Protein–RNA interactions for Protein: P13372

Vpreb1, Immunoglobulin iota chain, mousemouse

Predictions only

Length 142 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Vpreb1P13372 Mmgt2-203ENSMUST00000129162 1828 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.78□□□□□ -1.16
Vpreb1P13372 Glyctk-202ENSMUST00000112543 4081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.78□□□□□ -1.16
Vpreb1P13372 Dusp13-202ENSMUST00000119866 1342 ntTSL 5 BASIC7.78□□□□□ -1.16
Vpreb1P13372 Wdr89-201ENSMUST00000062370 2979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.77□□□□□ -1.16
Vpreb1P13372 Adarb1-204ENSMUST00000105406 6662 ntTSL 1 (best) BASIC7.77□□□□□ -1.16
Vpreb1P13372 Gm4454-201ENSMUST00000190585 2578 ntBASIC7.77□□□□□ -1.16
Vpreb1P13372 Fbxl22-201ENSMUST00000056890 3935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.77□□□□□ -1.17
Vpreb1P13372 Nsd3-203ENSMUST00000136107 3818 ntTSL 1 (best) BASIC7.77□□□□□ -1.17
Vpreb1P13372 Stat5a-203ENSMUST00000107357 3605 ntTSL 1 (best) BASIC7.77□□□□□ -1.17
Vpreb1P13372 P2ry1-202ENSMUST00000193201 3614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.77□□□□□ -1.17
Vpreb1P13372 AC154176.2-201ENSMUST00000225376 6429 ntBASIC7.77□□□□□ -1.17
Vpreb1P13372 4933417C20Rik-201ENSMUST00000193962 1874 ntBASIC7.77□□□□□ -1.17
Vpreb1P13372 Ngef-202ENSMUST00000068681 3109 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC7.77□□□□□ -1.17
Vpreb1P13372 Itgad-201ENSMUST00000033051 3965 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC7.77□□□□□ -1.17
Vpreb1P13372 Armc3-202ENSMUST00000114640 2818 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC7.77□□□□□ -1.17
Vpreb1P13372 1110002L01Rik-202ENSMUST00000168012 3569 ntTSL 2 BASIC7.77□□□□□ -1.17
Vpreb1P13372 Gm12341-201ENSMUST00000119724 503 ntBASIC7.77□□□□□ -1.17
Vpreb1P13372 Gm16342-201ENSMUST00000124025 1025 ntBASIC7.77□□□□□ -1.17
Vpreb1P13372 Gm16000-201ENSMUST00000146657 447 ntTSL 2 BASIC7.77□□□□□ -1.17
Vpreb1P13372 Atp5j2-202ENSMUST00000161741 955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.77□□□□□ -1.17
Vpreb1P13372 S100a14-201ENSMUST00000164481 915 ntTSL 2 BASIC7.77□□□□□ -1.17
Vpreb1P13372 Prr13-204ENSMUST00000164957 1055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.77□□□□□ -1.17
Vpreb1P13372 Tnfrsf12a-202ENSMUST00000167059 858 ntTSL 2 BASIC7.77□□□□□ -1.17
Vpreb1P13372 Smad7-204ENSMUST00000174411 769 ntTSL 5 BASIC7.77□□□□□ -1.17
Vpreb1P13372 Gm26894-201ENSMUST00000180828 1134 ntTSL 1 (best) BASIC7.77□□□□□ -1.17
Vpreb1P13372 1700030C10Rik-202ENSMUST00000186243 126 ntBASIC7.77□□□□□ -1.17
Vpreb1P13372 C030018K13Rik-202ENSMUST00000196829 712 ntTSL 3 BASIC7.77□□□□□ -1.17
Vpreb1P13372 Gm42722-201ENSMUST00000198855 940 ntTSL 3 BASIC7.77□□□□□ -1.17
Vpreb1P13372 Gm44069-201ENSMUST00000204898 506 ntBASIC7.77□□□□□ -1.17
Vpreb1P13372 1700011B04Rik-206ENSMUST00000221013 824 ntTSL 5 BASIC7.77□□□□□ -1.17
Vpreb1P13372 Gm8227-201ENSMUST00000223306 571 ntBASIC7.77□□□□□ -1.17
Vpreb1P13372 Tnfrsf12a-201ENSMUST00000024698 963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.77□□□□□ -1.17
Vpreb1P13372 Rps5-201ENSMUST00000004554 761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.77□□□□□ -1.17
Vpreb1P13372 Il27-201ENSMUST00000058429 1021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.77□□□□□ -1.17
Vpreb1P13372 A730061H03Rik-201ENSMUST00000066106 465 ntAPPRIS P1 BASIC7.77□□□□□ -1.17
Vpreb1P13372 Eapp-201ENSMUST00000067272 590 ntTSL 3 BASIC7.77□□□□□ -1.17
Vpreb1P13372 Vmn1r217-201ENSMUST00000091721 897 ntAPPRIS P1 BASIC7.77□□□□□ -1.17
Vpreb1P13372 Pdgfrb-201ENSMUST00000025522 5407 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC7.77□□□□□ -1.17
Vpreb1P13372 Trmt12-201ENSMUST00000036937 4454 ntAPPRIS P1 BASIC7.77□□□□□ -1.17
Vpreb1P13372 Dusp16-201ENSMUST00000100857 5104 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC7.77□□□□□ -1.17
Vpreb1P13372 Slc2a10-201ENSMUST00000029196 3544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.77□□□□□ -1.17
Vpreb1P13372 Ppp2r1b-202ENSMUST00000114437 3430 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC7.77□□□□□ -1.17
Vpreb1P13372 Zbtb43-203ENSMUST00000113156 1828 ntTSL 1 (best) BASIC7.77□□□□□ -1.17
Vpreb1P13372 Th-201ENSMUST00000000219 1829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.77□□□□□ -1.17
Vpreb1P13372 Pbx1-208ENSMUST00000188912 3970 ntTSL 1 (best) BASIC7.77□□□□□ -1.17
Vpreb1P13372 Nrbp2-201ENSMUST00000019516 2495 ntTSL 1 (best) BASIC7.77□□□□□ -1.17
Vpreb1P13372 Gm8036-201ENSMUST00000118089 1718 ntBASIC7.77□□□□□ -1.17
Vpreb1P13372 Tesk2-201ENSMUST00000045542 3033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.77□□□□□ -1.17
Vpreb1P13372 Furin-202ENSMUST00000120753 4332 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.77□□□□□ -1.17
Vpreb1P13372 Dcun1d2-203ENSMUST00000110839 2937 ntTSL 1 (best) BASIC7.77□□□□□ -1.17
Vpreb1P13372 Tuba1a-201ENSMUST00000097014 1647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.77□□□□□ -1.17
Vpreb1P13372 Qpctl-201ENSMUST00000032566 2710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.77□□□□□ -1.17
Vpreb1P13372 Dqx1-201ENSMUST00000077502 3257 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.77□□□□□ -1.17
Vpreb1P13372 Thsd7b-202ENSMUST00000073527 6213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.77□□□□□ -1.17
Vpreb1P13372 Arfgap1-202ENSMUST00000108859 2639 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.77□□□□□ -1.17
Vpreb1P13372 Ubtf-203ENSMUST00000107115 3199 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC7.77□□□□□ -1.17
Vpreb1P13372 Zranb2-201ENSMUST00000029831 2540 ntTSL 5 BASIC7.77□□□□□ -1.17
Vpreb1P13372 Gm13126-201ENSMUST00000117079 3063 ntBASIC7.77□□□□□ -1.17
Vpreb1P13372 Oas3-201ENSMUST00000044833 4720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.77□□□□□ -1.17
Vpreb1P13372 Anln-201ENSMUST00000040912 4605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.77□□□□□ -1.17
Vpreb1P13372 Krt7-201ENSMUST00000068904 4094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.77□□□□□ -1.17
Vpreb1P13372 Mageb4-202ENSMUST00000113969 2403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.77□□□□□ -1.17
Vpreb1P13372 Mageb4-201ENSMUST00000096378 2401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.77□□□□□ -1.17
Vpreb1P13372 Olfr582-202ENSMUST00000210119 1787 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.76□□□□□ -1.17
Vpreb1P13372 Ube3a-203ENSMUST00000200758 9856 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC7.76□□□□□ -1.17
Vpreb1P13372 Magi1-203ENSMUST00000093769 4598 ntTSL 1 (best) BASIC7.76□□□□□ -1.17
Vpreb1P13372 0610038B21Rik-201ENSMUST00000181420 1687 ntTSL 1 (best) BASIC7.76□□□□□ -1.17
Vpreb1P13372 Gas8-201ENSMUST00000093043 1681 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.76□□□□□ -1.17
Vpreb1P13372 Lrrc27-201ENSMUST00000016124 2113 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC7.76□□□□□ -1.17
Vpreb1P13372 Asxl2-207ENSMUST00000153102 4462 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC7.76□□□□□ -1.17
Vpreb1P13372 AC115891.3-201ENSMUST00000219161 2472 ntBASIC7.76□□□□□ -1.17
Vpreb1P13372 Rps6ka6-203ENSMUST00000096348 4151 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC7.76□□□□□ -1.17
Vpreb1P13372 Cxcr5-202ENSMUST00000179828 2824 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.76□□□□□ -1.17
Vpreb1P13372 Serinc2-202ENSMUST00000120126 1452 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC7.76□□□□□ -1.17
Vpreb1P13372 Slc22a13b-ps-201ENSMUST00000173185 1458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.76□□□□□ -1.17
Vpreb1P13372 Gal3st2b-202ENSMUST00000178757 2722 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC7.76□□□□□ -1.17
Vpreb1P13372 Ralgps1-205ENSMUST00000131298 6035 ntTSL 1 (best) BASIC7.76□□□□□ -1.17
Vpreb1P13372 Gm10417-201ENSMUST00000194341 3522 ntBASIC7.76□□□□□ -1.17
Vpreb1P13372 Lig3-202ENSMUST00000080461 3056 ntTSL 5 BASIC7.76□□□□□ -1.17
Vpreb1P13372 Rasgef1b-203ENSMUST00000146396 3339 ntTSL 1 (best) BASIC7.76□□□□□ -1.17
Vpreb1P13372 Gper1-201ENSMUST00000066211 2537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.76□□□□□ -1.17
Vpreb1P13372 Mlx-203ENSMUST00000107303 1736 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC7.76□□□□□ -1.17
Vpreb1P13372 Rapgef3-203ENSMUST00000126854 4005 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC7.76□□□□□ -1.17
Vpreb1P13372 Mat2b-202ENSMUST00000101347 2053 ntTSL 1 (best) BASIC7.76□□□□□ -1.17
Vpreb1P13372 Atg16l2-201ENSMUST00000120267 6459 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC7.76□□□□□ -1.17
Vpreb1P13372 Gm45187-201ENSMUST00000207697 2760 ntTSL 1 (best) BASIC7.76□□□□□ -1.17
Vpreb1P13372 Gm11555-202ENSMUST00000104929 638 ntAPPRIS P1 BASIC7.76□□□□□ -1.17
Vpreb1P13372 Birc7-201ENSMUST00000108875 1178 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.76□□□□□ -1.17
Vpreb1P13372 Rnd1-202ENSMUST00000109149 1034 ntTSL 1 (best) BASIC7.76□□□□□ -1.17
Vpreb1P13372 Gm13689-201ENSMUST00000119360 685 ntBASIC7.76□□□□□ -1.17
Vpreb1P13372 Gm13134-202ENSMUST00000144347 387 ntTSL 2 BASIC7.76□□□□□ -1.17
Vpreb1P13372 4930594M17Rik-201ENSMUST00000181204 1033 ntTSL 1 (best) BASIC7.76□□□□□ -1.17
Vpreb1P13372 1700022A21Rik-201ENSMUST00000182745 1051 ntBASIC7.76□□□□□ -1.17
Vpreb1P13372 2610300A13Rik-201ENSMUST00000192930 503 ntBASIC7.76□□□□□ -1.17
Vpreb1P13372 Psmc3ip-201ENSMUST00000019447 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.76□□□□□ -1.17
Vpreb1P13372 Ighv1-60-201ENSMUST00000195816 405 ntBASIC7.76□□□□□ -1.17
Vpreb1P13372 Mpv17-207ENSMUST00000201491 923 ntTSL 2 BASIC7.76□□□□□ -1.17
Vpreb1P13372 2310016G11Rik-202ENSMUST00000209111 733 ntTSL 3 BASIC7.76□□□□□ -1.17
Vpreb1P13372 Gm45668-201ENSMUST00000211271 493 ntBASIC7.76□□□□□ -1.17
Vpreb1P13372 Galc-201ENSMUST00000021390 3832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.76□□□□□ -1.17
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 40.3 ms