Protein–RNA interactions for Protein: P18524

Ig heavy chain V region RF, mousemouse

Predictions only

Length 117 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
P18524 Vsx2-202ENSMUST00000169934 3249 ntTSL 1 (best) BASIC10.74□□□□□ -0.69
P18524 Iqsec3-203ENSMUST00000151397 8067 ntTSL 2 BASIC10.74□□□□□ -0.69
P18524 Rgs11-201ENSMUST00000025020 2006 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC10.74□□□□□ -0.69
P18524 Gripap1-202ENSMUST00000101694 2867 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.74□□□□□ -0.69
P18524 Sik2-205ENSMUST00000176663 4107 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.74□□□□□ -0.69
P18524 Hoxc5-201ENSMUST00000001709 2923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.74□□□□□ -0.69
P18524 Ighv5-4-201ENSMUST00000103444 425 ntAPPRIS P1 BASIC10.74□□□□□ -0.69
P18524 Tnnt3-211ENSMUST00000105949 955 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.74□□□□□ -0.69
P18524 Rpl35a-204ENSMUST00000115078 500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.74□□□□□ -0.69
P18524 Rbm3-202ENSMUST00000115615 1183 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.74□□□□□ -0.69
P18524 Rbm3-203ENSMUST00000115616 1225 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.74□□□□□ -0.69
P18524 Dmrtc1a-202ENSMUST00000119624 1149 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.74□□□□□ -0.69
P18524 Gm12749-201ENSMUST00000122138 1159 ntBASIC10.74□□□□□ -0.69
P18524 Sumo3-203ENSMUST00000124024 776 ntTSL 2 BASIC10.74□□□□□ -0.69
P18524 Gm5616-201ENSMUST00000165252 384 ntBASIC10.74□□□□□ -0.69
P18524 S100a14-202ENSMUST00000167598 1059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.74□□□□□ -0.69
P18524 Gm8741-201ENSMUST00000174736 384 ntBASIC10.74□□□□□ -0.69
P18524 Rhoc-204ENSMUST00000176347 583 ntTSL 5 BASIC10.74□□□□□ -0.69
P18524 Adtrp-204ENSMUST00000179758 1046 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.74□□□□□ -0.69
P18524 Pfn1-201ENSMUST00000018437 861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.74□□□□□ -0.69
P18524 Gm11523-203ENSMUST00000184482 802 ntTSL 3 BASIC10.74□□□□□ -0.69
P18524 Gm12057-202ENSMUST00000189990 882 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.74□□□□□ -0.69
P18524 Gm38000-201ENSMUST00000192390 1215 ntBASIC10.74□□□□□ -0.69
P18524 Gm19287-201ENSMUST00000203190 358 ntBASIC10.74□□□□□ -0.69
P18524 1700011D18Rik-201ENSMUST00000205762 277 ntBASIC10.74□□□□□ -0.69
P18524 Acsm5-207ENSMUST00000207813 1084 ntTSL 1 (best) BASIC10.74□□□□□ -0.69
P18524 Tmem205-203ENSMUST00000213698 705 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC10.74□□□□□ -0.69
P18524 Prg2-201ENSMUST00000028467 838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.74□□□□□ -0.69
P18524 Olfr398-201ENSMUST00000053874 945 ntAPPRIS P1 BASIC10.74□□□□□ -0.69
P18524 Adm2-201ENSMUST00000066991 1043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.74□□□□□ -0.69
P18524 Rps15-202ENSMUST00000068408 500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.74□□□□□ -0.69
P18524 Olfr156-202ENSMUST00000079465 1099 ntAPPRIS P1 BASIC10.74□□□□□ -0.69
P18524 Olfr1209-201ENSMUST00000099809 933 ntAPPRIS P1 BASIC10.74□□□□□ -0.69
P18524 Crry-ps-201ENSMUST00000079090 1309 ntBASIC10.74□□□□□ -0.69
P18524 4931406C07Rik-202ENSMUST00000178977 2650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.74□□□□□ -0.69
P18524 Jak3-203ENSMUST00000110013 4009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.74□□□□□ -0.69
P18524 Jak3-201ENSMUST00000051995 4019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.74□□□□□ -0.69
P18524 6030458C11Rik-204ENSMUST00000228177 3156 ntBASIC10.74□□□□□ -0.69
P18524 Fmo2-202ENSMUST00000111510 2260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.74□□□□□ -0.69
P18524 Gm45871-202ENSMUST00000209969 1368 ntTSL 5 BASIC10.74□□□□□ -0.69
P18524 AC091458.1-201ENSMUST00000220902 1361 ntBASIC10.74□□□□□ -0.69
P18524 Txndc12-201ENSMUST00000030296 1359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.74□□□□□ -0.69
P18524 Mtap-201ENSMUST00000058030 2797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.74□□□□□ -0.69
P18524 Rbm47-204ENSMUST00000113726 4703 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.74□□□□□ -0.69
P18524 Adipor2-202ENSMUST00000169744 3489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.74□□□□□ -0.69
P18524 Cyp26b1-204ENSMUST00000204146 4495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.74□□□□□ -0.69
P18524 Col14a1-201ENSMUST00000023053 6457 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC10.74□□□□□ -0.69
P18524 Asxl1-205ENSMUST00000227428 6981 ntAPPRIS ALT2 BASIC10.74□□□□□ -0.69
P18524 Grpel1-201ENSMUST00000031099 3528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.74□□□□□ -0.69
P18524 Xpo1-201ENSMUST00000020538 5145 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.73□□□□□ -0.69
P18524 Cpsf7-201ENSMUST00000038379 3604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.73□□□□□ -0.69
P18524 Patl1-201ENSMUST00000061618 4221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.73□□□□□ -0.69
P18524 Tnip1-204ENSMUST00000108885 2686 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.73□□□□□ -0.69
P18524 AC122860.2-201ENSMUST00000217967 2671 ntBASIC10.73□□□□□ -0.69
P18524 Cd163l1-204ENSMUST00000209637 3210 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.73□□□□□ -0.69
P18524 Nfatc4-202ENSMUST00000172271 3775 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.73□□□□□ -0.69
P18524 Slc39a14-202ENSMUST00000068044 4926 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC10.73□□□□□ -0.69
P18524 Abca7-203ENSMUST00000171637 6638 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.73□□□□□ -0.69
P18524 Rgs17-203ENSMUST00000117676 1651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.73□□□□□ -0.69
P18524 March7-202ENSMUST00000102747 2271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.73□□□□□ -0.69
P18524 Kif5a-201ENSMUST00000099172 6295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.73□□□□□ -0.69
P18524 Brd3-202ENSMUST00000077737 5272 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.73□□□□□ -0.69
P18524 Gm12200-201ENSMUST00000144876 1858 ntTSL 1 (best) BASIC10.73□□□□□ -0.69
P18524 Limd2-203ENSMUST00000106875 936 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC10.73□□□□□ -0.69
P18524 Nrg4-204ENSMUST00000130158 1000 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.73□□□□□ -0.69
P18524 Gm15979-201ENSMUST00000149741 590 ntTSL 1 (best) BASIC10.73□□□□□ -0.69
P18524 Gm26083-201ENSMUST00000157904 193 ntBASIC10.73□□□□□ -0.69
P18524 Prox2os-201ENSMUST00000177043 1133 ntTSL 1 (best) BASIC10.73□□□□□ -0.69
P18524 Rhox5-201ENSMUST00000179626 633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.73□□□□□ -0.69
P18524 Gm9034-201ENSMUST00000182071 1005 ntBASIC10.73□□□□□ -0.69
P18524 Gm6114-201ENSMUST00000182472 968 ntBASIC10.73□□□□□ -0.69
P18524 1700020N18Rik-201ENSMUST00000188956 547 ntTSL 1 (best) BASIC10.73□□□□□ -0.69
P18524 Gm37666-201ENSMUST00000194110 866 ntBASIC10.73□□□□□ -0.69
P18524 Gm9678-201ENSMUST00000198979 1149 ntBASIC10.73□□□□□ -0.69
P18524 AY036118-201ENSMUST00000200021 923 ntBASIC10.73□□□□□ -0.69
P18524 Gm44262-201ENSMUST00000204969 372 ntBASIC10.73□□□□□ -0.69
P18524 Gm39318-201ENSMUST00000214606 1118 ntTSL 3 BASIC10.73□□□□□ -0.69
P18524 Ankrd2-201ENSMUST00000026172 1100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.73□□□□□ -0.69
P18524 L3mbtl2-208ENSMUST00000174229 2578 ntTSL 1 (best) BASIC10.73□□□□□ -0.69
P18524 Zfp112-204ENSMUST00000215113 2628 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.73□□□□□ -0.69
P18524 Gm13187-202ENSMUST00000133873 1321 ntTSL 1 (best) BASIC10.73□□□□□ -0.69
P18524 Gm39204-201ENSMUST00000210045 1307 ntTSL 5 BASIC10.73□□□□□ -0.69
P18524 Asphd2-201ENSMUST00000031291 2678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.73□□□□□ -0.69
P18524 Snx29-203ENSMUST00000122168 2096 ntTSL 5 BASIC10.73□□□□□ -0.69
P18524 Fga-201ENSMUST00000029630 2083 ntTSL 1 (best) BASIC10.73□□□□□ -0.69
P18524 Lsamp-208ENSMUST00000189358 2766 ntTSL 5 BASIC10.73□□□□□ -0.69
P18524 Riox2-206ENSMUST00000160571 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.73□□□□□ -0.69
P18524 Wif1-201ENSMUST00000020439 2294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.73□□□□□ -0.69
P18524 Map7-202ENSMUST00000116259 3831 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.73□□□□□ -0.69
P18524 4930432E11Rik-202ENSMUST00000063585 10871 ntBASIC10.73□□□□□ -0.69
P18524 Srek1-201ENSMUST00000074616 3934 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.73□□□□□ -0.69
P18524 Atxn2l-203ENSMUST00000167759 4023 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.73□□□□□ -0.69
P18524 Dysf-210ENSMUST00000153860 6525 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.73□□□□□ -0.69
P18524 Thegl-201ENSMUST00000031161 1719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.72□□□□□ -0.69
P18524 Fads1-201ENSMUST00000010807 3456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.72□□□□□ -0.69
P18524 Ppp1r3b-204ENSMUST00000211648 4386 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC10.72□□□□□ -0.69
P18524 Gfap-201ENSMUST00000067444 2648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.72□□□□□ -0.69
P18524 Fn1-211ENSMUST00000187938 7965 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.72□□□□□ -0.69
P18524 Myo18a-220ENSMUST00000164334 5381 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.72□□□□□ -0.69
P18524 Gm8146-201ENSMUST00000192106 1847 ntBASIC10.72□□□□□ -0.69
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 33.9 ms