Protein–RNA interactions for Protein: P20664

Prim1, DNA primase small subunit, mousemouse

Predictions only

Length 417 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Prim1P20664 Gm2965-201ENSMUST00000198365 343 ntBASIC15.4■□□□□ 0.06
Prim1P20664 Gm18393-201ENSMUST00000208349 1131 ntBASIC15.4■□□□□ 0.06
Prim1P20664 AC153801.1-201ENSMUST00000217904 947 ntBASIC15.4■□□□□ 0.06
Prim1P20664 AC153522.1-201ENSMUST00000220047 1090 ntBASIC15.4■□□□□ 0.06
Prim1P20664 Rbp2-201ENSMUST00000035029 672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Prim1P20664 Ufc1-201ENSMUST00000080001 1007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Prim1P20664 Gm10288-201ENSMUST00000084614 537 ntBASIC15.4■□□□□ 0.06
Prim1P20664 Orc4-202ENSMUST00000090976 1153 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Prim1P20664 Armcx1-203ENSMUST00000113197 2179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Prim1P20664 A730062M13Rik-201ENSMUST00000192843 1910 ntBASIC15.4■□□□□ 0.06
Prim1P20664 Krt33a-201ENSMUST00000018399 1683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Prim1P20664 Gm36235-201ENSMUST00000223158 1694 ntTSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Prim1P20664 Gfi1b-201ENSMUST00000028156 1681 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Prim1P20664 Cyp2a12-201ENSMUST00000075552 1681 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Prim1P20664 Tirap-203ENSMUST00000176531 2310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Prim1P20664 Zbtb20-205ENSMUST00000114695 2977 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Prim1P20664 Rab13-202ENSMUST00000107373 1415 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Prim1P20664 Slc25a13-203ENSMUST00000188414 3121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Prim1P20664 Gm12802-201ENSMUST00000145510 1813 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Prim1P20664 Gpr85-201ENSMUST00000060442 3661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Prim1P20664 Neu2-201ENSMUST00000070898 1570 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Prim1P20664 Tfe3-202ENSMUST00000079542 3163 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Prim1P20664 Tmppe-201ENSMUST00000111820 2921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Prim1P20664 Ivns1abp-202ENSMUST00000097543 3337 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Prim1P20664 Tmem200a-201ENSMUST00000066049 4115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Prim1P20664 Ppp2r2b-202ENSMUST00000117687 2271 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Prim1P20664 Hrct1-201ENSMUST00000095109 1452 ntAPPRIS P1 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Prim1P20664 Lynx1-201ENSMUST00000023259 4023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Prim1P20664 Gm11476-201ENSMUST00000127006 2019 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Prim1P20664 Hcls1-201ENSMUST00000023531 2016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Prim1P20664 Dpp9-201ENSMUST00000038794 3374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Prim1P20664 4931429P17Rik-201ENSMUST00000061899 2012 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Prim1P20664 Serpinb12-202ENSMUST00000112724 1623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Prim1P20664 Sfmbt1-206ENSMUST00000228006 3299 ntAPPRIS P1 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Prim1P20664 Hpse2-201ENSMUST00000099428 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Prim1P20664 5330439B14Rik-201ENSMUST00000194811 1392 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Prim1P20664 Ube2k-210ENSMUST00000202679 4682 ntTSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Prim1P20664 Brsk1-204ENSMUST00000205666 1398 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Prim1P20664 Ntrk2-204ENSMUST00000224259 3049 ntBASIC15.39■□□□□ 0.05
Prim1P20664 Asl-202ENSMUST00000159619 2088 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Prim1P20664 Heatr3-202ENSMUST00000121949 3086 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Prim1P20664 Slc35f6-205ENSMUST00000196740 1972 ntTSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Prim1P20664 Rap2b-201ENSMUST00000049064 6793 ntAPPRIS P1 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Prim1P20664 Rpl11-201ENSMUST00000102536 833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Prim1P20664 Zmym1-202ENSMUST00000106099 2982 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Prim1P20664 Cep97-204ENSMUST00000121129 989 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Prim1P20664 4930595D18Rik-201ENSMUST00000121608 818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Prim1P20664 Aldh3b2-201ENSMUST00000143380 2141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Prim1P20664 Gm13523-201ENSMUST00000151820 488 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Prim1P20664 Bud31-206ENSMUST00000162308 705 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Prim1P20664 Gnpda2-207ENSMUST00000173927 1011 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Prim1P20664 Gm26759-201ENSMUST00000181773 1251 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Prim1P20664 Smim22-207ENSMUST00000184439 382 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Prim1P20664 Gm42619-201ENSMUST00000197564 1136 ntBASIC15.39■□□□□ 0.05
Prim1P20664 Qdpr-209ENSMUST00000198258 1172 ntTSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Prim1P20664 Ankrd7-201ENSMUST00000031489 1190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Prim1P20664 Snapc5-201ENSMUST00000034965 1228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Prim1P20664 Ccdc54-201ENSMUST00000062439 1296 ntAPPRIS P1 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Prim1P20664 4833422M21Rik-202ENSMUST00000181252 2410 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Prim1P20664 Runx3-201ENSMUST00000056977 3884 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Prim1P20664 Gm9866-202ENSMUST00000182473 1882 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Prim1P20664 Mtf2-201ENSMUST00000081567 4060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Prim1P20664 Trip13-201ENSMUST00000022053 3399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Prim1P20664 Cnbd1-201ENSMUST00000137780 1331 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Prim1P20664 Gm16364-201ENSMUST00000153722 1313 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Prim1P20664 2610001J05Rik-203ENSMUST00000185219 1606 ntAPPRIS P1 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Prim1P20664 Tnf-201ENSMUST00000025263 1639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Prim1P20664 Pigk-201ENSMUST00000045029 1761 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Prim1P20664 Mob3a-201ENSMUST00000003438 2682 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Prim1P20664 Ankrd42-205ENSMUST00000138267 2827 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Prim1P20664 Thtpa-201ENSMUST00000050575 2830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Prim1P20664 Uap1l1-201ENSMUST00000102925 3349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Prim1P20664 Trim26-205ENSMUST00000130367 3187 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Prim1P20664 Pank4-202ENSMUST00000070953 2706 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Prim1P20664 Txndc5-203ENSMUST00000160653 2586 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Prim1P20664 Gm9796-201ENSMUST00000062249 2250 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
Prim1P20664 Cyb561d1-201ENSMUST00000065664 4058 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Prim1P20664 Sorcs1-206ENSMUST00000209783 3489 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Prim1P20664 Gm16010-202ENSMUST00000145410 4427 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Prim1P20664 Dmac2-202ENSMUST00000085953 2387 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Prim1P20664 2900097C17Rik-202ENSMUST00000192863 4915 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
Prim1P20664 Ighv2-6-8-201ENSMUST00000103455 342 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Prim1P20664 Agbl3-201ENSMUST00000115009 806 ntTSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Prim1P20664 Gm23085-201ENSMUST00000157849 293 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
Prim1P20664 Gm10925-201ENSMUST00000189941 678 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
Prim1P20664 Gm37835-201ENSMUST00000193305 361 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
Prim1P20664 Gm45575-201ENSMUST00000210283 548 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
Prim1P20664 Cct2-206ENSMUST00000219573 637 ntTSL 3 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Prim1P20664 AC154441.1-201ENSMUST00000223653 1006 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
Prim1P20664 AC154680.1-201ENSMUST00000224376 859 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
Prim1P20664 AC154849.4-201ENSMUST00000224868 365 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
Prim1P20664 AC158981.3-201ENSMUST00000226844 1024 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
Prim1P20664 Ntan1-201ENSMUST00000023362 1175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Prim1P20664 Ms4a4b-201ENSMUST00000035258 1244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Prim1P20664 Rpl10a-201ENSMUST00000042334 829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Prim1P20664 Obp1b-201ENSMUST00000088198 797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Prim1P20664 Irak1-203ENSMUST00000101458 2052 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Prim1P20664 Fam198a-202ENSMUST00000213773 2088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Prim1P20664 Riok1-201ENSMUST00000021866 2738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Prim1P20664 Spg20-202ENSMUST00000107971 3567 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 43 ms