASIC10.16□□□□□ -0.78
Pax8Q00288 Spata3-211ENSMUST00000159876 760 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.16□□□□□ -0.78
Pax8Q00288 Ubl5-206ENSMUST00000161486 794 ntTSL 2 BASIC10.16□□□□□ -0.78
Pax8Q00288 Smpd4-223ENSMUST00000172182 516 ntTSL 3 BASIC10.16□□□□□ -0.78
Pax8Q00288 Trmt112-204ENSMUST00000174786 646 ntTSL 1 (best) BASIC10.16□□□□□ -0.78
Pax8Q00288 Gm8888-201ENSMUST00000177677 381 ntAPPRIS P1 BASIC10.16□□□□□ -0.78
Pax8Q00288 Zfp229-206ENSMUST00000183192 653 ntTSL 1 (best) BASIC10.16□□□□□ -0.78
Pax8Q00288 4930479H17Rik-201ENSMUST00000208824 292 ntTSL 1 (best) BASIC10.16□□□□□ -0.78
Pax8Q00288 AC155637.1-201ENSMUST00000218560 636 ntBASIC10.16□□□□□ -0.78
Pax8Q00288 AC153937.1-201ENSMUST00000218734 412 ntBASIC10.16□□□□□ -0.78
Pax8Q00288 Mettl5-201ENSMUST00000060447 968 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.16□□□□□ -0.78
Pax8Q00288 Mir219a-1-201ENSMUST00000083621 110 ntBASIC10.16□□□□□ -0.78
Pax8Q00288 Slc22a16-201ENSMUST00000019978 2226 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.16□□□□□ -0.78
Pax8Q00288 Ikzf4-203ENSMUST00000221150 2213 ntTSL 1 (best) BASIC10.16□□□□□ -0.78
Pax8Q00288 Ralbp1-202ENSMUST00000166543 4089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.16□□□□□ -0.78
Pax8Q00288 Msra-201ENSMUST00000067927 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.16□□□□□ -0.78
Pax8Q00288 Trappc9-204ENSMUST00000170633 4688 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.16□□□□□ -0.78
Pax8Q00288 AC157950.1-201ENSMUST00000217561 2168 ntBASIC10.16□□□□□ -0.78
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 34.6 ms