Protein–RNA interactions for Protein: P41105

Rpl28, 60S ribosomal protein L28, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 137 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rpl28P41105 Jam3-201ENSMUST00000034472 1942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.05□□□□□ -1.12
Rpl28P41105 Traf7-202ENSMUST00000088464 2504 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC8.05□□□□□ -1.12
Rpl28P41105 Nrde2-201ENSMUST00000021596 3718 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC8.05□□□□□ -1.12
Rpl28P41105 Ciita-201ENSMUST00000023147 5254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.05□□□□□ -1.12
Rpl28P41105 Aplp2-209ENSMUST00000217641 3462 ntTSL 1 (best) BASIC8.05□□□□□ -1.12
Rpl28P41105 Enah-201ENSMUST00000078719 2889 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC8.05□□□□□ -1.12
Rpl28P41105 Tubgcp6-201ENSMUST00000041656 5357 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC8.05□□□□□ -1.12
Rpl28P41105 Tfr2-208ENSMUST00000199054 2966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.05□□□□□ -1.12
Rpl28P41105 Tnc-203ENSMUST00000107372 7106 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC8.05□□□□□ -1.12
Rpl28P41105 Abi1-211ENSMUST00000149719 3303 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC8.05□□□□□ -1.12
Rpl28P41105 Gm30725-201ENSMUST00000195170 1419 ntTSL 1 (best) BASIC8.05□□□□□ -1.12
Rpl28P41105 Skp1a-201ENSMUST00000037324 1440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.05□□□□□ -1.12
Rpl28P41105 Gm21103-202ENSMUST00000170923 1761 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC8.05□□□□□ -1.12
Rpl28P41105 Ankrd52-201ENSMUST00000014642 6620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.05□□□□□ -1.12
Rpl28P41105 Calhm2-201ENSMUST00000035822 2458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.05□□□□□ -1.12
Rpl28P41105 Zc3hc1-203ENSMUST00000115184 1504 ntTSL 5 BASIC8.05□□□□□ -1.12
Rpl28P41105 Pip5k1b-201ENSMUST00000025800 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.05□□□□□ -1.12
Rpl28P41105 Crispld2-202ENSMUST00000108972 2928 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC8.05□□□□□ -1.12
Rpl28P41105 Knop1-206ENSMUST00000126792 3253 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC8.05□□□□□ -1.12
Rpl28P41105 Anp32e-202ENSMUST00000165307 3274 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC8.05□□□□□ -1.12
Rpl28P41105 Plekhg6-201ENSMUST00000042647 3299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.05□□□□□ -1.12
Rpl28P41105 Zfp462-202ENSMUST00000079605 4684 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC8.05□□□□□ -1.12
Rpl28P41105 Map4-214ENSMUST00000199498 4055 ntTSL 1 (best) BASIC8.05□□□□□ -1.12
Rpl28P41105 Foxp1-221ENSMUST00000176632 2336 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC8.05□□□□□ -1.12
Rpl28P41105 Foxp1-222ENSMUST00000176850 2339 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC8.05□□□□□ -1.12
Rpl28P41105 Plscr1-201ENSMUST00000093801 2302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.05□□□□□ -1.12
Rpl28P41105 Mettl17-201ENSMUST00000047899 1623 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC8.05□□□□□ -1.12
Rpl28P41105 Hist1h2ae-201ENSMUST00000102969 704 ntAPPRIS P1 BASIC8.05□□□□□ -1.12
Rpl28P41105 Ppcs-202ENSMUST00000106316 954 ntTSL 1 (best) BASIC8.05□□□□□ -1.12
Rpl28P41105 Arpc3-203ENSMUST00000111713 708 ntTSL 3 BASIC8.05□□□□□ -1.12
Rpl28P41105 Eaf2-204ENSMUST00000114829 1030 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC8.05□□□□□ -1.12
Rpl28P41105 Gm11439-201ENSMUST00000118598 409 ntBASIC8.05□□□□□ -1.12
Rpl28P41105 Wisp1-202ENSMUST00000118823 708 ntTSL 5 BASIC8.05□□□□□ -1.12
Rpl28P41105 Snhg17-206ENSMUST00000152125 1046 ntTSL 3 BASIC8.05□□□□□ -1.12
Rpl28P41105 1700015O11Rik-201ENSMUST00000180964 678 ntTSL 1 (best) BASIC8.05□□□□□ -1.12
Rpl28P41105 Gm43818-201ENSMUST00000200605 466 ntBASIC8.05□□□□□ -1.12
Rpl28P41105 Vmo1-201ENSMUST00000021179 672 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC8.05□□□□□ -1.12
Rpl28P41105 Wfdc1-202ENSMUST00000212901 921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC8.05□□□□□ -1.12
Rpl28P41105 Upk2-201ENSMUST00000047740 1083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.05□□□□□ -1.12
Rpl28P41105 Gng8-201ENSMUST00000078182 910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.05□□□□□ -1.12
Rpl28P41105 Hist1h2ah-201ENSMUST00000091742 405 ntAPPRIS P1 BASIC8.05□□□□□ -1.12
Rpl28P41105 Gm6091-201ENSMUST00000098307 165 ntBASIC8.05□□□□□ -1.12
Rpl28P41105 Far2-201ENSMUST00000032443 3480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.05□□□□□ -1.12
Rpl28P41105 Megf8-201ENSMUST00000128119 10040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.05□□□□□ -1.12
Rpl28P41105 Rxra-206ENSMUST00000166775 3216 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC8.05□□□□□ -1.12
Rpl28P41105 Nap1l1-203ENSMUST00000217908 1350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.05□□□□□ -1.12
Rpl28P41105 Ncor2-202ENSMUST00000086083 8575 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC8.05□□□□□ -1.12
Rpl28P41105 Topbp1-201ENSMUST00000035164 5224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.05□□□□□ -1.12
Rpl28P41105 Pdzk1-203ENSMUST00000107070 2711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.05□□□□□ -1.12
Rpl28P41105 Fam107b-201ENSMUST00000027965 3156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.05□□□□□ -1.12
Rpl28P41105 Klhl6-201ENSMUST00000058839 2386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.05□□□□□ -1.12
Rpl28P41105 Sel1l-201ENSMUST00000021347 6300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.05□□□□□ -1.12
Rpl28P41105 Tiam1-204ENSMUST00000114124 7406 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC8.05□□□□□ -1.12
Rpl28P41105 Treh-201ENSMUST00000034609 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.05□□□□□ -1.12
Rpl28P41105 Sdccag8-202ENSMUST00000056773 1551 ntTSL 1 (best) BASIC8.05□□□□□ -1.12
Rpl28P41105 Zfp518b-203ENSMUST00000179555 6816 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC8.05□□□□□ -1.12
Rpl28P41105 Ttc33-203ENSMUST00000118193 1671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.05□□□□□ -1.12
Rpl28P41105 Dnmt3l-201ENSMUST00000000746 1676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.05□□□□□ -1.12
Rpl28P41105 Rbm8a-203ENSMUST00000198027 2757 ntTSL 3 BASIC8.05□□□□□ -1.12
Rpl28P41105 Nr2c1-202ENSMUST00000099343 2413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.04□□□□□ -1.12
Rpl28P41105 Sorcs1-202ENSMUST00000111756 3617 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC8.04□□□□□ -1.12
Rpl28P41105 Sorcs1-207ENSMUST00000211008 3617 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC8.04□□□□□ -1.12
Rpl28P41105 Qrsl1-201ENSMUST00000020012 1981 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.04□□□□□ -1.12
Rpl28P41105 Zdbf2-202ENSMUST00000114132 12629 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC8.04□□□□□ -1.12
Rpl28P41105 Dclk2-202ENSMUST00000191752 8042 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC8.04□□□□□ -1.12
Rpl28P41105 9230105E05Rik-201ENSMUST00000161291 2250 ntTSL 1 (best) BASIC8.04□□□□□ -1.12
Rpl28P41105 3110062M04Rik-201ENSMUST00000055097 3681 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC8.04□□□□□ -1.12
Rpl28P41105 Olfr1490-202ENSMUST00000213900 5165 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC8.04□□□□□ -1.12
Rpl28P41105 Tcf25-202ENSMUST00000108840 2582 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC8.04□□□□□ -1.12
Rpl28P41105 Slc12a9-201ENSMUST00000039991 3330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.04□□□□□ -1.12
Rpl28P41105 Tbc1d24-209ENSMUST00000201301 4261 ntTSL 5 BASIC8.04□□□□□ -1.12
Rpl28P41105 Dbf4-204ENSMUST00000168500 2000 ntTSL 5 BASIC8.04□□□□□ -1.12
Rpl28P41105 Zbtb21-201ENSMUST00000052089 5410 ntTSL 1 (best) BASIC8.04□□□□□ -1.12
Rpl28P41105 Rps8-201ENSMUST00000102696 860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.04□□□□□ -1.12
Rpl28P41105 Ppih-203ENSMUST00000106318 800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.04□□□□□ -1.12
Rpl28P41105 Folr1-205ENSMUST00000106986 1286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.04□□□□□ -1.12
Rpl28P41105 Apoc1-202ENSMUST00000108451 532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.04□□□□□ -1.12
Rpl28P41105 Phlda2-201ENSMUST00000010904 757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.04□□□□□ -1.12
Rpl28P41105 Defb30-203ENSMUST00000111208 503 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC8.04□□□□□ -1.12
Rpl28P41105 Defb30-204ENSMUST00000111209 721 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC8.04□□□□□ -1.12
Rpl28P41105 Camp-201ENSMUST00000112022 758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.04□□□□□ -1.12
Rpl28P41105 Hmgcll1-202ENSMUST00000117981 1189 ntTSL 5 BASIC8.04□□□□□ -1.12
Rpl28P41105 Gm15824-201ENSMUST00000119516 955 ntBASIC8.04□□□□□ -1.12
Rpl28P41105 Gm15703-201ENSMUST00000120250 880 ntBASIC8.04□□□□□ -1.12
Rpl28P41105 Gm11261-203ENSMUST00000132470 838 ntTSL 5 BASIC8.04□□□□□ -1.12
Rpl28P41105 Gm14230-202ENSMUST00000137463 874 ntTSL 2 BASIC8.04□□□□□ -1.12
Rpl28P41105 1700030C14Rik-201ENSMUST00000139912 756 ntTSL 1 (best) BASIC8.04□□□□□ -1.12
Rpl28P41105 Pisd-ps2-202ENSMUST00000142526 1175 ntBASIC8.04□□□□□ -1.12
Rpl28P41105 Dpy30-202ENSMUST00000164832 799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.04□□□□□ -1.12
Rpl28P41105 1700037F24Rik-201ENSMUST00000181254 973 ntTSL 1 (best) BASIC8.04□□□□□ -1.12
Rpl28P41105 Gsg1l2-202ENSMUST00000181566 1158 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC8.04□□□□□ -1.12
Rpl28P41105 Gm6652-201ENSMUST00000186414 1070 ntBASIC8.04□□□□□ -1.12
Rpl28P41105 Gm5896-201ENSMUST00000189662 1024 ntBASIC8.04□□□□□ -1.12
Rpl28P41105 Gm29233-201ENSMUST00000190311 281 ntTSL 5 BASIC8.04□□□□□ -1.12
Rpl28P41105 Myl10-203ENSMUST00000196436 598 ntTSL 3 BASIC8.04□□□□□ -1.12
Rpl28P41105 Pex3-201ENSMUST00000019945 2129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.04□□□□□ -1.12
Rpl28P41105 Gm29208-205ENSMUST00000214517 1056 ntTSL 5 BASIC8.04□□□□□ -1.12
Rpl28P41105 Cfc1-201ENSMUST00000027298 1040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.04□□□□□ -1.12
Rpl28P41105 Bpifa1-201ENSMUST00000028985 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.04□□□□□ -1.12
Rpl28P41105 Olfr91-201ENSMUST00000087144 939 ntAPPRIS P1 BASIC8.04□□□□□ -1.12
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 56.8 ms