Protein–RNA interactions for Protein: P18528

Ig heavy chain V region 6.96, mousemouse

Predictions only

Length 98 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
P18528 Aif1-206ENSMUST00000173324 875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.55□□□□□ -0.88
P18528 Gm26515-201ENSMUST00000181141 996 ntTSL 1 (best) BASIC9.55□□□□□ -0.88
P18528 1700029B24Rik-201ENSMUST00000194040 497 ntBASIC9.55□□□□□ -0.88
P18528 Gm42920-201ENSMUST00000196616 409 ntTSL 3 BASIC9.55□□□□□ -0.88
P18528 1700018A23Rik-201ENSMUST00000201350 398 ntTSL 1 (best) BASIC9.55□□□□□ -0.88
P18528 Gm5904-201ENSMUST00000210286 865 ntBASIC9.55□□□□□ -0.88
P18528 Mt3-203ENSMUST00000211930 477 ntTSL 2 BASIC9.55□□□□□ -0.88
P18528 Isca2-201ENSMUST00000021667 883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.55□□□□□ -0.88
P18528 Degs2-201ENSMUST00000021691 1287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.55□□□□□ -0.88
P18528 Bpifa1-201ENSMUST00000028985 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.55□□□□□ -0.88
P18528 Cdk19os-201ENSMUST00000044774 534 ntTSL 5 BASIC9.55□□□□□ -0.88
P18528 Gm10254-201ENSMUST00000052888 867 ntBASIC9.55□□□□□ -0.88
P18528 Alkbh6-201ENSMUST00000060834 982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.55□□□□□ -0.88
P18528 Camkmt-201ENSMUST00000095188 972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.55□□□□□ -0.88
P18528 Gm10570-201ENSMUST00000097865 513 ntAPPRIS P1 BASIC9.55□□□□□ -0.88
P18528 Nmrk1-203ENSMUST00000159572 1706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.55□□□□□ -0.88
P18528 Vrk1-201ENSMUST00000021539 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.55□□□□□ -0.88
P18528 Pitpnm2-201ENSMUST00000086123 6620 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.55□□□□□ -0.88
P18528 Fyb2-202ENSMUST00000106804 3068 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.55□□□□□ -0.88
P18528 Ift22-205ENSMUST00000200157 3071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.55□□□□□ -0.88
P18528 Plpbp-205ENSMUST00000209856 3954 ntTSL 1 (best) BASIC9.55□□□□□ -0.88
P18528 4930581F22Rik-201ENSMUST00000093873 2402 ntTSL 1 (best) BASIC9.55□□□□□ -0.88
P18528 Wfdc8-201ENSMUST00000094351 1530 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.55□□□□□ -0.88
P18528 Mybpc3-202ENSMUST00000137942 4134 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.55□□□□□ -0.88
P18528 Atp6v1d-201ENSMUST00000021536 3667 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.55□□□□□ -0.88
P18528 Trpv1-203ENSMUST00000108470 2667 ntTSL 5 BASIC9.55□□□□□ -0.88
P18528 Fetub-203ENSMUST00000167399 1421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.55□□□□□ -0.88
P18528 Rai2-201ENSMUST00000061514 2204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.55□□□□□ -0.88
P18528 Camsap3-209ENSMUST00000207970 3817 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.55□□□□□ -0.88
P18528 Cul9-204ENSMUST00000182485 7848 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC9.55□□□□□ -0.88
P18528 Pacsin1-201ENSMUST00000045896 4190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.55□□□□□ -0.88
P18528 Ttll10-206ENSMUST00000184348 2556 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.55□□□□□ -0.88
P18528 Gm11696-203ENSMUST00000188296 1793 ntTSL 3 BASIC9.55□□□□□ -0.88
P18528 Pigk-201ENSMUST00000045029 1761 ntTSL 1 (best) BASIC9.55□□□□□ -0.88
P18528 Myo16-203ENSMUST00000207477 7169 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.55□□□□□ -0.88
P18528 Gm44415-201ENSMUST00000204151 2112 ntBASIC9.55□□□□□ -0.88
P18528 Wdr36-201ENSMUST00000053663 3281 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC9.55□□□□□ -0.88
P18528 Rxfp2-206ENSMUST00000201612 2470 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.55□□□□□ -0.88
P18528 Srsf6-203ENSMUST00000130411 3527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.55□□□□□ -0.88
P18528 Cyp26b1-202ENSMUST00000168003 4170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.54□□□□□ -0.88
P18528 Cyp26b1-201ENSMUST00000077705 4157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.54□□□□□ -0.88
P18528 Ccdc15-206ENSMUST00000217238 1747 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.54□□□□□ -0.88
P18528 Ticam2-201ENSMUST00000070084 2340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.54□□□□□ -0.88
P18528 Uprt-201ENSMUST00000087867 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.54□□□□□ -0.88
P18528 Gm12992-201ENSMUST00000124738 4493 ntTSL 5 BASIC9.54□□□□□ -0.88
P18528 Gm35040-201ENSMUST00000206829 5094 ntTSL 2 BASIC9.54□□□□□ -0.88
P18528 Slc2a10-201ENSMUST00000029196 3544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.54□□□□□ -0.88
P18528 Zeb2-201ENSMUST00000028229 5335 ntTSL 1 (best) BASIC9.54□□□□□ -0.88
P18528 AC159195.3-201ENSMUST00000225162 2211 ntBASIC9.54□□□□□ -0.88
P18528 Kdm5b-201ENSMUST00000047714 8714 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.54□□□□□ -0.88
P18528 Tmc7-201ENSMUST00000044195 4546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.54□□□□□ -0.88
P18528 Fli1-201ENSMUST00000016231 3318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.54□□□□□ -0.88
P18528 Vmn1r45-201ENSMUST00000054202 3341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.54□□□□□ -0.88
P18528 Gm15920-201ENSMUST00000118998 402 ntBASIC9.54□□□□□ -0.88
P18528 Mia-202ENSMUST00000121848 572 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.54□□□□□ -0.88
P18528 Gm13205-201ENSMUST00000123548 562 ntTSL 3 BASIC9.54□□□□□ -0.88
P18528 Sumo3-204ENSMUST00000129492 487 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC9.54□□□□□ -0.88
P18528 Gm13966-201ENSMUST00000148420 832 ntTSL 3 BASIC9.54□□□□□ -0.88
P18528 Oprm1-229ENSMUST00000152674 1179 ntTSL 3 BASIC9.54□□□□□ -0.88
P18528 Rprl1-201ENSMUST00000158050 327 ntBASIC9.54□□□□□ -0.88
P18528 Ift27-201ENSMUST00000016781 1012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.54□□□□□ -0.88
P18528 1700121N20Rik-201ENSMUST00000167922 1027 ntTSL 1 (best) BASIC9.54□□□□□ -0.88
P18528 Gm8738-201ENSMUST00000172606 329 ntBASIC9.54□□□□□ -0.88
P18528 Gm6244-201ENSMUST00000178732 841 ntBASIC9.54□□□□□ -0.88
P18528 2700012I20Rik-201ENSMUST00000180525 684 ntTSL 1 (best) BASIC9.54□□□□□ -0.88
P18528 Gm26778-201ENSMUST00000181443 3805 ntTSL 5 BASIC9.54□□□□□ -0.88
P18528 Gm26927-201ENSMUST00000182385 965 ntBASIC9.54□□□□□ -0.88
P18528 1810026B05Rik-205ENSMUST00000184855 409 ntTSL 3 BASIC9.54□□□□□ -0.88
P18528 Gm18711-201ENSMUST00000199341 750 ntBASIC9.54□□□□□ -0.88
P18528 Mcee-203ENSMUST00000206194 532 ntTSL 2 BASIC9.54□□□□□ -0.88
P18528 Gm45384-201ENSMUST00000210451 277 ntBASIC9.54□□□□□ -0.88
P18528 Cartpt-201ENSMUST00000022150 827 ntTSL 1 (best) BASIC9.54□□□□□ -0.88
P18528 Cartpt-202ENSMUST00000224142 1238 ntAPPRIS P1 BASIC9.54□□□□□ -0.88
P18528 Ier3-201ENSMUST00000003635 1131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.54□□□□□ -0.88
P18528 Kcnk9-201ENSMUST00000044624 1209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.54□□□□□ -0.88
P18528 Olfr1368-201ENSMUST00000055298 1064 ntAPPRIS P1 BASIC9.54□□□□□ -0.88
P18528 Olfr373-201ENSMUST00000074540 945 ntAPPRIS P1 BASIC9.54□□□□□ -0.88
P18528 Lrrfip2-213ENSMUST00000216430 1525 ntTSL 5 BASIC9.54□□□□□ -0.88
P18528 Brd2-202ENSMUST00000095347 2617 ntTSL 5 BASIC9.54□□□□□ -0.88
P18528 Dll4-201ENSMUST00000102517 3747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.54□□□□□ -0.88
P18528 D130043K22Rik-201ENSMUST00000006893 4973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.54□□□□□ -0.88
P18528 Cyb5r3-202ENSMUST00000162178 2547 ntTSL 1 (best) BASIC9.54□□□□□ -0.88
P18528 Exoc3l4-201ENSMUST00000072646 2778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.54□□□□□ -0.88
P18528 Ubap2l-201ENSMUST00000029553 3509 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.54□□□□□ -0.88
P18528 Pck1-201ENSMUST00000029017 2661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.54□□□□□ -0.88
P18528 Pak6-201ENSMUST00000099557 4411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.54□□□□□ -0.88
P18528 Pip4k2b-201ENSMUST00000018691 5053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.54□□□□□ -0.88
P18528 Slc6a1-201ENSMUST00000032454 4302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.54□□□□□ -0.88
P18528 Plekhg4-203ENSMUST00000160191 3339 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.54□□□□□ -0.88
P18528 Tnip1-201ENSMUST00000018482 2810 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.54□□□□□ -0.88
P18528 Fbxo44-208ENSMUST00000167160 1572 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.54□□□□□ -0.88
P18528 Ncoa6-203ENSMUST00000109670 7101 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC9.54□□□□□ -0.88
P18528 Hsd17b13-202ENSMUST00000112803 1310 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.54□□□□□ -0.88
P18528 Gm7538-201ENSMUST00000200918 1348 ntTSL 1 (best) BASIC9.54□□□□□ -0.88
P18528 Gsg1-201ENSMUST00000087729 1307 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC9.54□□□□□ -0.88
P18528 Pfas-201ENSMUST00000021282 6373 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.54□□□□□ -0.88
P18528 Anxa6-201ENSMUST00000102727 2471 ntTSL 1 (best) BASIC9.54□□□□□ -0.88
P18528 4732491K20Rik-201ENSMUST00000181774 3142 ntTSL 1 (best) BASIC9.53□□□□□ -0.88
P18528 Srebf1-201ENSMUST00000020846 4299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.53□□□□□ -0.88
P18528 Mrrf-201ENSMUST00000028250 2623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.53□□□□□ -0.88
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 53.1 ms