Protein–RNA interactions for Protein: P20263

Pou5f1, POU domain, class 5, transcription factor 1, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 352 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pou5f1P20263 Pcsk7-209ENSMUST00000216672 3599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.02□□□□□ -0.48
Pou5f1P20263 Fads6-201ENSMUST00000056153 4951 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.02□□□□□ -0.48
Pou5f1P20263 AU022754-201ENSMUST00000180441 2976 ntTSL 1 (best) BASIC12.02□□□□□ -0.49
Pou5f1P20263 Cad-211ENSMUST00000202795 6559 ntTSL 1 (best) BASIC12.02□□□□□ -0.49
Pou5f1P20263 Prr29-202ENSMUST00000106816 771 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.02□□□□□ -0.49
Pou5f1P20263 Arvcf-202ENSMUST00000115610 3829 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.02□□□□□ -0.49
Pou5f1P20263 Gm11989-201ENSMUST00000117240 672 ntBASIC12.02□□□□□ -0.49
Pou5f1P20263 Gm15198-201ENSMUST00000117283 177 ntBASIC12.02□□□□□ -0.49
Pou5f1P20263 Gm11362-201ENSMUST00000118838 850 ntBASIC12.02□□□□□ -0.49
Pou5f1P20263 Gm12298-201ENSMUST00000126999 731 ntTSL 1 (best) BASIC12.02□□□□□ -0.49
Pou5f1P20263 Gm13966-201ENSMUST00000148420 832 ntTSL 3 BASIC12.02□□□□□ -0.49
Pou5f1P20263 Gm5070-201ENSMUST00000177599 862 ntBASIC12.02□□□□□ -0.49
Pou5f1P20263 Gm43179-201ENSMUST00000198797 275 ntBASIC12.02□□□□□ -0.49
Pou5f1P20263 Gm7118-201ENSMUST00000200167 1003 ntBASIC12.02□□□□□ -0.49
Pou5f1P20263 Gm44711-201ENSMUST00000205414 1264 ntBASIC12.02□□□□□ -0.49
Pou5f1P20263 Gm45331-201ENSMUST00000209868 554 ntBASIC12.02□□□□□ -0.49
Pou5f1P20263 Caly-204ENSMUST00000211283 975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.02□□□□□ -0.49
Pou5f1P20263 Gm39185-201ENSMUST00000212941 540 ntTSL 5 BASIC12.02□□□□□ -0.49
Pou5f1P20263 Gm46400-201ENSMUST00000222294 724 ntTSL 5 BASIC12.02□□□□□ -0.49
Pou5f1P20263 Mea1-201ENSMUST00000002845 840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.02□□□□□ -0.49
Pou5f1P20263 Pex11b-201ENSMUST00000048766 1122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.02□□□□□ -0.49
Pou5f1P20263 Nemp1-203ENSMUST00000118728 2362 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.02□□□□□ -0.49
Pou5f1P20263 2810407A14Rik-201ENSMUST00000069809 1699 ntTSL 1 (best) BASIC12.02□□□□□ -0.49
Pou5f1P20263 4833422M21Rik-202ENSMUST00000181252 2410 ntTSL 1 (best) BASIC12.02□□□□□ -0.49
Pou5f1P20263 Phka2-203ENSMUST00000112377 3947 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.02□□□□□ -0.49
Pou5f1P20263 Rnf123-218ENSMUST00000178267 4309 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC12.02□□□□□ -0.49
Pou5f1P20263 Vsx2-202ENSMUST00000169934 3249 ntTSL 1 (best) BASIC12.02□□□□□ -0.49
Pou5f1P20263 Usp22-201ENSMUST00000041683 4434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.02□□□□□ -0.49
Pou5f1P20263 Irx3os-203ENSMUST00000133528 1354 ntTSL 5 BASIC12.02□□□□□ -0.49
Pou5f1P20263 1700003D09Rik-201ENSMUST00000141929 1389 ntTSL 1 (best) BASIC12.02□□□□□ -0.49
Pou5f1P20263 Pomgnt1-205ENSMUST00000121052 2693 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.02□□□□□ -0.49
Pou5f1P20263 BC048403-201ENSMUST00000065600 3123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.02□□□□□ -0.49
Pou5f1P20263 Palm-204ENSMUST00000218631 2725 ntTSL 2 BASIC12.02□□□□□ -0.49
Pou5f1P20263 Ascc1-202ENSMUST00000164083 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.02□□□□□ -0.49
Pou5f1P20263 4833422C13Rik-202ENSMUST00000160385 2828 ntTSL 1 (best) BASIC12.01□□□□□ -0.49
Pou5f1P20263 Ocln-201ENSMUST00000022140 2839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.01□□□□□ -0.49
Pou5f1P20263 Rtn3-202ENSMUST00000065304 5030 ntTSL 1 (best) BASIC12.01□□□□□ -0.49
Pou5f1P20263 1110051M20Rik-203ENSMUST00000102594 1977 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.01□□□□□ -0.49
Pou5f1P20263 Tas1r1-201ENSMUST00000030792 2863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.01□□□□□ -0.49
Pou5f1P20263 Mmel1-207ENSMUST00000163732 2935 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.01□□□□□ -0.49
Pou5f1P20263 Rab14-202ENSMUST00000113025 4346 ntTSL 1 (best) BASIC12.01□□□□□ -0.49
Pou5f1P20263 Stau2-214ENSMUST00000162007 2964 ntTSL 1 (best) BASIC12.01□□□□□ -0.49
Pou5f1P20263 Gm44831-201ENSMUST00000208469 2989 ntBASIC12.01□□□□□ -0.49
Pou5f1P20263 Zbtb45-205ENSMUST00000210282 3908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.01□□□□□ -0.49
Pou5f1P20263 Sgce-209ENSMUST00000133306 1619 ntTSL 1 (best) BASIC12.01□□□□□ -0.49
Pou5f1P20263 2010315B03Rik-202ENSMUST00000177714 2623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.01□□□□□ -0.49
Pou5f1P20263 Ndufs4-201ENSMUST00000022286 1698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.01□□□□□ -0.49
Pou5f1P20263 Zfp853-203ENSMUST00000212715 3133 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.01□□□□□ -0.49
Pou5f1P20263 Csnk1g1-202ENSMUST00000117849 5173 ntTSL 1 (best) BASIC12.01□□□□□ -0.49
Pou5f1P20263 AC126444.1-201ENSMUST00000225938 1768 ntBASIC12.01□□□□□ -0.49
Pou5f1P20263 Gm14109-201ENSMUST00000118814 309 ntBASIC12.01□□□□□ -0.49
Pou5f1P20263 Gm44793-201ENSMUST00000136923 582 ntTSL 2 BASIC12.01□□□□□ -0.49
Pou5f1P20263 Gm13381-202ENSMUST00000177012 640 ntTSL 5 BASIC12.01□□□□□ -0.49
Pou5f1P20263 Ccl4-201ENSMUST00000019074 660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.01□□□□□ -0.49
Pou5f1P20263 Gm43758-201ENSMUST00000199500 367 ntBASIC12.01□□□□□ -0.49
Pou5f1P20263 Gm3961-201ENSMUST00000204425 994 ntBASIC12.01□□□□□ -0.49
Pou5f1P20263 Gm39929-201ENSMUST00000209672 693 ntTSL 3 BASIC12.01□□□□□ -0.49
Pou5f1P20263 AC154252.2-201ENSMUST00000223593 767 ntBASIC12.01□□□□□ -0.49
Pou5f1P20263 AC161537.1-201ENSMUST00000226199 1015 ntBASIC12.01□□□□□ -0.49
Pou5f1P20263 Fmr1nb-202ENSMUST00000071848 842 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.01□□□□□ -0.49
Pou5f1P20263 Prkag3-206ENSMUST00000188073 2832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.01□□□□□ -0.49
Pou5f1P20263 Tmc4-201ENSMUST00000038743 2310 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.01□□□□□ -0.49
Pou5f1P20263 Pamr1-201ENSMUST00000028612 2864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.01□□□□□ -0.49
Pou5f1P20263 Nfasc-203ENSMUST00000163770 3903 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.01□□□□□ -0.49
Pou5f1P20263 Cyp27b1-201ENSMUST00000165764 2380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.01□□□□□ -0.49
Pou5f1P20263 Akt1-205ENSMUST00000128300 1342 ntTSL 5 BASIC12.01□□□□□ -0.49
Pou5f1P20263 D930032P07Rik-201ENSMUST00000181393 1314 ntTSL 1 (best) BASIC12.01□□□□□ -0.49
Pou5f1P20263 Gm9866-202ENSMUST00000182473 1882 ntTSL 1 (best) BASIC12.01□□□□□ -0.49
Pou5f1P20263 Suox-201ENSMUST00000054764 2497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.01□□□□□ -0.49
Pou5f1P20263 Fam84a-201ENSMUST00000020926 4164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.01□□□□□ -0.49
Pou5f1P20263 Elp5-201ENSMUST00000108594 1454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.01□□□□□ -0.49
Pou5f1P20263 Izumo1-201ENSMUST00000033100 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.01□□□□□ -0.49
Pou5f1P20263 Ndrg2-201ENSMUST00000004673 2099 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.01□□□□□ -0.49
Pou5f1P20263 Gm28578-201ENSMUST00000187727 2698 ntTSL 1 (best) BASIC12.01□□□□□ -0.49
Pou5f1P20263 Tacc2-201ENSMUST00000033141 3940 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.01□□□□□ -0.49
Pou5f1P20263 Zfp957-202ENSMUST00000161649 2751 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.01□□□□□ -0.49
Pou5f1P20263 Mfsd4b5-205ENSMUST00000170579 1554 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.01□□□□□ -0.49
Pou5f1P20263 Gm5936-201ENSMUST00000114116 2857 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC12.01□□□□□ -0.49
Pou5f1P20263 Gm5640-201ENSMUST00000114119 2861 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC12.01□□□□□ -0.49
Pou5f1P20263 DXBay18-201ENSMUST00000080324 2862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.01□□□□□ -0.49
Pou5f1P20263 Gm14685-201ENSMUST00000088459 2864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.01□□□□□ -0.49
Pou5f1P20263 Setx-201ENSMUST00000061578 10970 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12□□□□□ -0.49
Pou5f1P20263 Ank3-205ENSMUST00000092433 5072 ntTSL 1 (best) BASIC12□□□□□ -0.49
Pou5f1P20263 Igfbp4-201ENSMUST00000017637 3831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12□□□□□ -0.49
Pou5f1P20263 Rgr-203ENSMUST00000225070 4704 ntBASIC12□□□□□ -0.49
Pou5f1P20263 Tsku-202ENSMUST00000164726 2620 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12□□□□□ -0.49
Pou5f1P20263 Hnrnpr-201ENSMUST00000084219 2647 ntTSL 1 (best) BASIC12□□□□□ -0.49
Pou5f1P20263 Dixdc1-204ENSMUST00000118707 989 ntTSL 1 (best) BASIC12□□□□□ -0.49
Pou5f1P20263 Gm15906-201ENSMUST00000124746 323 ntTSL 5 BASIC12□□□□□ -0.49
Pou5f1P20263 Gm14597-202ENSMUST00000129769 715 ntAPPRIS P5 TSL 3 BASIC12□□□□□ -0.49
Pou5f1P20263 Gm9230-201ENSMUST00000188228 532 ntBASIC12□□□□□ -0.49
Pou5f1P20263 2810405F17Rik-201ENSMUST00000189334 1117 ntBASIC12□□□□□ -0.49
Pou5f1P20263 Fxr1-204ENSMUST00000197694 2129 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12□□□□□ -0.49
Pou5f1P20263 Gm19994-201ENSMUST00000217086 586 ntBASIC12□□□□□ -0.49
Pou5f1P20263 Gm18615-201ENSMUST00000222919 1031 ntBASIC12□□□□□ -0.49
Pou5f1P20263 Scgb3a2-201ENSMUST00000043803 842 ntTSL 1 (best) BASIC12□□□□□ -0.49
Pou5f1P20263 Kalrn-207ENSMUST00000114960 6452 ntTSL 1 (best) BASIC12□□□□□ -0.49
Pou5f1P20263 Zdhhc20-205ENSMUST00000226057 2179 ntAPPRIS ALT2 BASIC12□□□□□ -0.49
Pou5f1P20263 Xrra1-202ENSMUST00000207855 1334 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12□□□□□ -0.49
Pou5f1P20263 Ankrd31-203ENSMUST00000208758 5859 ntTSL 5 BASIC12□□□□□ -0.49
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 76.7 ms