Protein–RNA interactions for Protein: P23336

Ggta1, N-acetyllactosaminide alpha-1,3-galactosyltransferase, mousemouse

Predictions only

Length 394 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ggta1P23336 Hars2-201ENSMUST00000019287 2002 ntTSL 1 (best) BASIC11.22□□□□□ -0.61
Ggta1P23336 Gm42599-201ENSMUST00000201308 469 ntBASIC11.22□□□□□ -0.61
Ggta1P23336 Gtf2ird1-224ENSMUST00000202280 3052 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.22□□□□□ -0.61
Ggta1P23336 Gm33175-201ENSMUST00000211562 461 ntTSL 5 BASIC11.22□□□□□ -0.61
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Ggta1P23336 1700025G04Rik-201ENSMUST00000044581 9559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.22□□□□□ -0.61
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Ggta1P23336 Rhox2a-201ENSMUST00000063340 795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.22□□□□□ -0.61
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Ggta1P23336 Mroh1-201ENSMUST00000092595 5111 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.22□□□□□ -0.61
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Ggta1P23336 Gramd2-201ENSMUST00000098661 1368 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.22□□□□□ -0.61
Ggta1P23336 Txndc5-203ENSMUST00000160653 2586 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.22□□□□□ -0.61
Ggta1P23336 4933434E20Rik-206ENSMUST00000160640 2510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.22□□□□□ -0.61
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Ggta1P23336 Tcn2-201ENSMUST00000020710 1897 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.21□□□□□ -0.61
Ggta1P23336 Plet1-201ENSMUST00000114474 1689 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.21□□□□□ -0.61
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Ggta1P23336 Jhy-201ENSMUST00000034521 3074 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.21□□□□□ -0.61
Ggta1P23336 Mapkapk5-204ENSMUST00000111783 1513 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.21□□□□□ -0.61
Ggta1P23336 Egr2-202ENSMUST00000105438 2864 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.21□□□□□ -0.61
Ggta1P23336 Coq3-201ENSMUST00000029909 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.21□□□□□ -0.61
Ggta1P23336 Tectb-202ENSMUST00000120936 1349 ntTSL 5 BASIC11.21□□□□□ -0.61
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Ggta1P23336 4930522L14Rik-201ENSMUST00000100937 599 ntTSL 1 (best) BASIC11.21□□□□□ -0.61
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Ggta1P23336 Terf2ip-201ENSMUST00000052138 3560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.21□□□□□ -0.62
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Ggta1P23336 Pdyn-201ENSMUST00000028883 2386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.21□□□□□ -0.62
Ggta1P23336 Usp14-201ENSMUST00000092096 2360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.21□□□□□ -0.62
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Ggta1P23336 Gm3764-205ENSMUST00000181134 2203 ntTSL 1 (best) BASIC11.21□□□□□ -0.62
Ggta1P23336 Uap1l1-201ENSMUST00000102925 3349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.21□□□□□ -0.62
Ggta1P23336 Myo18a-205ENSMUST00000100794 6182 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.21□□□□□ -0.62
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Ggta1P23336 Sh3tc1-201ENSMUST00000070203 4549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.2□□□□□ -0.62
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Ggta1P23336 Zscan22-201ENSMUST00000055528 2620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.2□□□□□ -0.62
Ggta1P23336 Ttll12-201ENSMUST00000016901 3220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.2□□□□□ -0.62
Ggta1P23336 Pla2g3-202ENSMUST00000064265 2566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.2□□□□□ -0.62
Ggta1P23336 N4bp2l1-201ENSMUST00000016279 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.2□□□□□ -0.62
Ggta1P23336 Cdc14a-201ENSMUST00000090464 4485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.2□□□□□ -0.62
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Ggta1P23336 Csnk2b-201ENSMUST00000025246 961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.2□□□□□ -0.62
Ggta1P23336 Dnajc4-201ENSMUST00000025915 1074 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.2□□□□□ -0.62
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Ggta1P23336 Cds2-201ENSMUST00000089461 8073 ntTSL 1 (best) BASIC11.2□□□□□ -0.62
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Ggta1P23336 Patj-201ENSMUST00000030290 2495 ntTSL 1 (best) BASIC11.2□□□□□ -0.62
Ggta1P23336 Map2k4-201ENSMUST00000046963 3695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.2□□□□□ -0.62
Ggta1P23336 Gjb2-201ENSMUST00000055698 2406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.2□□□□□ -0.62
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Ggta1P23336 AC157950.1-201ENSMUST00000217561 2168 ntBASIC11.2□□□□□ -0.62
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 49.6 ms