Protein–RNA interactions for Protein: P20444

Prkca, Protein kinase C alpha type, mousemouse

Predictions only

Length 672 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PrkcaP20444 Fhl1-204ENSMUST00000114772 2283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.91□□□□□ -0.66
PrkcaP20444 Rasgrp4-205ENSMUST00000159975 2296 ntTSL 1 (best) BASIC10.91□□□□□ -0.66
PrkcaP20444 Pycr1-206ENSMUST00000170556 2914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.91□□□□□ -0.66
PrkcaP20444 Akp-ps1-201ENSMUST00000188050 1600 ntBASIC10.91□□□□□ -0.66
PrkcaP20444 AC122197.2-201ENSMUST00000219196 1635 ntBASIC10.91□□□□□ -0.66
PrkcaP20444 Togaram1-207ENSMUST00000223166 6386 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.91□□□□□ -0.66
PrkcaP20444 Lhfpl1-201ENSMUST00000040084 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.91□□□□□ -0.66
PrkcaP20444 Pigh-203ENSMUST00000217998 2868 ntTSL 1 (best) BASIC10.91□□□□□ -0.66
PrkcaP20444 Asb8-204ENSMUST00000143400 2226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.9□□□□□ -0.66
PrkcaP20444 Acsf3-201ENSMUST00000015160 2206 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.9□□□□□ -0.66
PrkcaP20444 Cnmd-203ENSMUST00000165835 1362 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.9□□□□□ -0.66
PrkcaP20444 4732414G09Rik-201ENSMUST00000156243 2422 ntTSL 1 (best) BASIC10.9□□□□□ -0.66
PrkcaP20444 Abcd3-201ENSMUST00000029770 3489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.9□□□□□ -0.66
PrkcaP20444 1700025G04Rik-201ENSMUST00000044581 9559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.9□□□□□ -0.66
PrkcaP20444 Alg12-201ENSMUST00000043087 1793 ntTSL 1 (best) BASIC10.9□□□□□ -0.66
PrkcaP20444 Kalrn-209ENSMUST00000114963 3207 ntTSL 5 BASIC10.9□□□□□ -0.66
PrkcaP20444 Ripk3-202ENSMUST00000168716 1964 ntTSL 5 BASIC10.9□□□□□ -0.66
PrkcaP20444 Thsd4-202ENSMUST00000098660 8796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.9□□□□□ -0.66
PrkcaP20444 Btbd9-201ENSMUST00000079924 6657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.9□□□□□ -0.66
PrkcaP20444 Myo18a-211ENSMUST00000130627 6202 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.9□□□□□ -0.66
PrkcaP20444 4930488B22Rik-201ENSMUST00000172500 1722 ntTSL 1 (best) BASIC10.9□□□□□ -0.66
PrkcaP20444 Kifc2-201ENSMUST00000004294 3143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.9□□□□□ -0.66
PrkcaP20444 Ikzf4-204ENSMUST00000222067 2688 ntTSL 1 (best) BASIC10.9□□□□□ -0.66
PrkcaP20444 Maml2-202ENSMUST00000159294 6404 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.9□□□□□ -0.66
PrkcaP20444 Jmjd8-201ENSMUST00000026832 2091 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.9□□□□□ -0.66
PrkcaP20444 Tctn3-203ENSMUST00000135795 1686 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.9□□□□□ -0.66
PrkcaP20444 Bpifb6-201ENSMUST00000088955 1669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.9□□□□□ -0.66
PrkcaP20444 Lman1l-202ENSMUST00000093832 1685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.9□□□□□ -0.66
PrkcaP20444 Mettl17-206ENSMUST00000164902 1461 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.9□□□□□ -0.66
PrkcaP20444 Hsd3b3-201ENSMUST00000090743 1492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.9□□□□□ -0.66
PrkcaP20444 Fam160b2-201ENSMUST00000022690 4033 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.9□□□□□ -0.66
PrkcaP20444 Tnfrsf18-202ENSMUST00000103173 1189 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC10.9□□□□□ -0.66
PrkcaP20444 Trav4-2-201ENSMUST00000103637 370 ntAPPRIS P1 BASIC10.9□□□□□ -0.66
PrkcaP20444 Tpd52l2-203ENSMUST00000108799 985 ntTSL 5 BASIC10.9□□□□□ -0.66
PrkcaP20444 Mir1982-201ENSMUST00000157368 74 ntBASIC10.9□□□□□ -0.66
PrkcaP20444 Spdye4b-202ENSMUST00000159781 1128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.9□□□□□ -0.66
PrkcaP20444 1700122O11Rik-201ENSMUST00000178823 771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.9□□□□□ -0.66
PrkcaP20444 Gm5370-201ENSMUST00000187187 574 ntBASIC10.9□□□□□ -0.66
PrkcaP20444 Gm37201-201ENSMUST00000191845 523 ntBASIC10.9□□□□□ -0.66
PrkcaP20444 Sox2ot-207ENSMUST00000196987 727 ntTSL 3 BASIC10.9□□□□□ -0.66
PrkcaP20444 Tmem176b-209ENSMUST00000204073 986 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.9□□□□□ -0.66
PrkcaP20444 Gm44756-201ENSMUST00000206172 1069 ntTSL 1 (best) BASIC10.9□□□□□ -0.66
PrkcaP20444 Timm9-203ENSMUST00000220482 859 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC10.9□□□□□ -0.66
PrkcaP20444 AC154462.2-201ENSMUST00000227519 370 ntBASIC10.9□□□□□ -0.66
PrkcaP20444 Bicra-204ENSMUST00000210781 5975 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.9□□□□□ -0.66
PrkcaP20444 Acsf3-202ENSMUST00000212781 2604 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC10.9□□□□□ -0.66
PrkcaP20444 Med12l-203ENSMUST00000040846 3747 ntTSL 1 (best) BASIC10.9□□□□□ -0.66
PrkcaP20444 Tmem92-203ENSMUST00000162809 1437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.9□□□□□ -0.66
PrkcaP20444 Epb41l3-202ENSMUST00000112680 4073 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.9□□□□□ -0.66
PrkcaP20444 Abcb9-201ENSMUST00000031354 3661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.9□□□□□ -0.66
PrkcaP20444 Mylip-202ENSMUST00000222178 1954 ntTSL 1 (best) BASIC10.9□□□□□ -0.66
PrkcaP20444 Stxbp6-202ENSMUST00000120531 4209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.9□□□□□ -0.66
PrkcaP20444 Hmgcs2-202ENSMUST00000120541 2524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.9□□□□□ -0.67
PrkcaP20444 Lnx1-206ENSMUST00000121690 2302 ntTSL 1 (best) BASIC10.9□□□□□ -0.67
PrkcaP20444 Gm13857-203ENSMUST00000150561 2337 ntTSL 1 (best) BASIC10.9□□□□□ -0.67
PrkcaP20444 Cnot10-201ENSMUST00000070117 2853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.9□□□□□ -0.67
PrkcaP20444 Dlgap4-203ENSMUST00000099145 3402 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC10.9□□□□□ -0.67
PrkcaP20444 Zfp866-202ENSMUST00000137573 3245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.9□□□□□ -0.67
PrkcaP20444 Mzf1-201ENSMUST00000069289 3597 ntTSL 1 (best) BASIC10.9□□□□□ -0.67
PrkcaP20444 Zfp532-202ENSMUST00000169679 5003 ntTSL 5 BASIC10.9□□□□□ -0.67
PrkcaP20444 2810404F17Rik-201ENSMUST00000156615 1704 ntTSL 1 (best) BASIC10.89□□□□□ -0.67
PrkcaP20444 Fut4-201ENSMUST00000061498 4074 ntAPPRIS P1 BASIC10.89□□□□□ -0.67
PrkcaP20444 Lins1-202ENSMUST00000077967 2647 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC10.89□□□□□ -0.67
PrkcaP20444 Myf5-201ENSMUST00000000445 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.89□□□□□ -0.67
PrkcaP20444 Tspyl4-201ENSMUST00000047935 3879 ntAPPRIS P1 BASIC10.89□□□□□ -0.67
PrkcaP20444 Rbm8a-203ENSMUST00000198027 2757 ntTSL 3 BASIC10.89□□□□□ -0.67
PrkcaP20444 5430400D12Rik-201ENSMUST00000181717 1690 ntTSL 1 (best) BASIC10.89□□□□□ -0.67
PrkcaP20444 Hao1-201ENSMUST00000028704 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.89□□□□□ -0.67
PrkcaP20444 Bod1l-204ENSMUST00000202908 10399 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.89□□□□□ -0.67
PrkcaP20444 Ptpn4-201ENSMUST00000064091 10874 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.89□□□□□ -0.67
PrkcaP20444 1700030J22Rik-202ENSMUST00000213068 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.89□□□□□ -0.67
PrkcaP20444 Odf2-209ENSMUST00000113764 2450 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC10.89□□□□□ -0.67
PrkcaP20444 C230024C17Rik-201ENSMUST00000190663 3337 ntTSL 1 (best) BASIC10.89□□□□□ -0.67
PrkcaP20444 Gm24830-201ENSMUST00000102024 166 ntBASIC10.89□□□□□ -0.67
PrkcaP20444 Ccdc169-203ENSMUST00000118963 740 ntTSL 3 BASIC10.89□□□□□ -0.67
PrkcaP20444 Gm11658-201ENSMUST00000120913 1008 ntBASIC10.89□□□□□ -0.67
PrkcaP20444 Gm14999-201ENSMUST00000121039 624 ntBASIC10.89□□□□□ -0.67
PrkcaP20444 Med9os-203ENSMUST00000146334 527 ntTSL 1 (best) BASIC10.89□□□□□ -0.67
PrkcaP20444 Snora78-201ENSMUST00000158630 128 ntBASIC10.89□□□□□ -0.67
PrkcaP20444 Gm16282-201ENSMUST00000162641 451 ntTSL 3 BASIC10.89□□□□□ -0.67
PrkcaP20444 Gm17180-201ENSMUST00000172211 435 ntTSL 3 BASIC10.89□□□□□ -0.67
PrkcaP20444 Gm2467-201ENSMUST00000182266 1010 ntBASIC10.89□□□□□ -0.67
PrkcaP20444 Gm6981-201ENSMUST00000182467 1008 ntBASIC10.89□□□□□ -0.67
PrkcaP20444 Gm29856-201ENSMUST00000191905 1257 ntTSL 1 (best) BASIC10.89□□□□□ -0.67
PrkcaP20444 Gm37008-201ENSMUST00000195712 319 ntBASIC10.89□□□□□ -0.67
PrkcaP20444 Gm43433-201ENSMUST00000196573 481 ntBASIC10.89□□□□□ -0.67
PrkcaP20444 Gm45437-201ENSMUST00000209998 448 ntTSL 3 BASIC10.89□□□□□ -0.67
PrkcaP20444 AC140451.2-201ENSMUST00000228030 664 ntBASIC10.89□□□□□ -0.67
PrkcaP20444 Fau-201ENSMUST00000043074 574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.89□□□□□ -0.67
PrkcaP20444 Ccdc169-202ENSMUST00000061099 887 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.89□□□□□ -0.67
PrkcaP20444 Olfr223-201ENSMUST00000061293 1111 ntAPPRIS P1 BASIC10.89□□□□□ -0.67
PrkcaP20444 Coro6-203ENSMUST00000079770 1298 ntTSL 1 (best) BASIC10.89□□□□□ -0.67
PrkcaP20444 Gm26232-201ENSMUST00000083360 166 ntBASIC10.89□□□□□ -0.67
PrkcaP20444 Rnu1b6-201ENSMUST00000083839 166 ntBASIC10.89□□□□□ -0.67
PrkcaP20444 Olfr1428-201ENSMUST00000087824 945 ntAPPRIS P1 BASIC10.89□□□□□ -0.67
PrkcaP20444 Rnf123-218ENSMUST00000178267 4309 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC10.89□□□□□ -0.67
PrkcaP20444 Nynrin-201ENSMUST00000100529 6990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.89□□□□□ -0.67
PrkcaP20444 Chtop-201ENSMUST00000001043 3257 ntTSL 1 (best) BASIC10.89□□□□□ -0.67
PrkcaP20444 Gmppb-201ENSMUST00000047947 1429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.89□□□□□ -0.67
PrkcaP20444 Susd5-201ENSMUST00000135338 4083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.89□□□□□ -0.67
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 52 ms