Protein–RNA interactions for Protein: P28312

Defa5, Alpha-defensin 5, mousemouse

Predictions only

Length 93 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Defa5P28312 Tnpo3-201ENSMUST00000012679 4251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.14□□□□□ -0.95
Defa5P28312 Duoxa1-202ENSMUST00000110537 1506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.14□□□□□ -0.95
Defa5P28312 Gm19385-201ENSMUST00000214714 1813 ntTSL 1 (best) BASIC9.14□□□□□ -0.95
Defa5P28312 Gm2420-201ENSMUST00000119864 2149 ntBASIC9.14□□□□□ -0.95
Defa5P28312 Rps6ka6-210ENSMUST00000137712 2410 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.14□□□□□ -0.95
Defa5P28312 Fut2-201ENSMUST00000069800 2955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.14□□□□□ -0.95
Defa5P28312 Elovl3-201ENSMUST00000043739 1494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.14□□□□□ -0.95
Defa5P28312 Bcl2l2-203ENSMUST00000133397 3813 ntTSL 1 (best) BASIC9.14□□□□□ -0.95
Defa5P28312 Eif5-212ENSMUST00000222375 3547 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.14□□□□□ -0.95
Defa5P28312 Ralgps2-209ENSMUST00000189316 2924 ntTSL 1 (best) BASIC9.14□□□□□ -0.95
Defa5P28312 Chrnd-201ENSMUST00000073252 2925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.14□□□□□ -0.95
Defa5P28312 Psd2-203ENSMUST00000175734 4300 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.14□□□□□ -0.95
Defa5P28312 Med8-204ENSMUST00000106384 1743 ntTSL 1 (best) BASIC9.14□□□□□ -0.95
Defa5P28312 Serpine3-201ENSMUST00000171692 1402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.14□□□□□ -0.95
Defa5P28312 4933421I07Rik-201ENSMUST00000032648 1413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.14□□□□□ -0.95
Defa5P28312 Gm3294-201ENSMUST00000164104 7367 ntTSL 3 BASIC9.14□□□□□ -0.95
Defa5P28312 Gm16083-201ENSMUST00000125681 2547 ntTSL 1 (best) BASIC9.13□□□□□ -0.95
Defa5P28312 Gm15987-201ENSMUST00000141700 2231 ntTSL 1 (best) BASIC9.13□□□□□ -0.95
Defa5P28312 Runx3-201ENSMUST00000056977 3884 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.13□□□□□ -0.95
Defa5P28312 Lrrc57-203ENSMUST00000102498 1901 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.13□□□□□ -0.95
Defa5P28312 Coa4-201ENSMUST00000054310 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.13□□□□□ -0.95
Defa5P28312 Zfp108-201ENSMUST00000072713 1929 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.13□□□□□ -0.95
Defa5P28312 Gm14243-201ENSMUST00000131401 2172 ntTSL 2 BASIC9.13□□□□□ -0.95
Defa5P28312 Flna-201ENSMUST00000033699 8312 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.13□□□□□ -0.95
Defa5P28312 Zfp251-201ENSMUST00000080406 3497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.13□□□□□ -0.95
Defa5P28312 Dnmt3l-205ENSMUST00000138785 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.13□□□□□ -0.95
Defa5P28312 AC159195.1-201ENSMUST00000225867 2086 ntBASIC9.13□□□□□ -0.95
Defa5P28312 Fam189b-201ENSMUST00000041913 3083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.13□□□□□ -0.95
Defa5P28312 Lig3-202ENSMUST00000080461 3056 ntTSL 5 BASIC9.13□□□□□ -0.95
Defa5P28312 Mmd2-201ENSMUST00000037048 3317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.13□□□□□ -0.95
Defa5P28312 Rps19-203ENSMUST00000108430 774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.13□□□□□ -0.95
Defa5P28312 Derl2-202ENSMUST00000108523 884 ntTSL 1 (best) BASIC9.13□□□□□ -0.95
Defa5P28312 Fuom-203ENSMUST00000121115 872 ntTSL 1 (best) BASIC9.13□□□□□ -0.95
Defa5P28312 Eif4e1b-204ENSMUST00000132005 706 ntTSL 2 BASIC9.13□□□□□ -0.95
Defa5P28312 Gm14285-201ENSMUST00000146049 380 ntTSL 1 (best) BASIC9.13□□□□□ -0.95
Defa5P28312 Snora78-201ENSMUST00000158630 128 ntBASIC9.13□□□□□ -0.95
Defa5P28312 Alms1-ps2-201ENSMUST00000160606 1170 ntTSL 1 (best) BASIC9.13□□□□□ -0.95
Defa5P28312 Krtap16-3-201ENSMUST00000179707 601 ntAPPRIS P1 BASIC9.13□□□□□ -0.95
Defa5P28312 Gm27514-201ENSMUST00000183692 110 ntBASIC9.13□□□□□ -0.95
Defa5P28312 Ggt5-203ENSMUST00000189972 648 ntTSL 3 BASIC9.13□□□□□ -0.95
Defa5P28312 Gm44405-201ENSMUST00000198952 126 ntBASIC9.13□□□□□ -0.95
Defa5P28312 Gm4598-201ENSMUST00000206756 1080 ntTSL 1 (best) BASIC9.13□□□□□ -0.95
Defa5P28312 1700023F06Rik-201ENSMUST00000021323 1199 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC9.13□□□□□ -0.95
Defa5P28312 Gm17823-201ENSMUST00000217830 1006 ntBASIC9.13□□□□□ -0.95
Defa5P28312 Gm34084-201ENSMUST00000222236 1298 ntTSL 5 BASIC9.13□□□□□ -0.95
Defa5P28312 AC140406.1-201ENSMUST00000226481 465 ntBASIC9.13□□□□□ -0.95
Defa5P28312 Krtap19-2-201ENSMUST00000076186 605 ntAPPRIS P1 BASIC9.13□□□□□ -0.95
Defa5P28312 Gm815-201ENSMUST00000099536 610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.13□□□□□ -0.95
Defa5P28312 Kcnab2-201ENSMUST00000030768 3533 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC9.13□□□□□ -0.95
Defa5P28312 Vwa5b1-201ENSMUST00000030533 7486 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.13□□□□□ -0.95
Defa5P28312 Abi2-207ENSMUST00000188618 4723 ntTSL 1 (best) BASIC9.13□□□□□ -0.95
Defa5P28312 Slc35f6-205ENSMUST00000196740 1972 ntTSL 5 BASIC9.13□□□□□ -0.95
Defa5P28312 Hrg-201ENSMUST00000023590 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.13□□□□□ -0.95
Defa5P28312 C4b-201ENSMUST00000069507 5379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.13□□□□□ -0.95
Defa5P28312 Trpc2-201ENSMUST00000124189 2874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.13□□□□□ -0.95
Defa5P28312 Dnajb1-202ENSMUST00000212300 2854 ntTSL 1 (best) BASIC9.13□□□□□ -0.95
Defa5P28312 Zfp426-202ENSMUST00000115562 3557 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.13□□□□□ -0.95
Defa5P28312 Zfp433-202ENSMUST00000200889 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.13□□□□□ -0.95
Defa5P28312 Gm32687-201ENSMUST00000220314 2379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.13□□□□□ -0.95
Defa5P28312 Retreg1-206ENSMUST00000228306 1430 ntBASIC9.13□□□□□ -0.95
Defa5P28312 Ppil2-203ENSMUST00000115721 3088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.13□□□□□ -0.95
Defa5P28312 Agtrap-201ENSMUST00000030865 3996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.13□□□□□ -0.95
Defa5P28312 Hspa9-201ENSMUST00000025217 3049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.13□□□□□ -0.95
Defa5P28312 Dixdc1-202ENSMUST00000117093 1613 ntTSL 1 (best) BASIC9.13□□□□□ -0.95
Defa5P28312 Otub2-202ENSMUST00000101094 3228 ntTSL 1 (best) BASIC9.12□□□□□ -0.95
Defa5P28312 Lrrfip2-214ENSMUST00000217117 1363 ntTSL 5 BASIC9.12□□□□□ -0.95
Defa5P28312 Tcp11l1-202ENSMUST00000111118 5474 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.12□□□□□ -0.95
Defa5P28312 Zfp629-203ENSMUST00000122066 5850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.12□□□□□ -0.95
Defa5P28312 Zcchc18-202ENSMUST00000101227 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.12□□□□□ -0.95
Defa5P28312 AC091764.2-201ENSMUST00000218190 1590 ntTSL 5 BASIC9.12□□□□□ -0.95
Defa5P28312 Car6-201ENSMUST00000030817 1567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.12□□□□□ -0.95
Defa5P28312 C4a-207ENSMUST00000160679 5371 ntTSL 1 (best) BASIC9.12□□□□□ -0.95
Defa5P28312 Galr1-201ENSMUST00000065224 2871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.12□□□□□ -0.95
Defa5P28312 Rps13-203ENSMUST00000205490 1317 ntTSL 1 (best) BASIC9.12□□□□□ -0.95
Defa5P28312 Vipas39-203ENSMUST00000179379 2418 ntTSL 1 (best) BASIC9.12□□□□□ -0.95
Defa5P28312 Lrp8-203ENSMUST00000106732 2648 ntTSL 1 (best) BASIC9.12□□□□□ -0.95
Defa5P28312 Cdadc1-201ENSMUST00000022555 1500 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.12□□□□□ -0.95
Defa5P28312 AC154639.1-201ENSMUST00000224393 2849 ntBASIC9.12□□□□□ -0.95
Defa5P28312 Meltf-201ENSMUST00000023464 4133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.12□□□□□ -0.95
Defa5P28312 Clasp2-201ENSMUST00000111838 5609 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.12□□□□□ -0.95
Defa5P28312 Cdnf-201ENSMUST00000036350 3013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.12□□□□□ -0.95
Defa5P28312 Setd3-202ENSMUST00000109879 2387 ntTSL 3 BASIC9.12□□□□□ -0.95
Defa5P28312 Trub2-201ENSMUST00000048044 3408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.12□□□□□ -0.95
Defa5P28312 Bcl2l15-202ENSMUST00000106822 1902 ntTSL 1 (best) BASIC9.12□□□□□ -0.95
Defa5P28312 Chst4-201ENSMUST00000109222 1942 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.12□□□□□ -0.95
Defa5P28312 Rtbdn-201ENSMUST00000067472 1908 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.12□□□□□ -0.95
Defa5P28312 Gm12742-201ENSMUST00000117326 410 ntBASIC9.12□□□□□ -0.95
Defa5P28312 Tspan4-202ENSMUST00000117634 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.12□□□□□ -0.95
Defa5P28312 Gm14064-201ENSMUST00000134833 727 ntTSL 3 BASIC9.12□□□□□ -0.95
Defa5P28312 1110018N20Rik-202ENSMUST00000147446 1162 ntTSL 1 (best) BASIC9.12□□□□□ -0.95
Defa5P28312 Haglr-202ENSMUST00000152462 443 ntTSL 2 BASIC9.12□□□□□ -0.95
Defa5P28312 Gm12678-201ENSMUST00000154177 692 ntTSL 1 (best) BASIC9.12□□□□□ -0.95
Defa5P28312 Rmrp-201ENSMUST00000157463 271 ntBASIC9.12□□□□□ -0.95
Defa5P28312 Commd6-203ENSMUST00000168587 519 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.12□□□□□ -0.95
Defa5P28312 Gm20404-201ENSMUST00000174032 621 ntTSL 3 BASIC9.12□□□□□ -0.95
Defa5P28312 Gm9022-201ENSMUST00000182482 992 ntBASIC9.12□□□□□ -0.95
Defa5P28312 Hmgcll1-207ENSMUST00000183979 1136 ntTSL 5 BASIC9.12□□□□□ -0.95
Defa5P28312 AY702102-202ENSMUST00000194651 1173 ntBASIC9.12□□□□□ -0.95
Defa5P28312 Sox2ot-208ENSMUST00000197103 802 ntTSL 2 BASIC9.12□□□□□ -0.95
Defa5P28312 Gm5149-201ENSMUST00000199768 620 ntTSL 3 BASIC9.12□□□□□ -0.95
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 41.6 ms