Protein–RNA interactions for Protein: P20040

H-2 class II histocompatibility antigen, E-Q beta chain, mousemouse

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Length 264 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
P20040 Nrros-202ENSMUST00000115163 3559 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
P20040 Grhl1-202ENSMUST00000085553 3469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
P20040 Lsp1-205ENSMUST00000105968 1727 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
P20040 Gpr19-203ENSMUST00000111932 1711 ntTSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
P20040 Gm29609-201ENSMUST00000101411 3223 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.65□□□□□ -0.7
P20040 Zfp810-201ENSMUST00000086278 3238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
P20040 Tanc1-201ENSMUST00000037526 7873 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC10.65□□□□□ -0.7
P20040 Gm13350-201ENSMUST00000120519 479 ntBASIC10.65□□□□□ -0.7
P20040 Prkaca-ps1-201ENSMUST00000120823 919 ntBASIC10.65□□□□□ -0.7
P20040 C130026I21Rik-205ENSMUST00000161267 652 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC10.65□□□□□ -0.7
P20040 Crb3-205ENSMUST00000169543 778 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC10.65□□□□□ -0.7
P20040 Gm26973-201ENSMUST00000182105 696 ntTSL 3 BASIC10.65□□□□□ -0.7
P20040 Gm27023-201ENSMUST00000182372 285 ntBASIC10.65□□□□□ -0.7
P20040 Gm7895-201ENSMUST00000187459 1173 ntBASIC10.65□□□□□ -0.7
P20040 Gm8176-201ENSMUST00000191297 1099 ntBASIC10.65□□□□□ -0.7
P20040 Gm42838-201ENSMUST00000196503 439 ntTSL 5 BASIC10.65□□□□□ -0.7
P20040 CT025533.2-201ENSMUST00000228715 1248 ntBASIC10.65□□□□□ -0.7
P20040 Gm3402-201ENSMUST00000036715 981 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.65□□□□□ -0.7
P20040 Ctrc-201ENSMUST00000037059 951 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.65□□□□□ -0.7
P20040 Il25-201ENSMUST00000037863 1064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
P20040 Ggact-201ENSMUST00000038075 1076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
P20040 Polr2e-201ENSMUST00000004786 1148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
P20040 Trpt1-201ENSMUST00000088223 1142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
P20040 Igsf9-202ENSMUST00000111235 4205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
P20040 Tnfaip3-201ENSMUST00000019997 4422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
P20040 Rbms1-201ENSMUST00000028347 4436 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
P20040 Nrd1-203ENSMUST00000106644 3784 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.65□□□□□ -0.7
P20040 Yars-201ENSMUST00000106054 2909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
P20040 Pla2g4f-201ENSMUST00000054651 3116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
P20040 Mapk4-202ENSMUST00000159162 3514 ntTSL 5 BASIC10.65□□□□□ -0.7
P20040 Upk3b-201ENSMUST00000062606 3530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
P20040 Ttc25-201ENSMUST00000006976 2673 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
P20040 Vmn1r45-206ENSMUST00000227977 3297 ntAPPRIS P1 BASIC10.65□□□□□ -0.7
P20040 Mtf2-201ENSMUST00000081567 4060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
P20040 Gm34370-201ENSMUST00000209385 1410 ntTSL 5 BASIC10.65□□□□□ -0.7
P20040 Gm37737-201ENSMUST00000195013 1638 ntBASIC10.65□□□□□ -0.7
P20040 Gm43823-201ENSMUST00000197391 1808 ntBASIC10.65□□□□□ -0.71
P20040 Ank2-217ENSMUST00000182610 2231 ntTSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.71
P20040 Taf1b-201ENSMUST00000075954 2209 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.71
P20040 Gm26735-201ENSMUST00000180992 2649 ntTSL 5 BASIC10.65□□□□□ -0.71
P20040 Mindy1-202ENSMUST00000107187 2827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.71
P20040 Dcaf8-202ENSMUST00000191689 2754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.71
P20040 Bpi-202ENSMUST00000109499 1778 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.71
P20040 Igsf9-201ENSMUST00000052629 4133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.71
P20040 Coa4-201ENSMUST00000054310 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.71
P20040 Igfbp5-201ENSMUST00000027377 6006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
P20040 Clvs2-204ENSMUST00000161692 4283 ntTSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
P20040 Gusb-201ENSMUST00000026613 2687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
P20040 Wapl-202ENSMUST00000090027 4185 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.64□□□□□ -0.71
P20040 Gm26615-201ENSMUST00000181522 3201 ntTSL 2 BASIC10.64□□□□□ -0.71
P20040 Nmral1-203ENSMUST00000115851 1306 ntTSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
P20040 Nsf-202ENSMUST00000103075 3766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
P20040 Fosb-201ENSMUST00000003640 3782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
P20040 Jmjd8-201ENSMUST00000026832 2091 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
P20040 Slc46a2-201ENSMUST00000030081 2833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
P20040 H2-Ob-202ENSMUST00000167280 1878 ntTSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
P20040 Cd300lf-201ENSMUST00000051264 1864 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
P20040 Accs-202ENSMUST00000068513 1872 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC10.64□□□□□ -0.71
P20040 Lsp1-201ENSMUST00000018963 1695 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
P20040 Foxk1-201ENSMUST00000072837 7439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
P20040 Crkl-201ENSMUST00000006293 3863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
P20040 Oas1f-201ENSMUST00000057814 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
P20040 Prune1-201ENSMUST00000015855 3140 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
P20040 Skp2-203ENSMUST00000190131 1819 ntTSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
P20040 Gm13736-201ENSMUST00000119272 253 ntBASIC10.64□□□□□ -0.71
P20040 Gm16087-201ENSMUST00000124395 964 ntTSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
P20040 Gm7584-201ENSMUST00000175829 940 ntBASIC10.64□□□□□ -0.71
P20040 Gm37201-201ENSMUST00000191845 523 ntBASIC10.64□□□□□ -0.71
P20040 Gm5565-201ENSMUST00000199463 1162 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.64□□□□□ -0.71
P20040 Ube2a-202ENSMUST00000200835 911 ntTSL 5 BASIC10.64□□□□□ -0.71
P20040 Ube2a-209ENSMUST00000202991 715 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
P20040 Txndc17-201ENSMUST00000021158 981 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
P20040 Gm30285-201ENSMUST00000214614 422 ntBASIC10.64□□□□□ -0.71
P20040 Rps12-203ENSMUST00000218107 584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
P20040 Mea1-201ENSMUST00000002845 840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
P20040 Rps3a1-201ENSMUST00000029722 977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
P20040 Olfr1209-201ENSMUST00000099809 933 ntAPPRIS P1 BASIC10.64□□□□□ -0.71
P20040 Ripk3-202ENSMUST00000168716 1964 ntTSL 5 BASIC10.64□□□□□ -0.71
P20040 Prps1-201ENSMUST00000033809 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
P20040 Calu-202ENSMUST00000090481 2670 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
P20040 Cib2-201ENSMUST00000041901 1433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
P20040 Qrich1-202ENSMUST00000112155 3040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
P20040 Mob4-205ENSMUST00000162364 2840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
P20040 Camkv-204ENSMUST00000194206 2827 ntTSL 5 BASIC10.64□□□□□ -0.71
P20040 Grpel1-201ENSMUST00000031099 3528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
P20040 Col6a6-202ENSMUST00000098441 8781 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.64□□□□□ -0.71
P20040 4732414G09Rik-201ENSMUST00000156243 2422 ntTSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
P20040 Ccdc89-201ENSMUST00000061391 2093 ntAPPRIS P1 BASIC10.64□□□□□ -0.71
P20040 0610040F04Rik-201ENSMUST00000137478 1734 ntTSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
P20040 Mmel1-207ENSMUST00000163732 2935 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
P20040 Chchd3-202ENSMUST00000115091 1363 ntTSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
P20040 Dlec1-206ENSMUST00000140326 5815 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.64□□□□□ -0.71
P20040 AC160405.1-201ENSMUST00000218207 1545 ntBASIC10.63□□□□□ -0.71
P20040 Rufy2-203ENSMUST00000122231 2664 ntTSL 5 BASIC10.63□□□□□ -0.71
P20040 Dlk1-201ENSMUST00000056110 4653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
P20040 Adh6a-202ENSMUST00000106247 1341 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
P20040 Myh10-204ENSMUST00000108673 1315 ntTSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
P20040 Plin4-202ENSMUST00000190703 5756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
P20040 Ptprh-202ENSMUST00000166650 3642 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.63□□□□□ -0.71
P20040 Orc5-201ENSMUST00000030872 2103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
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