Protein–RNA interactions for Protein: P59708

Sf3b6, Splicing factor 3B subunit 6, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 125 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Sf3b6P59708 Fuca2-203ENSMUST00000121465 5741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Sf3b6P59708 Pidd1-202ENSMUST00000106005 2900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Sf3b6P59708 Gm23912-201ENSMUST00000104687 87 ntBASIC10.64□□□□□ -0.71
Sf3b6P59708 Spatc1l-202ENSMUST00000105414 1060 ntTSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Sf3b6P59708 Snap25-202ENSMUST00000110098 1014 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC10.64□□□□□ -0.71
Sf3b6P59708 Gm15444-201ENSMUST00000148335 388 ntTSL 5 BASIC10.64□□□□□ -0.71
Sf3b6P59708 C130026I21Rik-205ENSMUST00000161267 652 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC10.64□□□□□ -0.71
Sf3b6P59708 Naa60-209ENSMUST00000175809 279 ntTSL 5 BASIC10.64□□□□□ -0.71
Sf3b6P59708 Lsm10-203ENSMUST00000179323 808 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.64□□□□□ -0.71
Sf3b6P59708 1700015O11Rik-201ENSMUST00000180964 678 ntTSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Sf3b6P59708 AY702102-202ENSMUST00000194651 1173 ntBASIC10.64□□□□□ -0.71
Sf3b6P59708 Gm43002-201ENSMUST00000200310 155 ntBASIC10.64□□□□□ -0.71
Sf3b6P59708 Rpl7a-ps2-201ENSMUST00000200554 774 ntBASIC10.64□□□□□ -0.71
Sf3b6P59708 Gm39404-201ENSMUST00000216350 313 ntBASIC10.64□□□□□ -0.71
Sf3b6P59708 AC122459.1-201ENSMUST00000228373 885 ntBASIC10.64□□□□□ -0.71
Sf3b6P59708 Trappc4-201ENSMUST00000034623 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Sf3b6P59708 Rpl10l-201ENSMUST00000081908 1023 ntAPPRIS P1 BASIC10.64□□□□□ -0.71
Sf3b6P59708 Arhgef10l-202ENSMUST00000069623 4531 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Sf3b6P59708 Abi1-209ENSMUST00000140164 3403 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Sf3b6P59708 Gjd4-201ENSMUST00000041007 2661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Sf3b6P59708 Slc2a4-203ENSMUST00000141837 1776 ntTSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Sf3b6P59708 Ccm2-202ENSMUST00000109721 1551 ntTSL 5 BASIC10.64□□□□□ -0.71
Sf3b6P59708 Fam45a-202ENSMUST00000119633 2267 ntTSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Sf3b6P59708 4933407I05Rik-204ENSMUST00000217562 1561 ntBASIC10.64□□□□□ -0.71
Sf3b6P59708 Mcam-202ENSMUST00000098852 2772 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Sf3b6P59708 Kdm5c-201ENSMUST00000082177 5520 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.64□□□□□ -0.71
Sf3b6P59708 Hrg-201ENSMUST00000023590 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Sf3b6P59708 Chchd3-202ENSMUST00000115091 1363 ntTSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Sf3b6P59708 Lnx1-203ENSMUST00000113531 3098 ntTSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Sf3b6P59708 Slc39a14-202ENSMUST00000068044 4926 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC10.63□□□□□ -0.71
Sf3b6P59708 Gfm1-201ENSMUST00000077271 4078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
Sf3b6P59708 Gm3716-202ENSMUST00000198582 2879 ntTSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
Sf3b6P59708 Rgs3-202ENSMUST00000084521 3888 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.63□□□□□ -0.71
Sf3b6P59708 Pcdhgc4-201ENSMUST00000066140 5024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
Sf3b6P59708 Brwd1-202ENSMUST00000099502 8547 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
Sf3b6P59708 Gtf2i-216ENSMUST00000173888 2820 ntTSL 5 BASIC10.63□□□□□ -0.71
Sf3b6P59708 Irak4-201ENSMUST00000074936 2831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
Sf3b6P59708 Fkbp15-204ENSMUST00000107461 2337 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
Sf3b6P59708 Asxl1-205ENSMUST00000227428 6981 ntAPPRIS ALT2 BASIC10.63□□□□□ -0.71
Sf3b6P59708 D930032P07Rik-201ENSMUST00000181393 1314 ntTSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
Sf3b6P59708 Abcd3-201ENSMUST00000029770 3489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
Sf3b6P59708 Add2-207ENSMUST00000203724 3143 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
Sf3b6P59708 Epha6-201ENSMUST00000068860 3930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
Sf3b6P59708 Smarcb1-202ENSMUST00000121304 1622 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
Sf3b6P59708 Rgs6-211ENSMUST00000191107 1621 ntTSL 5 BASIC10.63□□□□□ -0.71
Sf3b6P59708 Tcf25-203ENSMUST00000211932 5002 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
Sf3b6P59708 Acly-201ENSMUST00000007131 4393 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
Sf3b6P59708 Gm38100-202ENSMUST00000201297 1789 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
Sf3b6P59708 Rnf13-210ENSMUST00000200497 2573 ntTSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
Sf3b6P59708 Ap2b1-206ENSMUST00000176523 2742 ntTSL 5 BASIC10.63□□□□□ -0.71
Sf3b6P59708 Palm-204ENSMUST00000218631 2725 ntTSL 2 BASIC10.63□□□□□ -0.71
Sf3b6P59708 AC154314.2-201ENSMUST00000223677 3502 ntBASIC10.63□□□□□ -0.71
Sf3b6P59708 Trim35-201ENSMUST00000022623 3678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
Sf3b6P59708 Mylk-201ENSMUST00000023538 7824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
Sf3b6P59708 Gm12742-201ENSMUST00000117326 410 ntBASIC10.63□□□□□ -0.71
Sf3b6P59708 Gm13183-201ENSMUST00000118615 789 ntBASIC10.63□□□□□ -0.71
Sf3b6P59708 Gm13736-201ENSMUST00000119272 253 ntBASIC10.63□□□□□ -0.71
Sf3b6P59708 Gm14660-201ENSMUST00000119809 575 ntBASIC10.63□□□□□ -0.71
Sf3b6P59708 Gm16177-201ENSMUST00000120728 718 ntBASIC10.63□□□□□ -0.71
Sf3b6P59708 Drap1-210ENSMUST00000148219 727 ntTSL 3 BASIC10.63□□□□□ -0.71
Sf3b6P59708 Surf2-201ENSMUST00000015017 1203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
Sf3b6P59708 Shisa5-203ENSMUST00000154184 1038 ntTSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
Sf3b6P59708 Snora78-201ENSMUST00000158630 128 ntBASIC10.63□□□□□ -0.71
Sf3b6P59708 Gm43084-201ENSMUST00000200696 947 ntBASIC10.63□□□□□ -0.71
Sf3b6P59708 Gm22058-201ENSMUST00000083393 310 ntBASIC10.63□□□□□ -0.71
Sf3b6P59708 Olfr91-201ENSMUST00000087144 939 ntAPPRIS P1 BASIC10.63□□□□□ -0.71
Sf3b6P59708 Cenpm-202ENSMUST00000089157 1201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
Sf3b6P59708 Ccdc33-202ENSMUST00000098681 1093 ntTSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
Sf3b6P59708 Kcnk18-201ENSMUST00000065204 3032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
Sf3b6P59708 Rapgef2-202ENSMUST00000118340 6544 ntTSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
Sf3b6P59708 Ikbkg-205ENSMUST00000114129 2222 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
Sf3b6P59708 Ablim1-213ENSMUST00000111559 3184 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.63□□□□□ -0.71
Sf3b6P59708 AU019823-201ENSMUST00000131351 3316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
Sf3b6P59708 AU019823-205ENSMUST00000171462 3339 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC10.63□□□□□ -0.71
Sf3b6P59708 Dip2a-201ENSMUST00000036033 6322 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.63□□□□□ -0.71
Sf3b6P59708 Mfsd13b-201ENSMUST00000033166 1883 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
Sf3b6P59708 Klhl22-208ENSMUST00000165790 2616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
Sf3b6P59708 Mthfd1l-202ENSMUST00000117291 3669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
Sf3b6P59708 Mfap3l-203ENSMUST00000161421 4142 ntTSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
Sf3b6P59708 Gm18782-201ENSMUST00000209023 1399 ntBASIC10.63□□□□□ -0.71
Sf3b6P59708 Gm7964-201ENSMUST00000051522 1378 ntBASIC10.63□□□□□ -0.71
Sf3b6P59708 Luc7l-201ENSMUST00000025023 1686 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
Sf3b6P59708 Gm8146-201ENSMUST00000192106 1847 ntBASIC10.63□□□□□ -0.71
Sf3b6P59708 Gm9796-201ENSMUST00000062249 2250 ntBASIC10.63□□□□□ -0.71
Sf3b6P59708 Hnrnph2-203ENSMUST00000074950 2426 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
Sf3b6P59708 Nfatc2-209ENSMUST00000171689 2742 ntTSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
Sf3b6P59708 Sin3a-206ENSMUST00000168177 5086 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
Sf3b6P59708 Cdh7-202ENSMUST00000112701 4945 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.62□□□□□ -0.71
Sf3b6P59708 Lrrn4-201ENSMUST00000049787 3715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
Sf3b6P59708 Dpysl4-201ENSMUST00000026551 3552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
Sf3b6P59708 4930431P19Rik-202ENSMUST00000207761 2959 ntBASIC10.62□□□□□ -0.71
Sf3b6P59708 Rad17-201ENSMUST00000022136 2839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
Sf3b6P59708 Gid8-202ENSMUST00000078687 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
Sf3b6P59708 F10-201ENSMUST00000033821 1903 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
Sf3b6P59708 Gm43242-201ENSMUST00000199507 1776 ntBASIC10.62□□□□□ -0.71
Sf3b6P59708 Mfsd13b-205ENSMUST00000216241 1761 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.62□□□□□ -0.71
Sf3b6P59708 Gm8155-201ENSMUST00000216363 1612 ntBASIC10.62□□□□□ -0.71
Sf3b6P59708 Gm5106-201ENSMUST00000181058 1334 ntTSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
Sf3b6P59708 Onecut1-201ENSMUST00000056006 3957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
Sf3b6P59708 B230317F23Rik-201ENSMUST00000052189 2472 ntBASIC10.62□□□□□ -0.71
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