Protein–RNA interactions for Protein: P62908

Rps3, 40S ribosomal protein S3, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 243 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rps3P62908 Kif28-202ENSMUST00000211943 2643 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.89□□□□□ -0.51
Rps3P62908 Mmab-201ENSMUST00000031560 3020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
Rps3P62908 Tnnt3-211ENSMUST00000105949 955 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.89□□□□□ -0.51
Rps3P62908 Dctn6-203ENSMUST00000118811 934 ntTSL 3 BASIC11.89□□□□□ -0.51
Rps3P62908 Nrg4-204ENSMUST00000130158 1000 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.89□□□□□ -0.51
Rps3P62908 Gm24749-201ENSMUST00000157838 343 ntBASIC11.89□□□□□ -0.51
Rps3P62908 Gm4857-201ENSMUST00000192718 785 ntBASIC11.89□□□□□ -0.51
Rps3P62908 Gm34728-201ENSMUST00000201510 414 ntTSL 3 BASIC11.89□□□□□ -0.51
Rps3P62908 Nkg7-203ENSMUST00000206741 686 ntTSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
Rps3P62908 Emp3-203ENSMUST00000210297 601 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC11.89□□□□□ -0.51
Rps3P62908 4930578M07Rik-202ENSMUST00000212946 552 ntTSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
Rps3P62908 Gm7293-201ENSMUST00000216682 1007 ntBASIC11.89□□□□□ -0.51
Rps3P62908 Blvrb-201ENSMUST00000037399 1028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
Rps3P62908 Rpl18-201ENSMUST00000072503 679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
Rps3P62908 Prr18-202ENSMUST00000163887 3251 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC11.89□□□□□ -0.51
Rps3P62908 Vwa7-201ENSMUST00000007245 4313 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
Rps3P62908 Gm28373-201ENSMUST00000178129 2724 ntTSL 2 BASIC11.89□□□□□ -0.51
Rps3P62908 Strada-202ENSMUST00000103072 1517 ntTSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
Rps3P62908 Cd72-201ENSMUST00000030179 1505 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
Rps3P62908 Serpinf2-202ENSMUST00000108437 2179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
Rps3P62908 Agxt2-204ENSMUST00000110542 2198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
Rps3P62908 Camsap3-205ENSMUST00000207432 3865 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
Rps3P62908 Epb41l2-207ENSMUST00000218903 4115 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
Rps3P62908 Bcl11a-201ENSMUST00000000881 3061 ntTSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
Rps3P62908 Gdap2-202ENSMUST00000106997 2014 ntTSL 2 BASIC11.89□□□□□ -0.51
Rps3P62908 Lrp2-203ENSMUST00000100051 4359 ntTSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
Rps3P62908 Smpd3-201ENSMUST00000067512 5148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
Rps3P62908 Tmem178b-201ENSMUST00000061740 3178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
Rps3P62908 Alox5-202ENSMUST00000164547 1854 ntTSL 5 BASIC11.89□□□□□ -0.51
Rps3P62908 Kdm1b-201ENSMUST00000037025 4987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
Rps3P62908 Fn1-216ENSMUST00000189821 7410 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
Rps3P62908 Gm45902-202ENSMUST00000140494 2390 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.89□□□□□ -0.51
Rps3P62908 Hrct1-201ENSMUST00000095109 1452 ntAPPRIS P1 BASIC11.89□□□□□ -0.51
Rps3P62908 Gipc3-201ENSMUST00000045102 3521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
Rps3P62908 Samd11-204ENSMUST00000218788 2217 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
Rps3P62908 Hltf-201ENSMUST00000002502 4955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
Rps3P62908 Krba1-203ENSMUST00000114571 6695 ntTSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
Rps3P62908 Gng5-202ENSMUST00000118280 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
Rps3P62908 Gm43773-201ENSMUST00000198548 2162 ntBASIC11.88□□□□□ -0.51
Rps3P62908 Gsdmcl2-203ENSMUST00000185431 1911 ntBASIC11.88□□□□□ -0.51
Rps3P62908 Ywhaz-203ENSMUST00000110361 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
Rps3P62908 Add2-208ENSMUST00000203786 2289 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
Rps3P62908 Sypl-201ENSMUST00000020885 2019 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
Rps3P62908 Pik3cd-203ENSMUST00000105689 3132 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
Rps3P62908 Ttbk2-203ENSMUST00000085840 11152 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.88□□□□□ -0.51
Rps3P62908 Fam214b-203ENSMUST00000107957 3234 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.88□□□□□ -0.51
Rps3P62908 Spint5-201ENSMUST00000103097 443 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
Rps3P62908 Limd2-203ENSMUST00000106875 936 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC11.88□□□□□ -0.51
Rps3P62908 Hopx-202ENSMUST00000113453 1113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
Rps3P62908 C030017D09Rik-201ENSMUST00000163690 923 ntTSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
Rps3P62908 5430405H02Rik-202ENSMUST00000176134 1196 ntTSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
Rps3P62908 Rpl41-203ENSMUST00000176683 437 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC11.88□□□□□ -0.51
Rps3P62908 Rpl41-206ENSMUST00000177163 544 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
Rps3P62908 Gm8888-201ENSMUST00000177677 381 ntAPPRIS P1 BASIC11.88□□□□□ -0.51
Rps3P62908 Spint5-202ENSMUST00000180193 443 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.88□□□□□ -0.51
Rps3P62908 Gm43184-201ENSMUST00000197247 542 ntBASIC11.88□□□□□ -0.51
Rps3P62908 9230114K14Rik-203ENSMUST00000199547 437 ntTSL 3 BASIC11.88□□□□□ -0.51
Rps3P62908 Gm2762-206ENSMUST00000202502 335 ntTSL 3 BASIC11.88□□□□□ -0.51
Rps3P62908 Gm2762-208ENSMUST00000202976 568 ntTSL 3 BASIC11.88□□□□□ -0.51
Rps3P62908 Calca-204ENSMUST00000205714 416 ntTSL 2 BASIC11.88□□□□□ -0.51
Rps3P62908 Gm21027-201ENSMUST00000219300 1236 ntBASIC11.88□□□□□ -0.51
Rps3P62908 Gm19605-202ENSMUST00000221514 1084 ntTSL 5 BASIC11.88□□□□□ -0.51
Rps3P62908 Pebp4-201ENSMUST00000022678 1079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
Rps3P62908 Prg2-201ENSMUST00000028467 838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
Rps3P62908 Mrpl41-201ENSMUST00000045604 776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
Rps3P62908 Olfr605-201ENSMUST00000080660 1011 ntAPPRIS P1 BASIC11.88□□□□□ -0.51
Rps3P62908 Cbx3-ps1-201ENSMUST00000091539 545 ntBASIC11.88□□□□□ -0.51
Rps3P62908 Smarcb1-202ENSMUST00000121304 1622 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
Rps3P62908 Slc6a13-201ENSMUST00000064580 2234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
Rps3P62908 B430119L08Rik-201ENSMUST00000130054 1994 ntTSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
Rps3P62908 6030443J06Rik-202ENSMUST00000181374 1353 ntTSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
Rps3P62908 Kif1a-210ENSMUST00000190723 6141 ntTSL 5 BASIC11.88□□□□□ -0.51
Rps3P62908 Pink1-202ENSMUST00000105816 1465 ntTSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
Rps3P62908 Synpo-211ENSMUST00000155195 4442 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
Rps3P62908 Eogt-201ENSMUST00000054344 4424 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
Rps3P62908 Capn2-201ENSMUST00000068505 3225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
Rps3P62908 Camta2-202ENSMUST00000100933 4383 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.88□□□□□ -0.51
Rps3P62908 Gabrr2-202ENSMUST00000108162 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
Rps3P62908 Camta2-204ENSMUST00000108545 4377 ntTSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
Rps3P62908 Camta2-206ENSMUST00000120261 4398 ntTSL 5 BASIC11.88□□□□□ -0.51
Rps3P62908 Pif1-202ENSMUST00000131483 3309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
Rps3P62908 Gja5-203ENSMUST00000199597 3668 ntTSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
Rps3P62908 Phkg2-201ENSMUST00000033086 1570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
Rps3P62908 Dock11-201ENSMUST00000033419 6665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
Rps3P62908 Jhy-201ENSMUST00000034521 3074 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.88□□□□□ -0.51
Rps3P62908 Rspry1-201ENSMUST00000060389 3852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
Rps3P62908 Cend1-203ENSMUST00000137488 1697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
Rps3P62908 Wars-201ENSMUST00000109848 2831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
Rps3P62908 Vmn1r45-206ENSMUST00000227977 3297 ntAPPRIS P1 BASIC11.87□□□□□ -0.51
Rps3P62908 Slc7a7-201ENSMUST00000000984 2132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
Rps3P62908 Slc16a12-201ENSMUST00000009522 4051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
Rps3P62908 Fam160b2-201ENSMUST00000022690 4033 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.87□□□□□ -0.51
Rps3P62908 AL670603.1-201ENSMUST00000216692 1535 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.87□□□□□ -0.51
Rps3P62908 Gm20125-205ENSMUST00000208005 1979 ntTSL 5 BASIC11.87□□□□□ -0.51
Rps3P62908 Grm5-201ENSMUST00000107263 3516 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
Rps3P62908 Gm23949-201ENSMUST00000104027 127 ntBASIC11.87□□□□□ -0.51
Rps3P62908 Gm11596-201ENSMUST00000105058 1079 ntAPPRIS P1 BASIC11.87□□□□□ -0.51
Rps3P62908 Eif5a-205ENSMUST00000108608 775 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.87□□□□□ -0.51
Rps3P62908 Bnip3-203ENSMUST00000130500 719 ntTSL 2 BASIC11.87□□□□□ -0.51
Rps3P62908 Gm12690-201ENSMUST00000132108 354 ntTSL 3 BASIC11.87□□□□□ -0.51
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 46.4 ms