Protein–RNA interactions for Protein: P19246

Nefh, Neurofilament heavy polypeptide, mousemouse

Predictions only

Length 1,090 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NefhP19246 Fyttd1-201ENSMUST00000023489 4312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.16□□□□□ -0.14
NefhP19246 Cdc42ep2-201ENSMUST00000055458 1491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.16□□□□□ -0.14
NefhP19246 Psd2-201ENSMUST00000115716 4607 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.16□□□□□ -0.14
NefhP19246 Uchl1os-201ENSMUST00000152002 1685 ntTSL 1 (best) BASIC14.16□□□□□ -0.14
NefhP19246 Fnbp1-202ENSMUST00000075326 1761 ntTSL 5 BASIC14.16□□□□□ -0.14
NefhP19246 Polr3e-202ENSMUST00000106483 3001 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.16□□□□□ -0.14
NefhP19246 Lrp2-203ENSMUST00000100051 4359 ntTSL 1 (best) BASIC14.16□□□□□ -0.14
NefhP19246 Pif1-202ENSMUST00000131483 3309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.16□□□□□ -0.14
NefhP19246 Ttc17-202ENSMUST00000094801 3408 ntTSL 5 BASIC14.16□□□□□ -0.14
NefhP19246 Irf1-203ENSMUST00000108922 2092 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.16□□□□□ -0.14
NefhP19246 Cerk-203ENSMUST00000156546 2162 ntTSL 1 (best) BASIC14.16□□□□□ -0.14
NefhP19246 Arhgap25-202ENSMUST00000101197 2493 ntTSL 1 (best) BASIC14.16□□□□□ -0.14
NefhP19246 Gm14123-201ENSMUST00000156345 2658 ntTSL 1 (best) BASIC14.16□□□□□ -0.14
NefhP19246 Mpv17l-201ENSMUST00000023360 3087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.16□□□□□ -0.14
NefhP19246 Rspo3-201ENSMUST00000092623 3085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.16□□□□□ -0.14
NefhP19246 Lrriq1-203ENSMUST00000166240 5232 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.16□□□□□ -0.14
NefhP19246 Cacna1g-210ENSMUST00000107792 7981 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.16□□□□□ -0.14
NefhP19246 Ltbp2-202ENSMUST00000110254 6602 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.15□□□□□ -0.14
NefhP19246 Ctdspl2-201ENSMUST00000036647 5053 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.15□□□□□ -0.14
NefhP19246 Gm3830-201ENSMUST00000185540 1715 ntTSL 1 (best) BASIC14.15□□□□□ -0.14
NefhP19246 Dnmt1-203ENSMUST00000178110 5870 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.15□□□□□ -0.14
NefhP19246 Lnx1-209ENSMUST00000153543 2208 ntTSL 5 BASIC14.15□□□□□ -0.14
NefhP19246 Gm43075-201ENSMUST00000198613 3905 ntBASIC14.15□□□□□ -0.14
NefhP19246 Ly75-202ENSMUST00000112533 6901 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.15□□□□□ -0.14
NefhP19246 Stau2-214ENSMUST00000162007 2964 ntTSL 1 (best) BASIC14.15□□□□□ -0.14
NefhP19246 Zufsp-201ENSMUST00000048222 2991 ntTSL 1 (best) BASIC14.15□□□□□ -0.14
NefhP19246 Ppip5k1-202ENSMUST00000110625 5226 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.15□□□□□ -0.14
NefhP19246 Ttc33-203ENSMUST00000118193 1671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.15□□□□□ -0.14
NefhP19246 Tctn3-203ENSMUST00000135795 1686 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.15□□□□□ -0.14
NefhP19246 Cdk10-212ENSMUST00000213005 1580 ntTSL 1 (best) BASIC14.15□□□□□ -0.14
NefhP19246 Dnajb12-203ENSMUST00000142819 1495 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.15□□□□□ -0.14
NefhP19246 Rgs6-209ENSMUST00000186848 1472 ntTSL 5 BASIC14.15□□□□□ -0.14
NefhP19246 Tonsl-207ENSMUST00000168185 4235 ntTSL 1 (best) BASIC14.15□□□□□ -0.14
NefhP19246 Dab2ip-209ENSMUST00000135741 4128 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.15□□□□□ -0.14
NefhP19246 Ighv1-61-201ENSMUST00000103531 351 ntAPPRIS P1 BASIC14.15□□□□□ -0.14
NefhP19246 Ttc4-202ENSMUST00000106772 935 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.15□□□□□ -0.14
NefhP19246 Gngt2-205ENSMUST00000107711 563 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.15□□□□□ -0.14
NefhP19246 Gm17391-201ENSMUST00000171036 126 ntBASIC14.15□□□□□ -0.14
NefhP19246 U2af1l4-234ENSMUST00000171850 564 ntTSL 5 BASIC14.15□□□□□ -0.14
NefhP19246 Gm21859-201ENSMUST00000178424 1045 ntTSL 1 (best) BASIC14.15□□□□□ -0.14
NefhP19246 Zfp229-206ENSMUST00000183192 653 ntTSL 1 (best) BASIC14.15□□□□□ -0.14
NefhP19246 Stpg4-202ENSMUST00000186211 591 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.15□□□□□ -0.14
NefhP19246 1700030I03Rik-201ENSMUST00000192978 942 ntBASIC14.15□□□□□ -0.14
NefhP19246 Gm43058-201ENSMUST00000197645 625 ntBASIC14.15□□□□□ -0.14
NefhP19246 Gm10069-203ENSMUST00000204081 907 ntTSL 1 (best) BASIC14.15□□□□□ -0.14
NefhP19246 Gm6905-201ENSMUST00000205729 511 ntBASIC14.15□□□□□ -0.14
NefhP19246 Slc39a8-205ENSMUST00000167390 3533 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.15□□□□□ -0.14
NefhP19246 Pdp1-205ENSMUST00000108301 2635 ntTSL 1 (best) BASIC14.15□□□□□ -0.14
NefhP19246 Lins1-202ENSMUST00000077967 2647 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.15□□□□□ -0.14
NefhP19246 Fyttd1-211ENSMUST00000171325 4295 ntTSL 1 (best) BASIC14.15□□□□□ -0.14
NefhP19246 Gm31518-201ENSMUST00000211925 2548 ntTSL 5 BASIC14.15□□□□□ -0.14
NefhP19246 Dmbt1-206ENSMUST00000213064 5779 ntTSL 5 BASIC14.15□□□□□ -0.14
NefhP19246 Cbln3-201ENSMUST00000063871 4866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.15□□□□□ -0.14
NefhP19246 Grik3-201ENSMUST00000030676 8973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.15□□□□□ -0.14
NefhP19246 Specc1-213ENSMUST00000202179 6676 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.15□□□□□ -0.14
NefhP19246 Nrf1-219ENSMUST00000167972 1541 ntTSL 5 BASIC14.15□□□□□ -0.14
NefhP19246 Wfdc8-201ENSMUST00000094351 1530 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.15□□□□□ -0.14
NefhP19246 Erich5-201ENSMUST00000060894 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.15□□□□□ -0.14
NefhP19246 Cers6-201ENSMUST00000028426 7038 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.15□□□□□ -0.14
NefhP19246 Cngb1-203ENSMUST00000120044 3243 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.15□□□□□ -0.14
NefhP19246 Zyg11a-201ENSMUST00000043793 2289 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.15□□□□□ -0.14
NefhP19246 Adh4-201ENSMUST00000013458 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.15□□□□□ -0.15
NefhP19246 Gm27177-202ENSMUST00000183514 2703 ntBASIC14.14□□□□□ -0.15
NefhP19246 Gm9866-202ENSMUST00000182473 1882 ntTSL 1 (best) BASIC14.14□□□□□ -0.15
NefhP19246 Mfsd13b-201ENSMUST00000033166 1883 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.14□□□□□ -0.15
NefhP19246 Tcea1-201ENSMUST00000081551 2547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.14□□□□□ -0.15
NefhP19246 Nox3-201ENSMUST00000115800 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.14□□□□□ -0.15
NefhP19246 Speg-201ENSMUST00000087122 10801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.14□□□□□ -0.15
NefhP19246 Daw1-201ENSMUST00000065403 1651 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.14□□□□□ -0.15
NefhP19246 Dmbt1-201ENSMUST00000084509 6243 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.14□□□□□ -0.15
NefhP19246 5330413P13Rik-204ENSMUST00000210606 1464 ntTSL 5 BASIC14.14□□□□□ -0.15
NefhP19246 Nrsn2-201ENSMUST00000079278 1455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.14□□□□□ -0.15
NefhP19246 Hao1-201ENSMUST00000028704 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.14□□□□□ -0.15
NefhP19246 Lrrc57-203ENSMUST00000102498 1901 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.14□□□□□ -0.15
NefhP19246 Bahcc1-202ENSMUST00000118987 10712 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.14□□□□□ -0.15
NefhP19246 Klk1b16-201ENSMUST00000005933 1387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.14□□□□□ -0.15
NefhP19246 St6galnac4-204ENSMUST00000179989 2826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.14□□□□□ -0.15
NefhP19246 Urad-201ENSMUST00000100433 766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.14□□□□□ -0.15
NefhP19246 Gm14190-201ENSMUST00000105073 153 ntAPPRIS P1 BASIC14.14□□□□□ -0.15
NefhP19246 Hmgcll1-202ENSMUST00000117981 1189 ntTSL 5 BASIC14.14□□□□□ -0.15
NefhP19246 Trmt112-204ENSMUST00000174786 646 ntTSL 1 (best) BASIC14.14□□□□□ -0.15
NefhP19246 Gm43184-201ENSMUST00000197247 542 ntBASIC14.14□□□□□ -0.15
NefhP19246 AC134869.3-201ENSMUST00000225581 343 ntAPPRIS P1 BASIC14.14□□□□□ -0.15
NefhP19246 Gm5455-201ENSMUST00000058710 715 ntBASIC14.14□□□□□ -0.15
NefhP19246 Gm26448-201ENSMUST00000082446 203 ntBASIC14.14□□□□□ -0.15
NefhP19246 Spaca4-201ENSMUST00000094424 707 ntAPPRIS P1 BASIC14.14□□□□□ -0.15
NefhP19246 Serpinb12-202ENSMUST00000112724 1623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.14□□□□□ -0.15
NefhP19246 Dusp19-201ENSMUST00000028384 1632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.14□□□□□ -0.15
NefhP19246 Mtmr10-201ENSMUST00000032736 5205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.14□□□□□ -0.15
NefhP19246 Atxn10-201ENSMUST00000163242 2425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.14□□□□□ -0.15
NefhP19246 Slc25a45-206ENSMUST00000155697 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.14□□□□□ -0.15
NefhP19246 Cyp4x1-201ENSMUST00000051400 1524 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.14□□□□□ -0.15
NefhP19246 Slc25a40-201ENSMUST00000066921 2784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.14□□□□□ -0.15
NefhP19246 Fam227a-202ENSMUST00000109646 1896 ntTSL 5 BASIC14.14□□□□□ -0.15
NefhP19246 Retreg1-206ENSMUST00000228306 1430 ntBASIC14.14□□□□□ -0.15
NefhP19246 Pmp2-201ENSMUST00000029034 1408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.14□□□□□ -0.15
NefhP19246 Susd3-201ENSMUST00000021816 1317 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.14□□□□□ -0.15
NefhP19246 Nr1i3-202ENSMUST00000075469 1305 ntTSL 1 (best) BASIC14.14□□□□□ -0.15
NefhP19246 Dgkg-201ENSMUST00000023578 2725 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.14□□□□□ -0.15
NefhP19246 Pex2-206ENSMUST00000195855 1587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.13□□□□□ -0.15
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