Protein–RNA interactions for Protein: P23812

Hoxd12, Homeobox protein Hox-D12, mousemouse

Predictions only

Length 268 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Hoxd12P23812 Gm15985-201ENSMUST00000137731 343 ntTSL 3 BASIC12.07□□□□□ -0.48
Hoxd12P23812 Irf9-205ENSMUST00000138037 2343 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.07□□□□□ -0.48
Hoxd12P23812 Gm13857-203ENSMUST00000150561 2337 ntTSL 1 (best) BASIC12.07□□□□□ -0.48
Hoxd12P23812 5430405H02Rik-201ENSMUST00000153616 1431 ntTSL 1 (best) BASIC12.07□□□□□ -0.48
Hoxd12P23812 Gm26047-201ENSMUST00000157308 113 ntBASIC12.07□□□□□ -0.48
Hoxd12P23812 Slc29a1-209ENSMUST00000166119 1598 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.07□□□□□ -0.48
Hoxd12P23812 Elof1-202ENSMUST00000166335 1053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.07□□□□□ -0.48
Hoxd12P23812 Gm20420-201ENSMUST00000173178 639 ntTSL 1 (best) BASIC12.07□□□□□ -0.48
Hoxd12P23812 Psmb6-201ENSMUST00000018430 798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.07□□□□□ -0.48
Hoxd12P23812 Gm26047-202ENSMUST00000198840 115 ntBASIC12.07□□□□□ -0.48
Hoxd12P23812 Gm45570-201ENSMUST00000211137 495 ntTSL 5 BASIC12.07□□□□□ -0.48
Hoxd12P23812 Olfr156-203ENSMUST00000214843 1559 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.07□□□□□ -0.48
Hoxd12P23812 Gm9111-201ENSMUST00000219394 709 ntBASIC12.07□□□□□ -0.48
Hoxd12P23812 AC160028.1-201ENSMUST00000219645 1095 ntTSL 1 (best) BASIC12.07□□□□□ -0.48
Hoxd12P23812 Cby1-201ENSMUST00000023064 1119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.07□□□□□ -0.48
Hoxd12P23812 Tk1-201ENSMUST00000026661 1440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.07□□□□□ -0.48
Hoxd12P23812 Aldh6a1-201ENSMUST00000085192 3399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.07□□□□□ -0.48
Hoxd12P23812 Gm10334-201ENSMUST00000095999 876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.07□□□□□ -0.48
Hoxd12P23812 Aff4-201ENSMUST00000060945 10099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.07□□□□□ -0.48
Hoxd12P23812 Srr-202ENSMUST00000108447 3138 ntTSL 5 BASIC12.07□□□□□ -0.48
Hoxd12P23812 Trim26-201ENSMUST00000053434 3198 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.07□□□□□ -0.48
Hoxd12P23812 Hmga2-203ENSMUST00000159699 3810 ntTSL 1 (best) BASIC12.07□□□□□ -0.48
Hoxd12P23812 Vrtn-202ENSMUST00000166772 3098 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC12.07□□□□□ -0.48
Hoxd12P23812 Ripk3-202ENSMUST00000168716 1964 ntTSL 5 BASIC12.07□□□□□ -0.48
Hoxd12P23812 Prrt3-204ENSMUST00000205075 1956 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC12.07□□□□□ -0.48
Hoxd12P23812 Dpp8-201ENSMUST00000034960 4808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.07□□□□□ -0.48
Hoxd12P23812 Usp10-210ENSMUST00000144458 3726 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.07□□□□□ -0.48
Hoxd12P23812 Gpr132-201ENSMUST00000021729 2478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.06□□□□□ -0.48
Hoxd12P23812 Dip2a-201ENSMUST00000036033 6322 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC12.06□□□□□ -0.48
Hoxd12P23812 Pex5-205ENSMUST00000112532 3148 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC12.06□□□□□ -0.48
Hoxd12P23812 Pde4a-203ENSMUST00000115458 2962 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.06□□□□□ -0.48
Hoxd12P23812 Prss47-202ENSMUST00000203968 1353 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC12.06□□□□□ -0.48
Hoxd12P23812 Ism2-201ENSMUST00000051601 1350 ntTSL 5 BASIC12.06□□□□□ -0.48
Hoxd12P23812 Apon-201ENSMUST00000060782 1397 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.06□□□□□ -0.48
Hoxd12P23812 Gm9866-202ENSMUST00000182473 1882 ntTSL 1 (best) BASIC12.06□□□□□ -0.48
Hoxd12P23812 Acrbp-202ENSMUST00000088294 1883 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.06□□□□□ -0.48
Hoxd12P23812 Arhgef2-201ENSMUST00000029694 4300 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.06□□□□□ -0.48
Hoxd12P23812 Cacna1g-202ENSMUST00000100561 8125 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.06□□□□□ -0.48
Hoxd12P23812 Tmem39a-201ENSMUST00000002924 2871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.06□□□□□ -0.48
Hoxd12P23812 Nynrin-202ENSMUST00000168479 7511 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.06□□□□□ -0.48
Hoxd12P23812 Chpf2-201ENSMUST00000088295 5371 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.06□□□□□ -0.48
Hoxd12P23812 Pcp4l1-201ENSMUST00000111332 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.06□□□□□ -0.48
Hoxd12P23812 Irf1-203ENSMUST00000108922 2092 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.06□□□□□ -0.48
Hoxd12P23812 Otx2-209ENSMUST00000226501 2592 ntAPPRIS P1 BASIC12.06□□□□□ -0.48
Hoxd12P23812 Tmem62-202ENSMUST00000110686 2417 ntTSL 1 (best) BASIC12.06□□□□□ -0.48
Hoxd12P23812 Nphs2-201ENSMUST00000027896 3116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.06□□□□□ -0.48
Hoxd12P23812 Gm26841-201ENSMUST00000180725 1787 ntTSL 1 (best) BASIC12.06□□□□□ -0.48
Hoxd12P23812 Capn3-201ENSMUST00000028748 2606 ntTSL 1 (best) BASIC12.06□□□□□ -0.48
Hoxd12P23812 Rad54b-203ENSMUST00000108306 652 ntTSL 3 BASIC12.06□□□□□ -0.48
Hoxd12P23812 Irf1-202ENSMUST00000108920 2137 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.06□□□□□ -0.48
Hoxd12P23812 Gm11422-201ENSMUST00000118925 1103 ntBASIC12.06□□□□□ -0.48
Hoxd12P23812 Gm11980-201ENSMUST00000121445 986 ntBASIC12.06□□□□□ -0.48
Hoxd12P23812 Snhg17-205ENSMUST00000151331 529 ntTSL 2 BASIC12.06□□□□□ -0.48
Hoxd12P23812 Ighv2-1-201ENSMUST00000170946 353 ntBASIC12.06□□□□□ -0.48
Hoxd12P23812 Apoe-210ENSMUST00000174710 514 ntTSL 1 (best) BASIC12.06□□□□□ -0.48
Hoxd12P23812 Gm18367-201ENSMUST00000176139 600 ntBASIC12.06□□□□□ -0.48
Hoxd12P23812 Gm26759-201ENSMUST00000181773 1251 ntTSL 1 (best) BASIC12.06□□□□□ -0.48
Hoxd12P23812 Gm4034-201ENSMUST00000187674 480 ntBASIC12.06□□□□□ -0.48
Hoxd12P23812 Gm37981-201ENSMUST00000194280 535 ntBASIC12.06□□□□□ -0.48
Hoxd12P23812 Fxyd4-203ENSMUST00000203082 815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.06□□□□□ -0.48
Hoxd12P23812 BC030499-201ENSMUST00000046361 959 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.06□□□□□ -0.48
Hoxd12P23812 Gm8325-201ENSMUST00000099086 453 ntBASIC12.06□□□□□ -0.48
Hoxd12P23812 Dab2ip-205ENSMUST00000112986 5580 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.06□□□□□ -0.48
Hoxd12P23812 Sugp1-201ENSMUST00000011450 2681 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.06□□□□□ -0.48
Hoxd12P23812 Gm26678-201ENSMUST00000181057 3025 ntTSL 5 BASIC12.06□□□□□ -0.48
Hoxd12P23812 Gnb1l-211ENSMUST00000167778 3569 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.06□□□□□ -0.48
Hoxd12P23812 Adgrl1-204ENSMUST00000131717 5152 ntTSL 1 (best) BASIC12.06□□□□□ -0.48
Hoxd12P23812 Hnf1b-202ENSMUST00000108113 2376 ntTSL 1 (best) BASIC12.06□□□□□ -0.48
Hoxd12P23812 Serpinb12-201ENSMUST00000081277 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.06□□□□□ -0.48
Hoxd12P23812 Clec4a3-201ENSMUST00000088468 1300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.06□□□□□ -0.48
Hoxd12P23812 Aqr-201ENSMUST00000043160 4888 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.06□□□□□ -0.48
Hoxd12P23812 Pla2g3-202ENSMUST00000064265 2566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.06□□□□□ -0.48
Hoxd12P23812 Mroh1-204ENSMUST00000159218 5085 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.06□□□□□ -0.48
Hoxd12P23812 Zfhx2os-202ENSMUST00000183750 4375 ntTSL 1 (best) BASIC12.06□□□□□ -0.48
Hoxd12P23812 Dok7-203ENSMUST00000114270 2779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.06□□□□□ -0.48
Hoxd12P23812 Srsf5-201ENSMUST00000094693 1527 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.06□□□□□ -0.48
Hoxd12P23812 Eme1-201ENSMUST00000039949 2444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.06□□□□□ -0.48
Hoxd12P23812 Clcn6-201ENSMUST00000030879 3306 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.06□□□□□ -0.48
Hoxd12P23812 Gm33543-203ENSMUST00000211096 1722 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC12.06□□□□□ -0.48
Hoxd12P23812 Cpsf4l-202ENSMUST00000100248 1375 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.05□□□□□ -0.48
Hoxd12P23812 Arntl-206ENSMUST00000211770 2464 ntTSL 5 BASIC12.05□□□□□ -0.48
Hoxd12P23812 Gm5385-201ENSMUST00000118988 1559 ntBASIC12.05□□□□□ -0.48
Hoxd12P23812 9230110C19Rik-201ENSMUST00000065291 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.05□□□□□ -0.48
Hoxd12P23812 Tecpr1-201ENSMUST00000085701 5106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.05□□□□□ -0.48
Hoxd12P23812 Slc38a10-204ENSMUST00000103018 4578 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.05□□□□□ -0.48
Hoxd12P23812 Olfr279-202ENSMUST00000205772 5330 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC12.05□□□□□ -0.48
Hoxd12P23812 Map2k4-201ENSMUST00000046963 3695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.05□□□□□ -0.48
Hoxd12P23812 Rnf183-203ENSMUST00000107455 1432 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC12.05□□□□□ -0.48
Hoxd12P23812 Ivns1abp-201ENSMUST00000023918 3511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.05□□□□□ -0.48
Hoxd12P23812 Chrna9-201ENSMUST00000031108 1843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.05□□□□□ -0.48
Hoxd12P23812 Nfic-202ENSMUST00000078185 3163 ntTSL 5 BASIC12.05□□□□□ -0.48
Hoxd12P23812 Trpv4-202ENSMUST00000112217 2436 ntTSL 5 BASIC12.05□□□□□ -0.48
Hoxd12P23812 Gm10652-201ENSMUST00000199790 2622 ntBASIC12.05□□□□□ -0.48
Hoxd12P23812 Irf8-201ENSMUST00000047737 2847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.05□□□□□ -0.48
Hoxd12P23812 4930432E11Rik-202ENSMUST00000063585 10871 ntBASIC12.05□□□□□ -0.48
Hoxd12P23812 Hist1h2bk-201ENSMUST00000110455 476 ntAPPRIS P1 BASIC12.05□□□□□ -0.48
Hoxd12P23812 Olfr1258-202ENSMUST00000111516 936 ntAPPRIS P1 BASIC12.05□□□□□ -0.48
Hoxd12P23812 Gm16166-201ENSMUST00000118291 787 ntBASIC12.05□□□□□ -0.48
Hoxd12P23812 Rpl19-ps1-201ENSMUST00000121059 591 ntBASIC12.05□□□□□ -0.48
Hoxd12P23812 Gm15744-201ENSMUST00000161734 213 ntBASIC12.05□□□□□ -0.48
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 71.3 ms