Protein–RNA interactions for Protein: P17208

Pou4f1, POU domain, class 4, transcription factor 1, mousemouse

Predictions only

Length 421 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pou4f1P17208 Rasal2-204ENSMUST00000132699 4013 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.75□□□□□ -0.53
Pou4f1P17208 Aak1-201ENSMUST00000003710 7203 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC11.75□□□□□ -0.53
Pou4f1P17208 Adamts14-202ENSMUST00000120336 3645 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.75□□□□□ -0.53
Pou4f1P17208 Gm3764-205ENSMUST00000181134 2203 ntTSL 1 (best) BASIC11.75□□□□□ -0.53
Pou4f1P17208 Nek5-202ENSMUST00000209656 2253 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.75□□□□□ -0.53
Pou4f1P17208 Prx-202ENSMUST00000098644 4841 ntTSL 1 (best) BASIC11.75□□□□□ -0.53
Pou4f1P17208 Plin4-202ENSMUST00000190703 5756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.75□□□□□ -0.53
Pou4f1P17208 Iqgap3-201ENSMUST00000071812 5756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.75□□□□□ -0.53
Pou4f1P17208 Pnmal2-201ENSMUST00000094807 4147 ntAPPRIS P1 BASIC11.75□□□□□ -0.53
Pou4f1P17208 3110062M04Rik-203ENSMUST00000115007 3326 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.75□□□□□ -0.53
Pou4f1P17208 Fam206a-201ENSMUST00000045368 4275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.74□□□□□ -0.53
Pou4f1P17208 Gm4780-202ENSMUST00000215200 2644 ntBASIC11.74□□□□□ -0.53
Pou4f1P17208 Gucy2e-203ENSMUST00000108665 3645 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.74□□□□□ -0.53
Pou4f1P17208 Serpine1-201ENSMUST00000041388 3011 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.74□□□□□ -0.53
Pou4f1P17208 5033428I22Rik-201ENSMUST00000181638 2040 ntTSL 1 (best) BASIC11.74□□□□□ -0.53
Pou4f1P17208 Arhgef28-201ENSMUST00000109426 5387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.74□□□□□ -0.53
Pou4f1P17208 Mfrp-201ENSMUST00000034654 4316 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.74□□□□□ -0.53
Pou4f1P17208 Borcs7-201ENSMUST00000074912 2176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.74□□□□□ -0.53
Pou4f1P17208 Tef-202ENSMUST00000109553 4401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.74□□□□□ -0.53
Pou4f1P17208 Tkfc-201ENSMUST00000037678 2253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.74□□□□□ -0.53
Pou4f1P17208 Cpn2-201ENSMUST00000064856 4583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.74□□□□□ -0.53
Pou4f1P17208 Plekhg2-201ENSMUST00000094644 4623 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.74□□□□□ -0.53
Pou4f1P17208 Plscr1-201ENSMUST00000093801 2302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.74□□□□□ -0.53
Pou4f1P17208 Ndst1-201ENSMUST00000169273 6070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.74□□□□□ -0.53
Pou4f1P17208 Bmp1-201ENSMUST00000022693 3684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.74□□□□□ -0.53
Pou4f1P17208 Fthl17d-201ENSMUST00000105004 856 ntAPPRIS P1 BASIC11.74□□□□□ -0.53
Pou4f1P17208 Upk3bl-202ENSMUST00000111137 1119 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.74□□□□□ -0.53
Pou4f1P17208 Aamdc-210ENSMUST00000146605 642 ntTSL 3 BASIC11.74□□□□□ -0.53
Pou4f1P17208 Gm25043-201ENSMUST00000158604 212 ntBASIC11.74□□□□□ -0.53
Pou4f1P17208 Gm16282-201ENSMUST00000162641 451 ntTSL 3 BASIC11.74□□□□□ -0.53
Pou4f1P17208 Gstp1-201ENSMUST00000169613 757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.74□□□□□ -0.53
Pou4f1P17208 Pfdn6-205ENSMUST00000174426 396 ntTSL 2 BASIC11.74□□□□□ -0.53
Pou4f1P17208 Rab11b-ps2-201ENSMUST00000178377 657 ntBASIC11.74□□□□□ -0.53
Pou4f1P17208 Otx2os1-202ENSMUST00000183803 743 ntTSL 1 (best) BASIC11.74□□□□□ -0.53
Pou4f1P17208 Nipsnap3a-204ENSMUST00000188045 1099 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.74□□□□□ -0.53
Pou4f1P17208 Gm19963-201ENSMUST00000208413 1255 ntBASIC11.74□□□□□ -0.53
Pou4f1P17208 Krtap19-9a-201ENSMUST00000062005 168 ntAPPRIS P1 BASIC11.74□□□□□ -0.53
Pou4f1P17208 Olfr1413-201ENSMUST00000074859 1082 ntAPPRIS P1 BASIC11.74□□□□□ -0.53
Pou4f1P17208 Tmem107-202ENSMUST00000094081 1263 ntTSL 1 (best) BASIC11.74□□□□□ -0.53
Pou4f1P17208 C2-201ENSMUST00000025230 2641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.74□□□□□ -0.53
Pou4f1P17208 Gm15541-201ENSMUST00000147449 2713 ntTSL 1 (best) BASIC11.74□□□□□ -0.53
Pou4f1P17208 Dna2-203ENSMUST00000131422 4122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.74□□□□□ -0.53
Pou4f1P17208 Tepsin-202ENSMUST00000093901 2770 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.74□□□□□ -0.53
Pou4f1P17208 Mbtps1-201ENSMUST00000081381 4195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.74□□□□□ -0.53
Pou4f1P17208 Gm14698-201ENSMUST00000096420 4226 ntAPPRIS P1 BASIC11.74□□□□□ -0.53
Pou4f1P17208 Arhgap1-204ENSMUST00000111331 2883 ntTSL 1 (best) BASIC11.74□□□□□ -0.53
Pou4f1P17208 Sirt3-201ENSMUST00000026559 1461 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.74□□□□□ -0.53
Pou4f1P17208 Flnc-201ENSMUST00000065090 9038 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.74□□□□□ -0.53
Pou4f1P17208 Tifa-203ENSMUST00000164447 1538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.74□□□□□ -0.53
Pou4f1P17208 Gm37131-201ENSMUST00000192502 1561 ntBASIC11.74□□□□□ -0.53
Pou4f1P17208 Xkr5-201ENSMUST00000055503 3176 ntTSL 1 (best) BASIC11.74□□□□□ -0.53
Pou4f1P17208 Trpc6-201ENSMUST00000050433 3259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.74□□□□□ -0.53
Pou4f1P17208 Slc6a5-201ENSMUST00000056442 7065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.74□□□□□ -0.53
Pou4f1P17208 Hmg20a-204ENSMUST00000214869 1782 ntTSL 1 (best) BASIC11.74□□□□□ -0.53
Pou4f1P17208 Dopey2-207ENSMUST00000227156 7340 ntBASIC11.74□□□□□ -0.53
Pou4f1P17208 Maged2-202ENSMUST00000112697 1851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.74□□□□□ -0.53
Pou4f1P17208 Nrd1-203ENSMUST00000106644 3784 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.74□□□□□ -0.53
Pou4f1P17208 Slc25a45-206ENSMUST00000155697 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.74□□□□□ -0.53
Pou4f1P17208 Fcrl1-201ENSMUST00000072480 1980 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.74□□□□□ -0.53
Pou4f1P17208 March7-202ENSMUST00000102747 2271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.74□□□□□ -0.53
Pou4f1P17208 Gfap-201ENSMUST00000067444 2648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.73□□□□□ -0.53
Pou4f1P17208 Tmem41b-202ENSMUST00000118429 2774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.73□□□□□ -0.53
Pou4f1P17208 Adgrg5-201ENSMUST00000074570 2802 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.73□□□□□ -0.53
Pou4f1P17208 Pdcd11-201ENSMUST00000072141 6041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.73□□□□□ -0.53
Pou4f1P17208 Ahsa2-202ENSMUST00000109539 3583 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.73□□□□□ -0.53
Pou4f1P17208 Rbm6-207ENSMUST00000183032 3716 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.73□□□□□ -0.53
Pou4f1P17208 Zfp687-201ENSMUST00000019482 4632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.73□□□□□ -0.53
Pou4f1P17208 Cyp4b1-201ENSMUST00000102707 1892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.73□□□□□ -0.53
Pou4f1P17208 Gaa-203ENSMUST00000106259 3633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.73□□□□□ -0.53
Pou4f1P17208 Toe1-202ENSMUST00000106455 1209 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.73□□□□□ -0.53
Pou4f1P17208 Pin4-201ENSMUST00000113627 489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.73□□□□□ -0.53
Pou4f1P17208 Pigp-205ENSMUST00000113917 805 ntTSL 1 (best) BASIC11.73□□□□□ -0.53
Pou4f1P17208 Grin1-208ENSMUST00000114318 3920 ntTSL 5 BASIC11.73□□□□□ -0.53
Pou4f1P17208 Cpa5-202ENSMUST00000115138 1778 ntTSL 5 BASIC11.73□□□□□ -0.53
Pou4f1P17208 Rhox2c-201ENSMUST00000115190 762 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.73□□□□□ -0.53
Pou4f1P17208 Leng8-202ENSMUST00000117274 874 ntTSL 1 (best) BASIC11.73□□□□□ -0.53
Pou4f1P17208 Hmga1-203ENSMUST00000117600 1635 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.73□□□□□ -0.53
Pou4f1P17208 Gm15824-201ENSMUST00000119516 955 ntBASIC11.73□□□□□ -0.53
Pou4f1P17208 Zmym3-205ENSMUST00000119699 1750 ntTSL 5 BASIC11.73□□□□□ -0.53
Pou4f1P17208 Serf1-203ENSMUST00000132053 516 ntTSL 1 (best) BASIC11.73□□□□□ -0.53
Pou4f1P17208 3110056K07Rik-202ENSMUST00000136690 1063 ntTSL 1 (best) BASIC11.73□□□□□ -0.53
Pou4f1P17208 1110028F11Rik-201ENSMUST00000137077 837 ntTSL 1 (best) BASIC11.73□□□□□ -0.53
Pou4f1P17208 Gm13133-201ENSMUST00000143888 736 ntTSL 1 (best) BASIC11.73□□□□□ -0.53
Pou4f1P17208 Gm8801-201ENSMUST00000173255 1064 ntBASIC11.73□□□□□ -0.53
Pou4f1P17208 Nlrp6-203ENSMUST00000183845 4436 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.73□□□□□ -0.53
Pou4f1P17208 Mocs2-215ENSMUST00000184335 646 ntTSL 5 BASIC11.73□□□□□ -0.53
Pou4f1P17208 Ccl4-201ENSMUST00000019074 660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.73□□□□□ -0.53
Pou4f1P17208 Gm44152-201ENSMUST00000205007 1691 ntBASIC11.73□□□□□ -0.53
Pou4f1P17208 4933440M02Rik-202ENSMUST00000205794 1601 ntTSL 1 (best) BASIC11.73□□□□□ -0.53
Pou4f1P17208 Gm44756-201ENSMUST00000206172 1069 ntTSL 1 (best) BASIC11.73□□□□□ -0.53
Pou4f1P17208 Fosb-202ENSMUST00000207334 3664 ntTSL 5 BASIC11.73□□□□□ -0.53
Pou4f1P17208 Gm7619-201ENSMUST00000210649 1282 ntBASIC11.73□□□□□ -0.53
Pou4f1P17208 Zfp112-204ENSMUST00000215113 2628 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.73□□□□□ -0.53
Pou4f1P17208 Samd11-204ENSMUST00000218788 2217 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.73□□□□□ -0.53
Pou4f1P17208 Gm18626-201ENSMUST00000221512 1409 ntBASIC11.73□□□□□ -0.53
Pou4f1P17208 Asic5-201ENSMUST00000029641 1657 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.73□□□□□ -0.53
Pou4f1P17208 Tbx10-201ENSMUST00000041871 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.73□□□□□ -0.53
Pou4f1P17208 Pacsin1-201ENSMUST00000045896 4190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.73□□□□□ -0.53
Pou4f1P17208 Shbg-201ENSMUST00000005334 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.73□□□□□ -0.53
Pou4f1P17208 Lck-201ENSMUST00000067240 2185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.73□□□□□ -0.53
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 59.3 ms