Protein–RNA interactions for Protein: P56916

Gsc2, Homeobox protein goosecoid-2, mousemouse

Predictions only

Length 198 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gsc2P56916 Mbnl2-208ENSMUST00000227594 2334 ntAPPRIS P1 BASIC10.09□□□□□ -0.79
Gsc2P56916 Ripk3-202ENSMUST00000168716 1964 ntTSL 5 BASIC10.09□□□□□ -0.79
Gsc2P56916 Qrsl1-201ENSMUST00000020012 1981 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.09□□□□□ -0.79
Gsc2P56916 Gm13075-202ENSMUST00000149247 1621 ntTSL 5 BASIC10.09□□□□□ -0.79
Gsc2P56916 Retsat-205ENSMUST00000176364 1647 ntTSL 5 BASIC10.09□□□□□ -0.79
Gsc2P56916 Ins2-203ENSMUST00000105931 472 ntTSL 1 (best) BASIC10.09□□□□□ -0.79
Gsc2P56916 Adamtsl1-204ENSMUST00000120678 977 ntTSL 1 (best) BASIC10.09□□□□□ -0.79
Gsc2P56916 Gm13563-201ENSMUST00000125518 643 ntTSL 3 BASIC10.09□□□□□ -0.79
Gsc2P56916 D930015M05Rik-201ENSMUST00000126002 1190 ntTSL 1 (best) BASIC10.09□□□□□ -0.79
Gsc2P56916 Eif4e1b-204ENSMUST00000132005 706 ntTSL 2 BASIC10.09□□□□□ -0.79
Gsc2P56916 Gm13112-201ENSMUST00000138795 1258 ntTSL 1 (best) BASIC10.09□□□□□ -0.79
Gsc2P56916 Gm11684-201ENSMUST00000144975 757 ntTSL 5 BASIC10.09□□□□□ -0.79
Gsc2P56916 Snhg20-201ENSMUST00000145438 459 ntTSL 3 BASIC10.09□□□□□ -0.79
Gsc2P56916 Ube2i-211ENSMUST00000173713 890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.09□□□□□ -0.79
Gsc2P56916 Nipsnap3a-204ENSMUST00000188045 1099 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.09□□□□□ -0.79
Gsc2P56916 Zfp709-202ENSMUST00000188374 717 ntTSL 1 (best) BASIC10.09□□□□□ -0.79
Gsc2P56916 Gm37641-201ENSMUST00000193837 239 ntBASIC10.09□□□□□ -0.79
Gsc2P56916 2310016G11Rik-202ENSMUST00000209111 733 ntTSL 3 BASIC10.09□□□□□ -0.79
Gsc2P56916 Gm42067-201ENSMUST00000209642 647 ntTSL 2 BASIC10.09□□□□□ -0.79
Gsc2P56916 CT009495.1-201ENSMUST00000224221 862 ntBASIC10.09□□□□□ -0.79
Gsc2P56916 Prss39-201ENSMUST00000027299 1267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.09□□□□□ -0.79
Gsc2P56916 Mmd2-201ENSMUST00000037048 3317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.09□□□□□ -0.79
Gsc2P56916 Pde7b-206ENSMUST00000170265 1380 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.09□□□□□ -0.79
Gsc2P56916 Lnx2-201ENSMUST00000016664 4557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.09□□□□□ -0.79
Gsc2P56916 Mier3-201ENSMUST00000047412 4243 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.09□□□□□ -0.79
Gsc2P56916 Gm37513-201ENSMUST00000194830 2268 ntBASIC10.09□□□□□ -0.79
Gsc2P56916 Gm38378-201ENSMUST00000195153 2268 ntBASIC10.09□□□□□ -0.79
Gsc2P56916 Cipc-211ENSMUST00000191463 1499 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.09□□□□□ -0.79
Gsc2P56916 Yif1a-201ENSMUST00000025811 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.09□□□□□ -0.79
Gsc2P56916 Rbms2-201ENSMUST00000092033 1481 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC10.09□□□□□ -0.79
Gsc2P56916 Arhgef10-202ENSMUST00000110800 5336 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.09□□□□□ -0.79
Gsc2P56916 Tfr2-204ENSMUST00000196471 2839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.09□□□□□ -0.79
Gsc2P56916 Slit2-202ENSMUST00000170109 7758 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.09□□□□□ -0.79
Gsc2P56916 Slit2-217ENSMUST00000174421 7785 ntTSL 1 (best) BASIC10.09□□□□□ -0.79
Gsc2P56916 Ep400-202ENSMUST00000112433 3399 ntTSL 1 (best) BASIC10.09□□□□□ -0.79
Gsc2P56916 G630016G05Rik-202ENSMUST00000156095 3398 ntTSL 1 (best) BASIC10.09□□□□□ -0.79
Gsc2P56916 Arsa-202ENSMUST00000165199 3492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.09□□□□□ -0.79
Gsc2P56916 Ankrd26-201ENSMUST00000112830 6930 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.09□□□□□ -0.79
Gsc2P56916 Ptpro-201ENSMUST00000077115 5049 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.09□□□□□ -0.79
Gsc2P56916 Ephb2-203ENSMUST00000105846 3653 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.09□□□□□ -0.79
Gsc2P56916 As3mt-201ENSMUST00000003655 1751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.09□□□□□ -0.79
Gsc2P56916 Pik3cd-202ENSMUST00000105688 4335 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.09□□□□□ -0.79
Gsc2P56916 Il1rap-206ENSMUST00000174202 2306 ntTSL 1 (best) BASIC10.08□□□□□ -0.8
Gsc2P56916 Accs-202ENSMUST00000068513 1872 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC10.08□□□□□ -0.8
Gsc2P56916 Fcho1-201ENSMUST00000093444 3073 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.08□□□□□ -0.8
Gsc2P56916 6030458C11Rik-204ENSMUST00000228177 3156 ntBASIC10.08□□□□□ -0.8
Gsc2P56916 Vps16-201ENSMUST00000028900 3161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.08□□□□□ -0.8
Gsc2P56916 Slc29a1-213ENSMUST00000167692 2092 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.08□□□□□ -0.8
Gsc2P56916 Zbtb45-205ENSMUST00000210282 3908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.08□□□□□ -0.8
Gsc2P56916 Gdpd5-208ENSMUST00000213887 2711 ntTSL 5 BASIC10.08□□□□□ -0.8
Gsc2P56916 Arfgap1-201ENSMUST00000029092 2714 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.08□□□□□ -0.8
Gsc2P56916 Gm45776-201ENSMUST00000212366 1522 ntBASIC10.08□□□□□ -0.8
Gsc2P56916 Gm8228-201ENSMUST00000189949 2192 ntBASIC10.08□□□□□ -0.8
Gsc2P56916 Tro-203ENSMUST00000112709 6610 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC10.08□□□□□ -0.8
Gsc2P56916 Gmps-201ENSMUST00000029405 8105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.08□□□□□ -0.8
Gsc2P56916 Adh5-201ENSMUST00000005964 1604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.08□□□□□ -0.8
Gsc2P56916 Cysltr2-202ENSMUST00000169168 1744 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.08□□□□□ -0.8
Gsc2P56916 Snap23-201ENSMUST00000028743 2658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.08□□□□□ -0.8
Gsc2P56916 Srebf1-201ENSMUST00000020846 4299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.08□□□□□ -0.8
Gsc2P56916 Icam4-201ENSMUST00000001040 971 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.08□□□□□ -0.8
Gsc2P56916 Nsg2-203ENSMUST00000109409 641 ntTSL 2 BASIC10.08□□□□□ -0.8
Gsc2P56916 Tmem128-202ENSMUST00000119047 726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.08□□□□□ -0.8
Gsc2P56916 Mrps10-202ENSMUST00000119841 1113 ntTSL 1 (best) BASIC10.08□□□□□ -0.8
Gsc2P56916 Gm12036-201ENSMUST00000120008 530 ntBASIC10.08□□□□□ -0.8
Gsc2P56916 Gm13315-201ENSMUST00000120376 991 ntBASIC10.08□□□□□ -0.8
Gsc2P56916 Gm11918-201ENSMUST00000121660 179 ntBASIC10.08□□□□□ -0.8
Gsc2P56916 Msrb3-202ENSMUST00000130950 561 ntTSL 3 BASIC10.08□□□□□ -0.8
Gsc2P56916 Rpl34-203ENSMUST00000133802 711 ntTSL 2 BASIC10.08□□□□□ -0.8
Gsc2P56916 A530058N18Rik-202ENSMUST00000134129 411 ntTSL 3 BASIC10.08□□□□□ -0.8
Gsc2P56916 Gm22331-201ENSMUST00000158066 136 ntBASIC10.08□□□□□ -0.8
Gsc2P56916 Ccdc103-202ENSMUST00000159834 1156 ntTSL 1 (best) BASIC10.08□□□□□ -0.8
Gsc2P56916 Ssr4-208ENSMUST00000166518 800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.08□□□□□ -0.8
Gsc2P56916 Tnfrsf12a-202ENSMUST00000167059 858 ntTSL 2 BASIC10.08□□□□□ -0.8
Gsc2P56916 Gm8018-201ENSMUST00000173536 789 ntBASIC10.08□□□□□ -0.8
Gsc2P56916 Tfr2-208ENSMUST00000199054 2966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.08□□□□□ -0.8
Gsc2P56916 Gm43597-201ENSMUST00000201650 1057 ntTSL 3 BASIC10.08□□□□□ -0.8
Gsc2P56916 Gm43974-201ENSMUST00000205080 684 ntBASIC10.08□□□□□ -0.8
Gsc2P56916 1700025J12Rik-201ENSMUST00000205586 630 ntTSL 1 (best) BASIC10.08□□□□□ -0.8
Gsc2P56916 Rps12-203ENSMUST00000218107 584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.08□□□□□ -0.8
Gsc2P56916 Gm45930-201ENSMUST00000221330 292 ntBASIC10.08□□□□□ -0.8
Gsc2P56916 Tnfrsf12a-201ENSMUST00000024698 963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.08□□□□□ -0.8
Gsc2P56916 Nicn1-201ENSMUST00000035227 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.08□□□□□ -0.8
Gsc2P56916 Il25-201ENSMUST00000037863 1064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.08□□□□□ -0.8
Gsc2P56916 Phxr2-201ENSMUST00000060761 1159 ntAPPRIS P1 BASIC10.08□□□□□ -0.8
Gsc2P56916 D17H6S53E-201ENSMUST00000061859 2142 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC10.08□□□□□ -0.8
Gsc2P56916 Gm2423-201ENSMUST00000074863 733 ntBASIC10.08□□□□□ -0.8
Gsc2P56916 1700011I03Rik-201ENSMUST00000079738 1013 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.08□□□□□ -0.8
Gsc2P56916 Pcdhgb8-201ENSMUST00000195764 4615 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.08□□□□□ -0.8
Gsc2P56916 C2-201ENSMUST00000025230 2641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.08□□□□□ -0.8
Gsc2P56916 Sez6l-205ENSMUST00000212480 5857 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.08□□□□□ -0.8
Gsc2P56916 Hs3st1-202ENSMUST00000117944 1686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.08□□□□□ -0.8
Gsc2P56916 Mob4-205ENSMUST00000162364 2840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.08□□□□□ -0.8
Gsc2P56916 Kalrn-209ENSMUST00000114963 3207 ntTSL 5 BASIC10.08□□□□□ -0.8
Gsc2P56916 Asb1-201ENSMUST00000027538 5826 ntTSL 1 (best) BASIC10.08□□□□□ -0.8
Gsc2P56916 Fibcd1-201ENSMUST00000028188 4751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.08□□□□□ -0.8
Gsc2P56916 Ppnr-201ENSMUST00000190974 3525 ntTSL 1 (best) BASIC10.08□□□□□ -0.8
Gsc2P56916 Nek5-202ENSMUST00000209656 2253 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.08□□□□□ -0.8
Gsc2P56916 Adra2b-202ENSMUST00000104934 4014 ntAPPRIS ALT2 BASIC10.08□□□□□ -0.8
Gsc2P56916 Zbtb24-205ENSMUST00000216656 2476 ntTSL 1 (best) BASIC10.08□□□□□ -0.8
Gsc2P56916 Tgfbr1-201ENSMUST00000007757 5756 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.08□□□□□ -0.8
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 67.5 ms