Protein–RNA interactions for Protein: P19123

Tnnc1, Troponin C, slow skeletal and cardiac muscles, mousemouse

Predictions only

Length 161 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tnnc1P19123 Gm12199-201ENSMUST00000137567 517 ntTSL 3 BASIC13.08□□□□□ -0.32
Tnnc1P19123 Gm15738-202ENSMUST00000140892 427 ntTSL 2 BASIC13.08□□□□□ -0.32
Tnnc1P19123 Gm6963-201ENSMUST00000147879 379 ntBASIC13.08□□□□□ -0.32
Tnnc1P19123 Rpl36-ps4-201ENSMUST00000179601 354 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.08□□□□□ -0.32
Tnnc1P19123 Gm4819-201ENSMUST00000182170 1009 ntBASIC13.08□□□□□ -0.32
Tnnc1P19123 Gm9230-201ENSMUST00000188228 532 ntBASIC13.08□□□□□ -0.32
Tnnc1P19123 AC125206.1-201ENSMUST00000214070 739 ntTSL 5 BASIC13.08□□□□□ -0.32
Tnnc1P19123 9230110C19Rik-202ENSMUST00000215478 533 ntTSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
Tnnc1P19123 Trappc4-206ENSMUST00000217163 1185 ntTSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
Tnnc1P19123 Gm46400-201ENSMUST00000222294 724 ntTSL 5 BASIC13.08□□□□□ -0.32
Tnnc1P19123 AC123665.1-201ENSMUST00000228204 438 ntBASIC13.08□□□□□ -0.32
Tnnc1P19123 Ehd3-201ENSMUST00000024860 3658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
Tnnc1P19123 Jak3-203ENSMUST00000110013 4009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
Tnnc1P19123 Jak3-201ENSMUST00000051995 4019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
Tnnc1P19123 Slc25a45-206ENSMUST00000155697 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
Tnnc1P19123 Slc25a22-203ENSMUST00000106007 2546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
Tnnc1P19123 Mfap3l-203ENSMUST00000161421 4142 ntTSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
Tnnc1P19123 Zfp61-208ENSMUST00000165241 1668 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.08□□□□□ -0.32
Tnnc1P19123 Psap-203ENSMUST00000165878 2564 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
Tnnc1P19123 Rps6ka6-203ENSMUST00000096348 4151 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.08□□□□□ -0.32
Tnnc1P19123 Wdr59-202ENSMUST00000038193 5083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
Tnnc1P19123 Plcxd3-201ENSMUST00000061925 1851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
Tnnc1P19123 Ebf2-202ENSMUST00000176029 2784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
Tnnc1P19123 Arhgap31-201ENSMUST00000023487 7964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
Tnnc1P19123 AC160405.1-201ENSMUST00000218207 1545 ntBASIC13.08□□□□□ -0.32
Tnnc1P19123 Ppm1l-201ENSMUST00000029355 9417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
Tnnc1P19123 Umod-201ENSMUST00000033263 2625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
Tnnc1P19123 Nxph1-202ENSMUST00000160300 2815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
Tnnc1P19123 Dis3l-208ENSMUST00000168844 3575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
Tnnc1P19123 Ccdc151-202ENSMUST00000115336 2103 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
Tnnc1P19123 Cdc25a-204ENSMUST00000198308 2880 ntTSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
Tnnc1P19123 Igsf3-201ENSMUST00000043983 7371 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
Tnnc1P19123 Aebp2-206ENSMUST00000161335 2524 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
Tnnc1P19123 Gm45902-202ENSMUST00000140494 2390 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.07□□□□□ -0.32
Tnnc1P19123 Pmp2-201ENSMUST00000029034 1408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
Tnnc1P19123 Cdc14a-201ENSMUST00000090464 4485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
Tnnc1P19123 Wdr33-201ENSMUST00000025264 6206 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.07□□□□□ -0.32
Tnnc1P19123 AC160411.1-201ENSMUST00000218544 4560 ntTSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
Tnnc1P19123 Rtn4-202ENSMUST00000078830 3615 ntTSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
Tnnc1P19123 Dnajc25-204ENSMUST00000152199 1141 ntTSL 5 BASIC13.07□□□□□ -0.32
Tnnc1P19123 Gas5-210ENSMUST00000159706 557 ntTSL 2 BASIC13.07□□□□□ -0.32
Tnnc1P19123 Gm17040-201ENSMUST00000168672 548 ntTSL 3 BASIC13.07□□□□□ -0.32
Tnnc1P19123 Rps13-201ENSMUST00000170953 589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
Tnnc1P19123 Rprl1-202ENSMUST00000198476 238 ntBASIC13.07□□□□□ -0.32
Tnnc1P19123 1700011D18Rik-201ENSMUST00000205762 277 ntBASIC13.07□□□□□ -0.32
Tnnc1P19123 Gm19187-201ENSMUST00000206781 892 ntBASIC13.07□□□□□ -0.32
Tnnc1P19123 Caly-204ENSMUST00000211283 975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
Tnnc1P19123 Fam96a-201ENSMUST00000034945 1240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
Tnnc1P19123 Klk1b27-201ENSMUST00000079859 889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
Tnnc1P19123 Cd79a-201ENSMUST00000003469 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
Tnnc1P19123 Gm10851-201ENSMUST00000192087 1685 ntTSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
Tnnc1P19123 Syt7-202ENSMUST00000076968 6624 ntTSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
Tnnc1P19123 Nme8-202ENSMUST00000091763 2122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
Tnnc1P19123 Tiparp-201ENSMUST00000047906 4191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
Tnnc1P19123 Tmem19-206ENSMUST00000218731 1346 ntTSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
Tnnc1P19123 Sec14l4-201ENSMUST00000019512 2956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
Tnnc1P19123 9430038I01Rik-203ENSMUST00000120340 4643 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
Tnnc1P19123 Cnpy2-202ENSMUST00000219037 1383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
Tnnc1P19123 Amz2-203ENSMUST00000103061 1832 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Tnnc1P19123 Npnt-203ENSMUST00000093971 1830 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Tnnc1P19123 Ecd-201ENSMUST00000022344 3132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Tnnc1P19123 Plrg1-202ENSMUST00000122128 1608 ntTSL 5 BASIC13.06□□□□□ -0.32
Tnnc1P19123 Fam227a-204ENSMUST00000187519 2283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Tnnc1P19123 Adamts10-201ENSMUST00000087623 4043 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.06□□□□□ -0.32
Tnnc1P19123 Irak2-201ENSMUST00000059286 3196 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Tnnc1P19123 Prr3-203ENSMUST00000172429 1878 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Tnnc1P19123 Camsap3-205ENSMUST00000207432 3865 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Tnnc1P19123 Padi6-201ENSMUST00000038749 2333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Tnnc1P19123 Styxl1-208ENSMUST00000178515 1651 ntTSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Tnnc1P19123 Ttc7-202ENSMUST00000125875 3917 ntTSL 2 BASIC13.06□□□□□ -0.32
Tnnc1P19123 Eif5-212ENSMUST00000222375 3547 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Tnnc1P19123 Lrp8-203ENSMUST00000106732 2648 ntTSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Tnnc1P19123 Cela2a-201ENSMUST00000102481 1070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Tnnc1P19123 Ccdc28b-202ENSMUST00000106035 821 ntTSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Tnnc1P19123 Pax5-204ENSMUST00000107826 1228 ntTSL 5 BASIC13.06□□□□□ -0.32
Tnnc1P19123 Gm14644-201ENSMUST00000116671 647 ntBASIC13.06□□□□□ -0.32
Tnnc1P19123 Dixdc1-204ENSMUST00000118707 989 ntTSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Tnnc1P19123 E130006D01Rik-203ENSMUST00000137398 906 ntTSL 2 BASIC13.06□□□□□ -0.32
Tnnc1P19123 Gm15979-201ENSMUST00000149741 590 ntTSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Tnnc1P19123 1700121N20Rik-201ENSMUST00000167922 1027 ntTSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Tnnc1P19123 Magohb-205ENSMUST00000173837 897 ntTSL 5 BASIC13.06□□□□□ -0.32
Tnnc1P19123 Gm4034-201ENSMUST00000187674 480 ntBASIC13.06□□□□□ -0.32
Tnnc1P19123 Gm4857-201ENSMUST00000192718 785 ntBASIC13.06□□□□□ -0.32
Tnnc1P19123 Rassf4-202ENSMUST00000203029 1243 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Tnnc1P19123 Gm45598-202ENSMUST00000210719 986 ntBASIC13.06□□□□□ -0.32
Tnnc1P19123 Rassf5-205ENSMUST00000212202 958 ntTSL 5 BASIC13.06□□□□□ -0.32
Tnnc1P19123 Gm31224-201ENSMUST00000212682 513 ntTSL 3 BASIC13.06□□□□□ -0.32
Tnnc1P19123 Gm19994-201ENSMUST00000217086 586 ntBASIC13.06□□□□□ -0.32
Tnnc1P19123 AC158523.3-201ENSMUST00000220664 864 ntTSL 5 BASIC13.06□□□□□ -0.32
Tnnc1P19123 Olfr117-201ENSMUST00000073636 954 ntAPPRIS P1 BASIC13.06□□□□□ -0.32
Tnnc1P19123 Ppp1r2-ps3-201ENSMUST00000078012 627 ntBASIC13.06□□□□□ -0.32
Tnnc1P19123 Olfr130-201ENSMUST00000087129 954 ntAPPRIS P1 BASIC13.06□□□□□ -0.32
Tnnc1P19123 Rgs3-205ENSMUST00000107424 4084 ntTSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Tnnc1P19123 Sppl2b-211ENSMUST00000220091 3629 ntTSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Tnnc1P19123 Hk2-201ENSMUST00000000642 5513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Tnnc1P19123 Cntnap4-201ENSMUST00000034225 4848 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Tnnc1P19123 Hmg20a-204ENSMUST00000214869 1782 ntTSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Tnnc1P19123 Tubgcp2-201ENSMUST00000026547 2960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Tnnc1P19123 Sfxn3-201ENSMUST00000062213 2966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Tnnc1P19123 Slc6a16-201ENSMUST00000179310 2007 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.06□□□□□ -0.32
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 30.8 ms