Protein–RNA interactions for Protein: P16305

Gabra6, Gamma-aminobutyric acid receptor subunit alpha-6, mousemouse

Predictions only

Length 453 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gabra6P16305 Spata33-202ENSMUST00000212161 2941 ntTSL 2 BASIC10.29□□□□□ -0.76
Gabra6P16305 Smc3-201ENSMUST00000025930 4851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.29□□□□□ -0.76
Gabra6P16305 Dclk2-202ENSMUST00000191752 8042 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.29□□□□□ -0.76
Gabra6P16305 Iqgap3-201ENSMUST00000071812 5756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.29□□□□□ -0.76
Gabra6P16305 Acvrl1-205ENSMUST00000120754 3506 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.29□□□□□ -0.76
Gabra6P16305 Myo18a-211ENSMUST00000130627 6202 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.29□□□□□ -0.76
Gabra6P16305 Ifna7-201ENSMUST00000105143 573 ntAPPRIS P1 BASIC10.29□□□□□ -0.76
Gabra6P16305 Gm11989-201ENSMUST00000117240 672 ntBASIC10.29□□□□□ -0.76
Gabra6P16305 Gm15198-201ENSMUST00000117283 177 ntBASIC10.29□□□□□ -0.76
Gabra6P16305 Gm11362-201ENSMUST00000118838 850 ntBASIC10.29□□□□□ -0.76
Gabra6P16305 Gm15610-201ENSMUST00000120584 195 ntBASIC10.29□□□□□ -0.76
Gabra6P16305 Myl3-203ENSMUST00000136695 614 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC10.29□□□□□ -0.76
Gabra6P16305 Gm6963-201ENSMUST00000147879 379 ntBASIC10.29□□□□□ -0.76
Gabra6P16305 Hsbp1l1-201ENSMUST00000166219 1251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.29□□□□□ -0.76
Gabra6P16305 Retn-202ENSMUST00000169234 1139 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.29□□□□□ -0.76
Gabra6P16305 Gm20482-202ENSMUST00000174729 825 ntBASIC10.29□□□□□ -0.76
Gabra6P16305 Rpl36-ps4-201ENSMUST00000179601 354 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.29□□□□□ -0.76
Gabra6P16305 Hspb9-201ENSMUST00000017976 652 ntAPPRIS ALT2 BASIC10.29□□□□□ -0.76
Gabra6P16305 Gm8885-201ENSMUST00000189382 598 ntBASIC10.29□□□□□ -0.76
Gabra6P16305 Gm29233-201ENSMUST00000190311 281 ntTSL 5 BASIC10.29□□□□□ -0.76
Gabra6P16305 Gsdmcl-ps-204ENSMUST00000191285 637 ntTSL 3 BASIC10.29□□□□□ -0.76
Gabra6P16305 Gm38241-201ENSMUST00000192641 898 ntBASIC10.29□□□□□ -0.76
Gabra6P16305 Gm43179-201ENSMUST00000198797 275 ntBASIC10.29□□□□□ -0.76
Gabra6P16305 4930404N11Rik-201ENSMUST00000020456 691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.29□□□□□ -0.76
Gabra6P16305 Gm38979-201ENSMUST00000207099 698 ntTSL 3 BASIC10.29□□□□□ -0.76
Gabra6P16305 Gm45331-201ENSMUST00000209868 554 ntBASIC10.29□□□□□ -0.76
Gabra6P16305 Gm18615-201ENSMUST00000222919 1031 ntBASIC10.29□□□□□ -0.76
Gabra6P16305 Klk1b27-201ENSMUST00000079859 889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.29□□□□□ -0.76
Gabra6P16305 Lgals1-201ENSMUST00000089377 800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.29□□□□□ -0.76
Gabra6P16305 Tmx2-203ENSMUST00000111665 2282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.29□□□□□ -0.76
Gabra6P16305 3200001D21Rik-201ENSMUST00000221603 2283 ntTSL 1 (best) BASIC10.29□□□□□ -0.76
Gabra6P16305 Gm42890-202ENSMUST00000167642 2566 ntTSL 1 (best) BASIC10.29□□□□□ -0.76
Gabra6P16305 Serpina16-202ENSMUST00000164148 1582 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.29□□□□□ -0.76
Gabra6P16305 Hdac7-205ENSMUST00000118294 4069 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.29□□□□□ -0.76
Gabra6P16305 Pex26-201ENSMUST00000088561 4093 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.29□□□□□ -0.76
Gabra6P16305 Gm2822-201ENSMUST00000164299 2910 ntTSL 1 (best) BASIC10.29□□□□□ -0.76
Gabra6P16305 Trhr2-201ENSMUST00000044123 1340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.29□□□□□ -0.76
Gabra6P16305 4930554G24Rik-201ENSMUST00000126260 1603 ntTSL 1 (best) BASIC10.29□□□□□ -0.76
Gabra6P16305 AC126444.1-201ENSMUST00000225938 1768 ntBASIC10.29□□□□□ -0.76
Gabra6P16305 Irf1-203ENSMUST00000108922 2092 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.29□□□□□ -0.76
Gabra6P16305 Ly6e-210ENSMUST00000188866 2068 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC10.29□□□□□ -0.76
Gabra6P16305 Wdcp-205ENSMUST00000220215 2202 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.29□□□□□ -0.76
Gabra6P16305 Agrn-203ENSMUST00000105575 7262 ntTSL 5 BASIC10.29□□□□□ -0.76
Gabra6P16305 Gm2670-201ENSMUST00000180668 2804 ntTSL 1 (best) BASIC10.29□□□□□ -0.76
Gabra6P16305 Limd2-201ENSMUST00000045923 2950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.29□□□□□ -0.76
Gabra6P16305 Dlgap4-203ENSMUST00000099145 3402 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC10.29□□□□□ -0.76
Gabra6P16305 Cyp26b1-204ENSMUST00000204146 4495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.29□□□□□ -0.76
Gabra6P16305 Nphs1-201ENSMUST00000006825 4608 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.29□□□□□ -0.76
Gabra6P16305 Ascc2-202ENSMUST00000109930 4844 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.28□□□□□ -0.76
Gabra6P16305 Stim1-202ENSMUST00000209255 4362 ntTSL 5 BASIC10.28□□□□□ -0.76
Gabra6P16305 Lipe-201ENSMUST00000003207 3613 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC10.28□□□□□ -0.76
Gabra6P16305 Armcx2-203ENSMUST00000119010 3007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.28□□□□□ -0.76
Gabra6P16305 Ildr1-201ENSMUST00000023617 3042 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.28□□□□□ -0.76
Gabra6P16305 Cep41-203ENSMUST00000115131 2256 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.28□□□□□ -0.76
Gabra6P16305 Esrp1-204ENSMUST00000108313 3696 ntTSL 5 BASIC10.28□□□□□ -0.76
Gabra6P16305 Chl1-204ENSMUST00000203912 4628 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.28□□□□□ -0.76
Gabra6P16305 Sowahc-201ENSMUST00000182161 4482 ntAPPRIS P1 BASIC10.28□□□□□ -0.76
Gabra6P16305 Hao1-201ENSMUST00000028704 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.28□□□□□ -0.76
Gabra6P16305 Rps6kb1-202ENSMUST00000058286 3250 ntTSL 1 (best) BASIC10.28□□□□□ -0.76
Gabra6P16305 Arhgap39-201ENSMUST00000036176 4500 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.28□□□□□ -0.76
Gabra6P16305 Cep350-204ENSMUST00000138762 13307 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.28□□□□□ -0.76
Gabra6P16305 Tmc4-202ENSMUST00000121743 2204 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.28□□□□□ -0.76
Gabra6P16305 Ash2l-210ENSMUST00000166078 2234 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.28□□□□□ -0.76
Gabra6P16305 9530077C05Rik-201ENSMUST00000058868 2223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.28□□□□□ -0.76
Gabra6P16305 Fbln2-201ENSMUST00000041544 4786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.28□□□□□ -0.76
Gabra6P16305 1700049J03Rik-201ENSMUST00000011196 421 ntTSL 1 (best) BASIC10.28□□□□□ -0.76
Gabra6P16305 Gm14723-201ENSMUST00000118686 215 ntBASIC10.28□□□□□ -0.76
Gabra6P16305 3110056K07Rik-202ENSMUST00000136690 1063 ntTSL 1 (best) BASIC10.28□□□□□ -0.76
Gabra6P16305 Iqcf6-201ENSMUST00000171091 537 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.28□□□□□ -0.76
Gabra6P16305 Rps13-ps2-201ENSMUST00000182017 453 ntBASIC10.28□□□□□ -0.76
Gabra6P16305 A430027H14Rik-202ENSMUST00000192797 618 ntTSL 2 BASIC10.28□□□□□ -0.76
Gabra6P16305 Gm43758-201ENSMUST00000199500 367 ntBASIC10.28□□□□□ -0.76
Gabra6P16305 1110006O24Rik-201ENSMUST00000201728 768 ntBASIC10.28□□□□□ -0.76
Gabra6P16305 Gm45598-202ENSMUST00000210719 986 ntBASIC10.28□□□□□ -0.76
Gabra6P16305 Colca2-202ENSMUST00000215038 1269 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.28□□□□□ -0.76
Gabra6P16305 Gm9949-201ENSMUST00000067743 962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.28□□□□□ -0.76
Gabra6P16305 Sod2-201ENSMUST00000007012 3824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.28□□□□□ -0.76
Gabra6P16305 Gm16519-201ENSMUST00000092011 489 ntAPPRIS P1 BASIC10.28□□□□□ -0.76
Gabra6P16305 9430038I01Rik-203ENSMUST00000120340 4643 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.28□□□□□ -0.76
Gabra6P16305 Mthfd1l-202ENSMUST00000117291 3669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.28□□□□□ -0.76
Gabra6P16305 Pdcd1-201ENSMUST00000027507 1930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.28□□□□□ -0.76
Gabra6P16305 Abca2-201ENSMUST00000102919 8033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.28□□□□□ -0.76
Gabra6P16305 Gjb2-201ENSMUST00000055698 2406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.28□□□□□ -0.76
Gabra6P16305 1700001L05Rik-201ENSMUST00000100370 2270 ntTSL 1 (best) BASIC10.28□□□□□ -0.76
Gabra6P16305 Pygo2-202ENSMUST00000107413 2911 ntTSL 1 (best) BASIC10.28□□□□□ -0.76
Gabra6P16305 Exosc1-202ENSMUST00000112123 1499 ntTSL 1 (best) BASIC10.28□□□□□ -0.76
Gabra6P16305 Ntpcr-202ENSMUST00000065135 1497 ntTSL 1 (best) BASIC10.28□□□□□ -0.76
Gabra6P16305 1110051M20Rik-203ENSMUST00000102594 1977 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.28□□□□□ -0.76
Gabra6P16305 Sdc4-201ENSMUST00000017153 2458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.28□□□□□ -0.76
Gabra6P16305 Igsf9-201ENSMUST00000052629 4133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.28□□□□□ -0.76
Gabra6P16305 Gm8862-201ENSMUST00000198379 1346 ntBASIC10.28□□□□□ -0.76
Gabra6P16305 Mxd3-201ENSMUST00000021941 1327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.28□□□□□ -0.76
Gabra6P16305 AC122840.1-201ENSMUST00000220915 3334 ntBASIC10.28□□□□□ -0.76
Gabra6P16305 Coq3-201ENSMUST00000029909 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.28□□□□□ -0.76
Gabra6P16305 Ggt1-201ENSMUST00000006508 2167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.28□□□□□ -0.76
Gabra6P16305 Nr1h3-203ENSMUST00000111355 1672 ntTSL 5 BASIC10.28□□□□□ -0.76
Gabra6P16305 Gm36235-201ENSMUST00000223158 1694 ntTSL 5 BASIC10.28□□□□□ -0.76
Gabra6P16305 Limk2-201ENSMUST00000101638 3514 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC10.28□□□□□ -0.76
Gabra6P16305 Egr1-202ENSMUST00000165033 3036 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.28□□□□□ -0.76
Gabra6P16305 Pdyn-201ENSMUST00000028883 2386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.28□□□□□ -0.76
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 32.5 ms