Protein–RNA interactions for Protein: P62274

Rps29, 40S ribosomal protein S29, mousemouse

Predictions only

Length 56 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rps29P62274 Gm44867-201ENSMUST00000205675 530 ntTSL 3 BASIC6.73□□□□□ -1.33
Rps29P62274 Ssr4-201ENSMUST00000002090 765 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC6.73□□□□□ -1.33
Rps29P62274 Ccl1-201ENSMUST00000021043 611 ntTSL 1 (best) BASIC6.73□□□□□ -1.33
Rps29P62274 Caly-203ENSMUST00000211044 1029 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.73□□□□□ -1.33
Rps29P62274 AC160052.1-201ENSMUST00000213173 1248 ntTSL 5 BASIC6.73□□□□□ -1.33
Rps29P62274 Ankrd7-201ENSMUST00000031489 1190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.73□□□□□ -1.33
Rps29P62274 Sftpd-201ENSMUST00000077136 1275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.73□□□□□ -1.33
Rps29P62274 Zfp932-201ENSMUST00000099484 451 ntTSL 1 (best) BASIC6.73□□□□□ -1.33
Rps29P62274 Fam13b-201ENSMUST00000040506 3343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.73□□□□□ -1.33
Rps29P62274 Cdh18-204ENSMUST00000165614 2162 ntTSL 5 BASIC6.73□□□□□ -1.33
Rps29P62274 Borcs7-201ENSMUST00000074912 2176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.73□□□□□ -1.33
Rps29P62274 9930014A18Rik-201ENSMUST00000180730 3074 ntTSL 1 (best) BASIC6.73□□□□□ -1.33
Rps29P62274 Rbm5-201ENSMUST00000035199 3064 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC6.73□□□□□ -1.33
Rps29P62274 Gm26883-201ENSMUST00000180945 4878 ntTSL 5 BASIC6.73□□□□□ -1.33
Rps29P62274 Dnpep-203ENSMUST00000185419 2833 ntTSL 1 (best) BASIC6.73□□□□□ -1.33
Rps29P62274 Adipor2-202ENSMUST00000169744 3489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.73□□□□□ -1.33
Rps29P62274 Reps1-201ENSMUST00000126390 2595 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC6.73□□□□□ -1.33
Rps29P62274 Gm42890-202ENSMUST00000167642 2566 ntTSL 1 (best) BASIC6.73□□□□□ -1.33
Rps29P62274 Dync1i2-202ENSMUST00000100028 2097 ntTSL 5 BASIC6.73□□□□□ -1.33
Rps29P62274 Ntrk2-201ENSMUST00000079828 8744 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.73□□□□□ -1.33
Rps29P62274 Nacc1-201ENSMUST00000001975 4300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.73□□□□□ -1.33
Rps29P62274 Lysmd1-201ENSMUST00000066386 2394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.73□□□□□ -1.33
Rps29P62274 Krtap10-10-201ENSMUST00000218843 1306 ntAPPRIS P1 BASIC6.73□□□□□ -1.33
Rps29P62274 4930528D03Rik-203ENSMUST00000225577 1348 ntBASIC6.73□□□□□ -1.33
Rps29P62274 Gm19817-201ENSMUST00000199764 2132 ntBASIC6.73□□□□□ -1.33
Rps29P62274 Gpa33-202ENSMUST00000060833 2515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.73□□□□□ -1.33
Rps29P62274 Pdp1-202ENSMUST00000095144 2506 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC6.73□□□□□ -1.33
Rps29P62274 Tfe3-204ENSMUST00000115677 2943 ntTSL 1 (best) BASIC6.73□□□□□ -1.33
Rps29P62274 Emp1-206ENSMUST00000205156 2911 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.73□□□□□ -1.33
Rps29P62274 Neu4-201ENSMUST00000050890 4511 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC6.73□□□□□ -1.33
Rps29P62274 Flrt1-201ENSMUST00000113383 5859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.73□□□□□ -1.33
Rps29P62274 Ptpn2-203ENSMUST00000122412 2667 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.73□□□□□ -1.33
Rps29P62274 Kdm4d-201ENSMUST00000058796 2695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.73□□□□□ -1.33
Rps29P62274 Grsf1-202ENSMUST00000113234 2286 ntTSL 1 (best) BASIC6.73□□□□□ -1.33
Rps29P62274 C130050O18Rik-202ENSMUST00000163940 1618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.72□□□□□ -1.33
Rps29P62274 Rgs6-211ENSMUST00000191107 1621 ntTSL 5 BASIC6.72□□□□□ -1.33
Rps29P62274 Gm43773-201ENSMUST00000198548 2162 ntBASIC6.72□□□□□ -1.33
Rps29P62274 Zfp687-201ENSMUST00000019482 4632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.72□□□□□ -1.33
Rps29P62274 Gm26811-201ENSMUST00000181258 5485 ntTSL 1 (best) BASIC6.72□□□□□ -1.33
Rps29P62274 Sh3tc2-201ENSMUST00000051720 4536 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC6.72□□□□□ -1.33
Rps29P62274 Gm6580-201ENSMUST00000117504 1357 ntBASIC6.72□□□□□ -1.33
Rps29P62274 Mff-209ENSMUST00000160972 1358 ntTSL 1 (best) BASIC6.72□□□□□ -1.33
Rps29P62274 AC166574.4-201ENSMUST00000227165 1937 ntBASIC6.72□□□□□ -1.33
Rps29P62274 Spast-201ENSMUST00000024869 4672 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC6.72□□□□□ -1.33
Rps29P62274 Txndc12-201ENSMUST00000030296 1359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.72□□□□□ -1.33
Rps29P62274 Ubqln1-202ENSMUST00000076454 3561 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC6.72□□□□□ -1.33
Rps29P62274 Ndrg2-201ENSMUST00000004673 2099 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC6.72□□□□□ -1.33
Rps29P62274 Olfr1156-202ENSMUST00000216191 3300 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.72□□□□□ -1.33
Rps29P62274 Prex1-202ENSMUST00000099080 5818 ntTSL 1 (best) BASIC6.72□□□□□ -1.33
Rps29P62274 Tmcc2-206ENSMUST00000142609 2769 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.72□□□□□ -1.33
Rps29P62274 AC159314.1-201ENSMUST00000216917 3485 ntTSL 1 (best) BASIC6.72□□□□□ -1.33
Rps29P62274 Gabpb1-206ENSMUST00000110425 4153 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC6.72□□□□□ -1.33
Rps29P62274 Clcn3-201ENSMUST00000004430 4175 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC6.72□□□□□ -1.33
Rps29P62274 Arhgef2-201ENSMUST00000029694 4300 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC6.72□□□□□ -1.33
Rps29P62274 Ap5b1-201ENSMUST00000096318 3092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.72□□□□□ -1.33
Rps29P62274 Cyp26b1-204ENSMUST00000204146 4495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.72□□□□□ -1.33
Rps29P62274 Cacna1g-205ENSMUST00000107786 7984 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.72□□□□□ -1.33
Rps29P62274 Cacna1g-210ENSMUST00000107792 7981 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC6.72□□□□□ -1.33
Rps29P62274 Cacnb2-203ENSMUST00000114723 3945 ntTSL 1 (best) BASIC6.72□□□□□ -1.33
Rps29P62274 Jak1-201ENSMUST00000102781 4906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.72□□□□□ -1.33
Rps29P62274 Plxna4os1-201ENSMUST00000150314 1977 ntTSL 1 (best) BASIC6.72□□□□□ -1.33
Rps29P62274 Pcgf2-203ENSMUST00000103149 817 ntTSL 5 BASIC6.72□□□□□ -1.33
Rps29P62274 Tax1bp3-202ENSMUST00000108477 1153 ntTSL 5 BASIC6.72□□□□□ -1.33
Rps29P62274 Gm14028-201ENSMUST00000117434 479 ntBASIC6.72□□□□□ -1.33
Rps29P62274 Gm11783-201ENSMUST00000119549 885 ntBASIC6.72□□□□□ -1.33
Rps29P62274 Gm14277-201ENSMUST00000121195 360 ntBASIC6.72□□□□□ -1.33
Rps29P62274 Tnfrsf18-203ENSMUST00000122001 1078 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.72□□□□□ -1.33
Rps29P62274 Gm14051-201ENSMUST00000131603 377 ntTSL 3 BASIC6.72□□□□□ -1.33
Rps29P62274 Bcas3os2-201ENSMUST00000134305 661 ntTSL 5 BASIC6.72□□□□□ -1.33
Rps29P62274 4930471C06Rik-202ENSMUST00000143070 579 ntTSL 3 BASIC6.72□□□□□ -1.33
Rps29P62274 Gm11753-201ENSMUST00000151091 396 ntTSL 1 (best) BASIC6.72□□□□□ -1.33
Rps29P62274 Rpl41-206ENSMUST00000177163 544 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC6.72□□□□□ -1.33
Rps29P62274 Gm29199-201ENSMUST00000187766 775 ntBASIC6.72□□□□□ -1.33
Rps29P62274 Gm38228-201ENSMUST00000193169 1293 ntBASIC6.72□□□□□ -1.33
Rps29P62274 Tfr2-208ENSMUST00000199054 2966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.72□□□□□ -1.33
Rps29P62274 Gm43050-202ENSMUST00000201152 651 ntTSL 1 (best) BASIC6.72□□□□□ -1.33
Rps29P62274 5330413P13Rik-205ENSMUST00000210961 913 ntTSL 5 BASIC6.72□□□□□ -1.33
Rps29P62274 AC113082.1-201ENSMUST00000217324 327 ntBASIC6.72□□□□□ -1.33
Rps29P62274 Gm33979-201ENSMUST00000219486 691 ntTSL 5 BASIC6.72□□□□□ -1.33
Rps29P62274 AC134869.4-202ENSMUST00000224350 837 ntBASIC6.72□□□□□ -1.33
Rps29P62274 Immp1l-201ENSMUST00000037499 955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.72□□□□□ -1.33
Rps29P62274 Lcn8-201ENSMUST00000038482 651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.72□□□□□ -1.33
Rps29P62274 Olfr686-201ENSMUST00000050157 1018 ntAPPRIS P1 BASIC6.72□□□□□ -1.33
Rps29P62274 Hk2-201ENSMUST00000000642 5513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.72□□□□□ -1.33
Rps29P62274 BC048507-201ENSMUST00000078471 600 ntAPPRIS P1 BASIC6.72□□□□□ -1.33
Rps29P62274 Frzb-201ENSMUST00000028389 3149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.72□□□□□ -1.33
Rps29P62274 Fam45a-202ENSMUST00000119633 2267 ntTSL 1 (best) BASIC6.72□□□□□ -1.33
Rps29P62274 Lmln-201ENSMUST00000023497 6147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.72□□□□□ -1.33
Rps29P62274 Pcgf2-202ENSMUST00000103148 1438 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.72□□□□□ -1.33
Rps29P62274 Cdip1-203ENSMUST00000118703 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.72□□□□□ -1.33
Rps29P62274 Grid2ip-203ENSMUST00000120825 3865 ntTSL 5 BASIC6.72□□□□□ -1.33
Rps29P62274 Hoxd3os1-202ENSMUST00000139005 1701 ntTSL 1 (best) BASIC6.72□□□□□ -1.33
Rps29P62274 Brinp2-201ENSMUST00000004133 4167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.72□□□□□ -1.33
Rps29P62274 Gjc1-202ENSMUST00000092567 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.72□□□□□ -1.33
Rps29P62274 Grap2-201ENSMUST00000043149 3158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.72□□□□□ -1.33
Rps29P62274 Tfe3-202ENSMUST00000079542 3163 ntTSL 1 (best) BASIC6.72□□□□□ -1.33
Rps29P62274 Sypl-201ENSMUST00000020885 2019 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.72□□□□□ -1.33
Rps29P62274 Agxt2-204ENSMUST00000110542 2198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.72□□□□□ -1.33
Rps29P62274 Irf9-205ENSMUST00000138037 2343 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.72□□□□□ -1.33
Rps29P62274 AC159308.2-201ENSMUST00000213592 2325 ntBASIC6.72□□□□□ -1.33
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 57.2 ms