Protein–RNA interactions for Protein: P17919

Hoxb1, Homeobox protein Hox-B1, mousemouse

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Length 297 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Hoxb1P17919 Lrriq1-203ENSMUST00000166240 5232 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.67□□□□□ -0.7
Hoxb1P17919 Pprc1-201ENSMUST00000062322 5205 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.67□□□□□ -0.7
Hoxb1P17919 4833418N02Rik-201ENSMUST00000137539 1820 ntTSL 1 (best) BASIC10.67□□□□□ -0.7
Hoxb1P17919 Slc10a6-201ENSMUST00000031263 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.67□□□□□ -0.7
Hoxb1P17919 Eif4enif1-204ENSMUST00000120721 2952 ntTSL 5 BASIC10.67□□□□□ -0.7
Hoxb1P17919 Odf2-201ENSMUST00000028128 2376 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.67□□□□□ -0.7
Hoxb1P17919 Runx1-201ENSMUST00000023673 5861 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.67□□□□□ -0.7
Hoxb1P17919 AC164161.2-201ENSMUST00000217446 1730 ntTSL 5 BASIC10.67□□□□□ -0.7
Hoxb1P17919 Fyttd1-211ENSMUST00000171325 4295 ntTSL 1 (best) BASIC10.67□□□□□ -0.7
Hoxb1P17919 4933421I07Rik-201ENSMUST00000032648 1413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.67□□□□□ -0.7
Hoxb1P17919 Snrk-203ENSMUST00000120173 4758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
Hoxb1P17919 Cyb5r3-202ENSMUST00000162178 2547 ntTSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
Hoxb1P17919 Cdadc1-203ENSMUST00000167100 2243 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
Hoxb1P17919 Tmeff2-201ENSMUST00000081851 3343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
Hoxb1P17919 Anxa6-201ENSMUST00000102727 2471 ntTSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
Hoxb1P17919 Anxa6-202ENSMUST00000108883 2489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
Hoxb1P17919 Htr2c-207ENSMUST00000156697 4654 ntTSL 5 BASIC10.66□□□□□ -0.7
Hoxb1P17919 Gm45342-201ENSMUST00000210903 1363 ntBASIC10.66□□□□□ -0.7
Hoxb1P17919 Map3k12-201ENSMUST00000023812 5182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
Hoxb1P17919 Sgce-209ENSMUST00000133306 1619 ntTSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
Hoxb1P17919 AU022754-201ENSMUST00000180441 2976 ntTSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
Hoxb1P17919 Nsf-202ENSMUST00000103075 3766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
Hoxb1P17919 Sufu-201ENSMUST00000039922 4522 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
Hoxb1P17919 Ttc4-201ENSMUST00000026480 2121 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
Hoxb1P17919 Wdfy2-201ENSMUST00000014691 6646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
Hoxb1P17919 Gm7642-201ENSMUST00000216345 1809 ntBASIC10.66□□□□□ -0.7
Hoxb1P17919 Tnk2-205ENSMUST00000115124 4424 ntTSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
Hoxb1P17919 Mrvi1-201ENSMUST00000005751 6198 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
Hoxb1P17919 Gm37580-201ENSMUST00000192408 2800 ntBASIC10.66□□□□□ -0.7
Hoxb1P17919 Gm24541-201ENSMUST00000103871 96 ntBASIC10.66□□□□□ -0.7
Hoxb1P17919 Gm15198-201ENSMUST00000117283 177 ntBASIC10.66□□□□□ -0.7
Hoxb1P17919 Gm14659-201ENSMUST00000117667 843 ntBASIC10.66□□□□□ -0.7
Hoxb1P17919 Gm11893-201ENSMUST00000117829 491 ntBASIC10.66□□□□□ -0.7
Hoxb1P17919 Polr3c-202ENSMUST00000125183 923 ntTSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
Hoxb1P17919 Myadml2os-201ENSMUST00000126642 1044 ntTSL 5 BASIC10.66□□□□□ -0.7
Hoxb1P17919 Gm16191-202ENSMUST00000148464 484 ntTSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
Hoxb1P17919 Fhit-206ENSMUST00000162278 981 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
Hoxb1P17919 Gm28041-201ENSMUST00000166080 779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
Hoxb1P17919 Gm2861-201ENSMUST00000199885 666 ntTSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
Hoxb1P17919 Brsk1-205ENSMUST00000206024 1216 ntTSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
Hoxb1P17919 Gm45184-201ENSMUST00000206354 955 ntTSL 5 BASIC10.66□□□□□ -0.7
Hoxb1P17919 Colca2-202ENSMUST00000215038 1269 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.66□□□□□ -0.7
Hoxb1P17919 Gm36198-201ENSMUST00000217490 416 ntTSL 3 BASIC10.66□□□□□ -0.7
Hoxb1P17919 CT025552.1-201ENSMUST00000224561 521 ntBASIC10.66□□□□□ -0.7
Hoxb1P17919 CT025642.1-201ENSMUST00000224734 1219 ntBASIC10.66□□□□□ -0.7
Hoxb1P17919 Alkbh3-201ENSMUST00000040005 1228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
Hoxb1P17919 Cabp5-201ENSMUST00000005791 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
Hoxb1P17919 Gm6092-201ENSMUST00000121659 2029 ntBASIC10.66□□□□□ -0.7
Hoxb1P17919 Oas1d-201ENSMUST00000044224 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
Hoxb1P17919 4931406C07Rik-203ENSMUST00000180339 2756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
Hoxb1P17919 Chrng-201ENSMUST00000027470 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
Hoxb1P17919 Gm38901-201ENSMUST00000202448 3008 ntTSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
Hoxb1P17919 Ttbk2-203ENSMUST00000085840 11152 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.66□□□□□ -0.7
Hoxb1P17919 Zbtb49-201ENSMUST00000094833 2978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
Hoxb1P17919 4930488B22Rik-201ENSMUST00000172500 1722 ntTSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
Hoxb1P17919 Zc3h6-202ENSMUST00000110320 4916 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.66□□□□□ -0.7
Hoxb1P17919 Hsd3b3-201ENSMUST00000090743 1492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
Hoxb1P17919 Gusb-201ENSMUST00000026613 2687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
Hoxb1P17919 Otud7b-201ENSMUST00000035519 8043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
Hoxb1P17919 Tardbp-204ENSMUST00000105699 1904 ntTSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
Hoxb1P17919 Kcnn3-201ENSMUST00000000811 2884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
Hoxb1P17919 Ipo13-201ENSMUST00000036156 3595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
Hoxb1P17919 Vax2os-201ENSMUST00000123402 1435 ntTSL 5 BASIC10.66□□□□□ -0.7
Hoxb1P17919 Nin-204ENSMUST00000169074 6636 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
Hoxb1P17919 Mamdc4-202ENSMUST00000114223 3998 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.66□□□□□ -0.7
Hoxb1P17919 Gm37885-201ENSMUST00000192568 1391 ntTSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
Hoxb1P17919 Abhd1-202ENSMUST00000201125 1352 ntTSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
Hoxb1P17919 Kalrn-201ENSMUST00000076810 8940 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.65□□□□□ -0.7
Hoxb1P17919 Kif1a-210ENSMUST00000190723 6141 ntTSL 5 BASIC10.65□□□□□ -0.7
Hoxb1P17919 Pip5k1a-206ENSMUST00000107236 3618 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
Hoxb1P17919 Tns2-202ENSMUST00000169627 4707 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
Hoxb1P17919 Napsa-201ENSMUST00000002274 1560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
Hoxb1P17919 Pnpla6-202ENSMUST00000111070 4496 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.65□□□□□ -0.7
Hoxb1P17919 Gm10465-201ENSMUST00000223133 3334 ntTSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
Hoxb1P17919 Poc1b-201ENSMUST00000020113 2862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
Hoxb1P17919 Rabif-201ENSMUST00000047978 2861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
Hoxb1P17919 Gjb2-201ENSMUST00000055698 2406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
Hoxb1P17919 Pdcd4-202ENSMUST00000074371 2418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
Hoxb1P17919 Chrdl1-204ENSMUST00000166406 2605 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
Hoxb1P17919 Cacna1g-205ENSMUST00000107786 7984 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
Hoxb1P17919 Rin3-201ENSMUST00000056950 3892 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
Hoxb1P17919 Efcab12-201ENSMUST00000032468 2551 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.65□□□□□ -0.7
Hoxb1P17919 Msantd1-201ENSMUST00000050535 2793 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
Hoxb1P17919 Gtf2h5-202ENSMUST00000100955 879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
Hoxb1P17919 Gm24830-201ENSMUST00000102024 166 ntBASIC10.65□□□□□ -0.7
Hoxb1P17919 Mir1247-201ENSMUST00000116706 82 ntBASIC10.65□□□□□ -0.7
Hoxb1P17919 Nfu1-203ENSMUST00000120240 1195 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC10.65□□□□□ -0.7
Hoxb1P17919 Gm12752-201ENSMUST00000121657 811 ntBASIC10.65□□□□□ -0.7
Hoxb1P17919 A330102I10Rik-202ENSMUST00000140415 682 ntTSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
Hoxb1P17919 Gm2639-201ENSMUST00000156881 1297 ntBASIC10.65□□□□□ -0.7
Hoxb1P17919 AI480526-203ENSMUST00000160099 1017 ntTSL 2 BASIC10.65□□□□□ -0.7
Hoxb1P17919 Bud31-206ENSMUST00000162308 705 ntTSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
Hoxb1P17919 Ppm1h-208ENSMUST00000162969 811 ntTSL 3 BASIC10.65□□□□□ -0.7
Hoxb1P17919 Gm8738-201ENSMUST00000172606 329 ntBASIC10.65□□□□□ -0.7
Hoxb1P17919 Fkbp2-202ENSMUST00000177752 627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
Hoxb1P17919 Abhd14b-202ENSMUST00000185347 1200 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC10.65□□□□□ -0.7
Hoxb1P17919 Gm38313-201ENSMUST00000191953 1266 ntBASIC10.65□□□□□ -0.7
Hoxb1P17919 Ssr2-202ENSMUST00000192495 620 ntTSL 5 BASIC10.65□□□□□ -0.7
Hoxb1P17919 Gm42920-201ENSMUST00000196616 409 ntTSL 3 BASIC10.65□□□□□ -0.7
Hoxb1P17919 Spc24-204ENSMUST00000216057 627 ntTSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
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