Protein–RNA interactions for Protein: P81067

Irx3, Iroquois-class homeodomain protein IRX-3, mousemouse

Predictions only

Length 507 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Irx3P81067 Mocs2-215ENSMUST00000184335 646 ntTSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Irx3P81067 Gm18212-201ENSMUST00000211678 889 ntBASIC15.17■□□□□ 0.02
Irx3P81067 Ssc4d-201ENSMUST00000054895 1191 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Irx3P81067 Zfp932-201ENSMUST00000099484 451 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Irx3P81067 Pidd1-202ENSMUST00000106005 2900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Irx3P81067 Mast1-201ENSMUST00000109741 4872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Irx3P81067 Parvg-207ENSMUST00000163667 2700 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Irx3P81067 Trim45-201ENSMUST00000037409 4612 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Irx3P81067 Zfyve1-203ENSMUST00000221919 4420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Irx3P81067 Rpap2-205ENSMUST00000112655 2686 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Irx3P81067 Gm43273-201ENSMUST00000199649 2594 ntBASIC15.17■□□□□ 0.02
Irx3P81067 Parp9-203ENSMUST00000114878 3548 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Irx3P81067 Celf2-225ENSMUST00000183091 2177 ntTSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Irx3P81067 Timd4-201ENSMUST00000068877 2173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Irx3P81067 Elmsan1-201ENSMUST00000046266 6848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Irx3P81067 Myh2-203ENSMUST00000170159 6083 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Irx3P81067 Gm38157-201ENSMUST00000194178 1698 ntBASIC15.16■□□□□ 0.02
Irx3P81067 Tmcc1-210ENSMUST00000204353 2851 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Irx3P81067 Paqr8-202ENSMUST00000167119 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Irx3P81067 Gm38292-201ENSMUST00000192646 3045 ntBASIC15.16■□□□□ 0.02
Irx3P81067 Zbtb44-201ENSMUST00000115222 8861 ntTSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Irx3P81067 Myl4-202ENSMUST00000106956 900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Irx3P81067 Prr15l-203ENSMUST00000107633 930 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Irx3P81067 Has2os-201ENSMUST00000125401 485 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Irx3P81067 Tepp-204ENSMUST00000161029 968 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Irx3P81067 Myl4-201ENSMUST00000018800 879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Irx3P81067 Cym-201ENSMUST00000029504 1236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Irx3P81067 Pcdhgb7-201ENSMUST00000194928 4713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Irx3P81067 Lrrc36-201ENSMUST00000067305 2082 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Irx3P81067 Aoc2-201ENSMUST00000041095 2543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Irx3P81067 Gm26660-202ENSMUST00000223620 4112 ntBASIC15.16■□□□□ 0.02
Irx3P81067 Mtap-201ENSMUST00000058030 2797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Irx3P81067 Pde4d-220ENSMUST00000177907 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Irx3P81067 Thoc5-201ENSMUST00000038237 2235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Irx3P81067 Txndc5-203ENSMUST00000160653 2586 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Irx3P81067 Kndc1-201ENSMUST00000053445 7299 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Irx3P81067 Prr15l-201ENSMUST00000054311 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Irx3P81067 Igf1-203ENSMUST00000105300 1673 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Irx3P81067 Sh2d5-201ENSMUST00000105823 3529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Irx3P81067 Chek1-202ENSMUST00000172702 3797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Irx3P81067 Nckap5-212ENSMUST00000162877 2630 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Irx3P81067 AC139350.1-201ENSMUST00000227064 1594 ntBASIC15.15■□□□□ 0.02
Irx3P81067 Per1-206ENSMUST00000166748 4636 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Irx3P81067 Zfand4-202ENSMUST00000112900 3220 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
Irx3P81067 Dnmbp-201ENSMUST00000026209 4882 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.15■□□□□ 0.02
Irx3P81067 Tbc1d14-202ENSMUST00000124036 2765 ntTSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
Irx3P81067 Gbf1-201ENSMUST00000026254 6450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Irx3P81067 Patl1-201ENSMUST00000061618 4221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Irx3P81067 Aldh16a1-206ENSMUST00000209963 3537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Irx3P81067 Zp1-201ENSMUST00000025641 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Irx3P81067 Acsl6-202ENSMUST00000064690 1988 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Irx3P81067 Slx4-201ENSMUST00000040790 5706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Irx3P81067 Stat3-203ENSMUST00000127638 4516 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Irx3P81067 Gm5466-201ENSMUST00000119395 1890 ntBASIC15.15■□□□□ 0.02
Irx3P81067 4930522L14Rik-201ENSMUST00000100937 599 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Irx3P81067 C330007P06Rik-203ENSMUST00000115249 1145 ntTSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
Irx3P81067 Rbm3-202ENSMUST00000115615 1183 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Irx3P81067 Rbm3-203ENSMUST00000115616 1225 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Irx3P81067 Gm14028-201ENSMUST00000117434 479 ntBASIC15.15■□□□□ 0.02
Irx3P81067 Gm11531-201ENSMUST00000117614 555 ntBASIC15.15■□□□□ 0.02
Irx3P81067 Gm34466-201ENSMUST00000222218 505 ntTSL 2 BASIC15.15■□□□□ 0.02
Irx3P81067 AC126253.1-202ENSMUST00000226732 835 ntBASIC15.15■□□□□ 0.02
Irx3P81067 Smndc1-201ENSMUST00000025997 2125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Irx3P81067 Cry2-201ENSMUST00000090559 3976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Irx3P81067 Gm43417-201ENSMUST00000201586 5207 ntBASIC15.15■□□□□ 0.02
Irx3P81067 Grip2-201ENSMUST00000159684 3006 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
Irx3P81067 Olfr56-202ENSMUST00000102785 1930 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Irx3P81067 Gm42141-201ENSMUST00000196534 2172 ntBASIC15.15■□□□□ 0.02
Irx3P81067 Tbc1d1-204ENSMUST00000121370 5419 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Irx3P81067 Myo5b-203ENSMUST00000121875 6065 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
Irx3P81067 Siglecg-201ENSMUST00000005592 2569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Irx3P81067 Ttll10-202ENSMUST00000051509 2304 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Irx3P81067 Eif4e2-206ENSMUST00000113233 1807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Irx3P81067 Gm16741-201ENSMUST00000145085 1818 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Irx3P81067 Gm10451-201ENSMUST00000101281 1598 ntTSL 2 BASIC15.15■□□□□ 0.02
Irx3P81067 Dmbt1-206ENSMUST00000213064 5779 ntTSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
Irx3P81067 Pex11g-201ENSMUST00000004686 2870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Irx3P81067 Ntng1-211ENSMUST00000156177 4652 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Irx3P81067 Nmral1-202ENSMUST00000079130 1459 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Irx3P81067 Zfp433-202ENSMUST00000200889 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Irx3P81067 Gm32687-201ENSMUST00000220314 2379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Irx3P81067 Spg11-201ENSMUST00000036450 7671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Irx3P81067 Pde3a-201ENSMUST00000043259 12302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Irx3P81067 Kif19a-201ENSMUST00000084368 3433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Irx3P81067 Tomt-202ENSMUST00000106970 1354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Irx3P81067 Lsp1-211ENSMUST00000149521 1910 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Irx3P81067 Zfp93-201ENSMUST00000032696 2324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Irx3P81067 Slc29a1-213ENSMUST00000167692 2092 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Irx3P81067 Rnf220-202ENSMUST00000094853 1675 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Irx3P81067 Nedd9-202ENSMUST00000163623 4626 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Irx3P81067 Gm25214-201ENSMUST00000104573 129 ntBASIC15.14■□□□□ 0.01
Irx3P81067 Gngt2-207ENSMUST00000107714 558 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.14■□□□□ 0.01
Irx3P81067 Gm15276-201ENSMUST00000145953 498 ntBASIC15.14■□□□□ 0.01
Irx3P81067 Gm26973-201ENSMUST00000182105 696 ntTSL 3 BASIC15.14■□□□□ 0.01
Irx3P81067 Gm2546-201ENSMUST00000182630 991 ntBASIC15.14■□□□□ 0.01
Irx3P81067 Gm4691-202ENSMUST00000182989 885 ntTSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
Irx3P81067 Gm28287-201ENSMUST00000186612 546 ntTSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
Irx3P81067 Gm2453-202ENSMUST00000195508 568 ntTSL 3 BASIC15.14■□□□□ 0.01
Irx3P81067 Gstp-ps-201ENSMUST00000195526 631 ntBASIC15.14■□□□□ 0.01
Irx3P81067 Gm19605-201ENSMUST00000220603 686 ntTSL 3 BASIC15.14■□□□□ 0.01
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 58.1 ms