Protein–RNA interactions for Protein: P13373

Vpreb2, Immunoglobulin omega chain, mousemouse

Predictions only

Length 142 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Vpreb2P13373 Pparg-204ENSMUST00000203732 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.03□□□□□ -1.12
Vpreb2P13373 Cyp2b10-201ENSMUST00000005477 1822 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC8.03□□□□□ -1.12
Vpreb2P13373 Fam180a-201ENSMUST00000051176 1606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.03□□□□□ -1.12
Vpreb2P13373 Ap1g2-211ENSMUST00000170285 2596 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC8.03□□□□□ -1.12
Vpreb2P13373 Mtmr4-201ENSMUST00000092802 5525 ntTSL 1 (best) BASIC8.03□□□□□ -1.12
Vpreb2P13373 A930038B10Rik-202ENSMUST00000181044 3415 ntTSL 1 (best) BASIC8.03□□□□□ -1.12
Vpreb2P13373 Adamtsl3-204ENSMUST00000173828 2292 ntTSL 5 BASIC8.03□□□□□ -1.12
Vpreb2P13373 Ecd-201ENSMUST00000022344 3132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.03□□□□□ -1.12
Vpreb2P13373 Specc1-212ENSMUST00000202178 2932 ntTSL 5 BASIC8.02□□□□□ -1.12
Vpreb2P13373 Ttc30b-201ENSMUST00000099996 2737 ntAPPRIS P1 BASIC8.02□□□□□ -1.12
Vpreb2P13373 Aknad1-202ENSMUST00000133931 2603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.02□□□□□ -1.12
Vpreb2P13373 Aebp2-206ENSMUST00000161335 2524 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC8.02□□□□□ -1.12
Vpreb2P13373 Tollip-204ENSMUST00000151890 1753 ntTSL 1 (best) BASIC8.02□□□□□ -1.13
Vpreb2P13373 Pabpc4-203ENSMUST00000106241 3050 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC8.02□□□□□ -1.13
Vpreb2P13373 Camk2b-206ENSMUST00000101585 1650 ntTSL 5 BASIC8.02□□□□□ -1.13
Vpreb2P13373 Pja1-204ENSMUST00000113797 1676 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC8.02□□□□□ -1.13
Vpreb2P13373 C4b-201ENSMUST00000069507 5379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.02□□□□□ -1.13
Vpreb2P13373 Gm6015-201ENSMUST00000217493 1586 ntBASIC8.02□□□□□ -1.13
Vpreb2P13373 Wdr19-204ENSMUST00000203653 6279 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.02□□□□□ -1.13
Vpreb2P13373 Plekhn1-202ENSMUST00000105571 2004 ntTSL 5 BASIC8.02□□□□□ -1.13
Vpreb2P13373 Dna2-203ENSMUST00000131422 4122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.02□□□□□ -1.13
Vpreb2P13373 Pou5f2-201ENSMUST00000175955 1394 ntAPPRIS P1 BASIC8.02□□□□□ -1.13
Vpreb2P13373 Cldn12-201ENSMUST00000060947 3597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.02□□□□□ -1.13
Vpreb2P13373 Slc9a3-203ENSMUST00000221703 5118 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC8.02□□□□□ -1.13
Vpreb2P13373 Chrna9-201ENSMUST00000031108 1843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.02□□□□□ -1.13
Vpreb2P13373 Gm24255-201ENSMUST00000104481 128 ntBASIC8.02□□□□□ -1.13
Vpreb2P13373 Sectm1a-204ENSMUST00000106120 1020 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC8.02□□□□□ -1.13
Vpreb2P13373 Tmod4-202ENSMUST00000107227 1260 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC8.02□□□□□ -1.13
Vpreb2P13373 Rpl3-ps1-201ENSMUST00000120557 1210 ntBASIC8.02□□□□□ -1.13
Vpreb2P13373 Gm14966-202ENSMUST00000129675 649 ntTSL 2 BASIC8.02□□□□□ -1.13
Vpreb2P13373 Gm45692-201ENSMUST00000131138 557 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC8.02□□□□□ -1.13
Vpreb2P13373 Pisd-ps1-203ENSMUST00000145164 789 ntTSL 1 (best) BASIC8.02□□□□□ -1.13
Vpreb2P13373 Timm10b-208ENSMUST00000151193 1083 ntTSL 2 BASIC8.02□□□□□ -1.13
Vpreb2P13373 2310057J18Rik-201ENSMUST00000015663 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.02□□□□□ -1.13
Vpreb2P13373 Gm24548-201ENSMUST00000158650 108 ntBASIC8.02□□□□□ -1.13
Vpreb2P13373 Cabp2-201ENSMUST00000159148 1030 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC8.02□□□□□ -1.13
Vpreb2P13373 Tead1-207ENSMUST00000165036 1248 ntTSL 5 BASIC8.02□□□□□ -1.13
Vpreb2P13373 Crb3-205ENSMUST00000169543 778 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC8.02□□□□□ -1.13
Vpreb2P13373 Tead1-212ENSMUST00000171197 1074 ntTSL 5 BASIC8.02□□□□□ -1.13
Vpreb2P13373 C87198-201ENSMUST00000173553 1045 ntTSL 3 BASIC8.02□□□□□ -1.13
Vpreb2P13373 Gm20416-201ENSMUST00000174760 484 ntTSL 1 (best) BASIC8.02□□□□□ -1.13
Vpreb2P13373 Gm28638-201ENSMUST00000188152 288 ntTSL 5 BASIC8.02□□□□□ -1.13
Vpreb2P13373 Pcbd1-201ENSMUST00000020298 789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.02□□□□□ -1.13
Vpreb2P13373 Caly-203ENSMUST00000211044 1029 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC8.02□□□□□ -1.13
Vpreb2P13373 Mettl6-204ENSMUST00000227595 1027 ntBASIC8.02□□□□□ -1.13
Vpreb2P13373 Majin-201ENSMUST00000025699 1239 ntTSL 1 (best) BASIC8.02□□□□□ -1.13
Vpreb2P13373 Gm9843-201ENSMUST00000052867 504 ntAPPRIS P1 BASIC8.02□□□□□ -1.13
Vpreb2P13373 Isoc2b-201ENSMUST00000064547 1080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.02□□□□□ -1.13
Vpreb2P13373 Gatad2a-201ENSMUST00000065169 3812 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC8.02□□□□□ -1.13
Vpreb2P13373 Olfr156-202ENSMUST00000079465 1099 ntAPPRIS P1 BASIC8.02□□□□□ -1.13
Vpreb2P13373 Gm16519-201ENSMUST00000092011 489 ntAPPRIS P1 BASIC8.02□□□□□ -1.13
Vpreb2P13373 Elf4-201ENSMUST00000033429 5847 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC8.02□□□□□ -1.13
Vpreb2P13373 Anp32e-202ENSMUST00000165307 3274 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC8.02□□□□□ -1.13
Vpreb2P13373 Gjb5-201ENSMUST00000046498 1721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.02□□□□□ -1.13
Vpreb2P13373 Catsper4-201ENSMUST00000055892 1725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.02□□□□□ -1.13
Vpreb2P13373 Olfr222-203ENSMUST00000215339 2166 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC8.02□□□□□ -1.13
Vpreb2P13373 Gcdh-201ENSMUST00000003907 2167 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC8.02□□□□□ -1.13
Vpreb2P13373 6030407O03Rik-201ENSMUST00000189514 2094 ntTSL 1 (best) BASIC8.02□□□□□ -1.13
Vpreb2P13373 Cryz-208ENSMUST00000192462 2505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.02□□□□□ -1.13
Vpreb2P13373 Psd2-203ENSMUST00000175734 4300 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC8.02□□□□□ -1.13
Vpreb2P13373 Trim61-201ENSMUST00000078409 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.02□□□□□ -1.13
Vpreb2P13373 Ate1-204ENSMUST00000178534 1530 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC8.02□□□□□ -1.13
Vpreb2P13373 Hdac6-201ENSMUST00000033501 4142 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC8.02□□□□□ -1.13
Vpreb2P13373 Ttll12-201ENSMUST00000016901 3220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.02□□□□□ -1.13
Vpreb2P13373 1110046J04Rik-202ENSMUST00000180906 2776 ntBASIC8.02□□□□□ -1.13
Vpreb2P13373 Entpd4-206ENSMUST00000184973 3589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.02□□□□□ -1.13
Vpreb2P13373 Entpd4b-204ENSMUST00000185072 3589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.02□□□□□ -1.13
Vpreb2P13373 Cd74-202ENSMUST00000097563 1410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.02□□□□□ -1.13
Vpreb2P13373 Zfp174-201ENSMUST00000041778 5897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.02□□□□□ -1.13
Vpreb2P13373 Aamp-202ENSMUST00000178235 1756 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC8.02□□□□□ -1.13
Vpreb2P13373 Paip2b-201ENSMUST00000058383 3982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.02□□□□□ -1.13
Vpreb2P13373 Per1-202ENSMUST00000101004 3507 ntTSL 1 (best) BASIC8.02□□□□□ -1.13
Vpreb2P13373 Zfp433-202ENSMUST00000200889 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.02□□□□□ -1.13
Vpreb2P13373 Gm32687-201ENSMUST00000220314 2379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.02□□□□□ -1.13
Vpreb2P13373 Nr5a2-202ENSMUST00000168126 3446 ntTSL 5 BASIC8.01□□□□□ -1.13
Vpreb2P13373 Dhx58os-201ENSMUST00000137154 1594 ntTSL 1 (best) BASIC8.01□□□□□ -1.13
Vpreb2P13373 Spert-202ENSMUST00000164082 1560 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC8.01□□□□□ -1.13
Vpreb2P13373 Astn1-209ENSMUST00000194369 3344 ntTSL 1 (best) BASIC8.01□□□□□ -1.13
Vpreb2P13373 Zfp112-204ENSMUST00000215113 2628 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC8.01□□□□□ -1.13
Vpreb2P13373 Vmn1r45-201ENSMUST00000054202 3341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.01□□□□□ -1.13
Vpreb2P13373 Chchd3-201ENSMUST00000066379 1550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.01□□□□□ -1.13
Vpreb2P13373 Ube3a-203ENSMUST00000200758 9856 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC8.01□□□□□ -1.13
Vpreb2P13373 Gm15991-202ENSMUST00000212123 3565 ntBASIC8.01□□□□□ -1.13
Vpreb2P13373 Trim25-201ENSMUST00000000284 5566 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC8.01□□□□□ -1.13
Vpreb2P13373 Slc29a3-201ENSMUST00000117513 5240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.01□□□□□ -1.13
Vpreb2P13373 Epb41l5-201ENSMUST00000027632 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.01□□□□□ -1.13
Vpreb2P13373 Bbof1-201ENSMUST00000081828 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.01□□□□□ -1.13
Vpreb2P13373 Arid2-201ENSMUST00000096250 8507 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC8.01□□□□□ -1.13
Vpreb2P13373 Spcs3-201ENSMUST00000067476 3466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.01□□□□□ -1.13
Vpreb2P13373 Apopt1-203ENSMUST00000162316 3107 ntTSL 1 (best) BASIC8.01□□□□□ -1.13
Vpreb2P13373 Mcf2l-222ENSMUST00000173099 6081 ntTSL 5 BASIC8.01□□□□□ -1.13
Vpreb2P13373 Bcl2l11-205ENSMUST00000110341 5036 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC8.01□□□□□ -1.13
Vpreb2P13373 Zfp961-202ENSMUST00000131237 2689 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC8.01□□□□□ -1.13
Vpreb2P13373 Tns1-209ENSMUST00000187691 2813 ntTSL 1 (best) BASIC8.01□□□□□ -1.13
Vpreb2P13373 Cadm2-201ENSMUST00000114292 9564 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC8.01□□□□□ -1.13
Vpreb2P13373 Trpm1-201ENSMUST00000085222 5711 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC8.01□□□□□ -1.13
Vpreb2P13373 Spop-201ENSMUST00000107722 3063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.01□□□□□ -1.13
Vpreb2P13373 Gm34425-201ENSMUST00000216269 3079 ntTSL 5 BASIC8.01□□□□□ -1.13
Vpreb2P13373 Gm14149-201ENSMUST00000123048 1853 ntTSL 1 (best) BASIC8.01□□□□□ -1.13
Vpreb2P13373 Tmem53-203ENSMUST00000106434 923 ntTSL 1 (best) BASIC8.01□□□□□ -1.13
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 32 ms