Protein–RNA interactions for Protein: P97873

Loxl1, Lysyl oxidase homolog 1, mousemouse

Predictions only

Length 607 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Loxl1P97873 Lrmda-201ENSMUST00000075639 908 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.95□□□□□ -0.82
Loxl1P97873 Krba1-203ENSMUST00000114571 6695 ntTSL 1 (best) BASIC9.95□□□□□ -0.82
Loxl1P97873 Chrdl1-202ENSMUST00000074660 4096 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.95□□□□□ -0.82
Loxl1P97873 Gm12915-201ENSMUST00000131381 1499 ntTSL 1 (best) BASIC9.95□□□□□ -0.82
Loxl1P97873 St6gal1-201ENSMUST00000023601 4506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.95□□□□□ -0.82
Loxl1P97873 Gm10787-201ENSMUST00000099552 1548 ntTSL 2 BASIC9.95□□□□□ -0.82
Loxl1P97873 Ckmt1-201ENSMUST00000000317 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.95□□□□□ -0.82
Loxl1P97873 Cdh7-202ENSMUST00000112701 4945 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.95□□□□□ -0.82
Loxl1P97873 Tcf4-252ENSMUST00000202477 1873 ntTSL 5 BASIC9.95□□□□□ -0.82
Loxl1P97873 Gabrr2-202ENSMUST00000108162 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.95□□□□□ -0.82
Loxl1P97873 Ppp1r16b-201ENSMUST00000045503 6408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.95□□□□□ -0.82
Loxl1P97873 Trf-203ENSMUST00000112645 2339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.95□□□□□ -0.82
Loxl1P97873 Gm16907-201ENSMUST00000180734 2317 ntTSL 1 (best) BASIC9.95□□□□□ -0.82
Loxl1P97873 Drc3-202ENSMUST00000094140 2438 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.95□□□□□ -0.82
Loxl1P97873 Ank2-203ENSMUST00000182008 2474 ntTSL 1 (best) BASIC9.95□□□□□ -0.82
Loxl1P97873 Dnaic2-202ENSMUST00000092469 2799 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.95□□□□□ -0.82
Loxl1P97873 Hdac5-204ENSMUST00000107152 3788 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.95□□□□□ -0.82
Loxl1P97873 Arid4a-201ENSMUST00000046305 4998 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.95□□□□□ -0.82
Loxl1P97873 E2f7-201ENSMUST00000073781 5473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.94□□□□□ -0.82
Loxl1P97873 Psd2-201ENSMUST00000115716 4607 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.94□□□□□ -0.82
Loxl1P97873 Synpo-211ENSMUST00000155195 4442 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.94□□□□□ -0.82
Loxl1P97873 Fam78a-201ENSMUST00000056406 4107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.94□□□□□ -0.82
Loxl1P97873 Nfya-212ENSMUST00000162460 3706 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.94□□□□□ -0.82
Loxl1P97873 Map2k4-201ENSMUST00000046963 3695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.94□□□□□ -0.82
Loxl1P97873 Rara-207ENSMUST00000164748 3129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.94□□□□□ -0.82
Loxl1P97873 Csf1-202ENSMUST00000118593 3058 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.94□□□□□ -0.82
Loxl1P97873 Lgr5-206ENSMUST00000172806 2652 ntTSL 5 BASIC9.94□□□□□ -0.82
Loxl1P97873 Myocd-201ENSMUST00000101042 2585 ntTSL 1 (best) BASIC9.94□□□□□ -0.82
Loxl1P97873 Mtus1-202ENSMUST00000059115 6548 ntTSL 5 BASIC9.94□□□□□ -0.82
Loxl1P97873 Prr3-203ENSMUST00000172429 1878 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.94□□□□□ -0.82
Loxl1P97873 Oscar-203ENSMUST00000148012 1796 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.94□□□□□ -0.82
Loxl1P97873 Gm9951-202ENSMUST00000149618 1772 ntTSL 2 BASIC9.94□□□□□ -0.82
Loxl1P97873 Mog-201ENSMUST00000102665 1704 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.94□□□□□ -0.82
Loxl1P97873 Mast1-201ENSMUST00000109741 4872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.94□□□□□ -0.82
Loxl1P97873 Rgs6-211ENSMUST00000191107 1621 ntTSL 5 BASIC9.94□□□□□ -0.82
Loxl1P97873 Pcdhgb6-201ENSMUST00000003599 4684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.94□□□□□ -0.82
Loxl1P97873 Tex45-203ENSMUST00000161680 1526 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.94□□□□□ -0.82
Loxl1P97873 Gsdma2-201ENSMUST00000017355 1314 ntTSL 1 (best) BASIC9.94□□□□□ -0.82
Loxl1P97873 Rbm20-204ENSMUST00000164202 6592 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.94□□□□□ -0.82
Loxl1P97873 Pcgf2-203ENSMUST00000103149 817 ntTSL 5 BASIC9.94□□□□□ -0.82
Loxl1P97873 Timm10b-204ENSMUST00000106784 494 ntTSL 3 BASIC9.94□□□□□ -0.82
Loxl1P97873 Tm2d3-203ENSMUST00000107495 1003 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC9.94□□□□□ -0.82
Loxl1P97873 Prr15l-203ENSMUST00000107633 930 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC9.94□□□□□ -0.82
Loxl1P97873 Cstl1-201ENSMUST00000109952 629 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.94□□□□□ -0.82
Loxl1P97873 Gm14724-201ENSMUST00000118400 537 ntBASIC9.94□□□□□ -0.82
Loxl1P97873 Gm8566-201ENSMUST00000120174 465 ntBASIC9.94□□□□□ -0.82
Loxl1P97873 Mia-202ENSMUST00000121848 572 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.94□□□□□ -0.82
Loxl1P97873 Gm16686-201ENSMUST00000141816 396 ntAPPRIS P1 BASIC9.94□□□□□ -0.82
Loxl1P97873 Gm14249-201ENSMUST00000156239 1017 ntTSL 5 BASIC9.94□□□□□ -0.82
Loxl1P97873 Gm25881-201ENSMUST00000157783 103 ntBASIC9.94□□□□□ -0.82
Loxl1P97873 Gm25732-201ENSMUST00000175168 60 ntBASIC9.94□□□□□ -0.82
Loxl1P97873 Gm4310-201ENSMUST00000177847 889 ntBASIC9.94□□□□□ -0.82
Loxl1P97873 Tnnt1-213ENSMUST00000178163 934 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.94□□□□□ -0.82
Loxl1P97873 Gm27530-201ENSMUST00000184096 98 ntBASIC9.94□□□□□ -0.82
Loxl1P97873 Mir6927-201ENSMUST00000184494 71 ntBASIC9.94□□□□□ -0.82
Loxl1P97873 Gm29539-201ENSMUST00000188031 758 ntTSL 3 BASIC9.94□□□□□ -0.82
Loxl1P97873 Gm29707-202ENSMUST00000198744 659 ntTSL 3 BASIC9.94□□□□□ -0.82
Loxl1P97873 Agrp-201ENSMUST00000005849 661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.94□□□□□ -0.82
Loxl1P97873 Atp8a1-201ENSMUST00000037380 8178 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC9.94□□□□□ -0.82
Loxl1P97873 Prr18-202ENSMUST00000163887 3251 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC9.94□□□□□ -0.82
Loxl1P97873 Tfcp2-201ENSMUST00000009877 3250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.94□□□□□ -0.82
Loxl1P97873 Tfe3-204ENSMUST00000115677 2943 ntTSL 1 (best) BASIC9.94□□□□□ -0.82
Loxl1P97873 A530016L24Rik-201ENSMUST00000057465 2636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.94□□□□□ -0.82
Loxl1P97873 Cerk-203ENSMUST00000156546 2162 ntTSL 1 (best) BASIC9.94□□□□□ -0.82
Loxl1P97873 Nicn1-201ENSMUST00000035227 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.94□□□□□ -0.82
Loxl1P97873 Gata3-201ENSMUST00000102976 3215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.94□□□□□ -0.82
Loxl1P97873 F10-201ENSMUST00000033821 1903 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.94□□□□□ -0.82
Loxl1P97873 Grap2-201ENSMUST00000043149 3158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.93□□□□□ -0.82
Loxl1P97873 Arid5a-203ENSMUST00000115031 3002 ntTSL 2 BASIC9.93□□□□□ -0.82
Loxl1P97873 Slc38a6-206ENSMUST00000140523 3032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.93□□□□□ -0.82
Loxl1P97873 Dcaf10-204ENSMUST00000155551 7250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.93□□□□□ -0.82
Loxl1P97873 Tagln2-202ENSMUST00000111230 1586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.93□□□□□ -0.82
Loxl1P97873 Dmtn-208ENSMUST00000228009 2643 ntAPPRIS P2 BASIC9.93□□□□□ -0.82
Loxl1P97873 Mxd1-201ENSMUST00000001184 4666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.93□□□□□ -0.82
Loxl1P97873 Ablim1-211ENSMUST00000111555 2562 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.93□□□□□ -0.82
Loxl1P97873 Arsg-202ENSMUST00000106696 1508 ntTSL 1 (best) BASIC9.93□□□□□ -0.82
Loxl1P97873 Kcnab2-201ENSMUST00000030768 3533 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC9.93□□□□□ -0.82
Loxl1P97873 Dennd4b-201ENSMUST00000098914 5423 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.93□□□□□ -0.82
Loxl1P97873 Tnk2-205ENSMUST00000115124 4424 ntTSL 1 (best) BASIC9.93□□□□□ -0.82
Loxl1P97873 Trpc7-207ENSMUST00000173817 2406 ntTSL 5 BASIC9.93□□□□□ -0.82
Loxl1P97873 Zfp536-203ENSMUST00000176114 4341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.93□□□□□ -0.82
Loxl1P97873 Pcgf2-202ENSMUST00000103148 1438 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.93□□□□□ -0.82
Loxl1P97873 Lcp2-202ENSMUST00000109329 2209 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.93□□□□□ -0.82
Loxl1P97873 Eif4a2-223ENSMUST00000168891 2203 ntTSL 1 (best) BASIC9.93□□□□□ -0.82
Loxl1P97873 Odf2l-201ENSMUST00000029920 2239 ntTSL 1 (best) BASIC9.93□□□□□ -0.82
Loxl1P97873 Olfr1349-204ENSMUST00000207820 1325 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC9.93□□□□□ -0.82
Loxl1P97873 Ighg2c-201ENSMUST00000103416 1214 ntAPPRIS P5 BASIC9.93□□□□□ -0.82
Loxl1P97873 Trav13d-4-201ENSMUST00000103607 264 ntAPPRIS P1 BASIC9.93□□□□□ -0.82
Loxl1P97873 Myl4-202ENSMUST00000106956 900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.93□□□□□ -0.82
Loxl1P97873 Dynlrb1-202ENSMUST00000109682 684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.93□□□□□ -0.82
Loxl1P97873 Gm15515-201ENSMUST00000117827 822 ntBASIC9.93□□□□□ -0.82
Loxl1P97873 Platr29-201ENSMUST00000130022 830 ntTSL 5 BASIC9.93□□□□□ -0.82
Loxl1P97873 Ubl5-206ENSMUST00000161486 794 ntTSL 2 BASIC9.93□□□□□ -0.82
Loxl1P97873 Lsm2-207ENSMUST00000173004 870 ntTSL 1 (best) BASIC9.93□□□□□ -0.82
Loxl1P97873 Apoe-208ENSMUST00000174191 472 ntTSL 2 BASIC9.93□□□□□ -0.82
Loxl1P97873 Gm20442-201ENSMUST00000174630 492 ntTSL 3 BASIC9.93□□□□□ -0.82
Loxl1P97873 Trav13-4-dv7-202ENSMUST00000184905 264 ntAPPRIS P1 BASIC9.93□□□□□ -0.82
Loxl1P97873 Myl4-201ENSMUST00000018800 879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.93□□□□□ -0.82
Loxl1P97873 Gm38228-201ENSMUST00000193169 1293 ntBASIC9.93□□□□□ -0.82
Loxl1P97873 Gm33222-201ENSMUST00000193725 654 ntTSL 3 BASIC9.93□□□□□ -0.82
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 43.9 ms