Protein–RNA interactions for Protein: P61969

Lmo4, LIM domain transcription factor LMO4, mousemouse

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Length 165 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Lmo4P61969 Olfr1258-202ENSMUST00000111516 936 ntAPPRIS P1 BASIC9.65□□□□□ -0.86
Lmo4P61969 Gm11892-201ENSMUST00000117711 1202 ntBASIC9.65□□□□□ -0.86
Lmo4P61969 Gm16071-201ENSMUST00000119589 793 ntBASIC9.65□□□□□ -0.86
Lmo4P61969 Gm14199-201ENSMUST00000130021 495 ntTSL 2 BASIC9.65□□□□□ -0.86
Lmo4P61969 Gm11815-201ENSMUST00000139423 708 ntTSL 5 BASIC9.65□□□□□ -0.86
Lmo4P61969 Gm42791-202ENSMUST00000147473 727 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.65□□□□□ -0.86
Lmo4P61969 Gm22138-201ENSMUST00000158748 128 ntBASIC9.65□□□□□ -0.86
Lmo4P61969 Gm7535-201ENSMUST00000164167 909 ntAPPRIS P1 BASIC9.65□□□□□ -0.86
Lmo4P61969 Gm5778-201ENSMUST00000171003 1072 ntBASIC9.65□□□□□ -0.86
Lmo4P61969 Ager-207ENSMUST00000173992 1248 ntTSL 1 (best) BASIC9.65□□□□□ -0.86
Lmo4P61969 Wdr53-204ENSMUST00000178573 1153 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.65□□□□□ -0.86
Lmo4P61969 Gm6114-201ENSMUST00000182472 968 ntBASIC9.65□□□□□ -0.86
Lmo4P61969 Gm17826-201ENSMUST00000189720 798 ntBASIC9.65□□□□□ -0.86
Lmo4P61969 Gm42980-201ENSMUST00000200582 1028 ntTSL 1 (best) BASIC9.65□□□□□ -0.86
Lmo4P61969 Gm45219-201ENSMUST00000205602 465 ntBASIC9.65□□□□□ -0.86
Lmo4P61969 Pgpep1l-202ENSMUST00000207874 677 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.65□□□□□ -0.86
Lmo4P61969 Fxyd2-211ENSMUST00000216289 668 ntTSL 5 BASIC9.65□□□□□ -0.86
Lmo4P61969 Gm10318-202ENSMUST00000217996 639 ntTSL 5 BASIC9.65□□□□□ -0.86
Lmo4P61969 AC122350.1-201ENSMUST00000228135 533 ntBASIC9.65□□□□□ -0.86
Lmo4P61969 Npff-201ENSMUST00000023814 540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.65□□□□□ -0.86
Lmo4P61969 Crygs-201ENSMUST00000040592 708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.65□□□□□ -0.86
Lmo4P61969 Gm5879-201ENSMUST00000089501 1209 ntBASIC9.65□□□□□ -0.86
Lmo4P61969 Lst1-201ENSMUST00000097336 415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.65□□□□□ -0.86
Lmo4P61969 Prkag3-206ENSMUST00000188073 2832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.65□□□□□ -0.86
Lmo4P61969 Psmc3-201ENSMUST00000002171 1819 ntTSL 1 (best) BASIC9.65□□□□□ -0.86
Lmo4P61969 Fig4-201ENSMUST00000043814 3282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.65□□□□□ -0.87
Lmo4P61969 AC169511.2-201ENSMUST00000226674 2063 ntBASIC9.65□□□□□ -0.87
Lmo4P61969 Cd33-202ENSMUST00000039861 1791 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.65□□□□□ -0.87
Lmo4P61969 H2-T10-201ENSMUST00000166442 1481 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.65□□□□□ -0.87
Lmo4P61969 Arhgef2-201ENSMUST00000029694 4300 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.65□□□□□ -0.87
Lmo4P61969 Mog-201ENSMUST00000102665 1704 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.65□□□□□ -0.87
Lmo4P61969 Zfp68-201ENSMUST00000063262 2254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.65□□□□□ -0.87
Lmo4P61969 Sema4a-213ENSMUST00000165898 3125 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.65□□□□□ -0.87
Lmo4P61969 Pbxip1-201ENSMUST00000038942 4479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.64□□□□□ -0.87
Lmo4P61969 Pak1-201ENSMUST00000033040 3065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.64□□□□□ -0.87
Lmo4P61969 Hbs1l-201ENSMUST00000020153 2793 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.64□□□□□ -0.87
Lmo4P61969 Bbs5-202ENSMUST00000112286 1397 ntTSL 5 BASIC9.64□□□□□ -0.87
Lmo4P61969 Prkaca-202ENSMUST00000211558 1399 ntTSL 5 BASIC9.64□□□□□ -0.87
Lmo4P61969 Fam222b-201ENSMUST00000073705 3258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.64□□□□□ -0.87
Lmo4P61969 Rad51c-201ENSMUST00000007790 1632 ntTSL 1 (best) BASIC9.64□□□□□ -0.87
Lmo4P61969 Foxb1-201ENSMUST00000071281 2984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.64□□□□□ -0.87
Lmo4P61969 Rai1-202ENSMUST00000090806 7217 ntTSL 1 (best) BASIC9.64□□□□□ -0.87
Lmo4P61969 Kcnn2-201ENSMUST00000066890 3682 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.64□□□□□ -0.87
Lmo4P61969 Trpc2-201ENSMUST00000124189 2874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.64□□□□□ -0.87
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Lmo4P61969 Entpd4b-204ENSMUST00000185072 3589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.64□□□□□ -0.87
Lmo4P61969 Gm5150-201ENSMUST00000108347 913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.64□□□□□ -0.87
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Lmo4P61969 Gm15764-201ENSMUST00000150389 672 ntTSL 1 (best) BASIC9.64□□□□□ -0.87
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Lmo4P61969 Odf3-201ENSMUST00000026555 1128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.64□□□□□ -0.87
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Lmo4P61969 Tmem92-203ENSMUST00000162809 1437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.64□□□□□ -0.87
Lmo4P61969 4930486L24Rik-201ENSMUST00000091569 1432 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.64□□□□□ -0.87
Lmo4P61969 Fam198a-204ENSMUST00000215990 2149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.64□□□□□ -0.87
Lmo4P61969 Polrmt-201ENSMUST00000020580 3755 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.64□□□□□ -0.87
Lmo4P61969 Klk7-201ENSMUST00000032955 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.64□□□□□ -0.87
Lmo4P61969 Ush1c-209ENSMUST00000222454 2580 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.64□□□□□ -0.87
Lmo4P61969 Mtus1-202ENSMUST00000059115 6548 ntTSL 5 BASIC9.64□□□□□ -0.87
Lmo4P61969 1110059E24Rik-201ENSMUST00000038830 1614 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.64□□□□□ -0.87
Lmo4P61969 Cfap100-207ENSMUST00000165673 2072 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC9.63□□□□□ -0.87
Lmo4P61969 Myf5-201ENSMUST00000000445 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.63□□□□□ -0.87
Lmo4P61969 Pstpip2-201ENSMUST00000114741 1395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.63□□□□□ -0.87
Lmo4P61969 Eif5b-201ENSMUST00000027252 7797 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC9.63□□□□□ -0.87
Lmo4P61969 Pip5kl1-201ENSMUST00000055304 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.63□□□□□ -0.87
Lmo4P61969 Slc2a7-201ENSMUST00000059893 1578 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.63□□□□□ -0.87
Lmo4P61969 Crybg1-202ENSMUST00000200401 7525 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.63□□□□□ -0.87
Lmo4P61969 Sfxn3-203ENSMUST00000111954 2867 ntTSL 5 BASIC9.63□□□□□ -0.87
Lmo4P61969 Cdc37l1-207ENSMUST00000225210 4163 ntAPPRIS ALT2 BASIC9.63□□□□□ -0.87
Lmo4P61969 Arhgef5-201ENSMUST00000031750 5469 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.63□□□□□ -0.87
Lmo4P61969 Hid1-202ENSMUST00000106542 3276 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.63□□□□□ -0.87
Lmo4P61969 Atp13a1-201ENSMUST00000034326 3915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.63□□□□□ -0.87
Lmo4P61969 Wdfy1-204ENSMUST00000113512 4551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.63□□□□□ -0.87
Lmo4P61969 Wdfy1-205ENSMUST00000113513 4551 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.63□□□□□ -0.87
Lmo4P61969 Wdfy1-206ENSMUST00000113514 4551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.63□□□□□ -0.87
Lmo4P61969 Wdfy1-207ENSMUST00000113515 4551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.63□□□□□ -0.87
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