Protein–RNA interactions for Protein: P97309

Mesp1, Mesoderm posterior protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 243 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Mesp1P97309 Gm13296-201ENSMUST00000117854 997 ntBASIC10.49□□□□□ -0.73
Mesp1P97309 Dctn6-203ENSMUST00000118811 934 ntTSL 3 BASIC10.49□□□□□ -0.73
Mesp1P97309 Gm7722-201ENSMUST00000120646 741 ntBASIC10.49□□□□□ -0.73
Mesp1P97309 Immp2l-202ENSMUST00000132121 1147 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.49□□□□□ -0.73
Mesp1P97309 Gm12199-201ENSMUST00000137567 517 ntTSL 3 BASIC10.49□□□□□ -0.73
Mesp1P97309 Gm829-202ENSMUST00000146622 722 ntTSL 1 (best) BASIC10.49□□□□□ -0.73
Mesp1P97309 Gm11379-201ENSMUST00000154678 381 ntTSL 3 BASIC10.49□□□□□ -0.73
Mesp1P97309 C030017D09Rik-201ENSMUST00000163690 923 ntTSL 1 (best) BASIC10.49□□□□□ -0.73
Mesp1P97309 Rps28-202ENSMUST00000166693 271 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.49□□□□□ -0.73
Mesp1P97309 Ftl1-ps2-201ENSMUST00000169477 549 ntBASIC10.49□□□□□ -0.73
Mesp1P97309 Mymx-203ENSMUST00000178858 804 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.49□□□□□ -0.73
Mesp1P97309 Gm9230-201ENSMUST00000188228 532 ntBASIC10.49□□□□□ -0.73
Mesp1P97309 Ighv5-7-201ENSMUST00000192302 244 ntBASIC10.49□□□□□ -0.73
Mesp1P97309 Gm9176-201ENSMUST00000219955 1120 ntBASIC10.49□□□□□ -0.73
Mesp1P97309 Hsd17b10-201ENSMUST00000026289 962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.49□□□□□ -0.73
Mesp1P97309 Vipas39-203ENSMUST00000179379 2418 ntTSL 1 (best) BASIC10.49□□□□□ -0.73
Mesp1P97309 Pcdhgb6-201ENSMUST00000003599 4684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.49□□□□□ -0.73
Mesp1P97309 Ncapd3-201ENSMUST00000073127 5499 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.49□□□□□ -0.73
Mesp1P97309 Gm45765-202ENSMUST00000212921 1313 ntTSL 5 BASIC10.49□□□□□ -0.73
Mesp1P97309 Gm36635-201ENSMUST00000221152 1332 ntTSL 5 BASIC10.49□□□□□ -0.73
Mesp1P97309 Synpo-211ENSMUST00000155195 4442 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.49□□□□□ -0.73
Mesp1P97309 Spata33-202ENSMUST00000212161 2941 ntTSL 2 BASIC10.49□□□□□ -0.73
Mesp1P97309 Pxylp1-201ENSMUST00000078478 2908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.49□□□□□ -0.73
Mesp1P97309 Pnp2-201ENSMUST00000095925 1372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.49□□□□□ -0.73
Mesp1P97309 Tom1-201ENSMUST00000078847 1769 ntTSL 1 (best) BASIC10.49□□□□□ -0.73
Mesp1P97309 Borcs7-201ENSMUST00000074912 2176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.49□□□□□ -0.73
Mesp1P97309 Eng-202ENSMUST00000113272 3021 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.49□□□□□ -0.73
Mesp1P97309 Nup205-201ENSMUST00000043815 6412 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.49□□□□□ -0.73
Mesp1P97309 Dis3l-208ENSMUST00000168844 3575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.49□□□□□ -0.73
Mesp1P97309 Izumo1-201ENSMUST00000033100 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.49□□□□□ -0.73
Mesp1P97309 Reln-207ENSMUST00000161356 11699 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC10.49□□□□□ -0.73
Mesp1P97309 Abca7-203ENSMUST00000171637 6638 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.48□□□□□ -0.73
Mesp1P97309 Otub2-202ENSMUST00000101094 3228 ntTSL 1 (best) BASIC10.48□□□□□ -0.73
Mesp1P97309 Usp14-201ENSMUST00000092096 2360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.48□□□□□ -0.73
Mesp1P97309 Syncrip-210ENSMUST00000174391 6257 ntTSL 1 (best) BASIC10.48□□□□□ -0.73
Mesp1P97309 Runx1-201ENSMUST00000023673 5861 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.48□□□□□ -0.73
Mesp1P97309 Ccdc159-202ENSMUST00000170304 1519 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.48□□□□□ -0.73
Mesp1P97309 Myo18a-210ENSMUST00000130305 5450 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.48□□□□□ -0.73
Mesp1P97309 Gbf1-201ENSMUST00000026254 6450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.48□□□□□ -0.73
Mesp1P97309 Dbf4-204ENSMUST00000168500 2000 ntTSL 5 BASIC10.48□□□□□ -0.73
Mesp1P97309 Strip2-205ENSMUST00000151738 5281 ntTSL 1 (best) BASIC10.48□□□□□ -0.73
Mesp1P97309 Slc6a9-209ENSMUST00000163288 2107 ntTSL 5 BASIC10.48□□□□□ -0.73
Mesp1P97309 Ercc8-201ENSMUST00000054835 2111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.48□□□□□ -0.73
Mesp1P97309 Cyyr1-201ENSMUST00000114174 5464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.48□□□□□ -0.73
Mesp1P97309 Tgm2-201ENSMUST00000103122 3596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.48□□□□□ -0.73
Mesp1P97309 Rgs17-203ENSMUST00000117676 1651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.48□□□□□ -0.73
Mesp1P97309 Glis3-209ENSMUST00000162022 7514 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.48□□□□□ -0.73
Mesp1P97309 Ptpn2-203ENSMUST00000122412 2667 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.48□□□□□ -0.73
Mesp1P97309 Asph-212ENSMUST00000108340 6646 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.48□□□□□ -0.73
Mesp1P97309 Wwtr1-201ENSMUST00000029380 4697 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.48□□□□□ -0.73
Mesp1P97309 Slc6a4-201ENSMUST00000021195 2725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.48□□□□□ -0.73
Mesp1P97309 Adamtsl3-204ENSMUST00000173828 2292 ntTSL 5 BASIC10.48□□□□□ -0.73
Mesp1P97309 3200001D21Rik-201ENSMUST00000221603 2283 ntTSL 1 (best) BASIC10.48□□□□□ -0.73
Mesp1P97309 Tax1bp3-202ENSMUST00000108477 1153 ntTSL 5 BASIC10.48□□□□□ -0.73
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Mesp1P97309 Rps10-203ENSMUST00000114882 614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.48□□□□□ -0.73
Mesp1P97309 H2-M6-ps-201ENSMUST00000119193 1034 ntBASIC10.48□□□□□ -0.73
Mesp1P97309 Mettl1-202ENSMUST00000120542 1044 ntTSL 1 (best) BASIC10.48□□□□□ -0.73
Mesp1P97309 Gm15906-201ENSMUST00000124746 323 ntTSL 5 BASIC10.48□□□□□ -0.73
Mesp1P97309 Gm13388-201ENSMUST00000126659 425 ntTSL 3 BASIC10.48□□□□□ -0.73
Mesp1P97309 Gm12298-201ENSMUST00000126999 731 ntTSL 1 (best) BASIC10.48□□□□□ -0.73
Mesp1P97309 4930483J18Rik-202ENSMUST00000138715 1093 ntTSL 1 (best) BASIC10.48□□□□□ -0.73
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Mesp1P97309 Adtrp-204ENSMUST00000179758 1046 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.48□□□□□ -0.73
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Mesp1P97309 Ip6k2-202ENSMUST00000192028 1199 ntTSL 1 (best) BASIC10.48□□□□□ -0.73
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Mesp1P97309 Hax1-205ENSMUST00000197767 1092 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.48□□□□□ -0.73
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Mesp1P97309 6430710M23Rik-201ENSMUST00000210843 1191 ntBASIC10.48□□□□□ -0.73
Mesp1P97309 Caly-204ENSMUST00000211283 975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.48□□□□□ -0.73
Mesp1P97309 AC131777.1-201ENSMUST00000214749 387 ntTSL 3 BASIC10.48□□□□□ -0.73
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Mesp1P97309 AC025913.2-202ENSMUST00000219248 605 ntTSL 5 BASIC10.48□□□□□ -0.73
Mesp1P97309 Gm46400-201ENSMUST00000222294 724 ntTSL 5 BASIC10.48□□□□□ -0.73
Mesp1P97309 Zfp706-203ENSMUST00000226453 517 ntAPPRIS P1 BASIC10.48□□□□□ -0.73
Mesp1P97309 4930569F06Rik-201ENSMUST00000036821 433 ntBASIC10.48□□□□□ -0.73
Mesp1P97309 Gm12166-201ENSMUST00000093169 958 ntAPPRIS P1 BASIC10.48□□□□□ -0.73
Mesp1P97309 Car10-206ENSMUST00000107863 3334 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.48□□□□□ -0.73
Mesp1P97309 Dnaic2-201ENSMUST00000069325 2874 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.48□□□□□ -0.73
Mesp1P97309 D930032P07Rik-201ENSMUST00000181393 1314 ntTSL 1 (best) BASIC10.48□□□□□ -0.73
Mesp1P97309 N4bp2l1-201ENSMUST00000016279 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.48□□□□□ -0.73
Mesp1P97309 Arhgef16-207ENSMUST00000169623 2474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.48□□□□□ -0.73
Mesp1P97309 Usp3-211ENSMUST00000174387 1901 ntTSL 5 BASIC10.48□□□□□ -0.73
Mesp1P97309 Gm18262-201ENSMUST00000222560 1946 ntBASIC10.48□□□□□ -0.73
Mesp1P97309 Fam78a-201ENSMUST00000056406 4107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.48□□□□□ -0.73
Mesp1P97309 Fyb2-201ENSMUST00000106803 3136 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.48□□□□□ -0.73
Mesp1P97309 Kcnj11-205ENSMUST00000211674 3142 ntAPPRIS P1 BASIC10.48□□□□□ -0.73
Mesp1P97309 Ankrd33-201ENSMUST00000070875 1442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.48□□□□□ -0.73
Mesp1P97309 Entpd5-203ENSMUST00000110272 4972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.48□□□□□ -0.73
Mesp1P97309 Arid4a-201ENSMUST00000046305 4998 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.48□□□□□ -0.73
Mesp1P97309 Gm5124-202ENSMUST00000132683 2083 ntBASIC10.48□□□□□ -0.73
Mesp1P97309 Myo15b-208ENSMUST00000222123 5154 ntTSL 5 BASIC10.48□□□□□ -0.73
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Mesp1P97309 Extl3-203ENSMUST00000225633 6013 ntAPPRIS P1 BASIC10.48□□□□□ -0.73
Mesp1P97309 Jak1-201ENSMUST00000102781 4906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.47□□□□□ -0.73
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